MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_021820	CG	3	6	4240428	4240433	0 %	0 %	50 %	50 %	526221268
78002	NC_021820	GCA	2	6	4240541	4240546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221268
78003	NC_021820	GTA	2	6	4240582	4240587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221268
78004	NC_021820	ATA	2	6	4240878	4240883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222422
78005	NC_021820	GCA	2	6	4240953	4240958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222422
78006	NC_021820	GAA	2	6	4240982	4240987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222422
78007	NC_021820	CAT	3	9	4241080	4241088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222422
78008	NC_021820	GAA	2	6	4241099	4241104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222422
78009	NC_021820	GC	3	6	4241115	4241120	0 %	0 %	50 %	50 %	526222422
78010	NC_021820	CCATCA	2	12	4241194	4241205	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	526222422
78011	NC_021820	GGAAT	2	10	4241209	4241218	40 %	20 %	40 %	0 %	526222422
78012	NC_021820	GGT	2	6	4241224	4241229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222422
78013	NC_021820	CGGCAA	2	12	4241254	4241265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222422
78014	NC_021820	TGC	2	6	4241292	4241297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222422
78015	NC_021820	ATG	2	6	4241312	4241317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222422
78016	NC_021820	ACG	2	6	4241352	4241357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222422
78017	NC_021820	ACT	2	6	4241370	4241375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222422
78018	NC_021820	CGA	2	6	4241377	4241382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222422
78019	NC_021820	ATG	2	6	4241394	4241399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222422
78020	NC_021820	AACTG	2	10	4241410	4241419	40 %	20 %	20 %	20 %	526222422
78021	NC_021820	CTA	2	6	4241437	4241442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222422
78022	NC_021820	ATG	2	6	4241657	4241662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222422
78023	NC_021820	AAC	2	6	4241804	4241809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222422
78024	NC_021820	TGA	2	6	4241811	4241816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222422
78025	NC_021820	CTGGT	2	10	4241829	4241838	0 %	40 %	40 %	20 %	526222422
78026	NC_021820	CAA	2	6	4241866	4241871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222422
78027	NC_021820	GCG	3	9	4241904	4241912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222422
78028	NC_021820	CG	3	6	4242034	4242039	0 %	0 %	50 %	50 %	526222422
78029	NC_021820	CA	3	6	4242070	4242075	50 %	0 %	0 %	50 %	526222422
78030	NC_021820	GAA	2	6	4242092	4242097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222422
78031	NC_021820	CCG	2	6	4242111	4242116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222422
78032	NC_021820	ATGCA	2	10	4242134	4242143	40 %	20 %	20 %	20 %	526222422
78033	NC_021820	ACG	2	6	4242216	4242221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222422
78034	NC_021820	ATC	2	6	4242307	4242312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221269
78035	NC_021820	ATT	2	6	4242313	4242318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221269
78036	NC_021820	CGC	2	6	4242330	4242335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221269
78037	NC_021820	GCG	2	6	4242394	4242399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221269
78038	NC_021820	ACA	2	6	4242416	4242421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221269
78039	NC_021820	GC	3	6	4242456	4242461	0 %	0 %	50 %	50 %	526221269
78040	NC_021820	GAT	2	6	4242463	4242468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221269
78041	NC_021820	GATGCC	2	12	4242547	4242558	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526221269
78042	NC_021820	GCC	2	6	4242633	4242638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221269
78043	NC_021820	CAG	2	6	4242676	4242681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221269
78044	NC_021820	CGG	3	9	4242735	4242743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221269
78045	NC_021820	CGC	2	6	4242810	4242815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221269
78046	NC_021820	CTG	3	9	4242892	4242900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221269
78047	NC_021820	GCC	2	6	4242991	4242996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221269
78048	NC_021820	GC	3	6	4243024	4243029	0 %	0 %	50 %	50 %	526221269
78049	NC_021820	TGC	2	6	4243136	4243141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221269
78050	NC_021820	CGG	2	6	4243194	4243199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221269
78051	NC_021820	CGC	2	6	4243205	4243210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221269
78052	NC_021820	GTCAAA	2	12	4243231	4243242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526221269
78053	NC_021820	GTGA	2	8	4243372	4243379	25 %	25 %	50 %	0 %	526221269
78054	NC_021820	CCG	2	6	4243580	4243585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221270
78055	NC_021820	CG	4	8	4243646	4243653	0 %	0 %	50 %	50 %	526221270
78056	NC_021820	CGC	2	6	4243677	4243682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221270
78057	NC_021820	CTG	2	6	4243717	4243722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221270
78058	NC_021820	CAT	2	6	4243755	4243760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221270
78059	NC_021820	GCC	2	6	4243809	4243814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221270
78060	NC_021820	GC	3	6	4243902	4243907	0 %	0 %	50 %	50 %	526221270
78061	NC_021820	GGC	2	6	4243909	4243914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221270
78062	NC_021820	GC	3	6	4243941	4243946	0 %	0 %	50 %	50 %	526221270
78063	NC_021820	CCGC	2	8	4243978	4243985	0 %	0 %	25 %	75 %	526221270
78064	NC_021820	CGC	2	6	4244010	4244015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221270
78065	NC_021820	GC	4	8	4244024	4244031	0 %	0 %	50 %	50 %	526221270
78066	NC_021820	CGG	2	6	4244166	4244171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221270
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78068	NC_021820	GC	3	6	4244232	4244237	0 %	0 %	50 %	50 %	526221270
78069	NC_021820	CCG	2	6	4244285	4244290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221270
78070	NC_021820	GCC	2	6	4244321	4244326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221270
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78074	NC_021820	CAGA	2	8	4244545	4244552	50 %	0 %	25 %	25 %	526221270
78075	NC_021820	CGG	2	6	4244587	4244592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221270
78076	NC_021820	GGC	2	6	4244609	4244614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221270
78077	NC_021820	ACG	2	6	4244647	4244652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221270
78078	NC_021820	CGC	2	6	4244661	4244666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221270
78079	NC_021820	GTC	2	6	4244683	4244688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221270
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78082	NC_021820	CAA	2	6	4244833	4244838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221270
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78084	NC_021820	CACC	2	8	4244871	4244878	25 %	0 %	0 %	75 %	526221270
78085	NC_021820	CTCA	2	8	4244902	4244909	25 %	25 %	0 %	50 %	526221270
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78087	NC_021820	CAG	2	6	4244962	4244967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221270
78088	NC_021820	CGCGC	2	10	4244972	4244981	0 %	0 %	40 %	60 %	526221270
78089	NC_021820	GCA	2	6	4245048	4245053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221270
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78099	NC_021820	GC	4	8	4245513	4245520	0 %	0 %	50 %	50 %	526221270
78100	NC_021820	ACG	2	6	4245531	4245536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221270
78101	NC_021820	GC	3	6	4245556	4245561	0 %	0 %	50 %	50 %	526221270
78102	NC_021820	GCG	2	6	4245564	4245569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221270
78103	NC_021820	CAG	2	6	4245613	4245618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221270
78104	NC_021820	ACG	3	9	4245623	4245631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221270
78105	NC_021820	AC	3	6	4245646	4245651	50 %	0 %	0 %	50 %	526221270
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78116	NC_021820	ACC	2	6	4246134	4246139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221271
78117	NC_021820	TGA	2	6	4246315	4246320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221271
78118	NC_021820	ACG	2	6	4246386	4246391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221271
78119	NC_021820	ATG	2	6	4246440	4246445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221271
78120	NC_021820	TCA	2	6	4246453	4246458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221271
78121	NC_021820	TTCC	2	8	4246736	4246743	0 %	50 %	0 %	50 %	526221272
78122	NC_021820	TAAT	2	8	4246758	4246765	50 %	50 %	0 %	0 %	526221272
78123	NC_021820	TGCG	2	8	4246910	4246917	0 %	25 %	50 %	25 %	526221272
78124	NC_021820	ATC	2	6	4246942	4246947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221272
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78127	NC_021820	GC	3	6	4247034	4247039	0 %	0 %	50 %	50 %	526221272
78128	NC_021820	T	6	6	4247215	4247220	0 %	100 %	0 %	0 %	526221272
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78132	NC_021820	CCG	2	6	4247524	4247529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221273
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78140	NC_021820	GCC	2	6	4247844	4247849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221273
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78148	NC_021820	GCGCG	2	10	4248060	4248069	0 %	0 %	60 %	40 %	526221274
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78218	NC_021820	CTG	2	6	4251233	4251238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221277
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78225	NC_021820	CAA	2	6	4251534	4251539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221278
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78227	NC_021820	CAG	3	9	4251568	4251576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221278
78228	NC_021820	CGA	2	6	4251624	4251629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221278
78229	NC_021820	ACC	2	6	4251641	4251646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221278
78230	NC_021820	GTT	2	6	4251648	4251653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221278
78231	NC_021820	AGGCGC	2	12	4251783	4251794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526221278
78232	NC_021820	GC	3	6	4251820	4251825	0 %	0 %	50 %	50 %	526221278
78233	NC_021820	GCG	2	6	4251887	4251892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221278
78234	NC_021820	CAG	3	9	4251904	4251912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221278
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78238	NC_021820	GAC	2	6	4252078	4252083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221278
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78240	NC_021820	GAC	2	6	4252176	4252181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221278
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78322	NC_021820	TGA	2	6	4255924	4255929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221281
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78330	NC_021820	TGA	2	6	4256384	4256389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222424
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78333	NC_021820	CCGC	2	8	4256450	4256457	0 %	0 %	25 %	75 %	526222424
78334	NC_021820	CGCC	2	8	4256474	4256481	0 %	0 %	25 %	75 %	526222424
78335	NC_021820	CGC	2	6	4256535	4256540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222424
78336	NC_021820	TGC	2	6	4256714	4256719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222424
78337	NC_021820	CTG	2	6	4256734	4256739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222424
78338	NC_021820	GC	3	6	4256777	4256782	0 %	0 %	50 %	50 %	526222424
78339	NC_021820	GTGAA	2	10	4256783	4256792	40 %	20 %	40 %	0 %	526222424
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78341	NC_021820	GCG	2	6	4256828	4256833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222424
78342	NC_021820	TGGC	2	8	4256848	4256855	0 %	25 %	50 %	25 %	526222424
78343	NC_021820	CTGG	2	8	4256856	4256863	0 %	25 %	50 %	25 %	526222424
78344	NC_021820	TGA	2	6	4256981	4256986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221282
78345	NC_021820	GAAGCG	2	12	4257054	4257065	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	526221282
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78347	NC_021820	CTG	2	6	4257123	4257128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221282
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78451	NC_021820	GGCG	2	8	4262296	4262303	0 %	0 %	75 %	25 %	526221285
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78453	NC_021820	A	6	6	4262703	4262708	100 %	0 %	0 %	0 %	526221285
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78459	NC_021820	GC	3	6	4262937	4262942	0 %	0 %	50 %	50 %	526221285
78460	NC_021820	GGC	2	6	4262948	4262953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221285
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78464	NC_021820	CAA	2	6	4263068	4263073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221285
78465	NC_021820	CGC	2	6	4263174	4263179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222427
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