MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021820	CGAC	2	8	355505	355512	25 %	0 %	25 %	50 %	526218293
6502	NC_021820	CGG	2	6	355617	355622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218293
6503	NC_021820	TAA	2	6	355653	355658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218293
6504	NC_021820	CG	3	6	355663	355668	0 %	0 %	50 %	50 %	526218293
6505	NC_021820	TGG	2	6	355700	355705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218293
6506	NC_021820	GAA	2	6	355740	355745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218293
6507	NC_021820	GCA	2	6	355801	355806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218293
6508	NC_021820	GCGT	2	8	355832	355839	0 %	25 %	50 %	25 %	526218293
6509	NC_021820	GAA	2	6	355891	355896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218293
6510	NC_021820	CGG	2	6	355923	355928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218293
6511	NC_021820	GCG	2	6	356047	356052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218293
6512	NC_021820	TGC	2	6	356061	356066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218293
6513	NC_021820	GTT	2	6	356071	356076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218293
6514	NC_021820	AT	3	6	356238	356243	50 %	50 %	0 %	0 %	526218294
6515	NC_021820	CTAT	2	8	356366	356373	25 %	50 %	0 %	25 %	526218294
6516	NC_021820	TTC	2	6	356447	356452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218294
6517	NC_021820	TTTAC	2	10	356605	356614	20 %	60 %	0 %	20 %	526218294
6518	NC_021820	CGG	2	6	356619	356624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218294
6519	NC_021820	AGA	2	6	356635	356640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218294
6520	NC_021820	TTC	2	6	356680	356685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218294
6521	NC_021820	GGCG	2	8	356813	356820	0 %	0 %	75 %	25 %	526218294
6522	NC_021820	CAG	2	6	356863	356868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218294
6523	NC_021820	AGAC	2	8	356921	356928	50 %	0 %	25 %	25 %	526218294
6524	NC_021820	GC	3	6	357026	357031	0 %	0 %	50 %	50 %	526218294
6525	NC_021820	CG	3	6	357050	357055	0 %	0 %	50 %	50 %	526218294
6526	NC_021820	GCGG	2	8	357119	357126	0 %	0 %	75 %	25 %	526218294
6527	NC_021820	GAT	2	6	357145	357150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218294
6528	NC_021820	CTG	2	6	357184	357189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218294
6529	NC_021820	CTC	2	6	357361	357366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218295
6530	NC_021820	GTAT	2	8	357414	357421	25 %	50 %	25 %	0 %	526218295
6531	NC_021820	CAC	2	6	357452	357457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218295
6532	NC_021820	GGT	2	6	357469	357474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218295
6533	NC_021820	CGA	2	6	357487	357492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6534	NC_021820	TCG	2	6	357519	357524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6535	NC_021820	GAT	2	6	357560	357565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218295
6536	NC_021820	GAA	2	6	357596	357601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218295
6537	NC_021820	CGG	3	9	357609	357617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
6538	NC_021820	CGG	2	6	357679	357684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
6539	NC_021820	AACTGG	2	12	357729	357740	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526218295
6540	NC_021820	AGA	2	6	357979	357984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218295
6541	NC_021820	GGC	2	6	358001	358006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
6542	NC_021820	TTG	2	6	358017	358022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218295
6543	NC_021820	TCT	2	6	358062	358067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218295
6544	NC_021820	CAA	2	6	358153	358158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218295
6545	NC_021820	CGG	2	6	358174	358179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
6546	NC_021820	GCG	2	6	358202	358207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
6547	NC_021820	AAG	2	6	358239	358244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218295
6548	NC_021820	A	6	6	358253	358258	100 %	0 %	0 %	0 %	526218295
6549	NC_021820	CGA	2	6	358279	358284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6550	NC_021820	GGT	2	6	358306	358311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218295
6551	NC_021820	CGG	2	6	358383	358388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
6552	NC_021820	CAG	2	6	358394	358399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6553	NC_021820	GAAC	2	8	358402	358409	50 %	0 %	25 %	25 %	526218295
6554	NC_021820	CTG	2	6	358424	358429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6555	NC_021820	TCG	3	9	358452	358460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6556	NC_021820	CGC	2	6	358474	358479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218295
6557	NC_021820	GCG	2	6	358493	358498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
6558	NC_021820	CGT	2	6	358520	358525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6559	NC_021820	GC	3	6	358530	358535	0 %	0 %	50 %	50 %	526218295
6560	NC_021820	TGG	2	6	358608	358613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218295
6561	NC_021820	GGC	2	6	358628	358633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218295
6562	NC_021820	GC	3	6	358709	358714	0 %	0 %	50 %	50 %	526218295
6563	NC_021820	TCC	2	6	358730	358735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218295
6564	NC_021820	CGA	2	6	358783	358788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6565	NC_021820	CAT	4	12	358819	358830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218295
6566	NC_021820	GCT	2	6	358867	358872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6567	NC_021820	CTT	2	6	358879	358884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218295
6568	NC_021820	GCC	2	6	358936	358941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218295
6569	NC_021820	GAA	2	6	358954	358959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218295
6570	NC_021820	GAC	2	6	358985	358990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6571	NC_021820	GCT	2	6	359155	359160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6572	NC_021820	TGA	2	6	359206	359211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218295
6573	NC_021820	AGC	2	6	359265	359270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6574	NC_021820	CAGT	2	8	359275	359282	25 %	25 %	25 %	25 %	526218295
6575	NC_021820	TCG	2	6	359404	359409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6576	NC_021820	ACC	2	6	359600	359605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218295
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6578	NC_021820	TGC	2	6	359628	359633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6579	NC_021820	TGC	2	6	359656	359661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6580	NC_021820	CGT	2	6	359705	359710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6581	NC_021820	GAG	2	6	359720	359725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218295
6582	NC_021820	AGC	2	6	359737	359742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218295
6583	NC_021820	CAT	2	6	359797	359802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218296
6584	NC_021820	A	6	6	359826	359831	100 %	0 %	0 %	0 %	526218296
6585	NC_021820	GGCG	2	8	359849	359856	0 %	0 %	75 %	25 %	526218296
6586	NC_021820	GC	3	6	359862	359867	0 %	0 %	50 %	50 %	526218296
6587	NC_021820	CAC	2	6	359972	359977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218296
6588	NC_021820	GCC	2	6	359991	359996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218296
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6591	NC_021820	GTTT	2	8	360192	360199	0 %	75 %	25 %	0 %	526218296
6592	NC_021820	T	6	6	360265	360270	0 %	100 %	0 %	0 %	526218296
6593	NC_021820	TGC	2	6	360318	360323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218296
6594	NC_021820	GAT	2	6	360338	360343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218296
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6596	NC_021820	CAA	2	6	360379	360384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218296
6597	NC_021820	T	6	6	360398	360403	0 %	100 %	0 %	0 %	526218296
6598	NC_021820	CAA	2	6	360451	360456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218296
6599	NC_021820	GGC	2	6	360464	360469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218296
6600	NC_021820	CAC	2	6	360503	360508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218296
6601	NC_021820	GGC	2	6	360605	360610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218296
6602	NC_021820	CG	3	6	360644	360649	0 %	0 %	50 %	50 %	526218296
6603	NC_021820	TGGT	2	8	360802	360809	0 %	50 %	50 %	0 %	526218297
6604	NC_021820	T	6	6	360812	360817	0 %	100 %	0 %	0 %	526218297
6605	NC_021820	TTC	2	6	360824	360829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218297
6606	NC_021820	TTC	2	6	360879	360884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218297
6607	NC_021820	CAG	2	6	360923	360928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218297
6608	NC_021820	CGC	2	6	361009	361014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218297
6609	NC_021820	TTC	2	6	361065	361070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218297
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6615	NC_021820	GCAT	2	8	361317	361324	25 %	25 %	25 %	25 %	526218297
6616	NC_021820	GAT	2	6	361331	361336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218297
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6619	NC_021820	GCC	2	6	361509	361514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218297
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6988	NC_021820	CTG	2	6	380249	380254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221769
6989	NC_021820	CTT	2	6	380311	380316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221769
6990	NC_021820	GC	3	6	380331	380336	0 %	0 %	50 %	50 %	526221769
6991	NC_021820	GCA	2	6	380410	380415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221769
6992	NC_021820	CGCGC	2	10	380450	380459	0 %	0 %	40 %	60 %	526221769
6993	NC_021820	CGA	2	6	380470	380475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221769
6994	NC_021820	GC	3	6	380507	380512	0 %	0 %	50 %	50 %	526221769
6995	NC_021820	CGG	2	6	380519	380524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221769
6996	NC_021820	GGC	2	6	380527	380532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221769
6997	NC_021820	CAC	2	6	380563	380568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221769
6998	NC_021820	CCA	2	6	380569	380574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221769
6999	NC_021820	CCG	2	6	380602	380607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221769
7000	NC_021820	CGG	2	6	380620	380625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221769

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