MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_021820	CAG	2	6	4006422	4006427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221080
74002	NC_021820	T	6	6	4006536	4006541	0 %	100 %	0 %	0 %	526221081
74003	NC_021820	AAAT	2	8	4006589	4006596	75 %	25 %	0 %	0 %	526221081
74004	NC_021820	GACGT	2	10	4006633	4006642	20 %	20 %	40 %	20 %	526221081
74005	NC_021820	CTGG	2	8	4006722	4006729	0 %	25 %	50 %	25 %	526221081
74006	NC_021820	GAA	2	6	4006815	4006820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221081
74007	NC_021820	CAG	3	9	4006824	4006832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221081
74008	NC_021820	TAT	2	6	4006871	4006876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221081
74009	NC_021820	GCC	2	6	4006878	4006883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221081
74010	NC_021820	CAG	2	6	4007052	4007057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221081
74011	NC_021820	TCC	2	6	4007118	4007123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221081
74012	NC_021820	GC	3	6	4007138	4007143	0 %	0 %	50 %	50 %	526221081
74013	NC_021820	ACC	2	6	4007173	4007178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221081
74014	NC_021820	AAC	2	6	4007200	4007205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221081
74015	NC_021820	CAT	2	6	4007216	4007221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221081
74016	NC_021820	ATT	2	6	4007337	4007342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221081
74017	NC_021820	CCG	2	6	4007461	4007466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221081
74018	NC_021820	ATC	2	6	4007518	4007523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221081
74019	NC_021820	GTG	2	6	4007600	4007605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221081
74020	NC_021820	TTGA	2	8	4007683	4007690	25 %	50 %	25 %	0 %	526221081
74021	NC_021820	AAC	2	6	4007825	4007830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221082
74022	NC_021820	TTCC	2	8	4007835	4007842	0 %	50 %	0 %	50 %	526221082
74023	NC_021820	TG	3	6	4007849	4007854	0 %	50 %	50 %	0 %	526221082
74024	NC_021820	CAT	2	6	4007903	4007908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221082
74025	NC_021820	AAC	2	6	4007924	4007929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221082
74026	NC_021820	TCA	2	6	4007935	4007940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221082
74027	NC_021820	ATT	2	6	4007952	4007957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221082
74028	NC_021820	AATTA	2	10	4007976	4007985	60 %	40 %	0 %	0 %	526221082
74029	NC_021820	ATT	2	6	4007998	4008003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221082
74030	NC_021820	AAT	2	6	4008024	4008029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221082
74031	NC_021820	A	6	6	4008039	4008044	100 %	0 %	0 %	0 %	526221082
74032	NC_021820	CTT	2	6	4008058	4008063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221082
74033	NC_021820	CT	3	6	4008393	4008398	0 %	50 %	0 %	50 %	526221082
74034	NC_021820	ATC	2	6	4008412	4008417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221082
74035	NC_021820	TAA	2	6	4008429	4008434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221082
74036	NC_021820	ACT	2	6	4008476	4008481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221082
74037	NC_021820	CGCT	2	8	4008529	4008536	0 %	25 %	25 %	50 %	526221082
74038	NC_021820	CTGC	2	8	4008651	4008658	0 %	25 %	25 %	50 %	526221082
74039	NC_021820	A	6	6	4008797	4008802	100 %	0 %	0 %	0 %	526221083
74040	NC_021820	GT	3	6	4008898	4008903	0 %	50 %	50 %	0 %	526221083
74041	NC_021820	GAA	2	6	4008986	4008991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221083
74042	NC_021820	CATG	2	8	4009207	4009214	25 %	25 %	25 %	25 %	526221084
74043	NC_021820	GCC	2	6	4009353	4009358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221084
74044	NC_021820	GCT	2	6	4009396	4009401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221084
74045	NC_021820	CG	3	6	4009536	4009541	0 %	0 %	50 %	50 %	526221085
74046	NC_021820	TTTCA	2	10	4009558	4009567	20 %	60 %	0 %	20 %	526221085
74047	NC_021820	TCA	2	6	4009590	4009595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221085
74048	NC_021820	AAT	2	6	4009606	4009611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221085
74049	NC_021820	GCC	2	6	4009715	4009720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221085
74050	NC_021820	AGC	2	6	4009788	4009793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221085
74051	NC_021820	GC	3	6	4009815	4009820	0 %	0 %	50 %	50 %	526221085
74052	NC_021820	CCG	3	9	4009827	4009835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221085
74053	NC_021820	GCC	3	9	4009886	4009894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221085
74054	NC_021820	GC	3	6	4009897	4009902	0 %	0 %	50 %	50 %	526221085
74055	NC_021820	GGT	2	6	4009954	4009959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221085
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74057	NC_021820	CGA	2	6	4010111	4010116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221085
74058	NC_021820	GCCT	2	8	4010149	4010156	0 %	25 %	25 %	50 %	526221085
74059	NC_021820	CGC	2	6	4010170	4010175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221085
74060	NC_021820	CCGGAT	2	12	4010181	4010192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526221085
74061	NC_021820	CG	3	6	4010202	4010207	0 %	0 %	50 %	50 %	526221085
74062	NC_021820	TCTT	2	8	4010278	4010285	0 %	75 %	0 %	25 %	526221086
74063	NC_021820	GTT	2	6	4010460	4010465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221086
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74070	NC_021820	CGC	2	6	4010810	4010815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221086
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74077	NC_021820	CGA	2	6	4011208	4011213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221087
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74082	NC_021820	CAG	2	6	4011451	4011456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221087
74083	NC_021820	GCA	2	6	4011511	4011516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221087
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74085	NC_021820	CGC	2	6	4011674	4011679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221087
74086	NC_021820	TCA	2	6	4011685	4011690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221087
74087	NC_021820	GC	3	6	4011702	4011707	0 %	0 %	50 %	50 %	526221087
74088	NC_021820	TTC	2	6	4011710	4011715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221087
74089	NC_021820	TCT	2	6	4011823	4011828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221087
74090	NC_021820	CGA	2	6	4011877	4011882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221087
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74100	NC_021820	CTG	2	6	4012496	4012501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221088
74101	NC_021820	CTG	2	6	4012522	4012527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221088
74102	NC_021820	TGA	2	6	4012538	4012543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221088
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74104	NC_021820	CAA	2	6	4012620	4012625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221088
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74108	NC_021820	TTTC	2	8	4013187	4013194	0 %	75 %	0 %	25 %	526221089
74109	NC_021820	CCG	2	6	4013237	4013242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221089
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74112	NC_021820	CAT	2	6	4013566	4013571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221089
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74115	NC_021820	AGCGT	2	10	4013693	4013702	20 %	20 %	40 %	20 %	526221089
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74117	NC_021820	AAAC	2	8	4013766	4013773	75 %	0 %	0 %	25 %	526221089
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74234	NC_021820	GTG	2	6	4024589	4024594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221093
74235	NC_021820	CCG	2	6	4024656	4024661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221093
74236	NC_021820	TGC	2	6	4024791	4024796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221093
74237	NC_021820	TCG	2	6	4024799	4024804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221093
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74241	NC_021820	TCAT	2	8	4025060	4025067	25 %	50 %	0 %	25 %	526221093
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74266	NC_021820	TCG	2	6	4026386	4026391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221093
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74305	NC_021820	GGC	2	6	4028295	4028300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221094
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74333	NC_021820	GC	3	6	4029658	4029663	0 %	0 %	50 %	50 %	526221096
74334	NC_021820	A	8	8	4029771	4029778	100 %	0 %	0 %	0 %	526221096
74335	NC_021820	CTC	3	9	4029888	4029896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221097
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74337	NC_021820	AG	3	6	4029938	4029943	50 %	0 %	50 %	0 %	526221097
74338	NC_021820	GGC	2	6	4029998	4030003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221097
74339	NC_021820	CGTTA	2	10	4030084	4030093	20 %	40 %	20 %	20 %	526221097
74340	NC_021820	GTT	2	6	4030108	4030113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221097
74341	NC_021820	GTT	2	6	4030131	4030136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221097
74342	NC_021820	CTC	2	6	4030235	4030240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221098
74343	NC_021820	CTG	2	6	4030263	4030268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221098
74344	NC_021820	GGC	2	6	4030284	4030289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221098
74345	NC_021820	T	7	7	4030290	4030296	0 %	100 %	0 %	0 %	526221098
74346	NC_021820	TA	3	6	4030304	4030309	50 %	50 %	0 %	0 %	526221098
74347	NC_021820	CGT	2	6	4030349	4030354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221098
74348	NC_021820	TGT	2	6	4030367	4030372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221098
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74350	NC_021820	CAC	2	6	4030436	4030441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221098
74351	NC_021820	GCAAAA	2	12	4030498	4030509	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526221098
74352	NC_021820	A	6	6	4030506	4030511	100 %	0 %	0 %	0 %	526221098
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74434	NC_021820	CTG	2	6	4034124	4034129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221101
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74442	NC_021820	GTG	2	6	4034577	4034582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221101
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74451	NC_021820	CGG	2	6	4035205	4035210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221102
74452	NC_021820	TG	3	6	4035216	4035221	0 %	50 %	50 %	0 %	526221102
74453	NC_021820	TCA	2	6	4035227	4035232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221102
74454	NC_021820	CCT	2	6	4035238	4035243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222384
74455	NC_021820	TCC	2	6	4035245	4035250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526222384
74456	NC_021820	AGG	2	6	4035274	4035279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221103
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74458	NC_021820	TCC	2	6	4035436	4035441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221103
74459	NC_021820	TAC	2	6	4035459	4035464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221103
74460	NC_021820	ACG	2	6	4035547	4035552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221103
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74462	NC_021820	CCA	2	6	4035584	4035589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221103
74463	NC_021820	CTT	2	6	4035608	4035613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221103
74464	NC_021820	GGC	2	6	4035662	4035667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221103
74465	NC_021820	GTC	2	6	4035751	4035756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221103
74466	NC_021820	CCGT	2	8	4035762	4035769	0 %	25 %	25 %	50 %	526221103
74467	NC_021820	ACT	2	6	4035968	4035973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221103
74468	NC_021820	GGGCG	2	10	4036237	4036246	0 %	0 %	80 %	20 %	526221103
74469	NC_021820	TCA	2	6	4036306	4036311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221103
74470	NC_021820	A	7	7	4036314	4036320	100 %	0 %	0 %	0 %	526221103
74471	NC_021820	GTT	3	9	4036541	4036549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221104
74472	NC_021820	TCAA	2	8	4036585	4036592	50 %	25 %	0 %	25 %	526221104
74473	NC_021820	TG	3	6	4036597	4036602	0 %	50 %	50 %	0 %	526221104
74474	NC_021820	CAG	2	6	4036776	4036781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221104
74475	NC_021820	TCA	2	6	4037093	4037098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221104
74476	NC_021820	TCC	2	6	4037148	4037153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221105
74477	NC_021820	CGG	2	6	4037175	4037180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221105
74478	NC_021820	CAG	2	6	4037193	4037198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221105
74479	NC_021820	AAT	2	6	4037199	4037204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221105
74480	NC_021820	CTG	2	6	4037206	4037211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221105
74481	NC_021820	CCA	2	6	4037215	4037220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221105
74482	NC_021820	GT	3	6	4037267	4037272	0 %	50 %	50 %	0 %	526221105
74483	NC_021820	A	6	6	4037310	4037315	100 %	0 %	0 %	0 %	526221105
74484	NC_021820	CGG	2	6	4037348	4037353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221105
74485	NC_021820	AC	3	6	4037360	4037365	50 %	0 %	0 %	50 %	526221105
74486	NC_021820	TTG	2	6	4037423	4037428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221105
74487	NC_021820	GGA	2	6	4037447	4037452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221105
74488	NC_021820	CAT	2	6	4037456	4037461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221105
74489	NC_021820	AAT	2	6	4037527	4037532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222385
74490	NC_021820	GCA	2	6	4037540	4037545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222385
74491	NC_021820	GGC	2	6	4037696	4037701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222385
74492	NC_021820	TCA	2	6	4037711	4037716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222385
74493	NC_021820	CAG	2	6	4037730	4037735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222385
74494	NC_021820	CTCCGC	2	12	4037743	4037754	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	526222385
74495	NC_021820	GCTG	2	8	4037778	4037785	0 %	25 %	50 %	25 %	526222385
74496	NC_021820	GCG	2	6	4037792	4037797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222385
74497	NC_021820	TCT	2	6	4037861	4037866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222385
74498	NC_021820	TTG	2	6	4037868	4037873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222385
74499	NC_021820	TGACAA	2	12	4037946	4037957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526221106
74500	NC_021820	GCG	2	6	4037985	4037990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221106

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