MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021820	CGA	2	6	669002	669007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221823
12502	NC_021820	CGG	2	6	669010	669015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221823
12503	NC_021820	GTG	2	6	669147	669152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221823
12504	NC_021820	CGC	2	6	669163	669168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221823
12505	NC_021820	CAA	2	6	669197	669202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221823
12506	NC_021820	A	6	6	669245	669250	100 %	0 %	0 %	0 %	526221824
12507	NC_021820	ACG	2	6	669305	669310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221824
12508	NC_021820	ACG	2	6	669373	669378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221824
12509	NC_021820	GCG	2	6	669395	669400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221824
12510	NC_021820	CG	3	6	669404	669409	0 %	0 %	50 %	50 %	526221824
12511	NC_021820	GTG	2	6	669424	669429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221824
12512	NC_021820	GCG	2	6	669504	669509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221824
12513	NC_021820	TCT	2	6	669512	669517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221824
12514	NC_021820	AGA	2	6	669531	669536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221824
12515	NC_021820	T	7	7	669555	669561	0 %	100 %	0 %	0 %	526221824
12516	NC_021820	AGCG	2	8	669638	669645	25 %	0 %	50 %	25 %	526221824
12517	NC_021820	CGG	2	6	669657	669662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221824
12518	NC_021820	CAG	2	6	669667	669672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221824
12519	NC_021820	CG	3	6	669688	669693	0 %	0 %	50 %	50 %	526221824
12520	NC_021820	TGA	2	6	669695	669700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221824
12521	NC_021820	TGC	2	6	669716	669721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221824
12522	NC_021820	ATC	3	9	669751	669759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221824
12523	NC_021820	CAG	2	6	669760	669765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221824
12524	NC_021820	GTG	2	6	669883	669888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221824
12525	NC_021820	CTG	2	6	669910	669915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221824
12526	NC_021820	CGAA	2	8	669917	669924	50 %	0 %	25 %	25 %	526221824
12527	NC_021820	G	7	7	670151	670157	0 %	0 %	100 %	0 %	526218513
12528	NC_021820	CGT	2	6	670173	670178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218513
12529	NC_021820	ATC	2	6	670197	670202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218513
12530	NC_021820	GAG	2	6	670209	670214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218513
12531	NC_021820	GAT	2	6	670242	670247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218513
12532	NC_021820	TGC	2	6	670253	670258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218513
12533	NC_021820	CG	3	6	670400	670405	0 %	0 %	50 %	50 %	526221825
12534	NC_021820	GCT	2	6	670465	670470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221825
12535	NC_021820	GGC	2	6	670471	670476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221825
12536	NC_021820	ATG	2	6	670515	670520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221825
12537	NC_021820	TTAT	2	8	670538	670545	25 %	75 %	0 %	0 %	526221825
12538	NC_021820	GCT	2	6	670549	670554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221825
12539	NC_021820	GCG	2	6	670619	670624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221825
12540	NC_021820	GGC	2	6	670629	670634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221825
12541	NC_021820	GAT	2	6	670930	670935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218514
12542	NC_021820	CAC	2	6	671002	671007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218514
12543	NC_021820	AAG	2	6	671046	671051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218514
12544	NC_021820	ATG	2	6	671213	671218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218514
12545	NC_021820	ACCG	2	8	671293	671300	25 %	0 %	25 %	50 %	526218514
12546	NC_021820	CTA	2	6	671308	671313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218514
12547	NC_021820	GTACT	2	10	671369	671378	20 %	40 %	20 %	20 %	526218514
12548	NC_021820	ACA	2	6	671379	671384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218514
12549	NC_021820	AGC	2	6	671418	671423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218514
12550	NC_021820	GCTG	2	8	671443	671450	0 %	25 %	50 %	25 %	526218514
12551	NC_021820	GGCA	2	8	671473	671480	25 %	0 %	50 %	25 %	526218514
12552	NC_021820	TAA	2	6	671605	671610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218514
12553	NC_021820	GCT	2	6	671635	671640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218514
12554	NC_021820	TCC	2	6	671738	671743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218514
12555	NC_021820	GCTC	2	8	671745	671752	0 %	25 %	25 %	50 %	526218514
12556	NC_021820	ATG	2	6	671795	671800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218514
12557	NC_021820	ACG	2	6	671805	671810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218514
12558	NC_021820	GC	3	6	671823	671828	0 %	0 %	50 %	50 %	526218514
12559	NC_021820	CGG	2	6	671845	671850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218514
12560	NC_021820	AGCC	2	8	671851	671858	25 %	0 %	25 %	50 %	526218514
12561	NC_021820	TAAAGA	2	12	671875	671886	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	526218514
12562	NC_021820	GCT	2	6	671939	671944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218514
12563	NC_021820	A	6	6	671955	671960	100 %	0 %	0 %	0 %	526218514
12564	NC_021820	ACC	2	6	671978	671983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218514
12565	NC_021820	GCC	2	6	671984	671989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218514
12566	NC_021820	TTA	2	6	672013	672018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218514
12567	NC_021820	GCC	2	6	672067	672072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218514
12568	NC_021820	GAA	2	6	672160	672165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218514
12569	NC_021820	TGC	2	6	672213	672218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218514
12570	NC_021820	TCA	2	6	672314	672319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218515
12571	NC_021820	GCTG	2	8	672342	672349	0 %	25 %	50 %	25 %	526218515
12572	NC_021820	TCG	2	6	672486	672491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218515
12573	NC_021820	TTA	2	6	672508	672513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218515
12574	NC_021820	GAC	2	6	672529	672534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218515
12575	NC_021820	GC	3	6	672546	672551	0 %	0 %	50 %	50 %	526218515
12576	NC_021820	CTG	2	6	672569	672574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218515
12577	NC_021820	CGC	2	6	672589	672594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218515
12578	NC_021820	TGG	2	6	672597	672602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218515
12579	NC_021820	GTG	2	6	672608	672613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218515
12580	NC_021820	TGC	3	9	672642	672650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218515
12581	NC_021820	CGCC	2	8	672663	672670	0 %	0 %	25 %	75 %	526218515
12582	NC_021820	CGC	2	6	672673	672678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218515
12583	NC_021820	CGGGG	2	10	672705	672714	0 %	0 %	80 %	20 %	526218515
12584	NC_021820	TGG	2	6	672789	672794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218515
12585	NC_021820	TTC	2	6	672836	672841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218515
12586	NC_021820	CGCT	2	8	672866	672873	0 %	25 %	25 %	50 %	526218515
12587	NC_021820	GCG	2	6	672881	672886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218515
12588	NC_021820	TCG	2	6	672910	672915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218515
12589	NC_021820	TTC	2	6	672917	672922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218515
12590	NC_021820	CTTT	2	8	672926	672933	0 %	75 %	0 %	25 %	526218515
12591	NC_021820	CTG	2	6	672962	672967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218515
12592	NC_021820	CGC	2	6	673015	673020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218515
12593	NC_021820	CCG	2	6	673023	673028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218515
12594	NC_021820	ACG	2	6	673049	673054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218515
12595	NC_021820	TC	3	6	673096	673101	0 %	50 %	0 %	50 %	526218515
12596	NC_021820	CCG	2	6	673107	673112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218515
12597	NC_021820	TCA	2	6	673140	673145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218515
12598	NC_021820	GGT	2	6	673153	673158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218515
12599	NC_021820	TCG	2	6	673206	673211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218516
12600	NC_021820	GAC	2	6	673303	673308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218516
12601	NC_021820	GCT	2	6	673335	673340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218516
12602	NC_021820	GC	3	6	673403	673408	0 %	0 %	50 %	50 %	526218516
12603	NC_021820	TGA	2	6	673418	673423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218516
12604	NC_021820	TTC	2	6	673531	673536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218516
12605	NC_021820	GAT	2	6	673539	673544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218516
12606	NC_021820	TGC	2	6	673559	673564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218516
12607	NC_021820	TTC	2	6	673687	673692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218516
12608	NC_021820	TGG	2	6	673712	673717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218516
12609	NC_021820	GGC	2	6	673719	673724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218516
12610	NC_021820	GGC	2	6	673794	673799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218516
12611	NC_021820	TCA	2	6	673808	673813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218516
12612	NC_021820	GAT	2	6	673902	673907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218516
12613	NC_021820	GGC	2	6	673947	673952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218516
12614	NC_021820	TGC	2	6	673955	673960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218516
12615	NC_021820	GC	3	6	674001	674006	0 %	0 %	50 %	50 %	526218516
12616	NC_021820	GTT	2	6	674176	674181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218517
12617	NC_021820	TGG	2	6	674187	674192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218517
12618	NC_021820	GCG	2	6	674214	674219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218517
12619	NC_021820	CT	3	6	674298	674303	0 %	50 %	0 %	50 %	526218517
12620	NC_021820	GAA	2	6	674375	674380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218517
12621	NC_021820	GGC	2	6	674392	674397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218517
12622	NC_021820	GC	3	6	674396	674401	0 %	0 %	50 %	50 %	526218517
12623	NC_021820	CGG	2	6	674449	674454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218517
12624	NC_021820	GC	3	6	674479	674484	0 %	0 %	50 %	50 %	526218517
12625	NC_021820	CGA	2	6	674515	674520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218517
12626	NC_021820	CT	3	6	674525	674530	0 %	50 %	0 %	50 %	526218517
12627	NC_021820	ACA	2	6	674572	674577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218517
12628	NC_021820	TCG	2	6	674584	674589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218517
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12630	NC_021820	GTGATG	2	12	674654	674665	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	526218517
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12638	NC_021820	CTG	2	6	675262	675267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218518
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12640	NC_021820	GGTT	2	8	675355	675362	0 %	50 %	50 %	0 %	526218518
12641	NC_021820	GCG	2	6	675365	675370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218518
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12651	NC_021820	CTG	2	6	675610	675615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218518
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12654	NC_021820	GCT	2	6	675777	675782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218518
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12724	NC_021820	TTC	2	6	678575	678580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218521
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12726	NC_021820	TGAG	2	8	678790	678797	25 %	25 %	50 %	0 %	526218521
12727	NC_021820	CGTCC	2	10	678913	678922	0 %	20 %	20 %	60 %	526218521
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12729	NC_021820	CAT	2	6	678997	679002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218521
12730	NC_021820	GCA	2	6	679031	679036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218521
12731	NC_021820	CTTT	2	8	679078	679085	0 %	75 %	0 %	25 %	526218521
12732	NC_021820	CCA	2	6	679087	679092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218521
12733	NC_021820	TGG	2	6	679275	679280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218522
12734	NC_021820	GAT	2	6	679315	679320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218522
12735	NC_021820	TCA	2	6	679361	679366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218522
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12858	NC_021820	CGA	2	6	686015	686020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218528
12859	NC_021820	ATC	2	6	686028	686033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218528
12860	NC_021820	TGA	2	6	686089	686094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218528
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12862	NC_021820	GGC	2	6	686204	686209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218528
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12870	NC_021820	CTG	2	6	686868	686873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218529
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12977	NC_021820	CGA	2	6	692482	692487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218532
12978	NC_021820	CGC	2	6	692538	692543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218533
12979	NC_021820	GCCAG	2	10	692699	692708	20 %	0 %	40 %	40 %	526218533
12980	NC_021820	CAGC	2	8	692744	692751	25 %	0 %	25 %	50 %	526218533
12981	NC_021820	GC	3	6	692798	692803	0 %	0 %	50 %	50 %	526218533
12982	NC_021820	ATC	2	6	692826	692831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218533
12983	NC_021820	CGG	2	6	692842	692847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218533
12984	NC_021820	CGG	2	6	692877	692882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218533
12985	NC_021820	CGC	2	6	692932	692937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218533
12986	NC_021820	TACC	2	8	692992	692999	25 %	25 %	0 %	50 %	526218533
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12991	NC_021820	CGTC	2	8	693522	693529	0 %	25 %	25 %	50 %	526218533
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12997	NC_021820	AAG	2	6	693945	693950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218533
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12999	NC_021820	CTG	2	6	694004	694009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218533
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