MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83001	NC_021820	GCC	2	6	4517300	4517305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221472
83002	NC_021820	GGC	2	6	4517363	4517368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221472
83003	NC_021820	GC	3	6	4517367	4517372	0 %	0 %	50 %	50 %	526221472
83004	NC_021820	CG	3	6	4517386	4517391	0 %	0 %	50 %	50 %	526221472
83005	NC_021820	CTG	2	6	4517435	4517440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221472
83006	NC_021820	GAC	2	6	4517462	4517467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221472
83007	NC_021820	CTGGC	2	10	4517548	4517557	0 %	20 %	40 %	40 %	526221472
83008	NC_021820	GGC	2	6	4517572	4517577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221472
83009	NC_021820	TTC	2	6	4517609	4517614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221472
83010	NC_021820	CCG	2	6	4517634	4517639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221472
83011	NC_021820	GAA	2	6	4517654	4517659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221472
83012	NC_021820	A	6	6	4517658	4517663	100 %	0 %	0 %	0 %	526221472
83013	NC_021820	GCT	3	9	4517695	4517703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221472
83014	NC_021820	CCG	2	6	4517730	4517735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221473
83015	NC_021820	GT	3	6	4517762	4517767	0 %	50 %	50 %	0 %	526221473
83016	NC_021820	GAC	2	6	4517826	4517831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221473
83017	NC_021820	GGC	2	6	4517910	4517915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221473
83018	NC_021820	GCT	2	6	4517954	4517959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221473
83019	NC_021820	GCGT	2	8	4517965	4517972	0 %	25 %	50 %	25 %	526221473
83020	NC_021820	GC	3	6	4517973	4517978	0 %	0 %	50 %	50 %	526221473
83021	NC_021820	GGC	2	6	4517987	4517992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221473
83022	NC_021820	GC	3	6	4518059	4518064	0 %	0 %	50 %	50 %	526221473
83023	NC_021820	GCA	2	6	4518159	4518164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221473
83024	NC_021820	TGGGCT	2	12	4518176	4518187	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	526221473
83025	NC_021820	CCG	2	6	4518279	4518284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221473
83026	NC_021820	TC	3	6	4518287	4518292	0 %	50 %	0 %	50 %	526221473
83027	NC_021820	GTTCG	2	10	4518326	4518335	0 %	40 %	40 %	20 %	526221473
83028	NC_021820	CCG	2	6	4518339	4518344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221473
83029	NC_021820	CCA	2	6	4518389	4518394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221473
83030	NC_021820	TTA	2	6	4518396	4518401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221473
83031	NC_021820	CCG	2	6	4518403	4518408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221473
83032	NC_021820	ACT	2	6	4518475	4518480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221473
83033	NC_021820	GCG	2	6	4518511	4518516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221473
83034	NC_021820	CAC	2	6	4518557	4518562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221473
83035	NC_021820	CGTGA	2	10	4518615	4518624	20 %	20 %	40 %	20 %	526221473
83036	NC_021820	TGA	2	6	4518626	4518631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221473
83037	NC_021820	GC	4	8	4518677	4518684	0 %	0 %	50 %	50 %	526221473
83038	NC_021820	CGA	2	6	4518743	4518748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221473
83039	NC_021820	CT	3	6	4518824	4518829	0 %	50 %	0 %	50 %	526221473
83040	NC_021820	GTT	2	6	4518836	4518841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221473
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83042	NC_021820	TAA	2	6	4518950	4518955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221474
83043	NC_021820	ACG	2	6	4518963	4518968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221474
83044	NC_021820	T	6	6	4518984	4518989	0 %	100 %	0 %	0 %	526221474
83045	NC_021820	GCC	2	6	4519154	4519159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221474
83046	NC_021820	CTG	2	6	4519188	4519193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221474
83047	NC_021820	GCT	2	6	4519284	4519289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221474
83048	NC_021820	ATC	2	6	4519308	4519313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221474
83049	NC_021820	CTT	2	6	4519394	4519399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221474
83050	NC_021820	T	6	6	4519398	4519403	0 %	100 %	0 %	0 %	526221474
83051	NC_021820	AG	3	6	4519431	4519436	50 %	0 %	50 %	0 %	526221474
83052	NC_021820	TTC	2	6	4519440	4519445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221474
83053	NC_021820	AGG	2	6	4519478	4519483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221474
83054	NC_021820	TCA	2	6	4519513	4519518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221474
83055	NC_021820	GTC	2	6	4519554	4519559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221474
83056	NC_021820	GCTG	2	8	4519578	4519585	0 %	25 %	50 %	25 %	526221474
83057	NC_021820	CCAG	2	8	4519614	4519621	25 %	0 %	25 %	50 %	526221474
83058	NC_021820	T	6	6	4519685	4519690	0 %	100 %	0 %	0 %	526221474
83059	NC_021820	CAA	2	6	4519691	4519696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221474
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83061	NC_021820	CCG	2	6	4519706	4519711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221474
83062	NC_021820	GAA	2	6	4519744	4519749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221474
83063	NC_021820	T	6	6	4519798	4519803	0 %	100 %	0 %	0 %	526221474
83064	NC_021820	GAA	2	6	4520254	4520259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221475
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83066	NC_021820	TACCG	2	10	4520268	4520277	20 %	20 %	20 %	40 %	526221475
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83068	NC_021820	GGT	2	6	4520469	4520474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221475
83069	NC_021820	CGTC	2	8	4520593	4520600	0 %	25 %	25 %	50 %	526221475
83070	NC_021820	TCAT	2	8	4520611	4520618	25 %	50 %	0 %	25 %	526221475
83071	NC_021820	ACC	2	6	4520620	4520625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221475
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83073	NC_021820	TAC	2	6	4520664	4520669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221475
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83078	NC_021820	CAC	2	6	4521014	4521019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221475
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83082	NC_021820	CTG	2	6	4521395	4521400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221476
83083	NC_021820	ACC	2	6	4521449	4521454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221476
83084	NC_021820	GCC	3	9	4521485	4521493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221476
83085	NC_021820	CTG	2	6	4521566	4521571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221476
83086	NC_021820	GCAC	2	8	4521579	4521586	25 %	0 %	25 %	50 %	526221476
83087	NC_021820	CCGT	2	8	4521618	4521625	0 %	25 %	25 %	50 %	526221476
83088	NC_021820	TGC	2	6	4521697	4521702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221476
83089	NC_021820	GAT	2	6	4521722	4521727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221476
83090	NC_021820	CG	3	6	4521757	4521762	0 %	0 %	50 %	50 %	526221476
83091	NC_021820	TCA	2	6	4521774	4521779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221476
83092	NC_021820	GC	3	6	4521790	4521795	0 %	0 %	50 %	50 %	526221476
83093	NC_021820	GCTC	2	8	4521826	4521833	0 %	25 %	25 %	50 %	526221476
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83095	NC_021820	CAG	2	6	4522019	4522024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221476
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83099	NC_021820	CTT	2	6	4522127	4522132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221477
83100	NC_021820	GC	3	6	4522140	4522145	0 %	0 %	50 %	50 %	526221477
83101	NC_021820	TTC	2	6	4522176	4522181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221477
83102	NC_021820	CCAGG	2	10	4522221	4522230	20 %	0 %	40 %	40 %	526221477
83103	NC_021820	TTA	2	6	4522255	4522260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221477
83104	NC_021820	TAA	2	6	4522277	4522282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221477
83105	NC_021820	T	7	7	4522379	4522385	0 %	100 %	0 %	0 %	526221477
83106	NC_021820	GAC	3	9	4522391	4522399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221477
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83109	NC_021820	CT	3	6	4522524	4522529	0 %	50 %	0 %	50 %	526221478
83110	NC_021820	AGA	2	6	4522553	4522558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221478
83111	NC_021820	GTCG	2	8	4522595	4522602	0 %	25 %	50 %	25 %	526221478
83112	NC_021820	CGC	2	6	4522615	4522620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221478
83113	NC_021820	TAT	2	6	4522678	4522683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221478
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83115	NC_021820	TCGCCA	2	12	4522888	4522899	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526221478
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83117	NC_021820	AAC	2	6	4522956	4522961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221478
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83231	NC_021820	CTG	3	9	4529653	4529661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221483
83232	NC_021820	CCG	2	6	4529747	4529752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221483
83233	NC_021820	T	6	6	4529764	4529769	0 %	100 %	0 %	0 %	526221483
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83469	NC_021820	GT	3	6	4543992	4543997	0 %	50 %	50 %	0 %	526221495
83470	NC_021820	AT	3	6	4544007	4544012	50 %	50 %	0 %	0 %	526221495
83471	NC_021820	TACGC	2	10	4544022	4544031	20 %	20 %	20 %	40 %	526221495
83472	NC_021820	TGA	2	6	4544149	4544154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221495
83473	NC_021820	TTA	2	6	4544185	4544190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221495
83474	NC_021820	TGA	2	6	4544418	4544423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222482
83475	NC_021820	AGC	2	6	4544480	4544485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222482
83476	NC_021820	TCA	3	9	4544701	4544709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221496
83477	NC_021820	CTG	2	6	4544758	4544763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221496
83478	NC_021820	CCG	2	6	4544840	4544845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221496
83479	NC_021820	GCC	2	6	4544848	4544853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221496
83480	NC_021820	CGT	2	6	4544919	4544924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221496
83481	NC_021820	CAG	2	6	4544972	4544977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221496
83482	NC_021820	GC	4	8	4545039	4545046	0 %	0 %	50 %	50 %	526221496
83483	NC_021820	A	7	7	4545176	4545182	100 %	0 %	0 %	0 %	526221496
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83485	NC_021820	ATC	2	6	4545939	4545944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221497
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83488	NC_021820	TCAA	2	8	4546072	4546079	50 %	25 %	0 %	25 %	526221497
83489	NC_021820	AAC	2	6	4546084	4546089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221497
83490	NC_021820	ATC	2	6	4546090	4546095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221497
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83493	NC_021820	ATC	2	6	4546257	4546262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221497
83494	NC_021820	TC	3	6	4546366	4546371	0 %	50 %	0 %	50 %	526221497
83495	NC_021820	TCC	2	6	4546405	4546410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221497
83496	NC_021820	AGA	2	6	4546411	4546416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221497
83497	NC_021820	TAG	2	6	4546558	4546563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221497
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83499	NC_021820	A	6	6	4546644	4546649	100 %	0 %	0 %	0 %	526221497
83500	NC_021820	GGT	2	6	4546650	4546655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221497

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