MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021820	TGC	2	6	819953	819958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218640
15502	NC_021820	TTGTT	2	10	819972	819981	0 %	80 %	20 %	0 %	526218640
15503	NC_021820	T	6	6	819980	819985	0 %	100 %	0 %	0 %	526218640
15504	NC_021820	T	6	6	820109	820114	0 %	100 %	0 %	0 %	526218641
15505	NC_021820	TCG	2	6	820180	820185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218641
15506	NC_021820	GACG	2	8	820229	820236	25 %	0 %	50 %	25 %	526218641
15507	NC_021820	CCAG	2	8	820270	820277	25 %	0 %	25 %	50 %	526218641
15508	NC_021820	TGC	2	6	820322	820327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218641
15509	NC_021820	GA	4	8	820329	820336	50 %	0 %	50 %	0 %	526218641
15510	NC_021820	CTT	3	9	820351	820359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218641
15511	NC_021820	GTT	2	6	820429	820434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218641
15512	NC_021820	TTA	2	6	820476	820481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218641
15513	NC_021820	TCT	2	6	820500	820505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218641
15514	NC_021820	CATC	2	8	820558	820565	25 %	25 %	0 %	50 %	526218641
15515	NC_021820	GCGCC	3	15	820621	820635	0 %	0 %	40 %	60 %	526218641
15516	NC_021820	AGC	2	6	820644	820649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218641
15517	NC_021820	CCA	2	6	820753	820758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218641
15518	NC_021820	TTC	2	6	820814	820819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218641
15519	NC_021820	CTG	2	6	820864	820869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218641
15520	NC_021820	ATA	2	6	820965	820970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218641
15521	NC_021820	GTT	2	6	821053	821058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218642
15522	NC_021820	GCG	2	6	821065	821070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218642
15523	NC_021820	AAT	2	6	821074	821079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218642
15524	NC_021820	GAT	2	6	821101	821106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218642
15525	NC_021820	GC	3	6	821179	821184	0 %	0 %	50 %	50 %	526218642
15526	NC_021820	GC	3	6	821202	821207	0 %	0 %	50 %	50 %	526218642
15527	NC_021820	GC	3	6	821217	821222	0 %	0 %	50 %	50 %	526218642
15528	NC_021820	GACA	2	8	821235	821242	50 %	0 %	25 %	25 %	526218642
15529	NC_021820	CTT	2	6	821245	821250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218642
15530	NC_021820	TCG	2	6	821307	821312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218642
15531	NC_021820	GAT	2	6	821336	821341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218642
15532	NC_021820	TGG	2	6	821346	821351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218642
15533	NC_021820	CTT	2	6	821383	821388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218642
15534	NC_021820	ATC	2	6	821411	821416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218642
15535	NC_021820	CTT	2	6	821443	821448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218642
15536	NC_021820	GGCGA	2	10	821695	821704	20 %	0 %	60 %	20 %	526218643
15537	NC_021820	CGCA	2	8	821749	821756	25 %	0 %	25 %	50 %	526218643
15538	NC_021820	AGG	2	6	821762	821767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218643
15539	NC_021820	CG	3	6	821778	821783	0 %	0 %	50 %	50 %	526218643
15540	NC_021820	T	6	6	821796	821801	0 %	100 %	0 %	0 %	526218643
15541	NC_021820	CAG	2	6	821810	821815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218643
15542	NC_021820	TGA	2	6	821823	821828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218643
15543	NC_021820	GCA	2	6	821853	821858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218643
15544	NC_021820	TG	3	6	821867	821872	0 %	50 %	50 %	0 %	526218643
15545	NC_021820	TCC	2	6	821889	821894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218643
15546	NC_021820	CCTG	2	8	821947	821954	0 %	25 %	25 %	50 %	526218643
15547	NC_021820	CGT	2	6	821976	821981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218643
15548	NC_021820	GGAGCC	2	12	821984	821995	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526218643
15549	NC_021820	CA	3	6	822098	822103	50 %	0 %	0 %	50 %	526218643
15550	NC_021820	CGC	2	6	822105	822110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218643
15551	NC_021820	G	6	6	822120	822125	0 %	0 %	100 %	0 %	526218643
15552	NC_021820	CATGC	2	10	822178	822187	20 %	20 %	20 %	40 %	526218643
15553	NC_021820	CGG	2	6	822210	822215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218643
15554	NC_021820	ATC	2	6	822283	822288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218643
15555	NC_021820	GGC	2	6	822321	822326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218643
15556	NC_021820	GC	3	6	822352	822357	0 %	0 %	50 %	50 %	526218643
15557	NC_021820	GC	3	6	822359	822364	0 %	0 %	50 %	50 %	526218643
15558	NC_021820	GCAC	2	8	822425	822432	25 %	0 %	25 %	50 %	526218643
15559	NC_021820	TTAA	2	8	822436	822443	50 %	50 %	0 %	0 %	526218643
15560	NC_021820	GAC	2	6	822462	822467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218643
15561	NC_021820	GGA	2	6	822471	822476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218643
15562	NC_021820	CGG	2	6	822521	822526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218643
15563	NC_021820	GGC	2	6	822558	822563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218643
15564	NC_021820	CGT	2	6	822618	822623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218643
15565	NC_021820	GGAT	2	8	822688	822695	25 %	25 %	50 %	0 %	526218643
15566	NC_021820	CGG	2	6	822708	822713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218643
15567	NC_021820	AGG	2	6	822727	822732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218643
15568	NC_021820	TTTG	2	8	822760	822767	0 %	75 %	25 %	0 %	526218643
15569	NC_021820	ACAT	2	8	822770	822777	50 %	25 %	0 %	25 %	526218644
15570	NC_021820	GCT	2	6	822868	822873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218644
15571	NC_021820	GAA	2	6	823172	823177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218644
15572	NC_021820	TGC	2	6	823203	823208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218644
15573	NC_021820	CGGA	2	8	823391	823398	25 %	0 %	50 %	25 %	526218645
15574	NC_021820	CAGT	2	8	823491	823498	25 %	25 %	25 %	25 %	526218645
15575	NC_021820	GAAAA	2	10	823708	823717	80 %	0 %	20 %	0 %	526218645
15576	NC_021820	AAT	2	6	823790	823795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218646
15577	NC_021820	CGC	2	6	823816	823821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218646
15578	NC_021820	CTG	2	6	823922	823927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218646
15579	NC_021820	AAC	2	6	823935	823940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218646
15580	NC_021820	GCC	2	6	823970	823975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218646
15581	NC_021820	TGA	2	6	824002	824007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218646
15582	NC_021820	CCG	2	6	824019	824024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218646
15583	NC_021820	GTTT	2	8	824068	824075	0 %	75 %	25 %	0 %	526218646
15584	NC_021820	CGC	2	6	824094	824099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218646
15585	NC_021820	ACCA	2	8	824141	824148	50 %	0 %	0 %	50 %	526218646
15586	NC_021820	TGG	2	6	824154	824159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218646
15587	NC_021820	CCA	2	6	824196	824201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218646
15588	NC_021820	GTGC	2	8	824246	824253	0 %	25 %	50 %	25 %	526218646
15589	NC_021820	TGA	2	6	824263	824268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218646
15590	NC_021820	GGT	2	6	824275	824280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218646
15591	NC_021820	ATG	2	6	824361	824366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218647
15592	NC_021820	TCA	2	6	824420	824425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218647
15593	NC_021820	CAG	2	6	824436	824441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218647
15594	NC_021820	TAA	2	6	824483	824488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218647
15595	NC_021820	AGG	2	6	824560	824565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218647
15596	NC_021820	TTA	2	6	824679	824684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218647
15597	NC_021820	GCGG	2	8	824742	824749	0 %	0 %	75 %	25 %	526218647
15598	NC_021820	CTTT	2	8	824778	824785	0 %	75 %	0 %	25 %	526218647
15599	NC_021820	ATT	2	6	824913	824918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218647
15600	NC_021820	TC	3	6	825029	825034	0 %	50 %	0 %	50 %	526218647
15601	NC_021820	GT	3	6	825038	825043	0 %	50 %	50 %	0 %	526218647
15602	NC_021820	ACA	2	6	825044	825049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218647
15603	NC_021820	TGG	2	6	825085	825090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218647
15604	NC_021820	AGC	2	6	825154	825159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218647
15605	NC_021820	CAG	2	6	825162	825167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218647
15606	NC_021820	ATT	2	6	825170	825175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218647
15607	NC_021820	GAA	2	6	825209	825214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221846
15608	NC_021820	GCC	2	6	825224	825229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221846
15609	NC_021820	ATC	2	6	825236	825241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221846
15610	NC_021820	A	7	7	825283	825289	100 %	0 %	0 %	0 %	526221846
15611	NC_021820	TGG	2	6	825310	825315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221846
15612	NC_021820	TGGC	2	8	825332	825339	0 %	25 %	50 %	25 %	526221846
15613	NC_021820	GAA	2	6	825368	825373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221846
15614	NC_021820	CAG	2	6	825398	825403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221846
15615	NC_021820	GAT	2	6	825407	825412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221846
15616	NC_021820	GTC	2	6	825445	825450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218648
15617	NC_021820	TC	3	6	825493	825498	0 %	50 %	0 %	50 %	526218648
15618	NC_021820	TGC	2	6	825569	825574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218648
15619	NC_021820	TCT	2	6	825608	825613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218648
15620	NC_021820	GCA	2	6	825681	825686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218648
15621	NC_021820	TGGAT	2	10	825739	825748	20 %	40 %	40 %	0 %	526218648
15622	NC_021820	GAA	2	6	825768	825773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218648
15623	NC_021820	CGC	2	6	825825	825830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218648
15624	NC_021820	CAC	2	6	825835	825840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218648
15625	NC_021820	CAT	2	6	825858	825863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218648
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15630	NC_021820	A	6	6	826111	826116	100 %	0 %	0 %	0 %	526221847
15631	NC_021820	A	7	7	826126	826132	100 %	0 %	0 %	0 %	526221847
15632	NC_021820	CGG	2	6	826163	826168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221847
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15637	NC_021820	GAA	2	6	831816	831821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221848
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15639	NC_021820	T	6	6	831842	831847	0 %	100 %	0 %	0 %	526221848
15640	NC_021820	AGCGC	2	10	831883	831892	20 %	0 %	40 %	40 %	526221848
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15651	NC_021820	GAG	2	6	832611	832616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218650
15652	NC_021820	GAC	2	6	832631	832636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218650
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15664	NC_021820	CG	3	6	833380	833385	0 %	0 %	50 %	50 %	526218650
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15675	NC_021820	TTGA	2	8	834502	834509	25 %	50 %	25 %	0 %	526218651
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15721	NC_021820	CTG	2	6	836330	836335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218652
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15724	NC_021820	CAG	3	9	836402	836410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218652
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15726	NC_021820	GCAT	2	8	836491	836498	25 %	25 %	25 %	25 %	526218652
15727	NC_021820	CAA	2	6	836540	836545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218652
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15729	NC_021820	CAG	2	6	836591	836596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218652
15730	NC_021820	CAC	2	6	836626	836631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218652
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15732	NC_021820	GCG	2	6	836643	836648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218652
15733	NC_021820	GAA	2	6	836681	836686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218652
15734	NC_021820	TGAT	2	8	836696	836703	25 %	50 %	25 %	0 %	526218652
15735	NC_021820	A	7	7	836794	836800	100 %	0 %	0 %	0 %	526218653
15736	NC_021820	GC	3	6	836888	836893	0 %	0 %	50 %	50 %	526218653
15737	NC_021820	AGC	2	6	836894	836899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218653
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15859	NC_021820	CGC	2	6	842762	842767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218655
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15978	NC_021820	GTC	2	6	849220	849225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221851
15979	NC_021820	AGT	2	6	849266	849271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221851
15980	NC_021820	GT	3	6	849309	849314	0 %	50 %	50 %	0 %	526221851
15981	NC_021820	GA	4	8	849325	849332	50 %	0 %	50 %	0 %	526221851
15982	NC_021820	GCA	2	6	849333	849338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221851
15983	NC_021820	TGT	2	6	849378	849383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221851
15984	NC_021820	CTTTG	2	10	849669	849678	0 %	60 %	20 %	20 %	526221852
15985	NC_021820	T	6	6	849686	849691	0 %	100 %	0 %	0 %	526221852
15986	NC_021820	TGCT	2	8	849759	849766	0 %	50 %	25 %	25 %	526221852
15987	NC_021820	TAA	2	6	849855	849860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221852
15988	NC_021820	TTC	2	6	849861	849866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221852
15989	NC_021820	CA	3	6	849992	849997	50 %	0 %	0 %	50 %	526221852
15990	NC_021820	T	9	9	849998	850006	0 %	100 %	0 %	0 %	526221852
15991	NC_021820	ATA	2	6	850025	850030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221852
15992	NC_021820	T	7	7	850086	850092	0 %	100 %	0 %	0 %	526221852
15993	NC_021820	CTAT	2	8	850130	850137	25 %	50 %	0 %	25 %	526221852
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15995	NC_021820	AAAC	2	8	850271	850278	75 %	0 %	0 %	25 %	526221852
15996	NC_021820	GCT	2	6	850296	850301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221852
15997	NC_021820	CTTTG	2	10	850335	850344	0 %	60 %	20 %	20 %	526221852
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15999	NC_021820	CAA	2	6	851105	851110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221853
16000	NC_021820	GC	3	6	851250	851255	0 %	0 %	50 %	50 %	526221853

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