MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
81501	NC_021820	GTT	2	6	4430488	4430493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221404
81502	NC_021820	ATA	2	6	4430507	4430512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221404
81503	NC_021820	TGAT	2	8	4430565	4430572	25 %	50 %	25 %	0 %	526221404
81504	NC_021820	GCC	2	6	4430629	4430634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221404
81505	NC_021820	AAC	2	6	4430749	4430754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221404
81506	NC_021820	CTG	2	6	4430822	4430827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221404
81507	NC_021820	GGC	2	6	4430837	4430842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221404
81508	NC_021820	TCG	2	6	4430874	4430879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221404
81509	NC_021820	GCA	2	6	4430920	4430925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221404
81510	NC_021820	CTG	2	6	4430954	4430959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221404
81511	NC_021820	TAA	2	6	4430985	4430990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221404
81512	NC_021820	C	7	7	4431014	4431020	0 %	0 %	0 %	100 %	526221404
81513	NC_021820	CGCC	2	8	4431179	4431186	0 %	0 %	25 %	75 %	526221405
81514	NC_021820	GAT	2	6	4431339	4431344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221405
81515	NC_021820	CAC	2	6	4431432	4431437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221405
81516	NC_021820	GCG	2	6	4431442	4431447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221405
81517	NC_021820	CAT	2	6	4431471	4431476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221405
81518	NC_021820	GA	3	6	4431499	4431504	50 %	0 %	50 %	0 %	526221405
81519	NC_021820	AGTC	2	8	4431654	4431661	25 %	25 %	25 %	25 %	526221405
81520	NC_021820	ACC	2	6	4431664	4431669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221405
81521	NC_021820	GTG	2	6	4431694	4431699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221405
81522	NC_021820	GCG	2	6	4431725	4431730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221405
81523	NC_021820	ATG	2	6	4431742	4431747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221405
81524	NC_021820	CTG	2	6	4431762	4431767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221405
81525	NC_021820	AGC	2	6	4431778	4431783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221405
81526	NC_021820	CGGCG	2	10	4431797	4431806	0 %	0 %	60 %	40 %	526221405
81527	NC_021820	AAT	2	6	4431826	4431831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221405
81528	NC_021820	CCCT	2	8	4431837	4431844	0 %	25 %	0 %	75 %	526221405
81529	NC_021820	TCA	2	6	4431880	4431885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221405
81530	NC_021820	GCA	2	6	4431908	4431913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221405
81531	NC_021820	GCA	2	6	4431917	4431922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221405
81532	NC_021820	GCCA	2	8	4431955	4431962	25 %	0 %	25 %	50 %	526221405
81533	NC_021820	ACC	2	6	4431985	4431990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221405
81534	NC_021820	AAT	2	6	4431993	4431998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221405
81535	NC_021820	GCAG	2	8	4432009	4432016	25 %	0 %	50 %	25 %	526221405
81536	NC_021820	CG	3	6	4432035	4432040	0 %	0 %	50 %	50 %	526221405
81537	NC_021820	A	6	6	4432075	4432080	100 %	0 %	0 %	0 %	526221405
81538	NC_021820	ATAC	2	8	4432113	4432120	50 %	25 %	0 %	25 %	526221405
81539	NC_021820	AG	3	6	4432158	4432163	50 %	0 %	50 %	0 %	526221405
81540	NC_021820	GCG	2	6	4432169	4432174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221405
81541	NC_021820	AGG	2	6	4432181	4432186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221405
81542	NC_021820	CAAT	2	8	4432223	4432230	50 %	25 %	0 %	25 %	526221405
81543	NC_021820	CGAGC	2	10	4432263	4432272	20 %	0 %	40 %	40 %	526221405
81544	NC_021820	GCCA	2	8	4432287	4432294	25 %	0 %	25 %	50 %	526221405
81545	NC_021820	AGCC	2	8	4432327	4432334	25 %	0 %	25 %	50 %	526221405
81546	NC_021820	AAT	2	6	4432339	4432344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221405
81547	NC_021820	CAT	2	6	4432365	4432370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221405
81548	NC_021820	GCT	2	6	4432371	4432376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221405
81549	NC_021820	GAC	2	6	4432377	4432382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221405
81550	NC_021820	TAA	2	6	4432421	4432426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221405
81551	NC_021820	AAAC	2	8	4432496	4432503	75 %	0 %	0 %	25 %	526221405
81552	NC_021820	CGT	2	6	4432513	4432518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221405
81553	NC_021820	GT	3	6	4432517	4432522	0 %	50 %	50 %	0 %	526221405
81554	NC_021820	GCCA	2	8	4432932	4432939	25 %	0 %	25 %	50 %	526221406
81555	NC_021820	GCG	2	6	4432980	4432985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221406
81556	NC_021820	GC	3	6	4433085	4433090	0 %	0 %	50 %	50 %	526221406
81557	NC_021820	TAT	2	6	4433101	4433106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221406
81558	NC_021820	CGC	2	6	4433194	4433199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221406
81559	NC_021820	GCC	2	6	4433231	4433236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221406
81560	NC_021820	TAA	2	6	4433263	4433268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221406
81561	NC_021820	GCC	2	6	4433273	4433278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221406
81562	NC_021820	GCC	3	9	4433304	4433312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221406
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81564	NC_021820	ACG	2	6	4433393	4433398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221406
81565	NC_021820	A	6	6	4433508	4433513	100 %	0 %	0 %	0 %	526221406
81566	NC_021820	CG	3	6	4433533	4433538	0 %	0 %	50 %	50 %	526221406
81567	NC_021820	CAA	2	6	4433557	4433562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221406
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81570	NC_021820	CAAA	2	8	4433810	4433817	75 %	0 %	0 %	25 %	526222459
81571	NC_021820	CAT	2	6	4433920	4433925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222459
81572	NC_021820	ATGGC	2	10	4433992	4434001	20 %	20 %	40 %	20 %	526222459
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81574	NC_021820	GC	3	6	4434186	4434191	0 %	0 %	50 %	50 %	526222459
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81578	NC_021820	CCG	2	6	4434398	4434403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222459
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81583	NC_021820	CGC	2	6	4435161	4435166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221407
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81586	NC_021820	CG	3	6	4435357	4435362	0 %	0 %	50 %	50 %	526221407
81587	NC_021820	GC	3	6	4435366	4435371	0 %	0 %	50 %	50 %	526221407
81588	NC_021820	TCA	4	12	4435410	4435421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221407
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81599	NC_021820	GCCC	2	8	4435845	4435852	0 %	0 %	25 %	75 %	526221407
81600	NC_021820	CGC	2	6	4435872	4435877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221407
81601	NC_021820	CCT	2	6	4435967	4435972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221407
81602	NC_021820	GC	3	6	4435987	4435992	0 %	0 %	50 %	50 %	526221407
81603	NC_021820	TAGCGT	2	12	4436046	4436057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526221407
81604	NC_021820	CGG	2	6	4436109	4436114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221407
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81615	NC_021820	GGCCG	2	10	4436535	4436544	0 %	0 %	60 %	40 %	526221408
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81735	NC_021820	CAT	2	6	4443010	4443015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222462
81736	NC_021820	GTTTT	2	10	4443030	4443039	0 %	80 %	20 %	0 %	526222462
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81738	NC_021820	ATC	2	6	4443138	4443143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221413
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