MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
86001	NC_021820	TGT	2	6	4684548	4684553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221610
86002	NC_021820	TGC	2	6	4684589	4684594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221610
86003	NC_021820	AGC	2	6	4684802	4684807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221610
86004	NC_021820	CAC	2	6	4684908	4684913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221610
86005	NC_021820	GC	4	8	4684915	4684922	0 %	0 %	50 %	50 %	526221610
86006	NC_021820	GAT	2	6	4684995	4685000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221610
86007	NC_021820	CGC	2	6	4685026	4685031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221611
86008	NC_021820	CGC	3	9	4685072	4685080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221611
86009	NC_021820	CAG	2	6	4685174	4685179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221611
86010	NC_021820	A	6	6	4685205	4685210	100 %	0 %	0 %	0 %	526221611
86011	NC_021820	CAC	2	6	4685321	4685326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221611
86012	NC_021820	CAC	2	6	4685396	4685401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221611
86013	NC_021820	CAC	2	6	4685459	4685464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221611
86014	NC_021820	CTG	2	6	4685484	4685489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221611
86015	NC_021820	GCA	2	6	4685520	4685525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221611
86016	NC_021820	GCG	2	6	4685545	4685550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221611
86017	NC_021820	ACC	2	6	4685562	4685567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221611
86018	NC_021820	CTT	2	6	4685702	4685707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222497
86019	NC_021820	ATCG	2	8	4685757	4685764	25 %	25 %	25 %	25 %	526222497
86020	NC_021820	CGC	2	6	4685821	4685826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222497
86021	NC_021820	GTT	2	6	4685827	4685832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222497
86022	NC_021820	AGC	2	6	4685842	4685847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222497
86023	NC_021820	CCT	2	6	4685897	4685902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222497
86024	NC_021820	ACC	3	9	4685965	4685973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222497
86025	NC_021820	TGC	2	6	4685977	4685982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222497
86026	NC_021820	ACC	2	6	4686016	4686021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222497
86027	NC_021820	CGC	2	6	4686045	4686050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222497
86028	NC_021820	GCA	2	6	4686084	4686089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222497
86029	NC_021820	A	6	6	4686089	4686094	100 %	0 %	0 %	0 %	526222497
86030	NC_021820	GGTC	2	8	4686107	4686114	0 %	25 %	50 %	25 %	526222497
86031	NC_021820	CGGCG	2	10	4686192	4686201	0 %	0 %	60 %	40 %	526222497
86032	NC_021820	GCG	2	6	4686215	4686220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222497
86033	NC_021820	CAG	2	6	4686237	4686242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222497
86034	NC_021820	CCG	2	6	4686247	4686252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222497
86035	NC_021820	GCA	2	6	4686484	4686489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221612
86036	NC_021820	GGCC	2	8	4686501	4686508	0 %	0 %	50 %	50 %	526221612
86037	NC_021820	TCA	2	6	4686515	4686520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221612
86038	NC_021820	A	7	7	4686555	4686561	100 %	0 %	0 %	0 %	526221612
86039	NC_021820	TGA	2	6	4686594	4686599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221612
86040	NC_021820	CGA	2	6	4686609	4686614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221612
86041	NC_021820	GCG	2	6	4686662	4686667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221612
86042	NC_021820	GTT	2	6	4686744	4686749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221612
86043	NC_021820	CGG	2	6	4686785	4686790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221612
86044	NC_021820	ATT	2	6	4686799	4686804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221612
86045	NC_021820	GAA	2	6	4686813	4686818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221612
86046	NC_021820	GTC	3	9	4686847	4686855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221612
86047	NC_021820	GAC	2	6	4686889	4686894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221612
86048	NC_021820	CTG	2	6	4686925	4686930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221612
86049	NC_021820	T	6	6	4686958	4686963	0 %	100 %	0 %	0 %	526221613
86050	NC_021820	AATTT	2	10	4686989	4686998	40 %	60 %	0 %	0 %	526221613
86051	NC_021820	GCA	2	6	4687029	4687034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221613
86052	NC_021820	CGA	2	6	4687052	4687057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221613
86053	NC_021820	CG	3	6	4687070	4687075	0 %	0 %	50 %	50 %	526221613
86054	NC_021820	CGC	2	6	4687125	4687130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221613
86055	NC_021820	GC	3	6	4687135	4687140	0 %	0 %	50 %	50 %	526221613
86056	NC_021820	GC	3	6	4687179	4687184	0 %	0 %	50 %	50 %	526221613
86057	NC_021820	ATC	2	6	4687216	4687221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221613
86058	NC_021820	CAC	2	6	4687277	4687282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221613
86059	NC_021820	CAC	2	6	4687312	4687317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221613
86060	NC_021820	GTT	2	6	4687320	4687325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221613
86061	NC_021820	GCCA	2	8	4687328	4687335	25 %	0 %	25 %	50 %	526221613
86062	NC_021820	GT	3	6	4687353	4687358	0 %	50 %	50 %	0 %	526221613
86063	NC_021820	GTATCT	2	12	4687426	4687437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	526222498
86064	NC_021820	ACC	2	6	4687475	4687480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222498
86065	NC_021820	CGT	2	6	4687490	4687495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222498
86066	NC_021820	GCA	2	6	4687501	4687506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222498
86067	NC_021820	GCG	2	6	4687565	4687570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222498
86068	NC_021820	TCGC	2	8	4687582	4687589	0 %	25 %	25 %	50 %	526222498
86069	NC_021820	GCT	2	6	4687675	4687680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222498
86070	NC_021820	CCA	2	6	4687733	4687738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222499
86071	NC_021820	TA	3	6	4687856	4687861	50 %	50 %	0 %	0 %	526222499
86072	NC_021820	CCG	2	6	4687886	4687891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222499
86073	NC_021820	GC	3	6	4687938	4687943	0 %	0 %	50 %	50 %	526222499
86074	NC_021820	GCG	2	6	4687979	4687984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222499
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86077	NC_021820	CCA	2	6	4688072	4688077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222499
86078	NC_021820	GCTTC	2	10	4688120	4688129	0 %	40 %	20 %	40 %	526222499
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86080	NC_021820	GCA	3	9	4688278	4688286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222500
86081	NC_021820	TTC	2	6	4688337	4688342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222500
86082	NC_021820	GCG	2	6	4688421	4688426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222500
86083	NC_021820	CTG	2	6	4688477	4688482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222500
86084	NC_021820	TTTTCA	2	12	4688496	4688507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	526222500
86085	NC_021820	TCA	2	6	4688674	4688679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222500
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86087	NC_021820	CTGCC	2	10	4688953	4688962	0 %	20 %	20 %	60 %	526221614
86088	NC_021820	GGC	2	6	4688983	4688988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221614
86089	NC_021820	A	8	8	4689072	4689079	100 %	0 %	0 %	0 %	526221614
86090	NC_021820	CGC	2	6	4689113	4689118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221614
86091	NC_021820	GC	3	6	4689175	4689180	0 %	0 %	50 %	50 %	526221614
86092	NC_021820	GGC	2	6	4689190	4689195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221614
86093	NC_021820	CAAC	2	8	4689300	4689307	50 %	0 %	0 %	50 %	526221614
86094	NC_021820	GTA	2	6	4689353	4689358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221614
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86096	NC_021820	GCT	2	6	4689465	4689470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221614
86097	NC_021820	TCTT	2	8	4689472	4689479	0 %	75 %	0 %	25 %	526221614
86098	NC_021820	CGCC	2	8	4689522	4689529	0 %	0 %	25 %	75 %	526221614
86099	NC_021820	GCA	2	6	4689544	4689549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221614
86100	NC_021820	CGC	2	6	4689552	4689557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221614
86101	NC_021820	ATG	2	6	4689579	4689584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221614
86102	NC_021820	GGA	2	6	4689679	4689684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221614
86103	NC_021820	CTG	2	6	4689710	4689715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221614
86104	NC_021820	GGC	2	6	4689727	4689732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221614
86105	NC_021820	GCC	2	6	4689759	4689764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221614
86106	NC_021820	CGAT	2	8	4689813	4689820	25 %	25 %	25 %	25 %	526221614
86107	NC_021820	GCC	2	6	4689830	4689835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221614
86108	NC_021820	TGGA	2	8	4689863	4689870	25 %	25 %	50 %	0 %	526221614
86109	NC_021820	TTA	2	6	4689972	4689977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221615
86110	NC_021820	CAG	2	6	4690009	4690014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221615
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86112	NC_021820	GCA	2	6	4690061	4690066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221615
86113	NC_021820	CG	3	6	4690072	4690077	0 %	0 %	50 %	50 %	526221615
86114	NC_021820	CTGG	2	8	4690092	4690099	0 %	25 %	50 %	25 %	526221615
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86116	NC_021820	GGT	2	6	4690134	4690139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221615
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86347	NC_021820	CGGG	2	8	4701202	4701209	0 %	0 %	75 %	25 %	526221624
86348	NC_021820	CG	3	6	4701213	4701218	0 %	0 %	50 %	50 %	526221624
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86351	NC_021820	GCT	2	6	4701336	4701341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221624
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86354	NC_021820	GCA	2	6	4701570	4701575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221624
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