MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021820	CTT	2	6	744154	744159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218566
14002	NC_021820	CTT	2	6	744178	744183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218566
14003	NC_021820	GC	3	6	744202	744207	0 %	0 %	50 %	50 %	526218566
14004	NC_021820	CTT	3	9	744271	744279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218566
14005	NC_021820	CAG	2	6	744320	744325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218566
14006	NC_021820	TCC	2	6	744372	744377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218566
14007	NC_021820	GCC	2	6	744423	744428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218566
14008	NC_021820	CGC	2	6	744509	744514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218566
14009	NC_021820	CAC	2	6	744536	744541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218566
14010	NC_021820	CGC	2	6	744652	744657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218566
14011	NC_021820	CTG	3	9	744662	744670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218566
14012	NC_021820	ATT	2	6	744671	744676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218566
14013	NC_021820	CAG	2	6	744776	744781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218566
14014	NC_021820	CGC	2	6	744865	744870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218566
14015	NC_021820	ATC	2	6	744924	744929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218566
14016	NC_021820	TC	3	6	744928	744933	0 %	50 %	0 %	50 %	526218566
14017	NC_021820	TCTT	2	8	744990	744997	0 %	75 %	0 %	25 %	526218567
14018	NC_021820	GC	3	6	745043	745048	0 %	0 %	50 %	50 %	526218567
14019	NC_021820	T	6	6	745057	745062	0 %	100 %	0 %	0 %	526218567
14020	NC_021820	CCG	2	6	745081	745086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218567
14021	NC_021820	CCGT	2	8	745153	745160	0 %	25 %	25 %	50 %	526218567
14022	NC_021820	CGA	2	6	745201	745206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218567
14023	NC_021820	ATC	2	6	745257	745262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218567
14024	NC_021820	CG	3	6	745274	745279	0 %	0 %	50 %	50 %	526218567
14025	NC_021820	CG	3	6	745293	745298	0 %	0 %	50 %	50 %	526218567
14026	NC_021820	GGA	2	6	745331	745336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218567
14027	NC_021820	TTTC	2	8	745339	745346	0 %	75 %	0 %	25 %	526218567
14028	NC_021820	CGG	2	6	745381	745386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218568
14029	NC_021820	GCG	3	9	745480	745488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218568
14030	NC_021820	GC	3	6	745558	745563	0 %	0 %	50 %	50 %	526218568
14031	NC_021820	TG	3	6	745596	745601	0 %	50 %	50 %	0 %	526218568
14032	NC_021820	TAA	2	6	745611	745616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218568
14033	NC_021820	ACGGT	2	10	745727	745736	20 %	20 %	40 %	20 %	526218568
14034	NC_021820	TCG	2	6	745738	745743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218568
14035	NC_021820	GC	3	6	745753	745758	0 %	0 %	50 %	50 %	526218568
14036	NC_021820	CGT	2	6	745770	745775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218568
14037	NC_021820	CCAGAC	2	12	745790	745801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526218568
14038	NC_021820	GCTC	2	8	745802	745809	0 %	25 %	25 %	50 %	526218568
14039	NC_021820	CTG	2	6	745857	745862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218568
14040	NC_021820	AT	3	6	745867	745872	50 %	50 %	0 %	0 %	526218568
14041	NC_021820	GCG	2	6	745886	745891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218568
14042	NC_021820	CTG	2	6	745899	745904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218568
14043	NC_021820	AGC	2	6	745963	745968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218568
14044	NC_021820	TCAATA	2	12	746011	746022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	526218568
14045	NC_021820	GA	3	6	746109	746114	50 %	0 %	50 %	0 %	526218569
14046	NC_021820	CAG	2	6	746242	746247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14047	NC_021820	GTG	2	6	746249	746254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218569
14048	NC_021820	CCA	2	6	746266	746271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218569
14049	NC_021820	TGC	2	6	746306	746311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14050	NC_021820	GCG	2	6	746433	746438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
14051	NC_021820	CCG	2	6	746495	746500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218569
14052	NC_021820	CG	3	6	746531	746536	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
14053	NC_021820	AGC	2	6	746609	746614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14054	NC_021820	CG	3	6	746644	746649	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
14055	NC_021820	ACGC	2	8	746707	746714	25 %	0 %	25 %	50 %	526218569
14056	NC_021820	CCG	2	6	746724	746729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218569
14057	NC_021820	TAA	2	6	746773	746778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218569
14058	NC_021820	CG	3	6	746823	746828	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
14059	NC_021820	GTC	2	6	746830	746835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14060	NC_021820	TGGA	2	8	746845	746852	25 %	25 %	50 %	0 %	526218569
14061	NC_021820	GAT	2	6	746938	746943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218569
14062	NC_021820	GAAT	2	8	747002	747009	50 %	25 %	25 %	0 %	526218569
14063	NC_021820	GC	3	6	747102	747107	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
14064	NC_021820	CAG	2	6	747160	747165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14065	NC_021820	ACA	2	6	747171	747176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218569
14066	NC_021820	CAG	2	6	747178	747183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14067	NC_021820	TGC	2	6	747204	747209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14068	NC_021820	TGC	2	6	747218	747223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14069	NC_021820	TCA	2	6	747242	747247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218569
14070	NC_021820	GC	3	6	747271	747276	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
14071	NC_021820	AATATC	2	12	747295	747306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	526218569
14072	NC_021820	TTG	2	6	747310	747315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218569
14073	NC_021820	GAT	2	6	747367	747372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218569
14074	NC_021820	ATT	2	6	747403	747408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218569
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14076	NC_021820	GC	3	6	747465	747470	0 %	0 %	50 %	50 %	526218569
14077	NC_021820	CGG	2	6	747478	747483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
14078	NC_021820	CAG	3	9	747511	747519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14079	NC_021820	CGC	2	6	747525	747530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218569
14080	NC_021820	ATC	2	6	747533	747538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218569
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14082	NC_021820	CGA	2	6	747594	747599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14083	NC_021820	AAC	2	6	747602	747607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218569
14084	NC_021820	AGCC	2	8	747618	747625	25 %	0 %	25 %	50 %	526218569
14085	NC_021820	GGC	2	6	747627	747632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
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14087	NC_021820	GCTC	2	8	747684	747691	0 %	25 %	25 %	50 %	526218569
14088	NC_021820	CGC	2	6	747696	747701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218569
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14090	NC_021820	GTT	2	6	747829	747834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218569
14091	NC_021820	TCA	2	6	747836	747841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218569
14092	NC_021820	GGC	2	6	747863	747868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218569
14093	NC_021820	GTA	2	6	747892	747897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218569
14094	NC_021820	TTA	2	6	747905	747910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218569
14095	NC_021820	TCAGCG	2	12	747981	747992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526218569
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14097	NC_021820	AG	3	6	748178	748183	50 %	0 %	50 %	0 %	526218569
14098	NC_021820	AGC	2	6	748195	748200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218569
14099	NC_021820	CCA	2	6	748569	748574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218570
14100	NC_021820	GCGT	2	8	748647	748654	0 %	25 %	50 %	25 %	526218570
14101	NC_021820	TGA	2	6	748714	748719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218570
14102	NC_021820	GCG	2	6	748817	748822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218570
14103	NC_021820	AGA	2	6	748837	748842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218570
14104	NC_021820	GC	3	6	748854	748859	0 %	0 %	50 %	50 %	526218570
14105	NC_021820	CTT	2	6	748870	748875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218570
14106	NC_021820	A	7	7	748876	748882	100 %	0 %	0 %	0 %	526218570
14107	NC_021820	GTG	2	6	748925	748930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218570
14108	NC_021820	CGA	2	6	748963	748968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218570
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14110	NC_021820	GC	3	6	749058	749063	0 %	0 %	50 %	50 %	526218570
14111	NC_021820	GT	3	6	749218	749223	0 %	50 %	50 %	0 %	526218571
14112	NC_021820	AAT	2	6	749236	749241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218571
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14118	NC_021820	CGC	2	6	749451	749456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
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14120	NC_021820	CGG	2	6	749516	749521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
14121	NC_021820	GAC	2	6	749551	749556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218571
14122	NC_021820	GCC	2	6	749614	749619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
14123	NC_021820	CG	3	6	749640	749645	0 %	0 %	50 %	50 %	526218571
14124	NC_021820	GC	3	6	749700	749705	0 %	0 %	50 %	50 %	526218571
14125	NC_021820	GCG	2	6	749724	749729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
14126	NC_021820	GCG	2	6	749742	749747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
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14152	NC_021820	GCC	2	6	751220	751225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218571
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14156	NC_021820	CGG	2	6	751531	751536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218571
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14217	NC_021820	GCA	2	6	754318	754323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218575
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14221	NC_021820	GGC	2	6	754508	754513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218575
14222	NC_021820	GCTG	2	8	754568	754575	0 %	25 %	50 %	25 %	526218575
14223	NC_021820	GGTG	2	8	754595	754602	0 %	25 %	75 %	0 %	526218575
14224	NC_021820	GAC	2	6	754607	754612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218575
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14227	NC_021820	GCT	2	6	754751	754756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218575
14228	NC_021820	CAGC	2	8	754770	754777	25 %	0 %	25 %	50 %	526218575
14229	NC_021820	CAAG	2	8	754784	754791	50 %	0 %	25 %	25 %	526218575
14230	NC_021820	GCG	2	6	754819	754824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218575
14231	NC_021820	GCG	2	6	754828	754833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218575
14232	NC_021820	AAG	2	6	754852	754857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218575
14233	NC_021820	TAC	2	6	754948	754953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218575
14234	NC_021820	GATA	2	8	754979	754986	50 %	25 %	25 %	0 %	526218575
14235	NC_021820	GCG	2	6	755020	755025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218575
14236	NC_021820	CGCTGG	2	12	755029	755040	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218575
14237	NC_021820	T	6	6	755047	755052	0 %	100 %	0 %	0 %	526218575
14238	NC_021820	A	6	6	755057	755062	100 %	0 %	0 %	0 %	526218575
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14356	NC_021820	GGC	2	6	761555	761560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218582
14357	NC_021820	TGT	2	6	761569	761574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218582
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14361	NC_021820	GCT	2	6	761723	761728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218582
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14464	NC_021820	CAT	2	6	766419	766424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221835
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14467	NC_021820	ACT	2	6	766581	766586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221835
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14469	NC_021820	CAA	2	6	766778	766783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221835
14470	NC_021820	TCA	2	6	766789	766794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221835
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14473	NC_021820	C	7	7	766842	766848	0 %	0 %	0 %	100 %	526221835
14474	NC_021820	CGCTGA	2	12	766904	766915	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526221835
14475	NC_021820	CCG	2	6	766975	766980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
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14477	NC_021820	ATC	2	6	766998	767003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221835
14478	NC_021820	CAA	2	6	767021	767026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221835
14479	NC_021820	CCG	2	6	767041	767046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
14480	NC_021820	TCA	2	6	767065	767070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221835
14481	NC_021820	GC	3	6	767078	767083	0 %	0 %	50 %	50 %	526221835
14482	NC_021820	CCG	2	6	767110	767115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
14483	NC_021820	ATC	2	6	767154	767159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221835
14484	NC_021820	CGC	2	6	767216	767221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
14485	NC_021820	CGC	2	6	767315	767320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221835
14486	NC_021820	GC	3	6	767327	767332	0 %	0 %	50 %	50 %	526221835
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14488	NC_021820	T	6	6	767443	767448	0 %	100 %	0 %	0 %	526221835
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