MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021820	CG	3	6	717600	717605	0 %	0 %	50 %	50 %	526218547
13502	NC_021820	CAC	2	6	717619	717624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218547
13503	NC_021820	GGC	2	6	717640	717645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13504	NC_021820	CGT	2	6	717715	717720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218547
13505	NC_021820	GGC	2	6	717731	717736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13506	NC_021820	CGGGC	2	10	717739	717748	0 %	0 %	60 %	40 %	526218547
13507	NC_021820	TGA	2	6	717762	717767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218547
13508	NC_021820	AAC	2	6	717777	717782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218547
13509	NC_021820	CGC	2	6	717796	717801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218547
13510	NC_021820	GCG	2	6	717859	717864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13511	NC_021820	CGG	3	9	717879	717887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13512	NC_021820	CGCTGG	2	12	717921	717932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218547
13513	NC_021820	GGT	2	6	717991	717996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218547
13514	NC_021820	CGA	2	6	718210	718215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218548
13515	NC_021820	GGC	2	6	718231	718236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218548
13516	NC_021820	TGA	2	6	718408	718413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218548
13517	NC_021820	TTTG	2	8	718414	718421	0 %	75 %	25 %	0 %	526218548
13518	NC_021820	GAAC	2	8	718684	718691	50 %	0 %	25 %	25 %	526221831
13519	NC_021820	ATTT	2	8	718706	718713	25 %	75 %	0 %	0 %	526221831
13520	NC_021820	CAT	2	6	718818	718823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218549
13521	NC_021820	CTG	2	6	718833	718838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13522	NC_021820	TGG	2	6	718910	718915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218549
13523	NC_021820	CGA	2	6	719054	719059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13524	NC_021820	TC	3	6	719105	719110	0 %	50 %	0 %	50 %	526218549
13525	NC_021820	TGCGC	2	10	719117	719126	0 %	20 %	40 %	40 %	526218549
13526	NC_021820	TGC	2	6	719131	719136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13527	NC_021820	TTG	2	6	719178	719183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218549
13528	NC_021820	CGT	2	6	719270	719275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13529	NC_021820	CAG	2	6	719313	719318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13530	NC_021820	CAG	2	6	719406	719411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13531	NC_021820	GC	3	6	719417	719422	0 %	0 %	50 %	50 %	526218549
13532	NC_021820	GGC	2	6	719499	719504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218549
13533	NC_021820	T	6	6	719508	719513	0 %	100 %	0 %	0 %	526218549
13534	NC_021820	TAA	2	6	719592	719597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218549
13535	NC_021820	CGC	2	6	719639	719644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218549
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13537	NC_021820	TGT	2	6	719686	719691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218549
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13539	NC_021820	GC	3	6	719727	719732	0 %	0 %	50 %	50 %	526218549
13540	NC_021820	GC	3	6	719754	719759	0 %	0 %	50 %	50 %	526218549
13541	NC_021820	GC	3	6	719777	719782	0 %	0 %	50 %	50 %	526218549
13542	NC_021820	GTT	2	6	719813	719818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218549
13543	NC_021820	CT	3	6	719849	719854	0 %	50 %	0 %	50 %	526218549
13544	NC_021820	TTG	2	6	719907	719912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218549
13545	NC_021820	ATG	2	6	719946	719951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218549
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13547	NC_021820	GCA	2	6	720014	720019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13548	NC_021820	CGT	2	6	720122	720127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13549	NC_021820	GC	3	6	720142	720147	0 %	0 %	50 %	50 %	526218549
13550	NC_021820	GC	4	8	720205	720212	0 %	0 %	50 %	50 %	526218549
13551	NC_021820	CAG	2	6	720213	720218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
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13553	NC_021820	CAG	2	6	720291	720296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13554	NC_021820	CAG	2	6	720330	720335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13555	NC_021820	GCA	2	6	720389	720394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13556	NC_021820	CGC	2	6	720408	720413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218549
13557	NC_021820	ATG	2	6	720420	720425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218549
13558	NC_021820	TCCA	2	8	720451	720458	25 %	25 %	0 %	50 %	526218549
13559	NC_021820	CCG	2	6	720494	720499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218549
13560	NC_021820	AAC	2	6	720538	720543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218549
13561	NC_021820	GTC	2	6	720570	720575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13562	NC_021820	TCC	2	6	720610	720615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218549
13563	NC_021820	TTC	2	6	720633	720638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218549
13564	NC_021820	TCAT	2	8	720664	720671	25 %	50 %	0 %	25 %	526218549
13565	NC_021820	A	6	6	720697	720702	100 %	0 %	0 %	0 %	526218549
13566	NC_021820	CCA	2	6	720740	720745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218549
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13568	NC_021820	CGG	2	6	720784	720789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218549
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13570	NC_021820	TCG	2	6	720868	720873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13571	NC_021820	GCT	2	6	720882	720887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13572	NC_021820	CGA	2	6	720906	720911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
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13575	NC_021820	TTGCT	2	10	720930	720939	0 %	60 %	20 %	20 %	526218549
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13580	NC_021820	CGT	2	6	721088	721093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13581	NC_021820	GTC	2	6	721122	721127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
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13583	NC_021820	TCGCT	2	10	721223	721232	0 %	40 %	20 %	40 %	526218549
13584	NC_021820	TCG	2	6	721312	721317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13585	NC_021820	AG	3	6	721318	721323	50 %	0 %	50 %	0 %	526218549
13586	NC_021820	CGC	2	6	721347	721352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218549
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13588	NC_021820	GAC	2	6	721481	721486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218549
13589	NC_021820	GCC	2	6	722138	722143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218550
13590	NC_021820	GTG	2	6	722203	722208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218550
13591	NC_021820	GCG	2	6	722220	722225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
13592	NC_021820	GC	3	6	722244	722249	0 %	0 %	50 %	50 %	526218550
13593	NC_021820	CGA	2	6	722265	722270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
13594	NC_021820	GCC	2	6	722316	722321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218550
13595	NC_021820	CTG	2	6	722405	722410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218550
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13598	NC_021820	TCGAT	2	10	722472	722481	20 %	40 %	20 %	20 %	526218550
13599	NC_021820	GTCA	2	8	722541	722548	25 %	25 %	25 %	25 %	526218550
13600	NC_021820	TTG	2	6	722550	722555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218550
13601	NC_021820	CGG	2	6	722647	722652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
13602	NC_021820	AAG	2	6	722664	722669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218550
13603	NC_021820	CAGGC	2	10	722697	722706	20 %	0 %	40 %	40 %	526218550
13604	NC_021820	ACG	2	6	722805	722810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
13605	NC_021820	GCGG	2	8	722821	722828	0 %	0 %	75 %	25 %	526218550
13606	NC_021820	CAG	2	6	722831	722836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
13607	NC_021820	CGG	2	6	722889	722894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
13608	NC_021820	A	6	6	722897	722902	100 %	0 %	0 %	0 %	526218550
13609	NC_021820	GCA	2	6	722914	722919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
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13612	NC_021820	ACCA	2	8	723131	723138	50 %	0 %	0 %	50 %	526218550
13613	NC_021820	CCTGG	2	10	723258	723267	0 %	20 %	40 %	40 %	526218550
13614	NC_021820	GGC	2	6	723364	723369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
13615	NC_021820	TGG	2	6	723384	723389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218550
13616	NC_021820	GCG	2	6	723497	723502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218550
13617	NC_021820	A	6	6	723521	723526	100 %	0 %	0 %	0 %	526218550
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13619	NC_021820	CAG	2	6	723593	723598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218550
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13860	NC_021820	ACG	2	6	736702	736707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218560
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13873	NC_021820	TCA	2	6	737568	737573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218561
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13975	NC_021820	GGC	2	6	742845	742850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218565
13976	NC_021820	GCT	2	6	742860	742865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218565
13977	NC_021820	GTG	2	6	742894	742899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218565
13978	NC_021820	GCT	2	6	742902	742907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218565
13979	NC_021820	GCT	2	6	742980	742985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218565
13980	NC_021820	ACGCTG	2	12	742990	743001	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526218565
13981	NC_021820	TGC	3	9	743003	743011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218565
13982	NC_021820	CG	3	6	743060	743065	0 %	0 %	50 %	50 %	526218565
13983	NC_021820	TAC	2	6	743066	743071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218565
13984	NC_021820	AT	4	8	743107	743114	50 %	50 %	0 %	0 %	526218565
13985	NC_021820	GCT	2	6	743115	743120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218565
13986	NC_021820	GTCT	2	8	743196	743203	0 %	50 %	25 %	25 %	526218565
13987	NC_021820	CGC	2	6	743242	743247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218565
13988	NC_021820	GGCAA	2	10	743267	743276	40 %	0 %	40 %	20 %	526218565
13989	NC_021820	TTG	2	6	743296	743301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218565
13990	NC_021820	TTGCTG	2	12	743314	743325	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526218565
13991	NC_021820	GATCA	2	10	743404	743413	40 %	20 %	20 %	20 %	526218565
13992	NC_021820	CAGAA	2	10	743491	743500	60 %	0 %	20 %	20 %	526218565
13993	NC_021820	TGA	2	6	743516	743521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218565
13994	NC_021820	TC	3	6	743543	743548	0 %	50 %	0 %	50 %	526218565
13995	NC_021820	CGG	2	6	743552	743557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218565
13996	NC_021820	GTG	2	6	743572	743577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218565
13997	NC_021820	TTG	2	6	743738	743743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218565
13998	NC_021820	TTG	2	6	743891	743896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218565
13999	NC_021820	TAC	2	6	743920	743925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218565
14000	NC_021820	GTT	2	6	744074	744079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218566

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