MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_021820	GGC	2	6	986172	986177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218743
18503	NC_021820	CTA	2	6	986225	986230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218743
18504	NC_021820	CT	3	6	986232	986237	0 %	50 %	0 %	50 %	526218743
18505	NC_021820	AGA	2	6	986309	986314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218743
18506	NC_021820	TGGTC	2	10	986315	986324	0 %	40 %	40 %	20 %	526218743
18507	NC_021820	GTG	2	6	986325	986330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218743
18508	NC_021820	GC	3	6	986383	986388	0 %	0 %	50 %	50 %	526218743
18509	NC_021820	TG	3	6	986469	986474	0 %	50 %	50 %	0 %	526218743
18510	NC_021820	AGCG	2	8	986488	986495	25 %	0 %	50 %	25 %	526218743
18511	NC_021820	CGC	2	6	986554	986559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218743
18512	NC_021820	CGT	2	6	986569	986574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218743
18513	NC_021820	ATT	2	6	986592	986597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218743
18514	NC_021820	CATG	2	8	986667	986674	25 %	25 %	25 %	25 %	526218743
18515	NC_021820	T	6	6	986689	986694	0 %	100 %	0 %	0 %	526218744
18516	NC_021820	CTG	3	9	986731	986739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218744
18517	NC_021820	GGC	2	6	986743	986748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18518	NC_021820	CGC	2	6	986765	986770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218744
18519	NC_021820	TGGGC	2	10	986811	986820	0 %	20 %	60 %	20 %	526218744
18520	NC_021820	TGCG	2	8	986855	986862	0 %	25 %	50 %	25 %	526218744
18521	NC_021820	TGC	3	9	986870	986878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218744
18522	NC_021820	CGG	2	6	986918	986923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18523	NC_021820	GCG	2	6	986929	986934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18524	NC_021820	CGG	2	6	986937	986942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18525	NC_021820	TTG	2	6	986959	986964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218744
18526	NC_021820	CGC	2	6	986978	986983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218744
18527	NC_021820	GGC	2	6	987006	987011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18528	NC_021820	AGT	2	6	987021	987026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218744
18529	NC_021820	CTT	2	6	987027	987032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218744
18530	NC_021820	ATG	2	6	987100	987105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218744
18531	NC_021820	GGC	3	9	987124	987132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18532	NC_021820	GGC	2	6	987138	987143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18533	NC_021820	TGA	2	6	987233	987238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218744
18534	NC_021820	CCG	2	6	987257	987262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218744
18535	NC_021820	GCA	2	6	987264	987269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218744
18536	NC_021820	GGC	2	6	987300	987305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18537	NC_021820	GTG	2	6	987319	987324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218744
18538	NC_021820	GC	4	8	987329	987336	0 %	0 %	50 %	50 %	526218744
18539	NC_021820	TGG	2	6	987374	987379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218744
18540	NC_021820	CGG	2	6	987386	987391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218744
18541	NC_021820	TAC	2	6	987562	987567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221882
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18543	NC_021820	TG	3	6	987662	987667	0 %	50 %	50 %	0 %	526221882
18544	NC_021820	GAT	3	9	987685	987693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221882
18545	NC_021820	ACC	2	6	987799	987804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221882
18546	NC_021820	T	6	6	987819	987824	0 %	100 %	0 %	0 %	526221882
18547	NC_021820	CTG	2	6	987907	987912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221882
18548	NC_021820	GGC	2	6	987930	987935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221882
18549	NC_021820	CTG	2	6	987958	987963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221882
18550	NC_021820	TGC	2	6	987989	987994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221882
18551	NC_021820	CGT	2	6	988032	988037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221882
18552	NC_021820	CAG	2	6	988063	988068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221882
18553	NC_021820	GTT	2	6	988098	988103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221882
18554	NC_021820	TCAGCA	2	12	988223	988234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526218745
18555	NC_021820	CGC	2	6	988289	988294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218745
18556	NC_021820	CTG	2	6	988462	988467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218745
18557	NC_021820	GCC	2	6	988512	988517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218745
18558	NC_021820	GGCA	2	8	988560	988567	25 %	0 %	50 %	25 %	526218745
18559	NC_021820	TGC	2	6	988609	988614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218745
18560	NC_021820	GTAC	2	8	988643	988650	25 %	25 %	25 %	25 %	526218745
18561	NC_021820	GTC	2	6	988677	988682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218745
18562	NC_021820	GCT	2	6	988686	988691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218745
18563	NC_021820	TTC	2	6	988704	988709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218745
18564	NC_021820	GC	3	6	988784	988789	0 %	0 %	50 %	50 %	526218745
18565	NC_021820	GAG	2	6	988912	988917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218745
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18567	NC_021820	GGTT	2	8	989025	989032	0 %	50 %	50 %	0 %	526218745
18568	NC_021820	TTG	2	6	989128	989133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218745
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18571	NC_021820	ATA	2	6	989265	989270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218745
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18575	NC_021820	GGTA	2	8	989390	989397	25 %	25 %	50 %	0 %	526218745
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18581	NC_021820	T	6	6	989937	989942	0 %	100 %	0 %	0 %	526218746
18582	NC_021820	TTTA	2	8	989990	989997	25 %	75 %	0 %	0 %	526218746
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18585	NC_021820	CTGGT	2	10	990192	990201	0 %	40 %	40 %	20 %	526218746
18586	NC_021820	A	6	6	990398	990403	100 %	0 %	0 %	0 %	526218746
18587	NC_021820	GA	3	6	990441	990446	50 %	0 %	50 %	0 %	526218746
18588	NC_021820	AGAA	2	8	990461	990468	75 %	0 %	25 %	0 %	526218746
18589	NC_021820	AAG	2	6	990484	990489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218746
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18591	NC_021820	CGAT	2	8	990653	990660	25 %	25 %	25 %	25 %	526218746
18592	NC_021820	CGG	2	6	990670	990675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218746
18593	NC_021820	CCAG	2	8	990704	990711	25 %	0 %	25 %	50 %	526218746
18594	NC_021820	AAT	2	6	990735	990740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218746
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18599	NC_021820	TAA	2	6	991738	991743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221884
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18601	NC_021820	TAA	2	6	991781	991786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221884
18602	NC_021820	T	8	8	991792	991799	0 %	100 %	0 %	0 %	526221884
18603	NC_021820	T	6	6	991819	991824	0 %	100 %	0 %	0 %	526221884
18604	NC_021820	TGA	2	6	991909	991914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218747
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18606	NC_021820	AAG	2	6	991988	991993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218747
18607	NC_021820	CA	3	6	992006	992011	50 %	0 %	0 %	50 %	526218747
18608	NC_021820	ATATT	2	10	992029	992038	40 %	60 %	0 %	0 %	526218747
18609	NC_021820	ATTC	2	8	992067	992074	25 %	50 %	0 %	25 %	526218747
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18612	NC_021820	TAT	2	6	992207	992212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218747
18613	NC_021820	AG	3	6	992252	992257	50 %	0 %	50 %	0 %	526218747
18614	NC_021820	TTA	2	6	992300	992305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218747
18615	NC_021820	GTC	2	6	992410	992415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218747
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18618	NC_021820	AATTA	2	10	992499	992508	60 %	40 %	0 %	0 %	526218747
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18740	NC_021820	TGG	2	6	1001068	1001073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218752
18741	NC_021820	TCA	2	6	1001077	1001082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218752
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18967	NC_021820	GCA	2	6	1013733	1013738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218764
18968	NC_021820	GAT	2	6	1013770	1013775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218764
18969	NC_021820	TCA	2	6	1013822	1013827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218764
18970	NC_021820	ATC	2	6	1013849	1013854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218764
18971	NC_021820	ACC	2	6	1013913	1013918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218765
18972	NC_021820	TGA	2	6	1013929	1013934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218765
18973	NC_021820	T	6	6	1013950	1013955	0 %	100 %	0 %	0 %	526218765
18974	NC_021820	GCC	2	6	1013976	1013981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218765
18975	NC_021820	GCA	2	6	1014013	1014018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218765
18976	NC_021820	GCC	2	6	1014024	1014029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218765
18977	NC_021820	CAC	3	9	1014050	1014058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218765
18978	NC_021820	CGA	2	6	1014076	1014081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218765
18979	NC_021820	GCA	2	6	1014175	1014180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218765
18980	NC_021820	T	6	6	1014203	1014208	0 %	100 %	0 %	0 %	526218765
18981	NC_021820	CCA	2	6	1014209	1014214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218765
18982	NC_021820	GTC	2	6	1014252	1014257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218765
18983	NC_021820	CTG	2	6	1014324	1014329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218766
18984	NC_021820	CTT	2	6	1014435	1014440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218766
18985	NC_021820	AAT	2	6	1014639	1014644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218766
18986	NC_021820	GTT	2	6	1014789	1014794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218766
18987	NC_021820	CAT	2	6	1014798	1014803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218766
18988	NC_021820	TGT	2	6	1014900	1014905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218766
18989	NC_021820	TCA	2	6	1014907	1014912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218766
18990	NC_021820	GCG	2	6	1014938	1014943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218766
18991	NC_021820	CAC	2	6	1014969	1014974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218766
18992	NC_021820	CCTTCT	2	12	1015008	1015019	0 %	50 %	0 %	50 %	526218767
18993	NC_021820	GCT	2	6	1015025	1015030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218767
18994	NC_021820	CCG	2	6	1015040	1015045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218767
18995	NC_021820	TGGC	2	8	1015056	1015063	0 %	25 %	50 %	25 %	526218767
18996	NC_021820	GTG	2	6	1015070	1015075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218767
18997	NC_021820	TCG	2	6	1015154	1015159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218767
18998	NC_021820	GC	3	6	1015191	1015196	0 %	0 %	50 %	50 %	526218767
18999	NC_021820	CAG	2	6	1015276	1015281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218767
19000	NC_021820	TACG	2	8	1015314	1015321	25 %	25 %	25 %	25 %	526218767

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