MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021820	ACTTCC	2	12	851297	851308	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	526221853
16002	NC_021820	TAT	2	6	851359	851364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221853
16003	NC_021820	CGC	2	6	851376	851381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221853
16004	NC_021820	ACG	2	6	851391	851396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221853
16005	NC_021820	CCG	2	6	851420	851425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221853
16006	NC_021820	CG	3	6	851460	851465	0 %	0 %	50 %	50 %	526221853
16007	NC_021820	GGT	2	6	851545	851550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221853
16008	NC_021820	AGT	2	6	851576	851581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221854
16009	NC_021820	TCC	2	6	851605	851610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221854
16010	NC_021820	CCG	2	6	851621	851626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221854
16011	NC_021820	GCG	2	6	851692	851697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221854
16012	NC_021820	TCAA	2	8	851713	851720	50 %	25 %	0 %	25 %	526221854
16013	NC_021820	CTG	2	6	851760	851765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221854
16014	NC_021820	GTGA	2	8	851782	851789	25 %	25 %	50 %	0 %	526221854
16015	NC_021820	CGG	2	6	851852	851857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221854
16016	NC_021820	CAT	2	6	851861	851866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221854
16017	NC_021820	GTA	2	6	851989	851994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221854
16018	NC_021820	CCA	2	6	852203	852208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221855
16019	NC_021820	CCA	3	9	852251	852259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221855
16020	NC_021820	TCC	2	6	852313	852318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221855
16021	NC_021820	AAAG	2	8	852325	852332	75 %	0 %	25 %	0 %	526221855
16022	NC_021820	ACC	2	6	852346	852351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221855
16023	NC_021820	CTC	2	6	852414	852419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221855
16024	NC_021820	C	7	7	852423	852429	0 %	0 %	0 %	100 %	526221855
16025	NC_021820	ACA	2	6	852437	852442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221855
16026	NC_021820	CAC	2	6	852499	852504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221855
16027	NC_021820	ACC	2	6	852535	852540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221855
16028	NC_021820	ATT	2	6	852580	852585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221855
16029	NC_021820	ACC	2	6	852640	852645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221855
16030	NC_021820	AGA	2	6	852656	852661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221855
16031	NC_021820	CTCCAC	2	12	852684	852695	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	526221855
16032	NC_021820	CCT	2	6	852707	852712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221855
16033	NC_021820	A	6	6	852772	852777	100 %	0 %	0 %	0 %	526221855
16034	NC_021820	CGC	2	6	852826	852831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16035	NC_021820	CGC	2	6	852850	852855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16036	NC_021820	CGT	2	6	852859	852864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221855
16037	NC_021820	TTA	2	6	852884	852889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221855
16038	NC_021820	GT	3	6	852952	852957	0 %	50 %	50 %	0 %	526221855
16039	NC_021820	GCC	2	6	852971	852976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16040	NC_021820	CGC	2	6	852994	852999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16041	NC_021820	GGT	2	6	853027	853032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221855
16042	NC_021820	TTA	2	6	853052	853057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221855
16043	NC_021820	CGC	2	6	853162	853167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16044	NC_021820	CGC	2	6	853315	853320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16045	NC_021820	CG	3	6	853464	853469	0 %	0 %	50 %	50 %	526221855
16046	NC_021820	CCG	2	6	853506	853511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16047	NC_021820	GCC	2	6	853561	853566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16048	NC_021820	GCA	2	6	853569	853574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221855
16049	NC_021820	TCG	3	9	853622	853630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221855
16050	NC_021820	GCC	2	6	853657	853662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16051	NC_021820	TCC	2	6	853667	853672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221855
16052	NC_021820	GCA	2	6	853674	853679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221855
16053	NC_021820	ATT	2	6	853705	853710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221855
16054	NC_021820	CGC	2	6	853737	853742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221855
16055	NC_021820	CTGG	2	8	853768	853775	0 %	25 %	50 %	25 %	526221855
16056	NC_021820	ATA	2	6	853786	853791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221855
16057	NC_021820	CAC	2	6	853797	853802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221855
16058	NC_021820	T	6	6	853837	853842	0 %	100 %	0 %	0 %	526221855
16059	NC_021820	AGG	2	6	853886	853891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221855
16060	NC_021820	TTG	2	6	853980	853985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218660
16061	NC_021820	GC	3	6	854036	854041	0 %	0 %	50 %	50 %	526218660
16062	NC_021820	ATT	2	6	854139	854144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218660
16063	NC_021820	GAA	2	6	854193	854198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218660
16064	NC_021820	ATA	2	6	854249	854254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218660
16065	NC_021820	TTAA	2	8	854317	854324	50 %	50 %	0 %	0 %	526218660
16066	NC_021820	GCA	2	6	854347	854352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218660
16067	NC_021820	AGCC	2	8	854356	854363	25 %	0 %	25 %	50 %	526218660
16068	NC_021820	CCA	2	6	854426	854431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218660
16069	NC_021820	CGG	2	6	854474	854479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218660
16070	NC_021820	TCG	2	6	854506	854511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218660
16071	NC_021820	GCG	3	9	854519	854527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218660
16072	NC_021820	CGTCA	2	10	854563	854572	20 %	20 %	20 %	40 %	526218661
16073	NC_021820	CGT	2	6	854637	854642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218661
16074	NC_021820	CG	3	6	854741	854746	0 %	0 %	50 %	50 %	526218661
16075	NC_021820	CGT	2	6	854755	854760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218661
16076	NC_021820	CGG	2	6	854769	854774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218661
16077	NC_021820	CTGAT	2	10	854798	854807	20 %	40 %	20 %	20 %	526218661
16078	NC_021820	CG	3	6	854814	854819	0 %	0 %	50 %	50 %	526218661
16079	NC_021820	AAG	2	6	854893	854898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218661
16080	NC_021820	CGT	3	9	855090	855098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218661
16081	NC_021820	CGC	2	6	855105	855110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218661
16082	NC_021820	GCC	2	6	855112	855117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218661
16083	NC_021820	GC	3	6	855174	855179	0 %	0 %	50 %	50 %	526218661
16084	NC_021820	GTT	2	6	855199	855204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218661
16085	NC_021820	TCG	2	6	855278	855283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218661
16086	NC_021820	GCC	2	6	855386	855391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218661
16087	NC_021820	AAT	2	6	855429	855434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218661
16088	NC_021820	CCT	2	6	855480	855485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218661
16089	NC_021820	AGC	2	6	855533	855538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218661
16090	NC_021820	T	6	6	855562	855567	0 %	100 %	0 %	0 %	526218661
16091	NC_021820	CTT	2	6	855576	855581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218661
16092	NC_021820	ATC	2	6	855593	855598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218661
16093	NC_021820	GCG	2	6	855685	855690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218662
16094	NC_021820	TCG	2	6	855728	855733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218662
16095	NC_021820	AAC	2	6	855795	855800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218662
16096	NC_021820	TGC	2	6	855848	855853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218662
16097	NC_021820	CG	3	6	855881	855886	0 %	0 %	50 %	50 %	526218662
16098	NC_021820	ATG	2	6	855898	855903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218662
16099	NC_021820	TGA	2	6	855913	855918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218662
16100	NC_021820	ATC	2	6	855921	855926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218662
16101	NC_021820	TTC	2	6	855942	855947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218662
16102	NC_021820	GTA	2	6	856210	856215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221857
16103	NC_021820	TCA	2	6	856223	856228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221857
16104	NC_021820	GCT	2	6	856308	856313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221857
16105	NC_021820	ATA	2	6	856322	856327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221857
16106	NC_021820	CGT	2	6	856357	856362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221857
16107	NC_021820	AAT	2	6	856404	856409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221857
16108	NC_021820	CTTT	2	8	856419	856426	0 %	75 %	0 %	25 %	526221857
16109	NC_021820	ATA	2	6	856447	856452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221857
16110	NC_021820	CAG	2	6	856464	856469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221857
16111	NC_021820	ACC	2	6	856492	856497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221857
16112	NC_021820	ATA	2	6	856519	856524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221857
16113	NC_021820	GAT	2	6	856531	856536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221857
16114	NC_021820	T	6	6	856575	856580	0 %	100 %	0 %	0 %	526221857
16115	NC_021820	T	7	7	856605	856611	0 %	100 %	0 %	0 %	526221857
16116	NC_021820	CGA	2	6	856683	856688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221857
16117	NC_021820	CGC	2	6	856701	856706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221857
16118	NC_021820	CGCAG	2	10	856840	856849	20 %	0 %	40 %	40 %	526221857
16119	NC_021820	AACAA	2	10	856916	856925	80 %	0 %	0 %	20 %	526221857
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16143	NC_021820	TA	3	6	857949	857954	50 %	50 %	0 %	0 %	526218663
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16361	NC_021820	GTGGAG	2	12	870460	870471	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	526218678
16362	NC_021820	GTA	2	6	870475	870480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218678
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16479	NC_021820	ATG	2	6	877158	877163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218682
16480	NC_021820	ACT	2	6	877188	877193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218682
16481	NC_021820	GGT	2	6	877232	877237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218682
16482	NC_021820	GC	3	6	877350	877355	0 %	0 %	50 %	50 %	526218682
16483	NC_021820	ATG	2	6	877361	877366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218682
16484	NC_021820	CGT	2	6	877419	877424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218682
16485	NC_021820	GGCG	2	8	877468	877475	0 %	0 %	75 %	25 %	526218682
16486	NC_021820	GCG	2	6	877515	877520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218682
16487	NC_021820	CGG	2	6	877528	877533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218682
16488	NC_021820	CGA	2	6	877539	877544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218682
16489	NC_021820	TCT	2	6	877620	877625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218682
16490	NC_021820	CGC	2	6	877665	877670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218682
16491	NC_021820	GGT	2	6	877682	877687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218682
16492	NC_021820	TATGA	2	10	877715	877724	40 %	40 %	20 %	0 %	526218682
16493	NC_021820	ATG	2	6	877896	877901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218683
16494	NC_021820	GCT	2	6	877964	877969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218683
16495	NC_021820	ATT	2	6	878030	878035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218683
16496	NC_021820	TGG	2	6	878065	878070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218683
16497	NC_021820	CTTT	2	8	878087	878094	0 %	75 %	0 %	25 %	526218683
16498	NC_021820	CGG	2	6	878239	878244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218683
16499	NC_021820	TCC	2	6	878248	878253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218683
16500	NC_021820	CGG	4	12	878561	878572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218684

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