MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76501	NC_021820	GCAG	2	8	4156552	4156559	25 %	0 %	50 %	25 %	526222408
76502	NC_021820	ACCGCC	2	12	4156600	4156611	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	526222408
76503	NC_021820	GCC	2	6	4156711	4156716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
76504	NC_021820	CG	3	6	4156736	4156741	0 %	0 %	50 %	50 %	526222408
76505	NC_021820	ATC	2	6	4156756	4156761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222408
76506	NC_021820	GAT	2	6	4156774	4156779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222408
76507	NC_021820	GGCG	2	8	4156857	4156864	0 %	0 %	75 %	25 %	526222408
76508	NC_021820	AAC	2	6	4156882	4156887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222408
76509	NC_021820	GCT	2	6	4156893	4156898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76510	NC_021820	CAC	3	9	4156902	4156910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
76511	NC_021820	CACCGC	2	12	4156977	4156988	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	526222408
76512	NC_021820	CCG	2	6	4157021	4157026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
76513	NC_021820	G	6	6	4157142	4157147	0 %	0 %	100 %	0 %	526222408
76514	NC_021820	CAC	3	9	4157157	4157165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
76515	NC_021820	GCA	2	6	4157171	4157176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76516	NC_021820	TC	3	6	4157188	4157193	0 %	50 %	0 %	50 %	526222408
76517	NC_021820	ACAAA	2	10	4157203	4157212	80 %	0 %	0 %	20 %	526222408
76518	NC_021820	GGC	2	6	4157301	4157306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76519	NC_021820	ATAAC	2	10	4157312	4157321	60 %	20 %	0 %	20 %	526222408
76520	NC_021820	CCG	2	6	4157342	4157347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
76521	NC_021820	CTG	3	9	4157380	4157388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76522	NC_021820	GC	3	6	4157393	4157398	0 %	0 %	50 %	50 %	526222408
76523	NC_021820	GGT	2	6	4157461	4157466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222408
76524	NC_021820	GCC	2	6	4157488	4157493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
76525	NC_021820	GCT	2	6	4157514	4157519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76526	NC_021820	GAC	2	6	4157571	4157576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76527	NC_021820	GCG	2	6	4157630	4157635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76528	NC_021820	ACCAG	2	10	4157741	4157750	40 %	0 %	20 %	40 %	526222408
76529	NC_021820	TAT	2	6	4157757	4157762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526222408
76530	NC_021820	TGA	2	6	4157799	4157804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222408
76531	NC_021820	CAC	2	6	4157820	4157825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
76532	NC_021820	CCAACG	2	12	4157840	4157851	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526222408
76533	NC_021820	GCGG	2	8	4157872	4157879	0 %	0 %	75 %	25 %	526222408
76534	NC_021820	CGG	2	6	4157957	4157962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76535	NC_021820	AG	3	6	4157976	4157981	50 %	0 %	50 %	0 %	526222408
76536	NC_021820	AGC	2	6	4158016	4158021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76537	NC_021820	TTA	2	6	4158035	4158040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526222408
76538	NC_021820	GACA	2	8	4158078	4158085	50 %	0 %	25 %	25 %	526222408
76539	NC_021820	CAA	2	6	4158126	4158131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222408
76540	NC_021820	GCG	2	6	4158149	4158154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76541	NC_021820	TGA	2	6	4158204	4158209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222408
76542	NC_021820	ATC	2	6	4158223	4158228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222408
76543	NC_021820	GAA	2	6	4158238	4158243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222408
76544	NC_021820	CGG	2	6	4158279	4158284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76545	NC_021820	CAA	2	6	4158340	4158345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222408
76546	NC_021820	CTG	2	6	4158385	4158390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76547	NC_021820	GGC	2	6	4158430	4158435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76548	NC_021820	ACC	2	6	4158544	4158549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
76549	NC_021820	ATG	2	6	4158566	4158571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222408
76550	NC_021820	CTC	2	6	4158589	4158594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222408
76551	NC_021820	GCG	2	6	4158619	4158624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76552	NC_021820	GCTC	2	8	4158656	4158663	0 %	25 %	25 %	50 %	526222408
76553	NC_021820	GAA	2	6	4158699	4158704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222408
76554	NC_021820	CGATAC	2	12	4158771	4158782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526222408
76555	NC_021820	ATG	2	6	4158830	4158835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222408
76556	NC_021820	CTGG	2	8	4158879	4158886	0 %	25 %	50 %	25 %	526222408
76557	NC_021820	GCG	2	6	4159198	4159203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76558	NC_021820	CACGC	2	10	4159209	4159218	20 %	0 %	20 %	60 %	526222408
76559	NC_021820	CAC	2	6	4159227	4159232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
76560	NC_021820	CGG	2	6	4159304	4159309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76561	NC_021820	GCC	2	6	4159372	4159377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
76562	NC_021820	CGC	2	6	4159386	4159391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
76563	NC_021820	ACC	2	6	4159399	4159404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
76564	NC_021820	TACACC	2	12	4159459	4159470	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	526222408
76565	NC_021820	AAT	2	6	4159474	4159479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222408
76566	NC_021820	GTC	2	6	4159491	4159496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76567	NC_021820	ACCA	2	8	4159597	4159604	50 %	0 %	0 %	50 %	526222408
76568	NC_021820	ACC	2	6	4159649	4159654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
76569	NC_021820	CGG	2	6	4159677	4159682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76570	NC_021820	CTG	2	6	4159747	4159752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76571	NC_021820	GGC	2	6	4159770	4159775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76572	NC_021820	GCG	2	6	4159808	4159813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222408
76573	NC_021820	AAC	2	6	4159921	4159926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222408
76574	NC_021820	TCA	2	6	4160059	4160064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221209
76575	NC_021820	GCC	2	6	4160086	4160091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221209
76576	NC_021820	CTTC	2	8	4160129	4160136	0 %	50 %	0 %	50 %	526221209
76577	NC_021820	CCG	2	6	4160148	4160153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221209
76578	NC_021820	GCC	2	6	4160171	4160176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221209
76579	NC_021820	GCGCA	2	10	4160448	4160457	20 %	0 %	40 %	40 %	526221209
76580	NC_021820	GCA	2	6	4160536	4160541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221209
76581	NC_021820	GCG	2	6	4160552	4160557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221209
76582	NC_021820	GAA	2	6	4160558	4160563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221209
76583	NC_021820	TCG	2	6	4160568	4160573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221209
76584	NC_021820	GCAGC	2	10	4160602	4160611	20 %	0 %	40 %	40 %	526221209
76585	NC_021820	CT	3	6	4160630	4160635	0 %	50 %	0 %	50 %	526221209
76586	NC_021820	GTG	2	6	4160639	4160644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221209
76587	NC_021820	GAATC	2	10	4160658	4160667	40 %	20 %	20 %	20 %	526221209
76588	NC_021820	TGA	2	6	4160724	4160729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221209
76589	NC_021820	GCTG	2	8	4160730	4160737	0 %	25 %	50 %	25 %	526221209
76590	NC_021820	AAT	2	6	4160762	4160767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221209
76591	NC_021820	CGA	2	6	4160812	4160817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221209
76592	NC_021820	GCC	2	6	4160840	4160845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221209
76593	NC_021820	GC	3	6	4160889	4160894	0 %	0 %	50 %	50 %	526221209
76594	NC_021820	CGA	2	6	4160904	4160909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221209
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76597	NC_021820	GC	3	6	4161128	4161133	0 %	0 %	50 %	50 %	526221209
76598	NC_021820	TCG	2	6	4161172	4161177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221209
76599	NC_021820	CAG	2	6	4161182	4161187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221209
76600	NC_021820	CG	3	6	4161201	4161206	0 %	0 %	50 %	50 %	526221209
76601	NC_021820	CAG	2	6	4161215	4161220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221209
76602	NC_021820	CCCG	2	8	4161240	4161247	0 %	0 %	25 %	75 %	526221209
76603	NC_021820	AACTG	2	10	4161333	4161342	40 %	20 %	20 %	20 %	526221209
76604	NC_021820	GC	3	6	4161357	4161362	0 %	0 %	50 %	50 %	526221209
76605	NC_021820	ATC	2	6	4161384	4161389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221209
76606	NC_021820	GCA	2	6	4161390	4161395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221209
76607	NC_021820	CGC	2	6	4161426	4161431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221210
76608	NC_021820	AGA	2	6	4161441	4161446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221210
76609	NC_021820	GC	4	8	4161459	4161466	0 %	0 %	50 %	50 %	526221210
76610	NC_021820	CG	3	6	4161594	4161599	0 %	0 %	50 %	50 %	526221210
76611	NC_021820	GTTG	2	8	4161666	4161673	0 %	50 %	50 %	0 %	526221210
76612	NC_021820	GAA	2	6	4161748	4161753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221210
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76614	NC_021820	CTG	2	6	4162078	4162083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221210
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76616	NC_021820	CTTT	2	8	4162286	4162293	0 %	75 %	0 %	25 %	526221210
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76968	NC_021820	GGC	2	6	4181096	4181101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221217
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76988	NC_021820	GA	3	6	4183226	4183231	50 %	0 %	50 %	0 %	526221218
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76998	NC_021820	AT	3	6	4183641	4183646	50 %	50 %	0 %	0 %	526221218
76999	NC_021820	GTA	2	6	4184156	4184161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221219
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