MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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84002	NC_021820	GAA	2	6	4574353	4574358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221521
84003	NC_021820	GAC	2	6	4574371	4574376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221521
84004	NC_021820	ATC	2	6	4574396	4574401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221521
84005	NC_021820	ATT	2	6	4574467	4574472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221521
84006	NC_021820	ATA	3	9	4574515	4574523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222486
84007	NC_021820	AAC	2	6	4574528	4574533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222486
84008	NC_021820	GCA	2	6	4574773	4574778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221522
84009	NC_021820	A	6	6	4574778	4574783	100 %	0 %	0 %	0 %	526221522
84010	NC_021820	CTT	2	6	4574821	4574826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221522
84011	NC_021820	A	6	6	4574853	4574858	100 %	0 %	0 %	0 %	526221522
84012	NC_021820	ATT	2	6	4574888	4574893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221522
84013	NC_021820	TG	3	6	4574941	4574946	0 %	50 %	50 %	0 %	526221522
84014	NC_021820	GGC	2	6	4574955	4574960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221522
84015	NC_021820	GC	3	6	4574968	4574973	0 %	0 %	50 %	50 %	526221522
84016	NC_021820	GCG	2	6	4574983	4574988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221522
84017	NC_021820	CGG	3	9	4574989	4574997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221522
84018	NC_021820	TGA	2	6	4575043	4575048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221522
84019	NC_021820	CCAG	2	8	4575067	4575074	25 %	0 %	25 %	50 %	526221522
84020	NC_021820	GCA	2	6	4575082	4575087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221522
84021	NC_021820	GAC	2	6	4575110	4575115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221522
84022	NC_021820	TCA	2	6	4575271	4575276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221522
84023	NC_021820	TGAT	2	8	4575277	4575284	25 %	50 %	25 %	0 %	526221522
84024	NC_021820	GGC	2	6	4575293	4575298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221522
84025	NC_021820	GC	3	6	4575408	4575413	0 %	0 %	50 %	50 %	526221522
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84028	NC_021820	TGGC	2	8	4575555	4575562	0 %	25 %	50 %	25 %	526221522
84029	NC_021820	CG	4	8	4575578	4575585	0 %	0 %	50 %	50 %	526221522
84030	NC_021820	ATC	2	6	4575589	4575594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221522
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84032	NC_021820	ATT	2	6	4575768	4575773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221522
84033	NC_021820	CGC	2	6	4575794	4575799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221522
84034	NC_021820	GGC	2	6	4575813	4575818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221522
84035	NC_021820	AG	3	6	4575860	4575865	50 %	0 %	50 %	0 %	526221522
84036	NC_021820	TGA	2	6	4575869	4575874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221522
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84039	NC_021820	CGT	2	6	4576134	4576139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221523
84040	NC_021820	CTG	2	6	4576180	4576185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221523
84041	NC_021820	CTG	2	6	4576213	4576218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221523
84042	NC_021820	T	6	6	4576257	4576262	0 %	100 %	0 %	0 %	526221523
84043	NC_021820	CGA	2	6	4576265	4576270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221523
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84045	NC_021820	GCT	2	6	4576301	4576306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221523
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84047	NC_021820	ATC	2	6	4576385	4576390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221523
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84049	NC_021820	TTGC	2	8	4576432	4576439	0 %	50 %	25 %	25 %	526221523
84050	NC_021820	CTG	2	6	4576468	4576473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221523
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84053	NC_021820	T	6	6	4576519	4576524	0 %	100 %	0 %	0 %	526221523
84054	NC_021820	CTG	2	6	4576540	4576545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221523
84055	NC_021820	GTG	2	6	4576684	4576689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221523
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84057	NC_021820	CGT	2	6	4576914	4576919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221524
84058	NC_021820	ATC	4	12	4576922	4576933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221524
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84067	NC_021820	ACA	2	6	4577577	4577582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221524
84068	NC_021820	CGCT	2	8	4577600	4577607	0 %	25 %	25 %	50 %	526221524
84069	NC_021820	ATT	2	6	4577609	4577614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221524
84070	NC_021820	ATT	2	6	4577620	4577625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221524
84071	NC_021820	T	6	6	4577624	4577629	0 %	100 %	0 %	0 %	526221524
84072	NC_021820	T	6	6	4577689	4577694	0 %	100 %	0 %	0 %	526221524
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84089	NC_021820	CGA	3	9	4578825	4578833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221525
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84103	NC_021820	CGCC	2	8	4579775	4579782	0 %	0 %	25 %	75 %	526221526
84104	NC_021820	GTC	2	6	4579819	4579824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221526
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84107	NC_021820	A	6	6	4581790	4581795	100 %	0 %	0 %	0 %	526221527
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84116	NC_021820	AAT	3	9	4582454	4582462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222487
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84118	NC_021820	GCA	2	6	4582708	4582713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221528
84119	NC_021820	GCA	2	6	4582913	4582918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221528
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84230	NC_021820	CAG	2	6	4588317	4588322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221532
84231	NC_021820	TTG	2	6	4588476	4588481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221532
84232	NC_021820	TCG	2	6	4588534	4588539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221532
84233	NC_021820	GC	3	6	4588568	4588573	0 %	0 %	50 %	50 %	526221532
84234	NC_021820	GCA	2	6	4588628	4588633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221532
84235	NC_021820	TCG	2	6	4588747	4588752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221532
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84243	NC_021820	CTG	2	6	4589160	4589165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221532
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84303	NC_021820	GCA	2	6	4592127	4592132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221534
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84347	NC_021820	CTG	2	6	4594314	4594319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222488
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84462	NC_021820	CGG	2	6	4600074	4600079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221541
84463	NC_021820	ATC	2	6	4600093	4600098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221541
84464	NC_021820	GCCA	2	8	4600120	4600127	25 %	0 %	25 %	50 %	526221541
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84466	NC_021820	CGAG	2	8	4600152	4600159	25 %	0 %	50 %	25 %	526221541
84467	NC_021820	CAG	2	6	4600373	4600378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221542
84468	NC_021820	CCAA	2	8	4600501	4600508	50 %	0 %	0 %	50 %	526221542
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84470	NC_021820	TGTC	2	8	4600550	4600557	0 %	50 %	25 %	25 %	526221542
84471	NC_021820	TC	3	6	4600556	4600561	0 %	50 %	0 %	50 %	526221542
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84473	NC_021820	GC	3	6	4600714	4600719	0 %	0 %	50 %	50 %	526221542
84474	NC_021820	GC	3	6	4600768	4600773	0 %	0 %	50 %	50 %	526221542
84475	NC_021820	GATCA	2	10	4600850	4600859	40 %	20 %	20 %	20 %	526221542
84476	NC_021820	CCAG	2	8	4600995	4601002	25 %	0 %	25 %	50 %	526221542
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84479	NC_021820	CTG	2	6	4601192	4601197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221543
84480	NC_021820	AC	3	6	4601204	4601209	50 %	0 %	0 %	50 %	526221543
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84483	NC_021820	TGGC	2	8	4601272	4601279	0 %	25 %	50 %	25 %	526221543
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84485	NC_021820	GGC	2	6	4601401	4601406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221543
84486	NC_021820	CAT	2	6	4601438	4601443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221543
84487	NC_021820	T	6	6	4601473	4601478	0 %	100 %	0 %	0 %	526221543
84488	NC_021820	T	6	6	4601486	4601491	0 %	100 %	0 %	0 %	526221544
84489	NC_021820	TGA	2	6	4601498	4601503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221544
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84491	NC_021820	CACC	2	8	4601664	4601671	25 %	0 %	0 %	75 %	526221544
84492	NC_021820	TCC	2	6	4601695	4601700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221544
84493	NC_021820	TGA	2	6	4601718	4601723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221544
84494	NC_021820	CTT	2	6	4601754	4601759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221544
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84499	NC_021820	TCG	2	6	4601891	4601896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221544
84500	NC_021820	CGG	2	6	4601922	4601927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221544

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