MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8003	NC_021820	GTT	2	6	428939	428944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218348
8004	NC_021820	CAA	2	6	428979	428984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218349
8005	NC_021820	CG	5	10	429071	429080	0 %	0 %	50 %	50 %	526218349
8006	NC_021820	TCG	2	6	429091	429096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218349
8007	NC_021820	TGG	2	6	429109	429114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218349
8008	NC_021820	A	6	6	429115	429120	100 %	0 %	0 %	0 %	526218349
8009	NC_021820	CGG	2	6	429181	429186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218349
8010	NC_021820	ATTGCC	2	12	429189	429200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526218349
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8012	NC_021820	TGC	2	6	429283	429288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218349
8013	NC_021820	GC	3	6	429310	429315	0 %	0 %	50 %	50 %	526218349
8014	NC_021820	GGC	2	6	429339	429344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218349
8015	NC_021820	CCG	2	6	429418	429423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218349
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8018	NC_021820	GCG	2	6	429565	429570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218349
8019	NC_021820	GCG	2	6	429589	429594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218349
8020	NC_021820	GCC	2	6	429651	429656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218349
8021	NC_021820	GCA	2	6	429665	429670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218349
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8024	NC_021820	GCA	2	6	429768	429773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218349
8025	NC_021820	CCAT	2	8	429805	429812	25 %	25 %	0 %	50 %	526218349
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8029	NC_021820	ATTG	2	8	430022	430029	25 %	50 %	25 %	0 %	526218349
8030	NC_021820	GCA	2	6	430059	430064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218349
8031	NC_021820	CTAT	2	8	430130	430137	25 %	50 %	0 %	25 %	526218350
8032	NC_021820	GCC	2	6	430141	430146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218350
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8034	NC_021820	TAC	2	6	430279	430284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218350
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8039	NC_021820	GGC	2	6	430368	430373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218350
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8049	NC_021820	CCTG	2	8	430673	430680	0 %	25 %	25 %	50 %	526218350
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8051	NC_021820	CAT	2	6	430761	430766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218350
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8053	NC_021820	ATG	2	6	431064	431069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218351
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8055	NC_021820	GAC	2	6	431161	431166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218351
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8057	NC_021820	GCTG	2	8	431439	431446	0 %	25 %	50 %	25 %	526218351
8058	NC_021820	GGT	2	6	431515	431520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218351
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8087	NC_021820	CCA	2	6	432679	432684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218352
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8092	NC_021820	GC	3	6	432847	432852	0 %	0 %	50 %	50 %	526218352
8093	NC_021820	CGG	2	6	432877	432882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218352
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8102	NC_021820	TGG	2	6	433555	433560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218353
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8117	NC_021820	AGC	2	6	434404	434409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218354
8118	NC_021820	A	6	6	434412	434417	100 %	0 %	0 %	0 %	526218354
8119	NC_021820	GGA	2	6	434453	434458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218354
8120	NC_021820	AGA	2	6	434501	434506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218354
8121	NC_021820	TCC	2	6	434561	434566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218354
8122	NC_021820	TTTA	2	8	434604	434611	25 %	75 %	0 %	0 %	526218354
8123	NC_021820	TCA	2	6	434641	434646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218354
8124	NC_021820	ATT	2	6	434703	434708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218354
8125	NC_021820	AGC	2	6	434768	434773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218354
8126	NC_021820	CAC	2	6	434798	434803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218354
8127	NC_021820	CGT	2	6	434817	434822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218354
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8129	NC_021820	CCG	2	6	434917	434922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218354
8130	NC_021820	CTG	2	6	434931	434936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218354
8131	NC_021820	CG	3	6	434941	434946	0 %	0 %	50 %	50 %	526218354
8132	NC_021820	TCAG	2	8	434956	434963	25 %	25 %	25 %	25 %	526218354
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8134	NC_021820	GATAAA	2	12	435048	435059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	526218354
8135	NC_021820	TCTG	2	8	435082	435089	0 %	50 %	25 %	25 %	526218354
8136	NC_021820	GCTG	2	8	435229	435236	0 %	25 %	50 %	25 %	526218354
8137	NC_021820	CTG	2	6	435273	435278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218354
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8139	NC_021820	CAT	2	6	435522	435527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218354
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8142	NC_021820	TAG	2	6	435581	435586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218354
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8145	NC_021820	TGG	2	6	435727	435732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218354
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8150	NC_021820	CTG	2	6	435858	435863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218354
8151	NC_021820	GGA	2	6	435959	435964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218354
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8153	NC_021820	AAAG	2	8	436014	436021	75 %	0 %	25 %	0 %	526218354
8154	NC_021820	TCTG	2	8	436108	436115	0 %	50 %	25 %	25 %	526218354
8155	NC_021820	A	6	6	436234	436239	100 %	0 %	0 %	0 %	526218354
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8161	NC_021820	T	6	6	436501	436506	0 %	100 %	0 %	0 %	526218354
8162	NC_021820	TCT	2	6	436698	436703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218354
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8198	NC_021820	GTA	2	6	438588	438593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218356
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8200	NC_021820	CGGCAT	2	12	438656	438667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526218356
8201	NC_021820	ATCA	2	8	438701	438708	50 %	25 %	0 %	25 %	526218356
8202	NC_021820	GCA	2	6	438709	438714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218356
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8221	NC_021820	GCCT	2	8	440433	440440	0 %	25 %	25 %	50 %	526218358
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8224	NC_021820	GGT	2	6	440603	440608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218358
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8228	NC_021820	TATG	2	8	440673	440680	25 %	50 %	25 %	0 %	526218358
8229	NC_021820	CAA	2	6	440723	440728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218358
8230	NC_021820	CACC	2	8	441039	441046	25 %	0 %	0 %	75 %	526218359
8231	NC_021820	TTC	2	6	441122	441127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218359
8232	NC_021820	GCT	2	6	441142	441147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218359
8233	NC_021820	TAT	2	6	441180	441185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218359
8234	NC_021820	CGG	2	6	441294	441299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218359
8235	NC_021820	ATC	2	6	441301	441306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218359
8236	NC_021820	GTC	2	6	441337	441342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218359
8237	NC_021820	ACC	2	6	441362	441367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218359
8238	NC_021820	GC	3	6	441399	441404	0 %	0 %	50 %	50 %	526218359
8239	NC_021820	CGAT	2	8	441548	441555	25 %	25 %	25 %	25 %	526218359
8240	NC_021820	TCAC	2	8	441623	441630	25 %	25 %	0 %	50 %	526218359
8241	NC_021820	GAC	2	6	441632	441637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218359
8242	NC_021820	CTT	2	6	441829	441834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218359
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8244	NC_021820	CGGA	2	8	441943	441950	25 %	0 %	50 %	25 %	526218359
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8365	NC_021820	CTA	2	6	451603	451608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218362
8366	NC_021820	AAC	2	6	451644	451649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218362
8367	NC_021820	GCCGC	2	10	451825	451834	0 %	0 %	40 %	60 %	526218363
8368	NC_021820	CGAA	2	8	451845	451852	50 %	0 %	25 %	25 %	526218363
8369	NC_021820	GTT	2	6	451872	451877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218363
8370	NC_021820	CGC	2	6	451895	451900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218363
8371	NC_021820	AGGA	2	8	451901	451908	50 %	0 %	50 %	0 %	526218363
8372	NC_021820	AAC	2	6	452005	452010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218363
8373	NC_021820	CGG	2	6	452274	452279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218363
8374	NC_021820	ATC	2	6	452351	452356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218363
8375	NC_021820	AGTTC	2	10	452400	452409	20 %	40 %	20 %	20 %	526218363
8376	NC_021820	GTC	2	6	452495	452500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218363
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8378	NC_021820	ACC	2	6	452539	452544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218363
8379	NC_021820	CAC	2	6	452550	452555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218363
8380	NC_021820	ACG	2	6	452561	452566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218363
8381	NC_021820	GTG	2	6	452661	452666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218363
8382	NC_021820	GAT	2	6	452709	452714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218363
8383	NC_021820	CGC	2	6	452716	452721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218363
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8385	NC_021820	GC	3	6	453131	453136	0 %	0 %	50 %	50 %	526218363
8386	NC_021820	GCG	2	6	453158	453163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218363
8387	NC_021820	GCG	2	6	453203	453208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218363
8388	NC_021820	GGT	2	6	453296	453301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218363
8389	NC_021820	GCC	2	6	453329	453334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218363
8390	NC_021820	GAC	2	6	453373	453378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218363
8391	NC_021820	GTG	2	6	453391	453396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218363
8392	NC_021820	CTT	2	6	453399	453404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218363
8393	NC_021820	GAT	2	6	453423	453428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218363
8394	NC_021820	GCG	2	6	453448	453453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218363
8395	NC_021820	ATG	2	6	453478	453483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218363
8396	NC_021820	GAT	2	6	453489	453494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218363
8397	NC_021820	CAG	2	6	453673	453678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218363
8398	NC_021820	CGTG	2	8	453705	453712	0 %	25 %	50 %	25 %	526218363
8399	NC_021820	ACT	2	6	453720	453725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218363
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8401	NC_021820	GCG	2	6	453896	453901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218363
8402	NC_021820	AAGGC	2	10	453902	453911	40 %	0 %	40 %	20 %	526218363
8403	NC_021820	GC	3	6	453910	453915	0 %	0 %	50 %	50 %	526218363
8404	NC_021820	GTG	2	6	454021	454026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218363
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8406	NC_021820	CTG	2	6	454210	454215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218364
8407	NC_021820	CTG	2	6	454345	454350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218364
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8410	NC_021820	GCG	2	6	454547	454552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218364
8411	NC_021820	TGA	2	6	454586	454591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218364
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8415	NC_021820	TAAA	2	8	454943	454950	75 %	25 %	0 %	0 %	526218364
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8422	NC_021820	CGC	2	6	455406	455411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218364
8423	NC_021820	GCG	2	6	455565	455570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218364
8424	NC_021820	GATGG	2	10	455667	455676	20 %	20 %	60 %	0 %	526218364
8425	NC_021820	GAT	2	6	455688	455693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218364
8426	NC_021820	GCA	2	6	455772	455777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218364
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8428	NC_021820	CAAT	2	8	455838	455845	50 %	25 %	0 %	25 %	526218364
8429	NC_021820	CGG	2	6	455983	455988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218365
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8432	NC_021820	GGC	2	6	456184	456189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218365
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8434	NC_021820	TGC	2	6	456242	456247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218365
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8436	NC_021820	ATCAGC	2	12	456284	456295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526218365
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8438	NC_021820	GTT	2	6	456349	456354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218365
8439	NC_021820	CGC	2	6	456426	456431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218365
8440	NC_021820	GCT	2	6	456468	456473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218365
8441	NC_021820	ATA	2	6	456577	456582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218365
8442	NC_021820	GCC	2	6	456671	456676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218365
8443	NC_021820	AAG	2	6	456690	456695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218365
8444	NC_021820	CAG	2	6	456727	456732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218365
8445	NC_021820	GAT	2	6	456733	456738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218365
8446	NC_021820	GAC	2	6	456748	456753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218365
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8449	NC_021820	AAT	2	6	456856	456861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218365
8450	NC_021820	CAC	2	6	456865	456870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218365
8451	NC_021820	GC	3	6	456901	456906	0 %	0 %	50 %	50 %	526218365
8452	NC_021820	GCC	2	6	456971	456976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218365
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8456	NC_021820	TTTGA	2	10	457099	457108	20 %	60 %	20 %	0 %	526218365
8457	NC_021820	ATA	2	6	457109	457114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218365
8458	NC_021820	TGC	2	6	457154	457159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218365
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8462	NC_021820	CGC	2	6	457622	457627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218366
8463	NC_021820	TGC	2	6	457636	457641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218366
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8465	NC_021820	GAA	2	6	457679	457684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218366
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8468	NC_021820	A	7	7	457746	457752	100 %	0 %	0 %	0 %	526218366
8469	NC_021820	CGA	2	6	457816	457821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218366
8470	NC_021820	G	6	6	457856	457861	0 %	0 %	100 %	0 %	526218366
8471	NC_021820	GTT	2	6	457866	457871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218366
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8473	NC_021820	CTG	2	6	457902	457907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218366
8474	NC_021820	CGG	2	6	457994	457999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218366
8475	NC_021820	CGGCG	2	10	458009	458018	0 %	0 %	60 %	40 %	526218366
8476	NC_021820	GGC	2	6	458115	458120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218366
8477	NC_021820	CCA	2	6	458149	458154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218366
8478	NC_021820	CT	3	6	458228	458233	0 %	50 %	0 %	50 %	526218366
8479	NC_021820	TG	3	6	458337	458342	0 %	50 %	50 %	0 %	526218366
8480	NC_021820	TTG	2	6	458347	458352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218366
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8482	NC_021820	TGA	2	6	458461	458466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218366
8483	NC_021820	TGG	2	6	458518	458523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218366
8484	NC_021820	ATG	2	6	458571	458576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218366
8485	NC_021820	ATG	2	6	458587	458592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218366
8486	NC_021820	CGG	2	6	458593	458598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218366
8487	NC_021820	GGC	2	6	458603	458608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218366
8488	NC_021820	ACCG	2	8	458670	458677	25 %	0 %	25 %	50 %	526218366
8489	NC_021820	TGG	2	6	458704	458709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218366
8490	NC_021820	TGC	2	6	458773	458778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218366
8491	NC_021820	A	6	6	458801	458806	100 %	0 %	0 %	0 %	526221789
8492	NC_021820	GCC	2	6	458863	458868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221789
8493	NC_021820	GGC	2	6	458926	458931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221789
8494	NC_021820	GGC	2	6	458940	458945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221789
8495	NC_021820	TAT	2	6	458972	458977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221789
8496	NC_021820	TGCCT	2	10	459041	459050	0 %	40 %	20 %	40 %	526221789
8497	NC_021820	GAG	2	6	459095	459100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221789
8498	NC_021820	TGCG	2	8	459108	459115	0 %	25 %	50 %	25 %	526221789
8499	NC_021820	CGG	2	6	459119	459124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221789
8500	NC_021820	ATG	2	6	459143	459148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221789

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