MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83501	NC_021820	ATT	2	6	4546662	4546667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221497
83502	NC_021820	CTC	2	6	4546718	4546723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221497
83503	NC_021820	TG	3	6	4546888	4546893	0 %	50 %	50 %	0 %	526222483
83504	NC_021820	TA	3	6	4546906	4546911	50 %	50 %	0 %	0 %	526222483
83505	NC_021820	GTT	2	6	4546941	4546946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222483
83506	NC_021820	C	7	7	4546951	4546957	0 %	0 %	0 %	100 %	526222483
83507	NC_021820	TTGA	2	8	4547012	4547019	25 %	50 %	25 %	0 %	526222483
83508	NC_021820	ATA	2	6	4547034	4547039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222483
83509	NC_021820	CAG	2	6	4547094	4547099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222483
83510	NC_021820	GCCC	2	8	4547110	4547117	0 %	0 %	25 %	75 %	526222483
83511	NC_021820	TCC	2	6	4547123	4547128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222483
83512	NC_021820	CGTG	2	8	4547169	4547176	0 %	25 %	50 %	25 %	526222483
83513	NC_021820	CAA	2	6	4547178	4547183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222483
83514	NC_021820	AT	3	6	4547428	4547433	50 %	50 %	0 %	0 %	526222483
83515	NC_021820	AAT	2	6	4547486	4547491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222483
83516	NC_021820	CTTT	2	8	4547502	4547509	0 %	75 %	0 %	25 %	526222483
83517	NC_021820	GCT	2	6	4547527	4547532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222483
83518	NC_021820	TCTT	2	8	4547579	4547586	0 %	75 %	0 %	25 %	526222483
83519	NC_021820	T	6	6	4547591	4547596	0 %	100 %	0 %	0 %	526222483
83520	NC_021820	AAG	2	6	4547666	4547671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222483
83521	NC_021820	GTG	2	6	4548193	4548198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221498
83522	NC_021820	GAT	2	6	4548229	4548234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221498
83523	NC_021820	ATA	2	6	4548242	4548247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221498
83524	NC_021820	GAA	2	6	4548268	4548273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221498
83525	NC_021820	ATA	2	6	4548287	4548292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221498
83526	NC_021820	CCAT	2	8	4548333	4548340	25 %	25 %	0 %	50 %	526221498
83527	NC_021820	ACG	2	6	4548413	4548418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221498
83528	NC_021820	TCA	2	6	4548453	4548458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221498
83529	NC_021820	ATC	2	6	4548509	4548514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221498
83530	NC_021820	ACG	2	6	4548541	4548546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221498
83531	NC_021820	GAA	2	6	4548580	4548585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221498
83532	NC_021820	CCG	2	6	4548621	4548626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221498
83533	NC_021820	T	6	6	4548799	4548804	0 %	100 %	0 %	0 %	526221498
83534	NC_021820	ACC	2	6	4548998	4549003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221498
83535	NC_021820	GCG	3	9	4549005	4549013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221498
83536	NC_021820	C	6	6	4549052	4549057	0 %	0 %	0 %	100 %	526221498
83537	NC_021820	TCG	2	6	4549074	4549079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221498
83538	NC_021820	CCGG	2	8	4549106	4549113	0 %	0 %	50 %	50 %	526221498
83539	NC_021820	GCC	2	6	4549171	4549176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221498
83540	NC_021820	CAA	2	6	4549210	4549215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221498
83541	NC_021820	AAG	2	6	4549226	4549231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221498
83542	NC_021820	CATC	2	8	4549251	4549258	25 %	25 %	0 %	50 %	526221498
83543	NC_021820	CAC	2	6	4549309	4549314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221498
83544	NC_021820	TTG	2	6	4549324	4549329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221498
83545	NC_021820	TCA	2	6	4549331	4549336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221498
83546	NC_021820	TCA	2	6	4549350	4549355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221498
83547	NC_021820	CCA	2	6	4549432	4549437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221498
83548	NC_021820	AAAC	2	8	4549866	4549873	75 %	0 %	0 %	25 %	526221499
83549	NC_021820	AG	3	6	4550048	4550053	50 %	0 %	50 %	0 %	526221499
83550	NC_021820	ACTGG	2	10	4550183	4550192	20 %	20 %	40 %	20 %	526221499
83551	NC_021820	GCGTT	2	10	4550235	4550244	0 %	40 %	40 %	20 %	526221499
83552	NC_021820	CGC	2	6	4550261	4550266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221499
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83554	NC_021820	GCG	2	6	4550339	4550344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221499
83555	NC_021820	CCA	2	6	4550350	4550355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221499
83556	NC_021820	ATT	2	6	4550391	4550396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221499
83557	NC_021820	GAA	2	6	4550415	4550420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221499
83558	NC_021820	ATT	2	6	4550517	4550522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221499
83559	NC_021820	CGA	2	6	4550531	4550536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221499
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83562	NC_021820	ATGG	2	8	4550627	4550634	25 %	25 %	50 %	0 %	526221499
83563	NC_021820	GC	3	6	4550693	4550698	0 %	0 %	50 %	50 %	526221499
83564	NC_021820	GCC	2	6	4550802	4550807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221499
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83567	NC_021820	CGA	2	6	4550888	4550893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221499
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83570	NC_021820	GC	3	6	4551026	4551031	0 %	0 %	50 %	50 %	526221499
83571	NC_021820	CGCC	2	8	4551193	4551200	0 %	0 %	25 %	75 %	526221500
83572	NC_021820	CG	3	6	4551263	4551268	0 %	0 %	50 %	50 %	526221500
83573	NC_021820	CAT	2	6	4551287	4551292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221500
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83577	NC_021820	CTG	2	6	4551389	4551394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221500
83578	NC_021820	AAG	2	6	4551453	4551458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221500
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83586	NC_021820	GC	3	6	4551990	4551995	0 %	0 %	50 %	50 %	526221500
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83589	NC_021820	CG	3	6	4552133	4552138	0 %	0 %	50 %	50 %	526221500
83590	NC_021820	GCGCTG	2	12	4552139	4552150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526221500
83591	NC_021820	TGA	2	6	4552156	4552161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221500
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83593	NC_021820	GATG	2	8	4552273	4552280	25 %	25 %	50 %	0 %	526221500
83594	NC_021820	TTG	2	6	4552304	4552309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221500
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83602	NC_021820	GAA	2	6	4552537	4552542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221500
83603	NC_021820	TAAG	2	8	4552624	4552631	50 %	25 %	25 %	0 %	526221500
83604	NC_021820	CGC	2	6	4552710	4552715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221501
83605	NC_021820	CGA	2	6	4552767	4552772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221501
83606	NC_021820	CTGG	2	8	4552800	4552807	0 %	25 %	50 %	25 %	526221501
83607	NC_021820	AT	3	6	4552896	4552901	50 %	50 %	0 %	0 %	526221501
83608	NC_021820	CG	4	8	4553067	4553074	0 %	0 %	50 %	50 %	526221501
83609	NC_021820	TAT	2	6	4553076	4553081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221501
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83734	NC_021820	GGT	2	6	4560208	4560213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221506
83735	NC_021820	ATC	2	6	4560497	4560502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221506
83736	NC_021820	ACC	2	6	4560530	4560535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221506
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83741	NC_021820	A	6	6	4560816	4560821	100 %	0 %	0 %	0 %	526221506
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83746	NC_021820	ATG	2	6	4561007	4561012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221507
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83748	NC_021820	CA	3	6	4561110	4561115	50 %	0 %	0 %	50 %	526221507
83749	NC_021820	ATC	2	6	4561141	4561146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221507
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83753	NC_021820	CG	3	6	4561479	4561484	0 %	0 %	50 %	50 %	526221508
83754	NC_021820	CTGC	2	8	4561500	4561507	0 %	25 %	25 %	50 %	526221508
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83758	NC_021820	CG	3	6	4561641	4561646	0 %	0 %	50 %	50 %	526221509
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83831	NC_021820	GT	3	6	4565502	4565507	0 %	50 %	50 %	0 %	526221513
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83833	NC_021820	CAGATC	2	12	4565555	4565566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526221513
83834	NC_021820	CAGCAC	2	12	4565585	4565596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526221513
83835	NC_021820	ACC	2	6	4565603	4565608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221513
83836	NC_021820	GTA	2	6	4565636	4565641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221513
83837	NC_021820	GTC	2	6	4565666	4565671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221513
83838	NC_021820	T	6	6	4565729	4565734	0 %	100 %	0 %	0 %	526221513
83839	NC_021820	CA	3	6	4565795	4565800	50 %	0 %	0 %	50 %	526221513
83840	NC_021820	GC	3	6	4565866	4565871	0 %	0 %	50 %	50 %	526221513
83841	NC_021820	GTT	2	6	4565879	4565884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221513
83842	NC_021820	GGCA	2	8	4565911	4565918	25 %	0 %	50 %	25 %	526221513
83843	NC_021820	T	6	6	4565984	4565989	0 %	100 %	0 %	0 %	526221513
83844	NC_021820	AAT	2	6	4566116	4566121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221513
83845	NC_021820	GTT	2	6	4566149	4566154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221513
83846	NC_021820	CGG	2	6	4566278	4566283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221513
83847	NC_021820	CGGCG	2	10	4566314	4566323	0 %	0 %	60 %	40 %	526221513
83848	NC_021820	GCT	2	6	4566348	4566353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221513
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83968	NC_021820	CGG	2	6	4573031	4573036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221519
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