MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021820	TGC	2	6	694041	694046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218533
13002	NC_021820	CAA	2	6	694081	694086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218533
13003	NC_021820	CTGG	2	8	694117	694124	0 %	25 %	50 %	25 %	526218533
13004	NC_021820	GCA	2	6	694129	694134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218533
13005	NC_021820	CCG	2	6	694161	694166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218533
13006	NC_021820	CAG	2	6	694184	694189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218533
13007	NC_021820	TGG	2	6	694214	694219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218533
13008	NC_021820	GAA	2	6	694220	694225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218533
13009	NC_021820	TGT	2	6	694314	694319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218533
13010	NC_021820	GC	3	6	694390	694395	0 %	0 %	50 %	50 %	526218533
13011	NC_021820	CGG	2	6	694434	694439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218533
13012	NC_021820	TG	4	8	694464	694471	0 %	50 %	50 %	0 %	526218533
13013	NC_021820	AG	3	6	694476	694481	50 %	0 %	50 %	0 %	526218533
13014	NC_021820	A	6	6	694485	694490	100 %	0 %	0 %	0 %	526218533
13015	NC_021820	AGA	2	6	694514	694519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218534
13016	NC_021820	GC	3	6	694537	694542	0 %	0 %	50 %	50 %	526218534
13017	NC_021820	CGG	2	6	694578	694583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218534
13018	NC_021820	TGG	2	6	694641	694646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218534
13019	NC_021820	CAT	2	6	694656	694661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218534
13020	NC_021820	GCA	2	6	694743	694748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218534
13021	NC_021820	CTG	2	6	694801	694806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218534
13022	NC_021820	CGGCA	2	10	694845	694854	20 %	0 %	40 %	40 %	526218534
13023	NC_021820	ATT	2	6	694879	694884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218534
13024	NC_021820	GTC	2	6	694906	694911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218534
13025	NC_021820	ACT	2	6	694943	694948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218534
13026	NC_021820	GATC	2	8	694959	694966	25 %	25 %	25 %	25 %	526218534
13027	NC_021820	GC	3	6	694979	694984	0 %	0 %	50 %	50 %	526218534
13028	NC_021820	AAG	2	6	695018	695023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218534
13029	NC_021820	ATT	2	6	695065	695070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218534
13030	NC_021820	C	6	6	695095	695100	0 %	0 %	0 %	100 %	526218534
13031	NC_021820	GGC	2	6	695181	695186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218534
13032	NC_021820	CGG	2	6	695505	695510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218534
13033	NC_021820	GGT	3	9	695529	695537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218534
13034	NC_021820	GTT	2	6	695598	695603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218534
13035	NC_021820	TAT	2	6	695664	695669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218534
13036	NC_021820	TCG	2	6	695712	695717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218534
13037	NC_021820	AGA	2	6	695730	695735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218534
13038	NC_021820	TGC	2	6	695762	695767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218534
13039	NC_021820	ATGT	2	8	695809	695816	25 %	50 %	25 %	0 %	526218535
13040	NC_021820	CTG	2	6	695832	695837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218535
13041	NC_021820	G	6	6	695844	695849	0 %	0 %	100 %	0 %	526218535
13042	NC_021820	GCC	2	6	695968	695973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218535
13043	NC_021820	GCT	2	6	695999	696004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218535
13044	NC_021820	CGC	2	6	696046	696051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218535
13045	NC_021820	TGC	2	6	696115	696120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218535
13046	NC_021820	GGGT	2	8	696135	696142	0 %	25 %	75 %	0 %	526218535
13047	NC_021820	GTG	2	6	696189	696194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218535
13048	NC_021820	GGC	2	6	696236	696241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218535
13049	NC_021820	GC	3	6	696240	696245	0 %	0 %	50 %	50 %	526218535
13050	NC_021820	CGGC	2	8	696249	696256	0 %	0 %	50 %	50 %	526218535
13051	NC_021820	CGG	2	6	696421	696426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218535
13052	NC_021820	TATGG	2	10	696471	696480	20 %	40 %	40 %	0 %	526218535
13053	NC_021820	CTG	2	6	696486	696491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218535
13054	NC_021820	CTG	3	9	696570	696578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218535
13055	NC_021820	CG	3	6	696592	696597	0 %	0 %	50 %	50 %	526218535
13056	NC_021820	AAAC	2	8	696620	696627	75 %	0 %	0 %	25 %	526218535
13057	NC_021820	ACCA	2	8	696699	696706	50 %	0 %	0 %	50 %	526218535
13058	NC_021820	GCT	2	6	696743	696748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218535
13059	NC_021820	GGGC	2	8	696755	696762	0 %	0 %	75 %	25 %	526218535
13060	NC_021820	CGG	4	12	696814	696825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218535
13061	NC_021820	TCGCA	2	10	696873	696882	20 %	20 %	20 %	40 %	526218535
13062	NC_021820	GCG	2	6	696889	696894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218535
13063	NC_021820	GCG	2	6	696980	696985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218535
13064	NC_021820	G	6	6	696990	696995	0 %	0 %	100 %	0 %	526218535
13065	NC_021820	CG	3	6	697092	697097	0 %	0 %	50 %	50 %	526218535
13066	NC_021820	TGT	2	6	697114	697119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218535
13067	NC_021820	GGCGAT	2	12	697157	697168	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	526218535
13068	NC_021820	GTT	2	6	697383	697388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218536
13069	NC_021820	TGG	2	6	697406	697411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218536
13070	NC_021820	GCTG	2	8	697415	697422	0 %	25 %	50 %	25 %	526218536
13071	NC_021820	TTA	2	6	697464	697469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218536
13072	NC_021820	CT	4	8	697499	697506	0 %	50 %	0 %	50 %	526218536
13073	NC_021820	GCT	2	6	697512	697517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218536
13074	NC_021820	GAC	2	6	697534	697539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218536
13075	NC_021820	GC	3	6	697547	697552	0 %	0 %	50 %	50 %	526218536
13076	NC_021820	CGG	2	6	697617	697622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218536
13077	NC_021820	GGC	2	6	697635	697640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218536
13078	NC_021820	GGC	2	6	697736	697741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218536
13079	NC_021820	CTGG	2	8	697761	697768	0 %	25 %	50 %	25 %	526218536
13080	NC_021820	GGCG	2	8	697825	697832	0 %	0 %	75 %	25 %	526218536
13081	NC_021820	CAG	2	6	697837	697842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218536
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13083	NC_021820	GC	3	6	697855	697860	0 %	0 %	50 %	50 %	526218536
13084	NC_021820	GATCA	2	10	697897	697906	40 %	20 %	20 %	20 %	526218536
13085	NC_021820	AC	3	6	697934	697939	50 %	0 %	0 %	50 %	526218536
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13087	NC_021820	ACT	2	6	698000	698005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218536
13088	NC_021820	GCG	2	6	698008	698013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218536
13089	NC_021820	CTG	2	6	698248	698253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218536
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13091	NC_021820	GAC	2	6	698278	698283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218536
13092	NC_021820	TCT	2	6	698306	698311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218536
13093	NC_021820	ACCA	2	8	698317	698324	50 %	0 %	0 %	50 %	526218536
13094	NC_021820	TGA	2	6	698330	698335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218536
13095	NC_021820	CG	3	6	698473	698478	0 %	0 %	50 %	50 %	526218536
13096	NC_021820	ATT	2	6	698482	698487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218536
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13098	NC_021820	GGT	3	9	698529	698537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218536
13099	NC_021820	CGC	2	6	698654	698659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218536
13100	NC_021820	GCTG	2	8	698663	698670	0 %	25 %	50 %	25 %	526218536
13101	NC_021820	CGC	2	6	698684	698689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218536
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13103	NC_021820	A	6	6	698818	698823	100 %	0 %	0 %	0 %	526218536
13104	NC_021820	CAA	2	6	698845	698850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218536
13105	NC_021820	TGG	2	6	698858	698863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218536
13106	NC_021820	TGA	2	6	698924	698929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218536
13107	NC_021820	GGC	2	6	699018	699023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218536
13108	NC_021820	ATT	2	6	699049	699054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218536
13109	NC_021820	ACG	2	6	699065	699070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218536
13110	NC_021820	AAC	2	6	699085	699090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218536
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13112	NC_021820	GC	3	6	699248	699253	0 %	0 %	50 %	50 %	526218536
13113	NC_021820	GAG	2	6	699307	699312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218536
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13115	NC_021820	TAT	2	6	699385	699390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218536
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13120	NC_021820	ATA	3	9	699866	699874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218537
13121	NC_021820	TGG	2	6	700022	700027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218537
13122	NC_021820	TTA	2	6	700036	700041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218537
13123	NC_021820	TAT	2	6	700060	700065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218537
13124	NC_021820	TAA	2	6	700092	700097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218537
13125	NC_021820	GCG	2	6	700099	700104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218537
13126	NC_021820	A	7	7	700120	700126	100 %	0 %	0 %	0 %	526218537
13127	NC_021820	GGA	2	6	700332	700337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218537
13128	NC_021820	TGC	2	6	700340	700345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218537
13129	NC_021820	CAGAT	2	10	700349	700358	40 %	20 %	20 %	20 %	526218537
13130	NC_021820	ACG	2	6	700378	700383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218537
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13133	NC_021820	GAT	2	6	700558	700563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218537
13134	NC_021820	TGA	2	6	700586	700591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218537
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13137	NC_021820	GAA	2	6	700802	700807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218538
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13151	NC_021820	GTGCTG	2	12	701319	701330	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	526218538
13152	NC_021820	CGG	2	6	701355	701360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218538
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13235	NC_021820	TTG	2	6	705268	705273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218539
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13359	NC_021820	AAAC	2	8	711406	711413	75 %	0 %	0 %	25 %	526218544
13360	NC_021820	A	7	7	711444	711450	100 %	0 %	0 %	0 %	526218544
13361	NC_021820	TGG	2	6	711476	711481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218544
13362	NC_021820	TCG	2	6	711510	711515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218544
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13385	NC_021820	CG	3	6	712693	712698	0 %	0 %	50 %	50 %	526218545
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13468	NC_021820	CCCG	2	8	716206	716213	0 %	0 %	25 %	75 %	526218546
13469	NC_021820	TCTG	2	8	716346	716353	0 %	50 %	25 %	25 %	526218546
13470	NC_021820	TGC	2	6	716379	716384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218546
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13473	NC_021820	GAAG	2	8	716501	716508	50 %	0 %	50 %	0 %	526218546
13474	NC_021820	CAA	2	6	716549	716554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218546
13475	NC_021820	GAT	2	6	716578	716583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218546
13476	NC_021820	GGC	2	6	716596	716601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218546
13477	NC_021820	CCA	2	6	716656	716661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218546
13478	NC_021820	AGC	2	6	716679	716684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218546
13479	NC_021820	CGGCG	2	10	716727	716736	0 %	0 %	60 %	40 %	526218546
13480	NC_021820	TGA	2	6	716844	716849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218546
13481	NC_021820	CGAA	2	8	716852	716859	50 %	0 %	25 %	25 %	526218546
13482	NC_021820	GAA	2	6	716863	716868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218546
13483	NC_021820	CGA	2	6	716938	716943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218546
13484	NC_021820	GGC	2	6	716980	716985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218546
13485	NC_021820	GGT	2	6	717025	717030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218546
13486	NC_021820	ATC	2	6	717059	717064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218547
13487	NC_021820	GCG	2	6	717090	717095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13488	NC_021820	GC	3	6	717172	717177	0 %	0 %	50 %	50 %	526218547
13489	NC_021820	GCT	2	6	717187	717192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218547
13490	NC_021820	CGG	2	6	717207	717212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13491	NC_021820	GCG	2	6	717234	717239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13492	NC_021820	CGA	2	6	717253	717258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218547
13493	NC_021820	CGG	2	6	717301	717306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13494	NC_021820	TGC	2	6	717351	717356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218547
13495	NC_021820	CGG	2	6	717412	717417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13496	NC_021820	CAGC	2	8	717493	717500	25 %	0 %	25 %	50 %	526218547
13497	NC_021820	CAC	2	6	717502	717507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218547
13498	NC_021820	GGC	3	9	717536	717544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13499	NC_021820	GCG	2	6	717545	717550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218547
13500	NC_021820	GTC	2	6	717557	717562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218547

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