MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021820	CTG	2	6	1040791	1040796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218784
19502	NC_021820	CGTA	2	8	1040819	1040826	25 %	25 %	25 %	25 %	526218784
19503	NC_021820	CTT	2	6	1040828	1040833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218784
19504	NC_021820	GTGGC	2	10	1040849	1040858	0 %	20 %	60 %	20 %	526218784
19505	NC_021820	CCGA	2	8	1040947	1040954	25 %	0 %	25 %	50 %	526218784
19506	NC_021820	TGA	2	6	1040961	1040966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218784
19507	NC_021820	CTA	2	6	1041008	1041013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218784
19508	NC_021820	CGT	4	12	1041019	1041030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218784
19509	NC_021820	GGCT	2	8	1041034	1041041	0 %	25 %	50 %	25 %	526218784
19510	NC_021820	TCG	2	6	1041057	1041062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218784
19511	NC_021820	GAC	2	6	1041199	1041204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218784
19512	NC_021820	GGC	2	6	1041291	1041296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218784
19513	NC_021820	GAA	2	6	1041319	1041324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218784
19514	NC_021820	ATT	2	6	1041346	1041351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218784
19515	NC_021820	GAT	2	6	1041378	1041383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218784
19516	NC_021820	ATC	2	6	1041565	1041570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218785
19517	NC_021820	CGT	2	6	1041667	1041672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218785
19518	NC_021820	ATCA	2	8	1041750	1041757	50 %	25 %	0 %	25 %	526218785
19519	NC_021820	CGGG	2	8	1041765	1041772	0 %	0 %	75 %	25 %	526218785
19520	NC_021820	CCG	2	6	1041781	1041786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218785
19521	NC_021820	A	6	6	1041794	1041799	100 %	0 %	0 %	0 %	526218785
19522	NC_021820	AGC	2	6	1041888	1041893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218785
19523	NC_021820	GTC	2	6	1041919	1041924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218785
19524	NC_021820	ATT	2	6	1042022	1042027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218785
19525	NC_021820	TGG	2	6	1042030	1042035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218785
19526	NC_021820	GAA	2	6	1042189	1042194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218786
19527	NC_021820	AGC	2	6	1042226	1042231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19528	NC_021820	CGC	2	6	1042246	1042251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218786
19529	NC_021820	GC	3	6	1042254	1042259	0 %	0 %	50 %	50 %	526218786
19530	NC_021820	CGC	2	6	1042291	1042296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218786
19531	NC_021820	CTG	2	6	1042327	1042332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19532	NC_021820	CGC	2	6	1042483	1042488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218786
19533	NC_021820	GAC	2	6	1042579	1042584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19534	NC_021820	GCC	2	6	1042586	1042591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218786
19535	NC_021820	AGA	2	6	1042617	1042622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218786
19536	NC_021820	GC	3	6	1042631	1042636	0 %	0 %	50 %	50 %	526218786
19537	NC_021820	TCGTGG	2	12	1042646	1042657	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	526218786
19538	NC_021820	TCG	2	6	1042706	1042711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19539	NC_021820	AGC	2	6	1042802	1042807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19540	NC_021820	AGA	2	6	1042824	1042829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218786
19541	NC_021820	GTCG	2	8	1042849	1042856	0 %	25 %	50 %	25 %	526218786
19542	NC_021820	GAC	2	6	1042915	1042920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19543	NC_021820	A	6	6	1042936	1042941	100 %	0 %	0 %	0 %	526218786
19544	NC_021820	CGG	3	9	1042944	1042952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218786
19545	NC_021820	TAT	2	6	1042987	1042992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218786
19546	NC_021820	GCC	2	6	1042998	1043003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218786
19547	NC_021820	CGC	2	6	1043006	1043011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218786
19548	NC_021820	GC	3	6	1043023	1043028	0 %	0 %	50 %	50 %	526218786
19549	NC_021820	TGA	2	6	1043198	1043203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218786
19550	NC_021820	TGC	2	6	1043243	1043248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19551	NC_021820	G	6	6	1043350	1043355	0 %	0 %	100 %	0 %	526218786
19552	NC_021820	CGG	2	6	1043483	1043488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218786
19553	NC_021820	CAC	2	6	1043544	1043549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218786
19554	NC_021820	AAAC	2	8	1043610	1043617	75 %	0 %	0 %	25 %	526218786
19555	NC_021820	CG	3	6	1043624	1043629	0 %	0 %	50 %	50 %	526218786
19556	NC_021820	CCGG	2	8	1043661	1043668	0 %	0 %	50 %	50 %	526218786
19557	NC_021820	TGC	2	6	1043678	1043683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19558	NC_021820	TGC	3	9	1043690	1043698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19559	NC_021820	CGC	2	6	1043788	1043793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218786
19560	NC_021820	TCTT	2	8	1043802	1043809	0 %	75 %	0 %	25 %	526218786
19561	NC_021820	CTG	2	6	1043830	1043835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218786
19562	NC_021820	ACT	2	6	1043885	1043890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218786
19563	NC_021820	CGC	2	6	1043938	1043943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218786
19564	NC_021820	TGA	2	6	1043946	1043951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218786
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19566	NC_021820	TGA	2	6	1044066	1044071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218786
19567	NC_021820	CGG	2	6	1044162	1044167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218786
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19570	NC_021820	CGT	2	6	1044334	1044339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218786
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19573	NC_021820	A	6	6	1044391	1044396	100 %	0 %	0 %	0 %	526218786
19574	NC_021820	AGC	2	6	1044408	1044413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218786
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19577	NC_021820	GCG	2	6	1044490	1044495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218786
19578	NC_021820	A	6	6	1044499	1044504	100 %	0 %	0 %	0 %	526218786
19579	NC_021820	CTG	2	6	1044646	1044651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218787
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19581	NC_021820	CGA	2	6	1044780	1044785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218787
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19583	NC_021820	T	6	6	1044891	1044896	0 %	100 %	0 %	0 %	526218787
19584	NC_021820	TGC	2	6	1044957	1044962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218787
19585	NC_021820	GAA	2	6	1045020	1045025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218787
19586	NC_021820	GCG	2	6	1045034	1045039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218787
19587	NC_021820	GC	3	6	1045078	1045083	0 %	0 %	50 %	50 %	526218787
19588	NC_021820	CGG	2	6	1045127	1045132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218787
19589	NC_021820	GAAGGT	2	12	1045198	1045209	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	526218787
19590	NC_021820	CGT	2	6	1045213	1045218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218787
19591	NC_021820	GTC	2	6	1045272	1045277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218787
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19595	NC_021820	ATGA	2	8	1045566	1045573	50 %	25 %	25 %	0 %	526218788
19596	NC_021820	TTTA	2	8	1045598	1045605	25 %	75 %	0 %	0 %	526218788
19597	NC_021820	CAA	2	6	1045611	1045616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218788
19598	NC_021820	TCGG	2	8	1045716	1045723	0 %	25 %	50 %	25 %	526218788
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19600	NC_021820	GC	3	6	1045765	1045770	0 %	0 %	50 %	50 %	526218788
19601	NC_021820	TCG	2	6	1045782	1045787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218788
19602	NC_021820	CAC	2	6	1045811	1045816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218788
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19604	NC_021820	TGA	2	6	1045954	1045959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221896
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19612	NC_021820	GC	4	8	1046335	1046342	0 %	0 %	50 %	50 %	526221896
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19733	NC_021820	GCA	2	6	1052085	1052090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221897
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19962	NC_021820	CGG	2	6	1065097	1065102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218808
19963	NC_021820	CGT	2	6	1065162	1065167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218808
19964	NC_021820	GGC	2	6	1065185	1065190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218808
19965	NC_021820	GAA	2	6	1065210	1065215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218808
19966	NC_021820	ACCG	2	8	1065303	1065310	25 %	0 %	25 %	50 %	526218808
19967	NC_021820	CG	4	8	1065368	1065375	0 %	0 %	50 %	50 %	526218808
19968	NC_021820	CTG	2	6	1065549	1065554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218808
19969	NC_021820	CGA	2	6	1065888	1065893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218809
19970	NC_021820	GGC	2	6	1065961	1065966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218809
19971	NC_021820	ATC	2	6	1066045	1066050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218809
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19974	NC_021820	TGC	2	6	1066091	1066096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218809
19975	NC_021820	GTG	2	6	1066216	1066221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218809
19976	NC_021820	CTG	2	6	1066294	1066299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218809
19977	NC_021820	TCG	2	6	1066367	1066372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218809
19978	NC_021820	TGA	2	6	1066403	1066408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218809
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19980	NC_021820	TGGT	2	8	1066550	1066557	0 %	50 %	50 %	0 %	526218809
19981	NC_021820	CCG	2	6	1066562	1066567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218809
19982	NC_021820	CG	4	8	1066598	1066605	0 %	0 %	50 %	50 %	526218809
19983	NC_021820	ATC	2	6	1066627	1066632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218809
19984	NC_021820	GTG	2	6	1066687	1066692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218809
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19986	NC_021820	TGG	2	6	1066727	1066732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218809
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19988	NC_021820	CGG	2	6	1066778	1066783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218809
19989	NC_021820	GCG	2	6	1066799	1066804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218809
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19991	NC_021820	AAG	2	6	1066841	1066846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218809
19992	NC_021820	CG	3	6	1066882	1066887	0 %	0 %	50 %	50 %	526218809
19993	NC_021820	CTGC	2	8	1066920	1066927	0 %	25 %	25 %	50 %	526218809
19994	NC_021820	GCG	2	6	1066931	1066936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218809
19995	NC_021820	CAT	2	6	1067025	1067030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218809
19996	NC_021820	CGC	2	6	1067198	1067203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218809
19997	NC_021820	GCTG	2	8	1067228	1067235	0 %	25 %	50 %	25 %	526218809
19998	NC_021820	ATT	2	6	1067382	1067387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218810
19999	NC_021820	GC	3	6	1067397	1067402	0 %	0 %	50 %	50 %	526218810
20000	NC_021820	ATC	2	6	1067446	1067451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218810

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