MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
81001	NC_021820	CGC	2	6	4403036	4403041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
81002	NC_021820	TCA	2	6	4403101	4403106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222452
81003	NC_021820	CAT	2	6	4403142	4403147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222452
81004	NC_021820	CTG	2	6	4403323	4403328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222452
81005	NC_021820	CGA	2	6	4403367	4403372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222452
81006	NC_021820	CAG	2	6	4403385	4403390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222452
81007	NC_021820	GC	3	6	4403410	4403415	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
81008	NC_021820	TCAT	2	8	4403608	4403615	25 %	50 %	0 %	25 %	526222452
81009	NC_021820	CTGA	2	8	4403616	4403623	25 %	25 %	25 %	25 %	526222452
81010	NC_021820	GC	3	6	4403687	4403692	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
81011	NC_021820	TGT	2	6	4403827	4403832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222452
81012	NC_021820	ATC	2	6	4403857	4403862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222452
81013	NC_021820	CGC	2	6	4403886	4403891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
81014	NC_021820	CGC	2	6	4403903	4403908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
81015	NC_021820	CGC	2	6	4403963	4403968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
81016	NC_021820	ACAA	2	8	4404073	4404080	75 %	0 %	0 %	25 %	526222452
81017	NC_021820	CGC	2	6	4404098	4404103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
81018	NC_021820	A	6	6	4404124	4404129	100 %	0 %	0 %	0 %	526222452
81019	NC_021820	TCT	2	6	4404178	4404183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222452
81020	NC_021820	CGAT	2	8	4404244	4404251	25 %	25 %	25 %	25 %	526222452
81021	NC_021820	GAT	2	6	4404256	4404261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222452
81022	NC_021820	CAC	2	6	4404295	4404300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222452
81023	NC_021820	TGC	2	6	4404301	4404306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222452
81024	NC_021820	GC	3	6	4404321	4404326	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
81025	NC_021820	TCC	2	6	4404358	4404363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222452
81026	NC_021820	GGC	2	6	4404370	4404375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
81027	NC_021820	CGAT	2	8	4404409	4404416	25 %	25 %	25 %	25 %	526222452
81028	NC_021820	ACC	2	6	4404457	4404462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222452
81029	NC_021820	CG	3	6	4404473	4404478	0 %	0 %	50 %	50 %	526222452
81030	NC_021820	CGC	2	6	4404496	4404501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
81031	NC_021820	CAA	2	6	4404528	4404533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222452
81032	NC_021820	ACA	2	6	4404563	4404568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222452
81033	NC_021820	TAA	2	6	4404660	4404665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222452
81034	NC_021820	TTC	2	6	4404696	4404701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222452
81035	NC_021820	GGC	2	6	4404801	4404806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
81036	NC_021820	ACC	2	6	4404820	4404825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222452
81037	NC_021820	TTC	2	6	4404831	4404836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222452
81038	NC_021820	ACGG	2	8	4404845	4404852	25 %	0 %	50 %	25 %	526222452
81039	NC_021820	GCG	2	6	4404859	4404864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222452
81040	NC_021820	GCC	2	6	4404867	4404872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222452
81041	NC_021820	TCAA	2	8	4404940	4404947	50 %	25 %	0 %	25 %	526222452
81042	NC_021820	CAT	2	6	4404995	4405000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222452
81043	NC_021820	TGC	2	6	4405031	4405036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81044	NC_021820	CCA	2	6	4405143	4405148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222453
81045	NC_021820	TGG	2	6	4405154	4405159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222453
81046	NC_021820	GAT	2	6	4405204	4405209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222453
81047	NC_021820	CTT	2	6	4405269	4405274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222453
81048	NC_021820	GCG	2	6	4405287	4405292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222453
81049	NC_021820	CTG	2	6	4405318	4405323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81050	NC_021820	TCG	2	6	4405580	4405585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81051	NC_021820	ACC	2	6	4405670	4405675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222453
81052	NC_021820	TTG	2	6	4405682	4405687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222453
81053	NC_021820	CGC	2	6	4405708	4405713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222453
81054	NC_021820	AG	3	6	4405739	4405744	50 %	0 %	50 %	0 %	526222453
81055	NC_021820	GCA	2	6	4405848	4405853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81056	NC_021820	TCA	2	6	4405865	4405870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222453
81057	NC_021820	ATC	2	6	4405895	4405900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222453
81058	NC_021820	CAT	2	6	4405951	4405956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222453
81059	NC_021820	TCC	2	6	4405991	4405996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222453
81060	NC_021820	CGT	2	6	4406001	4406006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81061	NC_021820	TTG	2	6	4406087	4406092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222453
81062	NC_021820	TAG	2	6	4406097	4406102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222453
81063	NC_021820	GCC	2	6	4406113	4406118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222453
81064	NC_021820	GCC	2	6	4406123	4406128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222453
81065	NC_021820	GCTGA	2	10	4406134	4406143	20 %	20 %	40 %	20 %	526222453
81066	NC_021820	ATC	2	6	4406356	4406361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222453
81067	NC_021820	TGC	2	6	4406414	4406419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81068	NC_021820	TTA	2	6	4406486	4406491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526222453
81069	NC_021820	GC	3	6	4406521	4406526	0 %	0 %	50 %	50 %	526222453
81070	NC_021820	GCG	2	6	4406532	4406537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222453
81071	NC_021820	TCA	2	6	4406538	4406543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222453
81072	NC_021820	CGC	2	6	4406593	4406598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222453
81073	NC_021820	GCCA	2	8	4406639	4406646	25 %	0 %	25 %	50 %	526222453
81074	NC_021820	TATC	2	8	4406730	4406737	25 %	50 %	0 %	25 %	526222453
81075	NC_021820	CGA	2	6	4406778	4406783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81076	NC_021820	TCA	2	6	4406786	4406791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222453
81077	NC_021820	CGC	2	6	4406838	4406843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222453
81078	NC_021820	ATCGG	2	10	4406858	4406867	20 %	20 %	40 %	20 %	526222453
81079	NC_021820	AG	3	6	4406914	4406919	50 %	0 %	50 %	0 %	526222453
81080	NC_021820	TGC	2	6	4406970	4406975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81081	NC_021820	GC	3	6	4406982	4406987	0 %	0 %	50 %	50 %	526222453
81082	NC_021820	GCA	2	6	4407015	4407020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81083	NC_021820	AAT	2	6	4407049	4407054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222453
81084	NC_021820	TGA	2	6	4407075	4407080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222453
81085	NC_021820	T	6	6	4407100	4407105	0 %	100 %	0 %	0 %	526222453
81086	NC_021820	GCG	2	6	4407137	4407142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222453
81087	NC_021820	TTA	2	6	4407170	4407175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526222453
81088	NC_021820	TCA	2	6	4407192	4407197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222453
81089	NC_021820	GCC	2	6	4407283	4407288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222453
81090	NC_021820	GC	3	6	4407364	4407369	0 %	0 %	50 %	50 %	526222453
81091	NC_021820	CGTTCG	2	12	4407398	4407409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
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81093	NC_021820	T	7	7	4407586	4407592	0 %	100 %	0 %	0 %	526222453
81094	NC_021820	TGA	2	6	4407635	4407640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222453
81095	NC_021820	CAC	2	6	4407670	4407675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222453
81096	NC_021820	CGGAT	2	10	4407703	4407712	20 %	20 %	40 %	20 %	526222453
81097	NC_021820	ACC	2	6	4407722	4407727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222453
81098	NC_021820	CAATAA	2	12	4407847	4407858	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526222453
81099	NC_021820	TGC	2	6	4407873	4407878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222453
81100	NC_021820	CTTCGC	2	12	4408176	4408187	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526221389
81101	NC_021820	CAT	2	6	4408195	4408200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221389
81102	NC_021820	ATC	2	6	4408249	4408254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221389
81103	NC_021820	GTC	2	6	4408255	4408260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221389
81104	NC_021820	CAT	2	6	4408269	4408274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221389
81105	NC_021820	GCC	2	6	4408306	4408311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221389
81106	NC_021820	CCG	2	6	4408460	4408465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221389
81107	NC_021820	AAT	2	6	4408541	4408546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221389
81108	NC_021820	TCC	2	6	4408550	4408555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221389
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81110	NC_021820	TGC	2	6	4408658	4408663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221389
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81112	NC_021820	CGT	2	6	4408755	4408760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221389
81113	NC_021820	CT	3	6	4408850	4408855	0 %	50 %	0 %	50 %	526221389
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81115	NC_021820	GACT	2	8	4408997	4409004	25 %	25 %	25 %	25 %	526221389
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81232	NC_021820	AATA	2	8	4414767	4414774	75 %	25 %	0 %	0 %	526221392
81233	NC_021820	C	6	6	4414830	4414835	0 %	0 %	0 %	100 %	526221392
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81337	NC_021820	ATC	2	6	4421147	4421152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221398
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81341	NC_021820	AGT	2	6	4421359	4421364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221398
81342	NC_021820	CTG	2	6	4421369	4421374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221398
81343	NC_021820	AGCG	2	8	4421403	4421410	25 %	0 %	50 %	25 %	526221398
81344	NC_021820	GC	3	6	4421658	4421663	0 %	0 %	50 %	50 %	526221398
81345	NC_021820	GCG	2	6	4421697	4421702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221398
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81456	NC_021820	TGT	2	6	4428147	4428152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221402
81457	NC_021820	CTG	2	6	4428256	4428261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221402
81458	NC_021820	ACC	2	6	4428299	4428304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221402
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81460	NC_021820	CCG	2	6	4428342	4428347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221402
81461	NC_021820	GGC	2	6	4428429	4428434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221402
81462	NC_021820	TACGC	2	10	4428448	4428457	20 %	20 %	20 %	40 %	526221402
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81468	NC_021820	GCC	2	6	4428788	4428793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221402
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