MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73001	NC_021820	CGC	2	6	3955732	3955737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73002	NC_021820	GCC	2	6	3955797	3955802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73003	NC_021820	GCG	2	6	3955840	3955845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73004	NC_021820	CTG	2	6	3955850	3955855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73005	NC_021820	CAGCG	2	10	3955868	3955877	20 %	0 %	40 %	40 %	526221045
73006	NC_021820	TAT	2	6	3955909	3955914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221045
73007	NC_021820	GCA	2	6	3955957	3955962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73008	NC_021820	CGG	2	6	3955991	3955996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73009	NC_021820	CG	3	6	3956018	3956023	0 %	0 %	50 %	50 %	526221045
73010	NC_021820	CCG	2	6	3956094	3956099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73011	NC_021820	GTA	2	6	3956116	3956121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221045
73012	NC_021820	GC	3	6	3956148	3956153	0 %	0 %	50 %	50 %	526221045
73013	NC_021820	TGG	2	6	3956233	3956238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221045
73014	NC_021820	GC	3	6	3956285	3956290	0 %	0 %	50 %	50 %	526221045
73015	NC_021820	GCG	2	6	3956299	3956304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73016	NC_021820	CAG	2	6	3956318	3956323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73017	NC_021820	TGGC	2	8	3956338	3956345	0 %	25 %	50 %	25 %	526221045
73018	NC_021820	TGC	2	6	3956361	3956366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73019	NC_021820	CT	3	6	3956382	3956387	0 %	50 %	0 %	50 %	526221045
73020	NC_021820	CAGGC	2	10	3956425	3956434	20 %	0 %	40 %	40 %	526221045
73021	NC_021820	ACGC	2	8	3956438	3956445	25 %	0 %	25 %	50 %	526221045
73022	NC_021820	TGC	2	6	3956463	3956468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73023	NC_021820	TTCGCC	2	12	3956519	3956530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526221045
73024	NC_021820	GC	3	6	3956542	3956547	0 %	0 %	50 %	50 %	526221045
73025	NC_021820	GGT	2	6	3956564	3956569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221045
73026	NC_021820	GCT	2	6	3956602	3956607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73027	NC_021820	GGC	2	6	3956633	3956638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73028	NC_021820	CGGT	2	8	3956664	3956671	0 %	25 %	50 %	25 %	526221045
73029	NC_021820	GCG	2	6	3956754	3956759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73030	NC_021820	CGC	2	6	3956776	3956781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73031	NC_021820	CTG	2	6	3956897	3956902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73032	NC_021820	GAT	2	6	3956906	3956911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221045
73033	NC_021820	CGG	2	6	3956927	3956932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73034	NC_021820	CCG	2	6	3956937	3956942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73035	NC_021820	GTC	2	6	3956951	3956956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73036	NC_021820	CGC	2	6	3956962	3956967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73037	NC_021820	CGC	2	6	3956978	3956983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73038	NC_021820	GCC	2	6	3956986	3956991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73039	NC_021820	GAA	2	6	3957053	3957058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221045
73040	NC_021820	CGC	2	6	3957103	3957108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73041	NC_021820	GGC	2	6	3957235	3957240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73042	NC_021820	GTA	2	6	3957265	3957270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221045
73043	NC_021820	CAC	2	6	3957320	3957325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221045
73044	NC_021820	CCA	2	6	3957416	3957421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221045
73045	NC_021820	CCA	2	6	3957442	3957447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221045
73046	NC_021820	CGGCG	2	10	3957470	3957479	0 %	0 %	60 %	40 %	526221045
73047	NC_021820	CGCGC	2	10	3957549	3957558	0 %	0 %	40 %	60 %	526221045
73048	NC_021820	GCT	2	6	3957608	3957613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73049	NC_021820	CCA	2	6	3957721	3957726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221045
73050	NC_021820	T	6	6	3957830	3957835	0 %	100 %	0 %	0 %	526221045
73051	NC_021820	GCG	2	6	3957870	3957875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73052	NC_021820	TCG	2	6	3957885	3957890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73053	NC_021820	GGT	2	6	3957908	3957913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221045
73054	NC_021820	GGC	2	6	3957941	3957946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73055	NC_021820	CGA	2	6	3958002	3958007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73056	NC_021820	GAC	2	6	3958015	3958020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73057	NC_021820	CAG	2	6	3958031	3958036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73058	NC_021820	GCG	2	6	3958060	3958065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
73059	NC_021820	CTT	2	6	3958072	3958077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221045
73060	NC_021820	CTGG	2	8	3958082	3958089	0 %	25 %	50 %	25 %	526221045
73061	NC_021820	CACT	2	8	3958093	3958100	25 %	25 %	0 %	50 %	526221045
73062	NC_021820	CAC	2	6	3958102	3958107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221045
73063	NC_021820	GC	3	6	3958261	3958266	0 %	0 %	50 %	50 %	526221045
73064	NC_021820	T	6	6	3958324	3958329	0 %	100 %	0 %	0 %	526221045
73065	NC_021820	GCA	2	6	3958393	3958398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73066	NC_021820	GGCT	2	8	3958488	3958495	0 %	25 %	50 %	25 %	526221045
73067	NC_021820	GAC	2	6	3958496	3958501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73068	NC_021820	CG	3	6	3958627	3958632	0 %	0 %	50 %	50 %	526221045
73069	NC_021820	TGCT	2	8	3958650	3958657	0 %	50 %	25 %	25 %	526221045
73070	NC_021820	GC	3	6	3958666	3958671	0 %	0 %	50 %	50 %	526221045
73071	NC_021820	AGC	2	6	3958719	3958724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
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73074	NC_021820	TCG	2	6	3958804	3958809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
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73076	NC_021820	GCGCC	2	10	3958864	3958873	0 %	0 %	40 %	60 %	526221045
73077	NC_021820	AAC	2	6	3958950	3958955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221045
73078	NC_021820	CGCC	2	8	3959011	3959018	0 %	0 %	25 %	75 %	526221045
73079	NC_021820	GCA	3	9	3959047	3959055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73080	NC_021820	GC	3	6	3959072	3959077	0 %	0 %	50 %	50 %	526221045
73081	NC_021820	CAG	2	6	3959123	3959128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73082	NC_021820	AG	4	8	3959147	3959154	50 %	0 %	50 %	0 %	526221045
73083	NC_021820	AGC	2	6	3959280	3959285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73084	NC_021820	GCTGG	2	10	3959309	3959318	0 %	20 %	60 %	20 %	526221045
73085	NC_021820	T	6	6	3959338	3959343	0 %	100 %	0 %	0 %	526221045
73086	NC_021820	CGG	2	6	3959383	3959388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221045
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73088	NC_021820	CGC	2	6	3959567	3959572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221045
73089	NC_021820	TGC	2	6	3959628	3959633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73090	NC_021820	GTC	2	6	3959703	3959708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221045
73091	NC_021820	GTT	2	6	3959723	3959728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221045
73092	NC_021820	CGCCAG	2	12	3959738	3959749	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526221045
73093	NC_021820	CCA	2	6	3959764	3959769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221045
73094	NC_021820	ACC	2	6	3959997	3960002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222373
73095	NC_021820	T	6	6	3960006	3960011	0 %	100 %	0 %	0 %	526222373
73096	NC_021820	CGC	2	6	3960014	3960019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222373
73097	NC_021820	TGA	2	6	3960041	3960046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222373
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73099	NC_021820	GGCG	2	8	3960107	3960114	0 %	0 %	75 %	25 %	526222373
73100	NC_021820	T	6	6	3960147	3960152	0 %	100 %	0 %	0 %	526222373
73101	NC_021820	ATG	2	6	3960195	3960200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222373
73102	NC_021820	TCCGC	2	10	3960291	3960300	0 %	20 %	20 %	60 %	526222373
73103	NC_021820	TGG	2	6	3960306	3960311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222373
73104	NC_021820	TGC	2	6	3960313	3960318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222373
73105	NC_021820	GGCG	2	8	3960350	3960357	0 %	0 %	75 %	25 %	526222373
73106	NC_021820	CGA	2	6	3960377	3960382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222373
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73108	NC_021820	CGC	2	6	3960442	3960447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222373
73109	NC_021820	GTG	2	6	3960453	3960458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222373
73110	NC_021820	A	6	6	3960490	3960495	100 %	0 %	0 %	0 %	526222373
73111	NC_021820	CG	3	6	3960512	3960517	0 %	0 %	50 %	50 %	526222373
73112	NC_021820	CGG	2	6	3960520	3960525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222373
73113	NC_021820	TGA	2	6	3960545	3960550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222373
73114	NC_021820	GC	3	6	3960586	3960591	0 %	0 %	50 %	50 %	526222373
73115	NC_021820	T	7	7	3960658	3960664	0 %	100 %	0 %	0 %	526222373
73116	NC_021820	GTG	2	6	3960732	3960737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526222373
73117	NC_021820	ACG	2	6	3960778	3960783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222373
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73230	NC_021820	CG	3	6	3966717	3966722	0 %	0 %	50 %	50 %	526221051
73231	NC_021820	GCC	2	6	3966774	3966779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221051
73232	NC_021820	ATC	2	6	3966786	3966791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221051
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73236	NC_021820	CTG	3	9	3966950	3966958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221051
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73348	NC_021820	GACA	2	8	3973786	3973793	50 %	0 %	25 %	25 %	526221059
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73351	NC_021820	TTCGT	2	10	3973914	3973923	0 %	60 %	20 %	20 %	526221059
73352	NC_021820	GAA	2	6	3973937	3973942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221059
73353	NC_021820	ACTG	2	8	3973985	3973992	25 %	25 %	25 %	25 %	526221059
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73370	NC_021820	GCG	2	6	3974627	3974632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221060
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73450	NC_021820	A	6	6	3978492	3978497	100 %	0 %	0 %	0 %	526221064
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73453	NC_021820	TCA	2	6	3978557	3978562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221064
73454	NC_021820	CGCC	2	8	3978570	3978577	0 %	0 %	25 %	75 %	526221064
73455	NC_021820	ACA	2	6	3978645	3978650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221064
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73457	NC_021820	GTC	2	6	3978737	3978742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221064
73458	NC_021820	CCCGA	2	10	3978823	3978832	20 %	0 %	20 %	60 %	526221064
73459	NC_021820	GCA	2	6	3978855	3978860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221064
73460	NC_021820	TGC	2	6	3978887	3978892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221064
73461	NC_021820	CGA	2	6	3978924	3978929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221064
73462	NC_021820	ATA	2	6	3979004	3979009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221064
73463	NC_021820	CAC	2	6	3979053	3979058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221064
73464	NC_021820	TGG	2	6	3979124	3979129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221064
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73466	NC_021820	ATG	2	6	3979205	3979210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221064
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