MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
80001	NC_021820	CGT	2	6	4346148	4346153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222443
80002	NC_021820	GGC	2	6	4346174	4346179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222443
80003	NC_021820	GCA	3	9	4346183	4346191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222443
80004	NC_021820	CTG	2	6	4346250	4346255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222443
80005	NC_021820	CAG	2	6	4346277	4346282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222443
80006	NC_021820	CCG	2	6	4346302	4346307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222443
80007	NC_021820	CGT	2	6	4346315	4346320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222443
80008	NC_021820	ACC	2	6	4346398	4346403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222443
80009	NC_021820	TAG	2	6	4346430	4346435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222444
80010	NC_021820	CCG	2	6	4346505	4346510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222444
80011	NC_021820	CGC	2	6	4346569	4346574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222444
80012	NC_021820	GC	3	6	4346587	4346592	0 %	0 %	50 %	50 %	526222444
80013	NC_021820	CAT	2	6	4346593	4346598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222444
80014	NC_021820	CTTGT	2	10	4346636	4346645	0 %	60 %	20 %	20 %	526222444
80015	NC_021820	T	6	6	4346653	4346658	0 %	100 %	0 %	0 %	526222444
80016	NC_021820	GAA	2	6	4346768	4346773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222444
80017	NC_021820	CCG	2	6	4346800	4346805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222444
80018	NC_021820	CG	3	6	4346804	4346809	0 %	0 %	50 %	50 %	526222444
80019	NC_021820	CTT	2	6	4346935	4346940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222444
80020	NC_021820	GGCGCG	2	12	4346975	4346986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222444
80021	NC_021820	GCA	2	6	4347088	4347093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222444
80022	NC_021820	GA	3	6	4347127	4347132	50 %	0 %	50 %	0 %	526222444
80023	NC_021820	CAA	2	6	4347145	4347150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222444
80024	NC_021820	CAA	2	6	4347241	4347246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222444
80025	NC_021820	AATC	2	8	4347442	4347449	50 %	25 %	0 %	25 %	526222444
80026	NC_021820	GCG	2	6	4347520	4347525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222444
80027	NC_021820	GC	3	6	4347633	4347638	0 %	0 %	50 %	50 %	526222444
80028	NC_021820	T	6	6	4347812	4347817	0 %	100 %	0 %	0 %	526222444
80029	NC_021820	CGG	2	6	4347854	4347859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222444
80030	NC_021820	GCC	2	6	4347963	4347968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222444
80031	NC_021820	ATC	2	6	4347974	4347979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222444
80032	NC_021820	ACG	2	6	4347998	4348003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222444
80033	NC_021820	GC	3	6	4348169	4348174	0 %	0 %	50 %	50 %	526222444
80034	NC_021820	CAGT	2	8	4348204	4348211	25 %	25 %	25 %	25 %	526222444
80035	NC_021820	GTC	2	6	4348221	4348226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222444
80036	NC_021820	TCA	2	6	4348647	4348652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222445
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80038	NC_021820	GCCT	2	8	4348698	4348705	0 %	25 %	25 %	50 %	526222445
80039	NC_021820	GCC	2	6	4348731	4348736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222445
80040	NC_021820	GCG	2	6	4348826	4348831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222445
80041	NC_021820	ACT	2	6	4348860	4348865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222445
80042	NC_021820	CCA	2	6	4348896	4348901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222445
80043	NC_021820	CGT	2	6	4348942	4348947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222445
80044	NC_021820	CCG	2	6	4349268	4349273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222446
80045	NC_021820	ATG	2	6	4349358	4349363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222446
80046	NC_021820	GCC	2	6	4349432	4349437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222446
80047	NC_021820	ACC	2	6	4349463	4349468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222446
80048	NC_021820	CAT	2	6	4349525	4349530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222446
80049	NC_021820	T	7	7	4349564	4349570	0 %	100 %	0 %	0 %	526222446
80050	NC_021820	TGC	2	6	4349600	4349605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222446
80051	NC_021820	GAT	2	6	4349636	4349641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222446
80052	NC_021820	CGC	3	9	4349668	4349676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222446
80053	NC_021820	CAC	2	6	4349702	4349707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222446
80054	NC_021820	GCC	2	6	4351947	4351952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221353
80055	NC_021820	CGCGT	2	10	4351985	4351994	0 %	20 %	40 %	40 %	526221353
80056	NC_021820	CTT	2	6	4351995	4352000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221353
80057	NC_021820	ATC	2	6	4352038	4352043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221353
80058	NC_021820	GC	3	6	4352117	4352122	0 %	0 %	50 %	50 %	526221353
80059	NC_021820	TGA	2	6	4352307	4352312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221353
80060	NC_021820	CG	3	6	4352321	4352326	0 %	0 %	50 %	50 %	526221353
80061	NC_021820	ATTA	2	8	4352341	4352348	50 %	50 %	0 %	0 %	526221353
80062	NC_021820	GCA	2	6	4352372	4352377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221353
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80065	NC_021820	GA	3	6	4352907	4352912	50 %	0 %	50 %	0 %	526221354
80066	NC_021820	CAG	2	6	4352916	4352921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221354
80067	NC_021820	CTT	2	6	4353027	4353032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221354
80068	NC_021820	GTC	2	6	4353061	4353066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221354
80069	NC_021820	ACCA	2	8	4353067	4353074	50 %	0 %	0 %	50 %	526221354
80070	NC_021820	TTC	2	6	4353178	4353183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221354
80071	NC_021820	TTC	2	6	4353199	4353204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221354
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80077	NC_021820	TGCCTT	2	12	4353411	4353422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	526221354
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80081	NC_021820	TGA	2	6	4353552	4353557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221354
80082	NC_021820	TCA	2	6	4353561	4353566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221354
80083	NC_021820	TTCAG	2	10	4353602	4353611	20 %	40 %	20 %	20 %	526221354
80084	NC_021820	GCA	3	9	4353644	4353652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221354
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80088	NC_021820	GAT	2	6	4353976	4353981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221354
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80090	NC_021820	GGC	2	6	4354127	4354132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221355
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80099	NC_021820	CTG	2	6	4354400	4354405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221355
80100	NC_021820	GCC	2	6	4354424	4354429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221355
80101	NC_021820	TCAA	2	8	4354572	4354579	50 %	25 %	0 %	25 %	526221355
80102	NC_021820	GC	3	6	4354637	4354642	0 %	0 %	50 %	50 %	526221355
80103	NC_021820	GCC	2	6	4354679	4354684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221355
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80105	NC_021820	ACC	2	6	4354787	4354792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221355
80106	NC_021820	AT	3	6	4354839	4354844	50 %	50 %	0 %	0 %	526221355
80107	NC_021820	CTT	2	6	4354885	4354890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221355
80108	NC_021820	ATC	2	6	4354961	4354966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221355
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80111	NC_021820	GCC	2	6	4355190	4355195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221355
80112	NC_021820	AGGTA	2	10	4355196	4355205	40 %	20 %	40 %	0 %	526221355
80113	NC_021820	CCG	2	6	4355307	4355312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221355
80114	NC_021820	CCA	2	6	4355317	4355322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221355
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80116	NC_021820	GCG	2	6	4355474	4355479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221355
80117	NC_021820	CAGGTC	2	12	4355516	4355527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526221355
80118	NC_021820	ATG	2	6	4355619	4355624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221355
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80348	NC_021820	GGCG	2	8	4368358	4368365	0 %	0 %	75 %	25 %	526221362
80349	NC_021820	GC	3	6	4368502	4368507	0 %	0 %	50 %	50 %	526221362
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80464	NC_021820	TGC	2	6	4375035	4375040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221369
80465	NC_021820	AG	3	6	4375063	4375068	50 %	0 %	50 %	0 %	526221369
80466	NC_021820	TTA	2	6	4375098	4375103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221369
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80470	NC_021820	TGA	2	6	4375176	4375181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221369
80471	NC_021820	CGC	2	6	4375211	4375216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221369
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80474	NC_021820	AGG	2	6	4375395	4375400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221369
80475	NC_021820	GA	3	6	4375452	4375457	50 %	0 %	50 %	0 %	526221369
80476	NC_021820	CTG	2	6	4375478	4375483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221369
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80483	NC_021820	CTG	2	6	4376459	4376464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221370
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80488	NC_021820	TCG	2	6	4376637	4376642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221370
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80490	NC_021820	CGGCG	2	10	4376686	4376695	0 %	0 %	60 %	40 %	526221370
80491	NC_021820	CCG	2	6	4376718	4376723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221370
80492	NC_021820	TGGC	2	8	4376756	4376763	0 %	25 %	50 %	25 %	526221370
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