MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76001	NC_021820	TTG	2	6	4129918	4129923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221188
76002	NC_021820	CGACTA	2	12	4130042	4130053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526221188
76003	NC_021820	GTT	2	6	4130223	4130228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221189
76004	NC_021820	CGG	3	9	4130276	4130284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221189
76005	NC_021820	CGA	2	6	4130318	4130323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221189
76006	NC_021820	GCCT	2	8	4130356	4130363	0 %	25 %	25 %	50 %	526221189
76007	NC_021820	CGC	2	6	4130387	4130392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221189
76008	NC_021820	CGA	2	6	4130441	4130446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221189
76009	NC_021820	GGT	2	6	4130471	4130476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221189
76010	NC_021820	CGG	2	6	4130504	4130509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221189
76011	NC_021820	CTA	2	6	4130561	4130566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221189
76012	NC_021820	CCG	2	6	4130657	4130662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221189
76013	NC_021820	CAT	2	6	4130737	4130742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221190
76014	NC_021820	CAC	2	6	4130751	4130756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221190
76015	NC_021820	GC	3	6	4130842	4130847	0 %	0 %	50 %	50 %	526221190
76016	NC_021820	GCG	2	6	4130901	4130906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221190
76017	NC_021820	GGC	2	6	4130914	4130919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221190
76018	NC_021820	TGC	2	6	4130955	4130960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221190
76019	NC_021820	CAC	2	6	4130983	4130988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221190
76020	NC_021820	TGT	2	6	4131021	4131026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221190
76021	NC_021820	T	6	6	4131049	4131054	0 %	100 %	0 %	0 %	526221190
76022	NC_021820	CGG	2	6	4131066	4131071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221190
76023	NC_021820	GCC	2	6	4131138	4131143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221191
76024	NC_021820	TCA	2	6	4131176	4131181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221191
76025	NC_021820	TAA	2	6	4131226	4131231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221191
76026	NC_021820	CGACC	2	10	4131270	4131279	20 %	0 %	20 %	60 %	526221192
76027	NC_021820	CA	3	6	4131331	4131336	50 %	0 %	0 %	50 %	526221192
76028	NC_021820	GC	3	6	4131396	4131401	0 %	0 %	50 %	50 %	526221192
76029	NC_021820	GCTG	2	8	4131454	4131461	0 %	25 %	50 %	25 %	526221192
76030	NC_021820	ACC	2	6	4131476	4131481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221192
76031	NC_021820	CG	3	6	4131491	4131496	0 %	0 %	50 %	50 %	526221192
76032	NC_021820	ACA	2	6	4131552	4131557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221192
76033	NC_021820	CATC	2	8	4131651	4131658	25 %	25 %	0 %	50 %	526221192
76034	NC_021820	ACA	2	6	4131665	4131670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221192
76035	NC_021820	GC	3	6	4131701	4131706	0 %	0 %	50 %	50 %	526221192
76036	NC_021820	GCA	2	6	4131715	4131720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76037	NC_021820	GCT	2	6	4131782	4131787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76038	NC_021820	TGC	2	6	4131793	4131798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76039	NC_021820	CGG	2	6	4131816	4131821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76040	NC_021820	AGCG	2	8	4131988	4131995	25 %	0 %	50 %	25 %	526221192
76041	NC_021820	ATC	2	6	4132001	4132006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221192
76042	NC_021820	GCG	2	6	4132017	4132022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76043	NC_021820	GCT	2	6	4132028	4132033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76044	NC_021820	GGC	2	6	4132042	4132047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76045	NC_021820	GGA	2	6	4132093	4132098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221192
76046	NC_021820	GCT	2	6	4132103	4132108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76047	NC_021820	CTG	2	6	4132109	4132114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76048	NC_021820	TC	3	6	4132174	4132179	0 %	50 %	0 %	50 %	526221192
76049	NC_021820	CCG	3	9	4132197	4132205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221192
76050	NC_021820	CCG	2	6	4132281	4132286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221192
76051	NC_021820	ACG	2	6	4132305	4132310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76052	NC_021820	CGGGTA	2	12	4132332	4132343	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	526221192
76053	NC_021820	GCC	2	6	4132359	4132364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221192
76054	NC_021820	GAAA	2	8	4132462	4132469	75 %	0 %	25 %	0 %	526221192
76055	NC_021820	GCAGC	2	10	4132471	4132480	20 %	0 %	40 %	40 %	526221192
76056	NC_021820	AAC	2	6	4132490	4132495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221192
76057	NC_021820	GCG	2	6	4132512	4132517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76058	NC_021820	GAG	2	6	4132541	4132546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221192
76059	NC_021820	CGG	4	12	4132554	4132565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76060	NC_021820	AGC	2	6	4132576	4132581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76061	NC_021820	CGG	2	6	4132672	4132677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76062	NC_021820	CT	3	6	4132744	4132749	0 %	50 %	0 %	50 %	526221192
76063	NC_021820	CA	3	6	4132771	4132776	50 %	0 %	0 %	50 %	526221192
76064	NC_021820	CGA	2	6	4132792	4132797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76065	NC_021820	ATT	2	6	4132838	4132843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221192
76066	NC_021820	ATC	2	6	4132871	4132876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221192
76067	NC_021820	GGC	2	6	4132877	4132882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76068	NC_021820	CAT	2	6	4132924	4132929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221192
76069	NC_021820	GCC	3	9	4132931	4132939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221192
76070	NC_021820	GCG	2	6	4133027	4133032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76071	NC_021820	CAT	2	6	4133107	4133112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221192
76072	NC_021820	GCG	2	6	4133187	4133192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221192
76073	NC_021820	GGT	2	6	4133199	4133204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221192
76074	NC_021820	CA	3	6	4133233	4133238	50 %	0 %	0 %	50 %	526221192
76075	NC_021820	GTG	2	6	4133334	4133339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221192
76076	NC_021820	A	6	6	4133375	4133380	100 %	0 %	0 %	0 %	526221192
76077	NC_021820	AGC	2	6	4133387	4133392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76078	NC_021820	GGA	2	6	4133435	4133440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221192
76079	NC_021820	CGA	2	6	4133448	4133453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76080	NC_021820	TGG	2	6	4133464	4133469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221192
76081	NC_021820	AGC	2	6	4133525	4133530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221192
76082	NC_021820	GTG	2	6	4133556	4133561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221192
76083	NC_021820	ATG	2	6	4133648	4133653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221192
76084	NC_021820	GAG	2	6	4133661	4133666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221192
76085	NC_021820	ATG	2	6	4133676	4133681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221193
76086	NC_021820	TGTTTG	2	12	4133695	4133706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221193
76087	NC_021820	CGA	2	6	4133897	4133902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221193
76088	NC_021820	TCG	2	6	4133956	4133961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221193
76089	NC_021820	CA	4	8	4133975	4133982	50 %	0 %	0 %	50 %	526221193
76090	NC_021820	GATT	2	8	4134014	4134021	25 %	50 %	25 %	0 %	526221193
76091	NC_021820	CGA	2	6	4134044	4134049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221193
76092	NC_021820	GGC	2	6	4134056	4134061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221193
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76096	NC_021820	CGA	2	6	4134319	4134324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221194
76097	NC_021820	TGGCT	2	10	4134374	4134383	0 %	40 %	40 %	20 %	526221194
76098	NC_021820	TGA	2	6	4134424	4134429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221194
76099	NC_021820	GC	3	6	4134444	4134449	0 %	0 %	50 %	50 %	526221194
76100	NC_021820	A	7	7	4134602	4134608	100 %	0 %	0 %	0 %	526221194
76101	NC_021820	CTG	2	6	4134710	4134715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221194
76102	NC_021820	GC	3	6	4134922	4134927	0 %	0 %	50 %	50 %	526221194
76103	NC_021820	AAAGC	2	10	4134941	4134950	60 %	0 %	20 %	20 %	526221194
76104	NC_021820	A	6	6	4134974	4134979	100 %	0 %	0 %	0 %	526221194
76105	NC_021820	GC	3	6	4134989	4134994	0 %	0 %	50 %	50 %	526221194
76106	NC_021820	GAC	2	6	4135039	4135044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221194
76107	NC_021820	GT	3	6	4135176	4135181	0 %	50 %	50 %	0 %	526221194
76108	NC_021820	AAT	3	9	4135244	4135252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221194
76109	NC_021820	ACG	2	6	4135259	4135264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221194
76110	NC_021820	ATG	2	6	4135403	4135408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221195
76111	NC_021820	CGC	2	6	4135429	4135434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221195
76112	NC_021820	CGAAA	2	10	4135465	4135474	60 %	0 %	20 %	20 %	526221195
76113	NC_021820	CCCCA	2	10	4135580	4135589	20 %	0 %	0 %	80 %	526221195
76114	NC_021820	CAA	2	6	4135598	4135603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221195
76115	NC_021820	GTA	2	6	4135817	4135822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221196
76116	NC_021820	CAC	2	6	4135843	4135848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221196
76117	NC_021820	GAGT	2	8	4135881	4135888	25 %	25 %	50 %	0 %	526221196
76118	NC_021820	CAA	2	6	4136014	4136019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221196
76119	NC_021820	CGGA	2	8	4136048	4136055	25 %	0 %	50 %	25 %	526221196
76120	NC_021820	TAA	2	6	4136098	4136103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221196
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76123	NC_021820	TGT	2	6	4136182	4136187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221197
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76129	NC_021820	TGC	2	6	4136700	4136705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221197
76130	NC_021820	CAT	2	6	4136733	4136738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221197
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76132	NC_021820	GTC	2	6	4136769	4136774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221197
76133	NC_021820	ACGGT	2	10	4136776	4136785	20 %	20 %	40 %	20 %	526221197
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76136	NC_021820	CAT	2	6	4137122	4137127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221198
76137	NC_021820	AGT	3	9	4137193	4137201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221198
76138	NC_021820	CTCC	2	8	4137202	4137209	0 %	25 %	0 %	75 %	526221198
76139	NC_021820	AGA	2	6	4137258	4137263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221198
76140	NC_021820	TGA	2	6	4137298	4137303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221198
76141	NC_021820	CTG	2	6	4137344	4137349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221198
76142	NC_021820	GGA	2	6	4137413	4137418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221198
76143	NC_021820	GAA	2	6	4137450	4137455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221198
76144	NC_021820	GCG	2	6	4137495	4137500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221198
76145	NC_021820	TTGC	2	8	4137503	4137510	0 %	50 %	25 %	25 %	526221198
76146	NC_021820	TCA	2	6	4137511	4137516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221198
76147	NC_021820	GCT	2	6	4137537	4137542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221199
76148	NC_021820	T	7	7	4137542	4137548	0 %	100 %	0 %	0 %	526221199
76149	NC_021820	CTT	2	6	4137550	4137555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221199
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76152	NC_021820	GAA	2	6	4137665	4137670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221199
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76165	NC_021820	TGA	2	6	4138316	4138321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221200
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76178	NC_021820	CGT	2	6	4138901	4138906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221200
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76201	NC_021820	AT	3	6	4139960	4139965	50 %	50 %	0 %	0 %	526221201
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76215	NC_021820	ATT	2	6	4140594	4140599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221202
76216	NC_021820	CGC	2	6	4140780	4140785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221202
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76218	NC_021820	CTG	2	6	4140823	4140828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
76219	NC_021820	TGA	2	6	4140845	4140850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221202
76220	NC_021820	CTG	2	6	4140886	4140891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
76221	NC_021820	TC	3	6	4140986	4140991	0 %	50 %	0 %	50 %	526221202
76222	NC_021820	TGC	2	6	4141007	4141012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
76223	NC_021820	CAT	2	6	4141050	4141055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221202
76224	NC_021820	GAC	2	6	4141093	4141098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221202
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76226	NC_021820	TGC	2	6	4141184	4141189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221202
76227	NC_021820	GCGT	2	8	4141190	4141197	0 %	25 %	50 %	25 %	526221202
76228	NC_021820	A	6	6	4141222	4141227	100 %	0 %	0 %	0 %	526221202
76229	NC_021820	GAT	2	6	4141242	4141247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221202
76230	NC_021820	GC	3	6	4141251	4141256	0 %	0 %	50 %	50 %	526221202
76231	NC_021820	CGC	2	6	4141289	4141294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221202
76232	NC_021820	AAAG	2	8	4141329	4141336	75 %	0 %	25 %	0 %	526221202
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76463	NC_021820	ACG	2	6	4154779	4154784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222408
76464	NC_021820	CGC	2	6	4154813	4154818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
76465	NC_021820	CGC	2	6	4154822	4154827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222408
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76470	NC_021820	CGA	2	6	4155002	4155007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222408
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76485	NC_021820	ACC	2	6	4155853	4155858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
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76492	NC_021820	CCA	2	6	4156139	4156144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222408
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