MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021820	GCA	2	6	958816	958821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221871
18002	NC_021820	GAG	2	6	958898	958903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221871
18003	NC_021820	GCC	2	6	959005	959010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221871
18004	NC_021820	TAA	2	6	959067	959072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221871
18005	NC_021820	GTA	2	6	959083	959088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221871
18006	NC_021820	TGGT	2	8	959111	959118	0 %	50 %	50 %	0 %	526221871
18007	NC_021820	GCC	2	6	959129	959134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221871
18008	NC_021820	ACC	2	6	959162	959167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221871
18009	NC_021820	GATT	2	8	959169	959176	25 %	50 %	25 %	0 %	526221871
18010	NC_021820	GAC	2	6	959209	959214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221871
18011	NC_021820	T	6	6	959215	959220	0 %	100 %	0 %	0 %	526221871
18012	NC_021820	AGG	2	6	959582	959587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221872
18013	NC_021820	AGC	2	6	959614	959619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221872
18014	NC_021820	AG	3	6	959646	959651	50 %	0 %	50 %	0 %	526221872
18015	NC_021820	TTTTTC	2	12	959657	959668	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	526221872
18016	NC_021820	TGC	2	6	959689	959694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221872
18017	NC_021820	TCG	2	6	959741	959746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221872
18018	NC_021820	GGC	2	6	959758	959763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221872
18019	NC_021820	ATA	2	6	959846	959851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221872
18020	NC_021820	TCG	2	6	959894	959899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221872
18021	NC_021820	GTC	2	6	959962	959967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221872
18022	NC_021820	CGC	2	6	960064	960069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221872
18023	NC_021820	CCG	2	6	960123	960128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221872
18024	NC_021820	CGT	2	6	960201	960206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221872
18025	NC_021820	GCT	2	6	960321	960326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221872
18026	NC_021820	GTTTTT	2	12	960408	960419	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	526221872
18027	NC_021820	ATA	2	6	960452	960457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221872
18028	NC_021820	TGC	2	6	960475	960480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221872
18029	NC_021820	CTT	3	9	960866	960874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218732
18030	NC_021820	T	6	6	960902	960907	0 %	100 %	0 %	0 %	526218732
18031	NC_021820	CGG	2	6	960918	960923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218732
18032	NC_021820	ACC	2	6	960928	960933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218732
18033	NC_021820	ATG	2	6	960963	960968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218732
18034	NC_021820	ACC	2	6	961003	961008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218732
18035	NC_021820	GCG	2	6	961060	961065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218732
18036	NC_021820	ATCC	2	8	961067	961074	25 %	25 %	0 %	50 %	526218732
18037	NC_021820	TGT	2	6	961146	961151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218732
18038	NC_021820	ATC	2	6	961361	961366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218733
18039	NC_021820	AAT	2	6	961521	961526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218733
18040	NC_021820	TCA	2	6	961554	961559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218733
18041	NC_021820	CCG	3	9	961647	961655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218733
18042	NC_021820	G	6	6	961657	961662	0 %	0 %	100 %	0 %	526218733
18043	NC_021820	ATA	2	6	961714	961719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218733
18044	NC_021820	AG	3	6	961750	961755	50 %	0 %	50 %	0 %	526218733
18045	NC_021820	ATG	2	6	961772	961777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218733
18046	NC_021820	TTC	2	6	961987	961992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218734
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18048	NC_021820	A	7	7	962708	962714	100 %	0 %	0 %	0 %	526218735
18049	NC_021820	CAT	2	6	962743	962748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218735
18050	NC_021820	TGA	2	6	962749	962754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218735
18051	NC_021820	CCG	2	6	962778	962783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218735
18052	NC_021820	TTG	2	6	962832	962837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218735
18053	NC_021820	GAT	2	6	962887	962892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218735
18054	NC_021820	CGG	2	6	962938	962943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218735
18055	NC_021820	AGA	2	6	962982	962987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218735
18056	NC_021820	CGA	2	6	963054	963059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218735
18057	NC_021820	TGT	2	6	963081	963086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218735
18058	NC_021820	GCTG	2	8	963192	963199	0 %	25 %	50 %	25 %	526218735
18059	NC_021820	GTG	2	6	963239	963244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218735
18060	NC_021820	CGA	2	6	963255	963260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218735
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18062	NC_021820	ATT	2	6	963329	963334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218735
18063	NC_021820	GGA	2	6	963358	963363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218735
18064	NC_021820	CAG	2	6	963377	963382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218735
18065	NC_021820	CCA	2	6	963456	963461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218735
18066	NC_021820	TGT	2	6	963477	963482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218735
18067	NC_021820	CCA	2	6	963504	963509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218735
18068	NC_021820	CTA	2	6	963517	963522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218735
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18070	NC_021820	ATC	2	6	963596	963601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218735
18071	NC_021820	GCT	2	6	963643	963648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218735
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18074	NC_021820	GC	3	6	963855	963860	0 %	0 %	50 %	50 %	526218735
18075	NC_021820	GGC	3	9	963862	963870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218735
18076	NC_021820	ATTG	2	8	963886	963893	25 %	50 %	25 %	0 %	526218735
18077	NC_021820	GGC	2	6	963913	963918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218735
18078	NC_021820	CTGG	2	8	963919	963926	0 %	25 %	50 %	25 %	526218735
18079	NC_021820	TGA	2	6	963945	963950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218735
18080	NC_021820	TAT	2	6	963959	963964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218735
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18083	NC_021820	CGA	2	6	964117	964122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218735
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18085	NC_021820	CAG	2	6	964321	964326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221873
18086	NC_021820	TG	3	6	964336	964341	0 %	50 %	50 %	0 %	526221873
18087	NC_021820	ACG	2	6	964346	964351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221873
18088	NC_021820	CGCTT	2	10	964515	964524	0 %	40 %	20 %	40 %	526221874
18089	NC_021820	TCA	2	6	964543	964548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221874
18090	NC_021820	ATA	2	6	964576	964581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221874
18091	NC_021820	CCA	2	6	964649	964654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221874
18092	NC_021820	CAC	3	9	964695	964703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221874
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18098	NC_021820	CG	3	6	964841	964846	0 %	0 %	50 %	50 %	526221874
18099	NC_021820	CAT	2	6	964875	964880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221874
18100	NC_021820	GCG	2	6	964901	964906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221874
18101	NC_021820	AAT	2	6	964933	964938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221874
18102	NC_021820	GCG	2	6	964964	964969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221874
18103	NC_021820	CGG	2	6	964991	964996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221874
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18105	NC_021820	TTGA	2	8	965043	965050	25 %	50 %	25 %	0 %	526221874
18106	NC_021820	GAC	2	6	965058	965063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221874
18107	NC_021820	CCG	2	6	965114	965119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221874
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18116	NC_021820	GC	3	6	965771	965776	0 %	0 %	50 %	50 %	526218736
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18476	NC_021820	CGTG	2	8	984772	984779	0 %	25 %	50 %	25 %	526218742
18477	NC_021820	GGC	2	6	984816	984821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218742
18478	NC_021820	CAA	2	6	984829	984834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218742
18479	NC_021820	TTG	2	6	984872	984877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218742
18480	NC_021820	GGAC	2	8	984924	984931	25 %	0 %	50 %	25 %	526218742
18481	NC_021820	CGA	2	6	984960	984965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218742
18482	NC_021820	AAAC	2	8	985056	985063	75 %	0 %	0 %	25 %	526218742
18483	NC_021820	TG	3	6	985095	985100	0 %	50 %	50 %	0 %	526218742
18484	NC_021820	CTG	2	6	985154	985159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218742
18485	NC_021820	TGG	2	6	985194	985199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218742
18486	NC_021820	GCG	2	6	985211	985216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218742
18487	NC_021820	GCA	2	6	985275	985280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218742
18488	NC_021820	CAG	2	6	985376	985381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218742
18489	NC_021820	TACC	2	8	985400	985407	25 %	25 %	0 %	50 %	526218742
18490	NC_021820	AGC	2	6	985461	985466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218742
18491	NC_021820	CGCCGA	2	12	985492	985503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526218742
18492	NC_021820	GCGA	2	8	985593	985600	25 %	0 %	50 %	25 %	526218742
18493	NC_021820	TGC	2	6	985734	985739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218742
18494	NC_021820	GTG	2	6	985838	985843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218742
18495	NC_021820	GGC	2	6	985885	985890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218742
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18499	NC_021820	GCA	2	6	985999	986004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218742
18500	NC_021820	CTC	2	6	986075	986080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218743

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