MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021820	ATT	2	6	646064	646069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218495
12002	NC_021820	GCG	2	6	646071	646076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218495
12003	NC_021820	GC	5	10	646094	646103	0 %	0 %	50 %	50 %	526218495
12004	NC_021820	GGC	2	6	646178	646183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218495
12005	NC_021820	CAA	2	6	646198	646203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218495
12006	NC_021820	CGAG	2	8	646249	646256	25 %	0 %	50 %	25 %	526218495
12007	NC_021820	ATG	2	6	646310	646315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218495
12008	NC_021820	TGG	2	6	646347	646352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218495
12009	NC_021820	GATC	2	8	646410	646417	25 %	25 %	25 %	25 %	526218495
12010	NC_021820	CCA	2	6	646455	646460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218495
12011	NC_021820	TTA	2	6	646514	646519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218495
12012	NC_021820	CGG	2	6	646555	646560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218495
12013	NC_021820	CGC	2	6	646566	646571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218495
12014	NC_021820	CGA	2	6	646617	646622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218495
12015	NC_021820	CTG	2	6	646700	646705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218495
12016	NC_021820	GGC	2	6	646712	646717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218495
12017	NC_021820	TTC	2	6	646721	646726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218495
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12019	NC_021820	CGC	2	6	646905	646910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218496
12020	NC_021820	CAT	2	6	646923	646928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218496
12021	NC_021820	ATG	4	12	647029	647040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218496
12022	NC_021820	GGCT	2	8	647058	647065	0 %	25 %	50 %	25 %	526218496
12023	NC_021820	TG	3	6	647114	647119	0 %	50 %	50 %	0 %	526218496
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12029	NC_021820	CTT	2	6	647524	647529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218497
12030	NC_021820	GCC	2	6	647553	647558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218497
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12033	NC_021820	TCG	2	6	647682	647687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218497
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12036	NC_021820	CGG	2	6	647746	647751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218497
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12041	NC_021820	TCGG	2	8	648007	648014	0 %	25 %	50 %	25 %	526218498
12042	NC_021820	TGC	2	6	648040	648045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218498
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12044	NC_021820	GAAA	2	8	648144	648151	75 %	0 %	25 %	0 %	526218498
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12047	NC_021820	ACC	2	6	648225	648230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218498
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12050	NC_021820	CGG	2	6	648301	648306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218498
12051	NC_021820	CCAG	2	8	648397	648404	25 %	0 %	25 %	50 %	526218498
12052	NC_021820	AGC	2	6	648429	648434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218498
12053	NC_021820	TCA	2	6	648568	648573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218498
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12055	NC_021820	TGT	2	6	648620	648625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218498
12056	NC_021820	ATCC	2	8	648650	648657	25 %	25 %	0 %	50 %	526218498
12057	NC_021820	GCA	2	6	648754	648759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218498
12058	NC_021820	CACC	2	8	648793	648800	25 %	0 %	0 %	75 %	526218498
12059	NC_021820	GAC	2	6	648824	648829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218498
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12064	NC_021820	AAT	2	6	648968	648973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218498
12065	NC_021820	CAG	2	6	648992	648997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218498
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12070	NC_021820	CTG	2	6	649468	649473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218499
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12119	NC_021820	TTG	2	6	651697	651702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218501
12120	NC_021820	CCG	2	6	651730	651735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218501
12121	NC_021820	ATA	2	6	651737	651742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218501
12122	NC_021820	CCTG	2	8	651790	651797	0 %	25 %	25 %	50 %	526221818
12123	NC_021820	TCC	2	6	651869	651874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221818
12124	NC_021820	ATG	2	6	651923	651928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221818
12125	NC_021820	CGA	2	6	651982	651987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221818
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12127	NC_021820	TTAT	2	8	652075	652082	25 %	75 %	0 %	0 %	526221818
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12130	NC_021820	CGA	2	6	652202	652207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218502
12131	NC_021820	GCC	3	9	652271	652279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218502
12132	NC_021820	GCT	2	6	652280	652285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218502
12133	NC_021820	TTC	2	6	652291	652296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218502
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12135	NC_021820	CTTTG	2	10	652365	652374	0 %	60 %	20 %	20 %	526218502
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12139	NC_021820	GCGG	2	8	652606	652613	0 %	0 %	75 %	25 %	526218502
12140	NC_021820	T	6	6	652689	652694	0 %	100 %	0 %	0 %	526218502
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12144	NC_021820	GGC	2	6	652849	652854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218502
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12148	NC_021820	GCT	2	6	652903	652908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218502
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12151	NC_021820	CTG	2	6	652987	652992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218502
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12154	NC_021820	CCAG	2	8	653133	653140	25 %	0 %	25 %	50 %	526218502
12155	NC_021820	GCT	2	6	653206	653211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218502
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12158	NC_021820	GGC	2	6	653320	653325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218502
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12208	NC_021820	TCA	2	6	655639	655644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218503
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12217	NC_021820	GTCGGC	2	12	655880	655891	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218503
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12220	NC_021820	TGCC	2	8	656023	656030	0 %	25 %	25 %	50 %	526218503
12221	NC_021820	GC	3	6	656047	656052	0 %	0 %	50 %	50 %	526218503
12222	NC_021820	TTC	2	6	656066	656071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218503
12223	NC_021820	GCA	3	9	656072	656080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218503
12224	NC_021820	AGG	2	6	656116	656121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218503
12225	NC_021820	T	6	6	656135	656140	0 %	100 %	0 %	0 %	526218503
12226	NC_021820	AGCG	2	8	656255	656262	25 %	0 %	50 %	25 %	526218504
12227	NC_021820	GGC	3	9	656293	656301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218504
12228	NC_021820	CGG	3	9	656324	656332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218504
12229	NC_021820	CCAG	2	8	656343	656350	25 %	0 %	25 %	50 %	526218504
12230	NC_021820	CAG	2	6	656368	656373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218504
12231	NC_021820	GAA	2	6	656416	656421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218504
12232	NC_021820	CGCC	2	8	656430	656437	0 %	0 %	25 %	75 %	526218504
12233	NC_021820	CTC	2	6	656491	656496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218504
12234	NC_021820	CAGCGG	2	12	656548	656559	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526218504
12235	NC_021820	AGA	2	6	656562	656567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218504
12236	NC_021820	TGGC	2	8	656582	656589	0 %	25 %	50 %	25 %	526218504
12237	NC_021820	CAG	2	6	656641	656646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218504
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12239	NC_021820	TAA	2	6	656764	656769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218504
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12355	NC_021820	TTTC	2	8	662131	662138	0 %	75 %	0 %	25 %	526218508
12356	NC_021820	TGC	2	6	662176	662181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218508
12357	NC_021820	AGC	2	6	662254	662259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218508
12358	NC_021820	TGG	2	6	662293	662298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218508
12359	NC_021820	CG	3	6	662299	662304	0 %	0 %	50 %	50 %	526218508
12360	NC_021820	CGTG	2	8	662327	662334	0 %	25 %	50 %	25 %	526218508
12361	NC_021820	GGC	2	6	662351	662356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218508
12362	NC_021820	CAGC	2	8	662399	662406	25 %	0 %	25 %	50 %	526218508
12363	NC_021820	GCC	2	6	662487	662492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218508
12364	NC_021820	CGA	2	6	662522	662527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218508
12365	NC_021820	CGCT	2	8	662549	662556	0 %	25 %	25 %	50 %	526218508
12366	NC_021820	CGA	2	6	663071	663076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218509
12367	NC_021820	GTCCG	2	10	663104	663113	0 %	20 %	40 %	40 %	526218509
12368	NC_021820	TCG	2	6	663202	663207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218509
12369	NC_021820	GAC	2	6	663219	663224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218509
12370	NC_021820	GTG	2	6	663264	663269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218509
12371	NC_021820	ACG	2	6	663271	663276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218509
12372	NC_021820	CA	3	6	663314	663319	50 %	0 %	0 %	50 %	526218509
12373	NC_021820	ACGAAG	2	12	663337	663348	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	526218509
12374	NC_021820	TGA	2	6	663355	663360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218509
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12376	NC_021820	CG	4	8	663392	663399	0 %	0 %	50 %	50 %	526218509
12377	NC_021820	CAC	2	6	663419	663424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218509
12378	NC_021820	CGG	2	6	663451	663456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218509
12379	NC_021820	AGC	2	6	663511	663516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218509
12380	NC_021820	GC	4	8	663534	663541	0 %	0 %	50 %	50 %	526218509
12381	NC_021820	GAA	2	6	663557	663562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218509
12382	NC_021820	GGC	2	6	663564	663569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218509
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12384	NC_021820	GC	3	6	663630	663635	0 %	0 %	50 %	50 %	526218509
12385	NC_021820	GAA	2	6	663638	663643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218509
12386	NC_021820	CTA	2	6	663662	663667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218509
12387	NC_021820	CGG	2	6	663668	663673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218509
12388	NC_021820	CGC	2	6	663713	663718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218509
12389	NC_021820	GAA	2	6	663818	663823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218509
12390	NC_021820	GCG	2	6	663889	663894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218509
12391	NC_021820	ACC	2	6	663906	663911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218509
12392	NC_021820	CGC	2	6	663914	663919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218509
12393	NC_021820	CGA	2	6	663953	663958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218509
12394	NC_021820	CGG	2	6	663961	663966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218509
12395	NC_021820	CTTT	2	8	664294	664301	0 %	75 %	0 %	25 %	526221822
12396	NC_021820	CCA	2	6	664397	664402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221822
12397	NC_021820	CGA	2	6	664403	664408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221822
12398	NC_021820	CTT	2	6	664432	664437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221822
12399	NC_021820	CGC	2	6	664456	664461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221822
12400	NC_021820	CACG	2	8	664477	664484	25 %	0 %	25 %	50 %	526221822
12401	NC_021820	GC	3	6	664498	664503	0 %	0 %	50 %	50 %	526221822
12402	NC_021820	CAA	2	6	664538	664543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221822
12403	NC_021820	CG	3	6	664557	664562	0 %	0 %	50 %	50 %	526221822
12404	NC_021820	GAG	2	6	664596	664601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221822
12405	NC_021820	GATC	2	8	664630	664637	25 %	25 %	25 %	25 %	526221822
12406	NC_021820	GAA	2	6	664666	664671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221822
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12412	NC_021820	GGCGGT	2	12	665345	665356	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	526218510
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12414	NC_021820	ACG	2	6	665374	665379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218510
12415	NC_021820	TTC	3	9	665408	665416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218510
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12417	NC_021820	ATGAAG	2	12	665440	665451	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	526218510
12418	NC_021820	TGA	2	6	665458	665463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218510
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12420	NC_021820	CTC	2	6	665537	665542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218510
12421	NC_021820	GC	3	6	665637	665642	0 %	0 %	50 %	50 %	526218510
12422	NC_021820	T	6	6	665685	665690	0 %	100 %	0 %	0 %	526218510
12423	NC_021820	CGG	2	6	665771	665776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218510
12424	NC_021820	CTA	2	6	665777	665782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218510
12425	NC_021820	GCGG	2	8	665883	665890	0 %	0 %	75 %	25 %	526218510
12426	NC_021820	GCG	2	6	665892	665897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218510
12427	NC_021820	AAGA	2	8	665979	665986	75 %	0 %	25 %	0 %	526218510
12428	NC_021820	CGC	2	6	666017	666022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218510
12429	NC_021820	GCCA	2	8	666057	666064	25 %	0 %	25 %	50 %	526218510
12430	NC_021820	GCA	2	6	666301	666306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218511
12431	NC_021820	ATC	2	6	666443	666448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218511
12432	NC_021820	ATG	3	9	666458	666466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218511
12433	NC_021820	TGG	2	6	666489	666494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218511
12434	NC_021820	ATT	3	9	666515	666523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218511
12435	NC_021820	CGAG	2	8	666547	666554	25 %	0 %	50 %	25 %	526218511
12436	NC_021820	CG	3	6	666657	666662	0 %	0 %	50 %	50 %	526218511
12437	NC_021820	GCA	2	6	666705	666710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218511
12438	NC_021820	CAC	2	6	666733	666738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218511
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12440	NC_021820	ACCG	2	8	666875	666882	25 %	0 %	25 %	50 %	526218511
12441	NC_021820	GGC	2	6	666919	666924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218511
12442	NC_021820	GGCG	2	8	666928	666935	0 %	0 %	75 %	25 %	526218511
12443	NC_021820	TGC	2	6	666936	666941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218511
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12445	NC_021820	GCA	2	6	667029	667034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218511
12446	NC_021820	GAT	2	6	667045	667050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218511
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12448	NC_021820	CTG	2	6	667133	667138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218511
12449	NC_021820	CTG	2	6	667148	667153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218511
12450	NC_021820	GCG	2	6	667234	667239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218512
12451	NC_021820	TTC	2	6	667243	667248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218512
12452	NC_021820	CTGG	2	8	667252	667259	0 %	25 %	50 %	25 %	526218512
12453	NC_021820	TGG	3	9	667301	667309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218512
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12456	NC_021820	TGC	2	6	667376	667381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12457	NC_021820	CGAT	2	8	667439	667446	25 %	25 %	25 %	25 %	526218512
12458	NC_021820	GCT	2	6	667482	667487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12459	NC_021820	CG	3	6	667520	667525	0 %	0 %	50 %	50 %	526218512
12460	NC_021820	CCA	2	6	667541	667546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218512
12461	NC_021820	ATC	2	6	667561	667566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218512
12462	NC_021820	GTG	3	9	667585	667593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218512
12463	NC_021820	CTG	2	6	667606	667611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12464	NC_021820	CGG	2	6	667623	667628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218512
12465	NC_021820	GCT	2	6	667659	667664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12466	NC_021820	TAT	2	6	667672	667677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218512
12467	NC_021820	CCTG	2	8	667694	667701	0 %	25 %	25 %	50 %	526218512
12468	NC_021820	CCG	2	6	667721	667726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218512
12469	NC_021820	CTG	2	6	667727	667732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12470	NC_021820	GCG	2	6	667766	667771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218512
12471	NC_021820	CTG	2	6	667819	667824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12472	NC_021820	CAA	2	6	667827	667832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218512
12473	NC_021820	CGG	2	6	667845	667850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218512
12474	NC_021820	GCA	2	6	667907	667912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12475	NC_021820	GGC	2	6	667921	667926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218512
12476	NC_021820	TGG	2	6	667994	667999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218512
12477	NC_021820	TGG	2	6	668009	668014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218512
12478	NC_021820	CTG	2	6	668041	668046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12479	NC_021820	GTT	2	6	668181	668186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218512
12480	NC_021820	GCC	2	6	668188	668193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218512
12481	NC_021820	GGC	2	6	668298	668303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218512
12482	NC_021820	CTG	2	6	668308	668313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12483	NC_021820	GTG	2	6	668314	668319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218512
12484	NC_021820	CG	3	6	668321	668326	0 %	0 %	50 %	50 %	526218512
12485	NC_021820	CGG	2	6	668367	668372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218512
12486	NC_021820	TGA	3	9	668384	668392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218512
12487	NC_021820	TGC	2	6	668411	668416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218512
12488	NC_021820	ATT	2	6	668483	668488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221823
12489	NC_021820	TGA	2	6	668503	668508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221823
12490	NC_021820	CAA	2	6	668534	668539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221823
12491	NC_021820	ACG	2	6	668604	668609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221823
12492	NC_021820	CAG	2	6	668694	668699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221823
12493	NC_021820	CTG	2	6	668772	668777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221823
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12495	NC_021820	CCG	2	6	668840	668845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221823
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12497	NC_021820	AAGCG	2	10	668852	668861	40 %	0 %	40 %	20 %	526221823
12498	NC_021820	CG	3	6	668868	668873	0 %	0 %	50 %	50 %	526221823
12499	NC_021820	CTG	2	6	668898	668903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221823
12500	NC_021820	GCCAG	2	10	668917	668926	20 %	0 %	40 %	40 %	526221823

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