MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
86501	NC_021820	TGT	2	6	4709141	4709146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222501
86502	NC_021820	GAAT	2	8	4709148	4709155	50 %	25 %	25 %	0 %	526222501
86503	NC_021820	TTC	2	6	4709156	4709161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222501
86504	NC_021820	AGA	2	6	4709250	4709255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222501
86505	NC_021820	CTG	2	6	4709339	4709344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222501
86506	NC_021820	AAG	2	6	4709559	4709564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222501
86507	NC_021820	AAGC	2	8	4709644	4709651	50 %	0 %	25 %	25 %	526222501
86508	NC_021820	CAAC	2	8	4709659	4709666	50 %	0 %	0 %	50 %	526222501
86509	NC_021820	TAA	2	6	4709696	4709701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222501
86510	NC_021820	GCT	2	6	4709704	4709709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222501
86511	NC_021820	GCTG	2	8	4709745	4709752	0 %	25 %	50 %	25 %	526222501
86512	NC_021820	AGC	2	6	4709757	4709762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222501
86513	NC_021820	AGC	2	6	4709778	4709783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222501
86514	NC_021820	TCATTT	2	12	4709791	4709802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	526222501
86515	NC_021820	T	6	6	4709827	4709832	0 %	100 %	0 %	0 %	526222501
86516	NC_021820	T	7	7	4709873	4709879	0 %	100 %	0 %	0 %	526222501
86517	NC_021820	AGC	2	6	4709984	4709989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222501
86518	NC_021820	CAAT	2	8	4710052	4710059	50 %	25 %	0 %	25 %	526222501
86519	NC_021820	GCA	2	6	4710555	4710560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222502
86520	NC_021820	TTG	2	6	4710624	4710629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222502
86521	NC_021820	TGA	3	9	4710655	4710663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222502
86522	NC_021820	CCG	2	6	4710682	4710687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222502
86523	NC_021820	TAGCG	2	10	4710728	4710737	20 %	20 %	40 %	20 %	526222502
86524	NC_021820	AGG	2	6	4710754	4710759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526222502
86525	NC_021820	TGC	2	6	4710783	4710788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222502
86526	NC_021820	AAC	2	6	4710830	4710835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222502
86527	NC_021820	CCA	2	6	4711144	4711149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221630
86528	NC_021820	CCG	2	6	4711225	4711230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221630
86529	NC_021820	CGC	2	6	4711264	4711269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221630
86530	NC_021820	CGG	2	6	4711273	4711278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221630
86531	NC_021820	CGC	2	6	4711361	4711366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221630
86532	NC_021820	GCT	2	6	4711525	4711530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221630
86533	NC_021820	TCA	2	6	4711558	4711563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221630
86534	NC_021820	CGC	3	9	4711576	4711584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221630
86535	NC_021820	CG	4	8	4711609	4711616	0 %	0 %	50 %	50 %	526221630
86536	NC_021820	TGATC	2	10	4711627	4711636	20 %	40 %	20 %	20 %	526221630
86537	NC_021820	ATG	2	6	4711668	4711673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221630
86538	NC_021820	GTCGCC	2	12	4711679	4711690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526221630
86539	NC_021820	CG	3	6	4711729	4711734	0 %	0 %	50 %	50 %	526221630
86540	NC_021820	CG	3	6	4711742	4711747	0 %	0 %	50 %	50 %	526221630
86541	NC_021820	GTCG	2	8	4711751	4711758	0 %	25 %	50 %	25 %	526221630
86542	NC_021820	CTT	2	6	4711765	4711770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221630
86543	NC_021820	GCA	2	6	4711831	4711836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221630
86544	NC_021820	GGTA	2	8	4711852	4711859	25 %	25 %	50 %	0 %	526221630
86545	NC_021820	GTTC	2	8	4711906	4711913	0 %	50 %	25 %	25 %	526221630
86546	NC_021820	CGG	2	6	4711948	4711953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221630
86547	NC_021820	CGA	2	6	4711957	4711962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221630
86548	NC_021820	CTT	2	6	4712032	4712037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221630
86549	NC_021820	AGA	2	6	4712071	4712076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221630
86550	NC_021820	CG	3	6	4712135	4712140	0 %	0 %	50 %	50 %	526221630
86551	NC_021820	GTTT	2	8	4712417	4712424	0 %	75 %	25 %	0 %	526221631
86552	NC_021820	CAGA	2	8	4712432	4712439	50 %	0 %	25 %	25 %	526221631
86553	NC_021820	CCA	2	6	4712447	4712452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221631
86554	NC_021820	GC	3	6	4712501	4712506	0 %	0 %	50 %	50 %	526221631
86555	NC_021820	CGCA	2	8	4712528	4712535	25 %	0 %	25 %	50 %	526221631
86556	NC_021820	ACCA	2	8	4712580	4712587	50 %	0 %	0 %	50 %	526221631
86557	NC_021820	CAG	2	6	4712610	4712615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221631
86558	NC_021820	ATG	2	6	4712628	4712633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221631
86559	NC_021820	GA	4	8	4712669	4712676	50 %	0 %	50 %	0 %	526221631
86560	NC_021820	ACCGAA	2	12	4712682	4712693	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	526221631
86561	NC_021820	CAA	2	6	4712706	4712711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221631
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86563	NC_021820	CAT	2	6	4712906	4712911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221631
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86565	NC_021820	GC	3	6	4712921	4712926	0 %	0 %	50 %	50 %	526221631
86566	NC_021820	CTT	2	6	4713035	4713040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221631
86567	NC_021820	C	8	8	4713077	4713084	0 %	0 %	0 %	100 %	526221631
86568	NC_021820	AAT	2	6	4713090	4713095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221631
86569	NC_021820	GC	3	6	4713155	4713160	0 %	0 %	50 %	50 %	526221631
86570	NC_021820	TGAG	2	8	4713214	4713221	25 %	25 %	50 %	0 %	526221631
86571	NC_021820	TTAC	2	8	4713401	4713408	25 %	50 %	0 %	25 %	526222503
86572	NC_021820	ACT	2	6	4713602	4713607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222503
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86574	NC_021820	CGG	2	6	4713650	4713655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222503
86575	NC_021820	CA	3	6	4713724	4713729	50 %	0 %	0 %	50 %	526222503
86576	NC_021820	TGC	2	6	4713742	4713747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222503
86577	NC_021820	TC	3	6	4713763	4713768	0 %	50 %	0 %	50 %	526222503
86578	NC_021820	GCT	2	6	4714084	4714089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221632
86579	NC_021820	GCGT	2	8	4714114	4714121	0 %	25 %	50 %	25 %	526221632
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86581	NC_021820	ACG	2	6	4714217	4714222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221632
86582	NC_021820	TCA	2	6	4714233	4714238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221632
86583	NC_021820	GCG	2	6	4714243	4714248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221632
86584	NC_021820	TCA	2	6	4714267	4714272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221632
86585	NC_021820	GTCA	2	8	4714307	4714314	25 %	25 %	25 %	25 %	526221632
86586	NC_021820	GAT	2	6	4714370	4714375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221632
86587	NC_021820	TCA	2	6	4714386	4714391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221632
86588	NC_021820	CTT	2	6	4714441	4714446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221632
86589	NC_021820	GAC	2	6	4714585	4714590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221632
86590	NC_021820	CAGG	2	8	4714654	4714661	25 %	0 %	50 %	25 %	526221632
86591	NC_021820	AAG	2	6	4714662	4714667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221632
86592	NC_021820	CG	3	6	4714687	4714692	0 %	0 %	50 %	50 %	526221632
86593	NC_021820	TCA	2	6	4714795	4714800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221632
86594	NC_021820	CAT	2	6	4714823	4714828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221632
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86596	NC_021820	CGC	2	6	4714964	4714969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221632
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86600	NC_021820	GAT	2	6	4715129	4715134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221632
86601	NC_021820	CCG	2	6	4715205	4715210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221632
86602	NC_021820	CGA	2	6	4715326	4715331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221632
86603	NC_021820	CAG	2	6	4715402	4715407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221632
86604	NC_021820	CGG	2	6	4715423	4715428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221632
86605	NC_021820	CTT	3	9	4715515	4715523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221632
86606	NC_021820	TGATC	2	10	4715563	4715572	20 %	40 %	20 %	20 %	526221632
86607	NC_021820	CCG	2	6	4715625	4715630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221632
86608	NC_021820	GAA	2	6	4715648	4715653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221632
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86610	NC_021820	GGT	2	6	4715727	4715732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221632
86611	NC_021820	CAA	2	6	4715737	4715742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221632
86612	NC_021820	CAG	2	6	4715759	4715764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221632
86613	NC_021820	AGC	2	6	4715772	4715777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221632
86614	NC_021820	TCTT	2	8	4715820	4715827	0 %	75 %	0 %	25 %	526221632
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