MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
82001	NC_021820	CTG	2	6	4459292	4459297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221423
82002	NC_021820	GCTG	2	8	4459303	4459310	0 %	25 %	50 %	25 %	526221423
82003	NC_021820	AAT	2	6	4459314	4459319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221423
82004	NC_021820	CAC	2	6	4459442	4459447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221423
82005	NC_021820	CCA	2	6	4459483	4459488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221423
82006	NC_021820	GCG	2	6	4459567	4459572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221423
82007	NC_021820	GC	3	6	4459648	4459653	0 %	0 %	50 %	50 %	526221423
82008	NC_021820	ATC	2	6	4459658	4459663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221423
82009	NC_021820	ATC	2	6	4459781	4459786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221423
82010	NC_021820	GAT	2	6	4459816	4459821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221423
82011	NC_021820	CGA	2	6	4459851	4459856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221423
82012	NC_021820	T	6	6	4460068	4460073	0 %	100 %	0 %	0 %	526221424
82013	NC_021820	ACG	2	6	4460191	4460196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221424
82014	NC_021820	AGG	2	6	4460239	4460244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221424
82015	NC_021820	CCGTT	2	10	4460621	4460630	0 %	40 %	20 %	40 %	526221425
82016	NC_021820	GCT	2	6	4460649	4460654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221425
82017	NC_021820	CTT	2	6	4460688	4460693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221425
82018	NC_021820	CCG	2	6	4460703	4460708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221425
82019	NC_021820	TGA	2	6	4460723	4460728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221425
82020	NC_021820	CCTGCC	2	12	4460802	4460813	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	526221425
82021	NC_021820	TC	3	6	4460844	4460849	0 %	50 %	0 %	50 %	526221425
82022	NC_021820	AGT	2	6	4460906	4460911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221425
82023	NC_021820	ATC	2	6	4460912	4460917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221425
82024	NC_021820	ATGA	2	8	4460977	4460984	50 %	25 %	25 %	0 %	526221425
82025	NC_021820	GC	3	6	4461002	4461007	0 %	0 %	50 %	50 %	526221425
82026	NC_021820	TAAA	2	8	4461124	4461131	75 %	25 %	0 %	0 %	526222469
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82041	NC_021820	GGT	2	6	4461964	4461969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221426
82042	NC_021820	GCT	2	6	4461988	4461993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221426
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82045	NC_021820	GCT	2	6	4462218	4462223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221426
82046	NC_021820	CG	3	6	4462274	4462279	0 %	0 %	50 %	50 %	526221426
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82050	NC_021820	CGA	2	6	4462465	4462470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221426
82051	NC_021820	ACG	2	6	4462765	4462770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221427
82052	NC_021820	CAG	2	6	4462782	4462787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221427
82053	NC_021820	CGC	2	6	4462793	4462798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221427
82054	NC_021820	CAGC	2	8	4462842	4462849	25 %	0 %	25 %	50 %	526221427
82055	NC_021820	CG	3	6	4462955	4462960	0 %	0 %	50 %	50 %	526221427
82056	NC_021820	GCG	2	6	4462964	4462969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221427
82057	NC_021820	CAG	2	6	4462983	4462988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221427
82058	NC_021820	AGAT	2	8	4463017	4463024	50 %	25 %	25 %	0 %	526221427
82059	NC_021820	TGA	2	6	4463065	4463070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221427
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82061	NC_021820	CCAAT	2	10	4463213	4463222	40 %	20 %	0 %	40 %	526221427
82062	NC_021820	CAGC	2	8	4463252	4463259	25 %	0 %	25 %	50 %	526221427
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82113	NC_021820	CA	3	6	4467627	4467632	50 %	0 %	0 %	50 %	526221430
82114	NC_021820	TTC	2	6	4467646	4467651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221430
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82116	NC_021820	ATG	2	6	4467683	4467688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221430
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82340	NC_021820	GCT	2	6	4480525	4480530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221440
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82343	NC_021820	GGT	2	6	4480627	4480632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221440
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82347	NC_021820	CCG	2	6	4480779	4480784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221440
82348	NC_021820	GAT	2	6	4480802	4480807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221440
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82423	NC_021820	CG	3	6	4484215	4484220	0 %	0 %	50 %	50 %	526221444
82424	NC_021820	GTA	2	6	4484300	4484305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221444
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82450	NC_021820	TCGG	2	8	4485710	4485717	0 %	25 %	50 %	25 %	526221445
82451	NC_021820	CAG	2	6	4485739	4485744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221445
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82455	NC_021820	CAG	2	6	4485976	4485981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221445
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82457	NC_021820	CA	3	6	4486077	4486082	50 %	0 %	0 %	50 %	526221445
82458	NC_021820	GCG	2	6	4486085	4486090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221445
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82461	NC_021820	TCTT	2	8	4486115	4486122	0 %	75 %	0 %	25 %	526221445
82462	NC_021820	ACC	2	6	4486154	4486159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221445
82463	NC_021820	AAC	2	6	4486243	4486248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221445
82464	NC_021820	GCA	2	6	4486251	4486256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221445
82465	NC_021820	GA	3	6	4486257	4486262	50 %	0 %	50 %	0 %	526221445
82466	NC_021820	TTC	2	6	4486264	4486269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221445
82467	NC_021820	GAC	2	6	4486290	4486295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221445
82468	NC_021820	CG	3	6	4486370	4486375	0 %	0 %	50 %	50 %	526221445
82469	NC_021820	CTT	2	6	4486392	4486397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221445
82470	NC_021820	CCAGAT	2	12	4486443	4486454	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526221445
82471	NC_021820	GTG	2	6	4486556	4486561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221446
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82473	NC_021820	ACCAG	2	10	4486599	4486608	40 %	0 %	20 %	40 %	526221446
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82475	NC_021820	TGC	2	6	4486741	4486746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221446
82476	NC_021820	GCA	2	6	4486752	4486757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221446
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82478	NC_021820	ATCG	2	8	4486807	4486814	25 %	25 %	25 %	25 %	526221446
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82481	NC_021820	CG	4	8	4486936	4486943	0 %	0 %	50 %	50 %	526221446
82482	NC_021820	CTG	2	6	4486978	4486983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221446
82483	NC_021820	TCG	2	6	4487004	4487009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221446
82484	NC_021820	CAT	2	6	4487037	4487042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221446
82485	NC_021820	CAA	2	6	4487044	4487049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221446
82486	NC_021820	CGCA	2	8	4487110	4487117	25 %	0 %	25 %	50 %	526221446
82487	NC_021820	TGGTTC	2	12	4487120	4487131	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526221446
82488	NC_021820	ACG	2	6	4487141	4487146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221446
82489	NC_021820	TGC	2	6	4487163	4487168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221446
82490	NC_021820	TTC	2	6	4487189	4487194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221446
82491	NC_021820	CAACA	2	10	4487254	4487263	60 %	0 %	0 %	40 %	526221446
82492	NC_021820	GCT	2	6	4487343	4487348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221446
82493	NC_021820	CAA	2	6	4487401	4487406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221446
82494	NC_021820	CCA	2	6	4487445	4487450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221446
82495	NC_021820	CG	3	6	4487461	4487466	0 %	0 %	50 %	50 %	526221446
82496	NC_021820	CAC	2	6	4487930	4487935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221447
82497	NC_021820	GC	3	6	4487948	4487953	0 %	0 %	50 %	50 %	526221447
82498	NC_021820	GCC	2	6	4488032	4488037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221447
82499	NC_021820	GCATCT	2	12	4488166	4488177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526221447
82500	NC_021820	CGG	2	6	4488208	4488213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221447

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