MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021820	GCA	2	6	402067	402072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218325
7502	NC_021820	CGC	2	6	402139	402144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218325
7503	NC_021820	TG	3	6	402146	402151	0 %	50 %	50 %	0 %	526218325
7504	NC_021820	GAC	2	6	402152	402157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218325
7505	NC_021820	ATT	2	6	402164	402169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218325
7506	NC_021820	CGG	2	6	402247	402252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218325
7507	NC_021820	GGCGC	2	10	402290	402299	0 %	0 %	60 %	40 %	526218325
7508	NC_021820	CAA	2	6	402313	402318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218325
7509	NC_021820	TGA	3	9	402348	402356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218325
7510	NC_021820	ATC	2	6	402404	402409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218325
7511	NC_021820	TGA	2	6	402411	402416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218325
7512	NC_021820	ACG	2	6	402420	402425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218325
7513	NC_021820	GCG	2	6	402479	402484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218325
7514	NC_021820	GCC	2	6	402518	402523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218325
7515	NC_021820	GGC	2	6	402571	402576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218325
7516	NC_021820	TCG	2	6	402592	402597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218325
7517	NC_021820	AGA	2	6	402634	402639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218325
7518	NC_021820	GCC	2	6	402658	402663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218325
7519	NC_021820	TGG	2	6	402684	402689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218325
7520	NC_021820	TGA	2	6	402762	402767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218326
7521	NC_021820	GAT	2	6	402892	402897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218326
7522	NC_021820	GGT	2	6	402931	402936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218326
7523	NC_021820	CCA	2	6	402954	402959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218326
7524	NC_021820	T	6	6	402980	402985	0 %	100 %	0 %	0 %	526218326
7525	NC_021820	TGA	2	6	403016	403021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218327
7526	NC_021820	TCA	2	6	403129	403134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218327
7527	NC_021820	GGC	2	6	403194	403199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218327
7528	NC_021820	ATC	2	6	403203	403208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218327
7529	NC_021820	CGC	2	6	403244	403249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218327
7530	NC_021820	ATT	2	6	403299	403304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218327
7531	NC_021820	CAT	2	6	403307	403312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218327
7532	NC_021820	GCC	2	6	403341	403346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218327
7533	NC_021820	TTCA	2	8	403374	403381	25 %	50 %	0 %	25 %	526218327
7534	NC_021820	ATC	2	6	403428	403433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218327
7535	NC_021820	A	8	8	403476	403483	100 %	0 %	0 %	0 %	526218327
7536	NC_021820	CGG	2	6	403508	403513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218327
7537	NC_021820	GTC	2	6	403533	403538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218327
7538	NC_021820	GAT	2	6	403541	403546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218327
7539	NC_021820	GCC	2	6	403611	403616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218327
7540	NC_021820	AGC	2	6	403618	403623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218327
7541	NC_021820	TCA	2	6	403639	403644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218327
7542	NC_021820	TCA	2	6	403670	403675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218327
7543	NC_021820	CG	3	6	403693	403698	0 %	0 %	50 %	50 %	526218327
7544	NC_021820	TGG	2	6	404131	404136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218328
7545	NC_021820	ACCA	2	8	404151	404158	50 %	0 %	0 %	50 %	526218328
7546	NC_021820	AAG	2	6	404167	404172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218328
7547	NC_021820	GCG	2	6	404209	404214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218328
7548	NC_021820	GGC	2	6	404237	404242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218328
7549	NC_021820	CGA	2	6	404285	404290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218328
7550	NC_021820	ACA	2	6	404302	404307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218328
7551	NC_021820	ACG	2	6	404340	404345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218328
7552	NC_021820	CAG	2	6	404369	404374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218328
7553	NC_021820	ATC	2	6	404424	404429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218328
7554	NC_021820	TC	3	6	404447	404452	0 %	50 %	0 %	50 %	526218328
7555	NC_021820	ATCG	2	8	404463	404470	25 %	25 %	25 %	25 %	526218328
7556	NC_021820	CG	3	6	404469	404474	0 %	0 %	50 %	50 %	526218328
7557	NC_021820	A	7	7	404486	404492	100 %	0 %	0 %	0 %	526218328
7558	NC_021820	TTA	2	6	404580	404585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218328
7559	NC_021820	ATT	2	6	404751	404756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218328
7560	NC_021820	GC	3	6	404776	404781	0 %	0 %	50 %	50 %	526218328
7561	NC_021820	GCG	2	6	404845	404850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218328
7562	NC_021820	TAC	2	6	404883	404888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218328
7563	NC_021820	GCC	2	6	404910	404915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218328
7564	NC_021820	A	6	6	404919	404924	100 %	0 %	0 %	0 %	526218328
7565	NC_021820	T	6	6	405257	405262	0 %	100 %	0 %	0 %	526218329
7566	NC_021820	A	7	7	405291	405297	100 %	0 %	0 %	0 %	526218329
7567	NC_021820	CGG	2	6	405442	405447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218329
7568	NC_021820	GAT	2	6	405464	405469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218329
7569	NC_021820	CGGCG	2	10	405527	405536	0 %	0 %	60 %	40 %	526218329
7570	NC_021820	GTG	2	6	405693	405698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218329
7571	NC_021820	CTG	2	6	405711	405716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218329
7572	NC_021820	T	6	6	405951	405956	0 %	100 %	0 %	0 %	526218329
7573	NC_021820	TGA	2	6	405982	405987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218329
7574	NC_021820	GC	3	6	406033	406038	0 %	0 %	50 %	50 %	526218329
7575	NC_021820	TGGCGC	2	12	406054	406065	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218329
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7577	NC_021820	CGGCG	2	10	406208	406217	0 %	0 %	60 %	40 %	526218329
7578	NC_021820	CGC	2	6	406358	406363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218329
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7583	NC_021820	TTACGG	2	12	406455	406466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526218330
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7585	NC_021820	GAT	2	6	406549	406554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218330
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7587	NC_021820	TTGCT	2	10	406645	406654	0 %	60 %	20 %	20 %	526218330
7588	NC_021820	AGA	2	6	406693	406698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218330
7589	NC_021820	GAC	2	6	406739	406744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218330
7590	NC_021820	CTGG	2	8	406747	406754	0 %	25 %	50 %	25 %	526218330
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7593	NC_021820	GC	3	6	406857	406862	0 %	0 %	50 %	50 %	526218330
7594	NC_021820	TGGC	2	8	407036	407043	0 %	25 %	50 %	25 %	526218330
7595	NC_021820	TTC	2	6	407123	407128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218330
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7604	NC_021820	GCG	2	6	407606	407611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218331
7605	NC_021820	GTAT	2	8	407617	407624	25 %	50 %	25 %	0 %	526218331
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7609	NC_021820	GC	4	8	407750	407757	0 %	0 %	50 %	50 %	526218331
7610	NC_021820	TC	3	6	407763	407768	0 %	50 %	0 %	50 %	526218331
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7620	NC_021820	TCT	2	6	408109	408114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218332
7621	NC_021820	CCG	2	6	408115	408120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218332
7622	NC_021820	GGC	2	6	408173	408178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218332
7623	NC_021820	TGC	2	6	408214	408219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218332
7624	NC_021820	CG	3	6	408226	408231	0 %	0 %	50 %	50 %	526218332
7625	NC_021820	GCT	2	6	408263	408268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218332
7626	NC_021820	TGA	2	6	408316	408321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218332
7627	NC_021820	GT	3	6	408328	408333	0 %	50 %	50 %	0 %	526218332
7628	NC_021820	CCG	2	6	408418	408423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218332
7629	NC_021820	CCCTG	2	10	408439	408448	0 %	20 %	20 %	60 %	526218332
7630	NC_021820	CTG	2	6	408483	408488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218332
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7632	NC_021820	GCGG	2	8	408604	408611	0 %	0 %	75 %	25 %	526218332
7633	NC_021820	ATCTG	2	10	408613	408622	20 %	40 %	20 %	20 %	526218332
7634	NC_021820	CTG	3	9	408627	408635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218332
7635	NC_021820	CTG	2	6	408670	408675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218332
7636	NC_021820	TGGC	2	8	408737	408744	0 %	25 %	50 %	25 %	526218332
7637	NC_021820	GC	3	6	408748	408753	0 %	0 %	50 %	50 %	526218332
7638	NC_021820	TGA	2	6	408766	408771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218332
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7640	NC_021820	ATC	2	6	408808	408813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218332
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7642	NC_021820	GC	3	6	408921	408926	0 %	0 %	50 %	50 %	526218332
7643	NC_021820	TCT	2	6	408947	408952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218332
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7645	NC_021820	GCG	2	6	408971	408976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218332
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7652	NC_021820	GTCA	2	8	409239	409246	25 %	25 %	25 %	25 %	526218332
7653	NC_021820	ATGCCA	2	12	409342	409353	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526218332
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7657	NC_021820	CGG	2	6	409490	409495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218332
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7678	NC_021820	TGG	2	6	410482	410487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218333
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7728	NC_021820	A	6	6	413588	413593	100 %	0 %	0 %	0 %	526221781
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7731	NC_021820	AGA	2	6	413724	413729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221781
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7733	NC_021820	TAT	2	6	413905	413910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221781
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7735	NC_021820	AATT	2	8	414003	414010	50 %	50 %	0 %	0 %	526221781
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7738	NC_021820	ATGGT	2	10	414293	414302	20 %	40 %	40 %	0 %	526221782
7739	NC_021820	GTG	2	6	414499	414504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221782
7740	NC_021820	TGCT	2	8	414509	414516	0 %	50 %	25 %	25 %	526221782
7741	NC_021820	AGC	2	6	414533	414538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221782
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7952	NC_021820	CTG	2	6	426581	426586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218345
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7980	NC_021820	CAT	2	6	428022	428027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218347
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7989	NC_021820	A	6	6	428395	428400	100 %	0 %	0 %	0 %	526218348
7990	NC_021820	CG	3	6	428401	428406	0 %	0 %	50 %	50 %	526218348
7991	NC_021820	GCG	2	6	428493	428498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218348
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