MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021820	CG	3	6	620934	620939	0 %	0 %	50 %	50 %	526218477
11502	NC_021820	GCGG	2	8	620985	620992	0 %	0 %	75 %	25 %	526218477
11503	NC_021820	TCC	2	6	621029	621034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218477
11504	NC_021820	TGC	2	6	621098	621103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218477
11505	NC_021820	TGT	2	6	621107	621112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218477
11506	NC_021820	GATG	2	8	621129	621136	25 %	25 %	50 %	0 %	526218477
11507	NC_021820	CGA	2	6	621151	621156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218477
11508	NC_021820	GCG	2	6	621188	621193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218477
11509	NC_021820	CGC	2	6	621194	621199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218477
11510	NC_021820	TGT	2	6	621249	621254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218477
11511	NC_021820	CAG	2	6	621262	621267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218477
11512	NC_021820	GC	3	6	621291	621296	0 %	0 %	50 %	50 %	526218477
11513	NC_021820	GGCCC	2	10	621300	621309	0 %	0 %	40 %	60 %	526218477
11514	NC_021820	A	6	6	621322	621327	100 %	0 %	0 %	0 %	526218477
11515	NC_021820	TCAG	2	8	621339	621346	25 %	25 %	25 %	25 %	526218477
11516	NC_021820	ATG	2	6	621353	621358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218477
11517	NC_021820	GGC	2	6	621408	621413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218478
11518	NC_021820	CAC	2	6	621415	621420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218478
11519	NC_021820	CGC	2	6	621465	621470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218478
11520	NC_021820	CCG	2	6	621485	621490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218478
11521	NC_021820	TCG	2	6	621584	621589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218478
11522	NC_021820	CCAT	2	8	621615	621622	25 %	25 %	0 %	50 %	526218478
11523	NC_021820	CCG	2	6	621689	621694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218478
11524	NC_021820	GGC	2	6	621781	621786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218478
11525	NC_021820	TTC	2	6	621802	621807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218478
11526	NC_021820	TCA	2	6	621842	621847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218478
11527	NC_021820	CGG	2	6	621867	621872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218478
11528	NC_021820	CGTA	2	8	622003	622010	25 %	25 %	25 %	25 %	526218478
11529	NC_021820	GAA	2	6	622046	622051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218478
11530	NC_021820	CGC	2	6	622066	622071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218478
11531	NC_021820	GC	3	6	622076	622081	0 %	0 %	50 %	50 %	526218478
11532	NC_021820	GAC	2	6	622107	622112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218478
11533	NC_021820	TCG	2	6	622151	622156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218478
11534	NC_021820	CG	3	6	622155	622160	0 %	0 %	50 %	50 %	526218478
11535	NC_021820	CAG	2	6	622189	622194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218478
11536	NC_021820	TCCA	2	8	622259	622266	25 %	25 %	0 %	50 %	526218478
11537	NC_021820	CGC	2	6	622301	622306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218478
11538	NC_021820	GC	3	6	622305	622310	0 %	0 %	50 %	50 %	526218478
11539	NC_021820	TCT	2	6	622322	622327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218478
11540	NC_021820	CGG	2	6	622357	622362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218478
11541	NC_021820	ATA	2	6	622378	622383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218478
11542	NC_021820	ATC	2	6	622421	622426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218478
11543	NC_021820	TAAG	2	8	622452	622459	50 %	25 %	25 %	0 %	526218478
11544	NC_021820	AAT	2	6	622509	622514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218478
11545	NC_021820	CAG	2	6	622564	622569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218478
11546	NC_021820	CG	3	6	622599	622604	0 %	0 %	50 %	50 %	526218478
11547	NC_021820	CGA	2	6	622704	622709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218478
11548	NC_021820	GCG	2	6	622711	622716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218478
11549	NC_021820	GC	3	6	622785	622790	0 %	0 %	50 %	50 %	526218478
11550	NC_021820	TTG	2	6	622824	622829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218478
11551	NC_021820	ATC	2	6	622901	622906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218478
11552	NC_021820	AGC	2	6	623400	623405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218479
11553	NC_021820	GCC	2	6	623411	623416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218479
11554	NC_021820	CAG	2	6	623456	623461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218479
11555	NC_021820	GCA	2	6	623604	623609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218479
11556	NC_021820	CAT	2	6	623617	623622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218479
11557	NC_021820	GTC	2	6	623747	623752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218479
11558	NC_021820	CGA	2	6	623773	623778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218479
11559	NC_021820	TAA	2	6	623845	623850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218479
11560	NC_021820	GAT	2	6	623911	623916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218479
11561	NC_021820	TGAT	2	8	624000	624007	25 %	50 %	25 %	0 %	526218479
11562	NC_021820	ATG	2	6	624073	624078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218479
11563	NC_021820	ATG	2	6	624252	624257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218480
11564	NC_021820	CCAG	2	8	624289	624296	25 %	0 %	25 %	50 %	526218480
11565	NC_021820	AGG	2	6	624305	624310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218480
11566	NC_021820	GCG	2	6	624337	624342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218480
11567	NC_021820	GCG	2	6	624351	624356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218480
11568	NC_021820	AAG	2	6	624385	624390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218480
11569	NC_021820	AAC	2	6	624435	624440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218480
11570	NC_021820	CCG	2	6	624441	624446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218480
11571	NC_021820	GC	3	6	624541	624546	0 %	0 %	50 %	50 %	526218480
11572	NC_021820	TGG	2	6	624583	624588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218480
11573	NC_021820	GA	3	6	624643	624648	50 %	0 %	50 %	0 %	526218480
11574	NC_021820	CTG	2	6	624663	624668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218480
11575	NC_021820	CAG	2	6	624687	624692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218480
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11577	NC_021820	GC	3	6	624758	624763	0 %	0 %	50 %	50 %	526218480
11578	NC_021820	GCG	2	6	624841	624846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218480
11579	NC_021820	CCTA	2	8	624862	624869	25 %	25 %	0 %	50 %	526218480
11580	NC_021820	GCATCT	2	12	624874	624885	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526218480
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11582	NC_021820	CG	3	6	625020	625025	0 %	0 %	50 %	50 %	526218480
11583	NC_021820	A	6	6	625038	625043	100 %	0 %	0 %	0 %	526218480
11584	NC_021820	GCC	2	6	625048	625053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218480
11585	NC_021820	CT	4	8	625127	625134	0 %	50 %	0 %	50 %	526218480
11586	NC_021820	TAA	2	6	625136	625141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218480
11587	NC_021820	ACG	2	6	625194	625199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218480
11588	NC_021820	CGC	2	6	625200	625205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218480
11589	NC_021820	ATTA	2	8	625225	625232	50 %	50 %	0 %	0 %	526218480
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11591	NC_021820	CGG	2	6	625364	625369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221817
11592	NC_021820	GAC	2	6	625443	625448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221817
11593	NC_021820	GCA	2	6	625454	625459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221817
11594	NC_021820	TC	3	6	625495	625500	0 %	50 %	0 %	50 %	526221817
11595	NC_021820	GCC	2	6	625504	625509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221817
11596	NC_021820	TC	3	6	625544	625549	0 %	50 %	0 %	50 %	526221817
11597	NC_021820	CAA	2	6	625577	625582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221817
11598	NC_021820	GTCT	2	8	625612	625619	0 %	50 %	25 %	25 %	526221817
11599	NC_021820	GAC	2	6	625620	625625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221817
11600	NC_021820	TA	3	6	625635	625640	50 %	50 %	0 %	0 %	526221817
11601	NC_021820	ACA	2	6	625706	625711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221817
11602	NC_021820	CT	3	6	625722	625727	0 %	50 %	0 %	50 %	526221817
11603	NC_021820	GAC	2	6	625752	625757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221817
11604	NC_021820	ATT	2	6	625872	625877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221817
11605	NC_021820	TAT	2	6	625902	625907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221817
11606	NC_021820	CTT	2	6	625982	625987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221817
11607	NC_021820	T	6	6	625994	625999	0 %	100 %	0 %	0 %	526221817
11608	NC_021820	AAAG	2	8	626037	626044	75 %	0 %	25 %	0 %	526221817
11609	NC_021820	CGG	2	6	626077	626082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221817
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11611	NC_021820	TGA	2	6	626229	626234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218481
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11620	NC_021820	TTA	2	6	626459	626464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218481
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11740	NC_021820	ACG	2	6	632121	632126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218485
11741	NC_021820	ACAG	2	8	632279	632286	50 %	0 %	25 %	25 %	526218485
11742	NC_021820	CAGCG	2	10	632305	632314	20 %	0 %	40 %	40 %	526218485
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11978	NC_021820	GAT	2	6	645152	645157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218494
11979	NC_021820	CGA	2	6	645175	645180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218494
11980	NC_021820	AAC	2	6	645205	645210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218494
11981	NC_021820	CTT	2	6	645239	645244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218494
11982	NC_021820	GC	3	6	645253	645258	0 %	0 %	50 %	50 %	526218494
11983	NC_021820	GCT	2	6	645320	645325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218494
11984	NC_021820	TCA	2	6	645331	645336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218494
11985	NC_021820	GCT	2	6	645353	645358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218494
11986	NC_021820	CGC	2	6	645386	645391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218494
11987	NC_021820	ATT	2	6	645408	645413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218494
11988	NC_021820	GATC	2	8	645446	645453	25 %	25 %	25 %	25 %	526218494
11989	NC_021820	CG	4	8	645524	645531	0 %	0 %	50 %	50 %	526218494
11990	NC_021820	TTAT	2	8	645573	645580	25 %	75 %	0 %	0 %	526218494
11991	NC_021820	GGT	2	6	645602	645607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218494
11992	NC_021820	CTG	3	9	645624	645632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218494
11993	NC_021820	A	6	6	645633	645638	100 %	0 %	0 %	0 %	526218494
11994	NC_021820	AGG	2	6	645640	645645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218494
11995	NC_021820	CTG	2	6	645701	645706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218495
11996	NC_021820	CTC	2	6	645760	645765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218495
11997	NC_021820	ATCGCC	2	12	645803	645814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526218495
11998	NC_021820	GCC	2	6	645877	645882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218495
11999	NC_021820	GAT	2	6	645886	645891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218495
12000	NC_021820	CCG	2	6	645953	645958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218495

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