MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021820	AGTA	2	8	329574	329581	50 %	25 %	25 %	0 %	526221763
6002	NC_021820	ACC	2	6	329767	329772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218274
6003	NC_021820	GTG	2	6	329828	329833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218274
6004	NC_021820	AGCC	2	8	329847	329854	25 %	0 %	25 %	50 %	526218274
6005	NC_021820	GGT	2	6	329861	329866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218274
6006	NC_021820	GTT	2	6	329878	329883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218274
6007	NC_021820	CAG	2	6	329927	329932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6008	NC_021820	CAT	2	6	329935	329940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218274
6009	NC_021820	CAC	2	6	329944	329949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218274
6010	NC_021820	TGGCG	2	10	329953	329962	0 %	20 %	60 %	20 %	526218274
6011	NC_021820	CCAG	2	8	330031	330038	25 %	0 %	25 %	50 %	526218274
6012	NC_021820	TCA	2	6	330069	330074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218274
6013	NC_021820	CTG	2	6	330107	330112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6014	NC_021820	CGA	3	9	330197	330205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6015	NC_021820	AGG	2	6	330250	330255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218274
6016	NC_021820	CAG	2	6	330257	330262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6017	NC_021820	GCC	2	6	330266	330271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218274
6018	NC_021820	CTCA	2	8	330296	330303	25 %	25 %	0 %	50 %	526218274
6019	NC_021820	GCG	2	6	330347	330352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218274
6020	NC_021820	CGG	2	6	330358	330363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218274
6021	NC_021820	ATA	2	6	330391	330396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218274
6022	NC_021820	A	6	6	330396	330401	100 %	0 %	0 %	0 %	526218274
6023	NC_021820	TCC	2	6	330404	330409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218274
6024	NC_021820	TGTC	2	8	330550	330557	0 %	50 %	25 %	25 %	526218274
6025	NC_021820	CAG	2	6	330596	330601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6026	NC_021820	CCA	2	6	330661	330666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218274
6027	NC_021820	AGC	3	9	330756	330764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6028	NC_021820	AAC	2	6	330843	330848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218274
6029	NC_021820	CAT	2	6	330907	330912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218274
6030	NC_021820	CGG	2	6	330922	330927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218274
6031	NC_021820	GCC	2	6	330964	330969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218274
6032	NC_021820	GTG	2	6	330971	330976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218274
6033	NC_021820	TGC	2	6	331050	331055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6034	NC_021820	ATA	2	6	331103	331108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218274
6035	NC_021820	GCA	2	6	331162	331167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6036	NC_021820	CAG	2	6	331196	331201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218274
6037	NC_021820	CCT	2	6	331339	331344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218274
6038	NC_021820	AAC	2	6	331386	331391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218274
6039	NC_021820	TCA	2	6	331576	331581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218275
6040	NC_021820	TAA	2	6	331595	331600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218275
6041	NC_021820	GGC	2	6	331625	331630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218275
6042	NC_021820	CCGA	2	8	331713	331720	25 %	0 %	25 %	50 %	526218275
6043	NC_021820	GCG	2	6	331738	331743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218275
6044	NC_021820	AAG	2	6	331789	331794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218275
6045	NC_021820	TGG	2	6	331807	331812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218275
6046	NC_021820	ACA	2	6	331888	331893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218275
6047	NC_021820	TC	3	6	331936	331941	0 %	50 %	0 %	50 %	526218275
6048	NC_021820	TTTGC	2	10	331953	331962	0 %	60 %	20 %	20 %	526218275
6049	NC_021820	GGT	2	6	331971	331976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218275
6050	NC_021820	GC	3	6	331996	332001	0 %	0 %	50 %	50 %	526218275
6051	NC_021820	TGA	2	6	332042	332047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218275
6052	NC_021820	AAC	2	6	332059	332064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218275
6053	NC_021820	TTAA	2	8	332124	332131	50 %	50 %	0 %	0 %	526218275
6054	NC_021820	TGGC	2	8	332149	332156	0 %	25 %	50 %	25 %	526218275
6055	NC_021820	ATG	2	6	332161	332166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218275
6056	NC_021820	TGG	2	6	332224	332229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218275
6057	NC_021820	CGC	2	6	332245	332250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218275
6058	NC_021820	AGC	2	6	332375	332380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218275
6059	NC_021820	CTA	2	6	332443	332448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218276
6060	NC_021820	A	7	7	332454	332460	100 %	0 %	0 %	0 %	526218276
6061	NC_021820	TTG	2	6	332461	332466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218276
6062	NC_021820	GGC	2	6	332507	332512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218276
6063	NC_021820	GTG	2	6	332542	332547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218276
6064	NC_021820	GAA	2	6	332585	332590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218276
6065	NC_021820	CGG	2	6	332638	332643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218276
6066	NC_021820	TTG	2	6	332668	332673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218276
6067	NC_021820	CGGCG	2	10	332699	332708	0 %	0 %	60 %	40 %	526218276
6068	NC_021820	A	6	6	332711	332716	100 %	0 %	0 %	0 %	526218276
6069	NC_021820	CTT	2	6	332782	332787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218276
6070	NC_021820	TGG	3	9	332857	332865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218276
6071	NC_021820	GGA	2	6	332868	332873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218276
6072	NC_021820	CT	3	6	332886	332891	0 %	50 %	0 %	50 %	526218276
6073	NC_021820	GGC	2	6	332933	332938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218276
6074	NC_021820	GGT	2	6	332955	332960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218276
6075	NC_021820	GGC	2	6	332963	332968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218276
6076	NC_021820	CTGG	2	8	332991	332998	0 %	25 %	50 %	25 %	526218276
6077	NC_021820	GCG	2	6	333073	333078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218276
6078	NC_021820	GGGA	2	8	333089	333096	25 %	0 %	75 %	0 %	526218276
6079	NC_021820	GTG	2	6	333237	333242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218276
6080	NC_021820	GAC	2	6	333275	333280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218276
6081	NC_021820	TGG	2	6	333356	333361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218276
6082	NC_021820	GGC	2	6	333428	333433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218276
6083	NC_021820	GGC	2	6	333440	333445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218276
6084	NC_021820	GGC	2	6	333485	333490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218276
6085	NC_021820	CGC	2	6	333581	333586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218276
6086	NC_021820	TGT	2	6	334017	334022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218277
6087	NC_021820	CGC	2	6	334023	334028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218277
6088	NC_021820	GCA	3	9	334060	334068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218277
6089	NC_021820	TACC	2	8	334125	334132	25 %	25 %	0 %	50 %	526218277
6090	NC_021820	AGAA	2	8	334133	334140	75 %	0 %	25 %	0 %	526218277
6091	NC_021820	CGG	2	6	334179	334184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218277
6092	NC_021820	CGG	2	6	334290	334295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218277
6093	NC_021820	GTG	2	6	334297	334302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218277
6094	NC_021820	AAG	2	6	334387	334392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218277
6095	NC_021820	GAT	2	6	334396	334401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218277
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6097	NC_021820	ACG	2	6	334520	334525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218277
6098	NC_021820	ACG	2	6	334592	334597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218277
6099	NC_021820	AAC	2	6	334666	334671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218277
6100	NC_021820	AG	3	6	334725	334730	50 %	0 %	50 %	0 %	526218277
6101	NC_021820	GCG	2	6	334741	334746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218277
6102	NC_021820	ACCA	2	8	334786	334793	50 %	0 %	0 %	50 %	526218277
6103	NC_021820	TG	3	6	334806	334811	0 %	50 %	50 %	0 %	526218277
6104	NC_021820	CCA	2	6	334823	334828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218277
6105	NC_021820	AGA	2	6	334853	334858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218277
6106	NC_021820	TTC	2	6	334888	334893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218277
6107	NC_021820	GTT	2	6	334960	334965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218277
6108	NC_021820	TGC	2	6	334977	334982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218277
6109	NC_021820	ATTA	2	8	335024	335031	50 %	50 %	0 %	0 %	526218277
6110	NC_021820	CCG	2	6	335191	335196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218278
6111	NC_021820	A	6	6	335200	335205	100 %	0 %	0 %	0 %	526218278
6112	NC_021820	GC	3	6	335222	335227	0 %	0 %	50 %	50 %	526218278
6113	NC_021820	TAT	2	6	335271	335276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218278
6114	NC_021820	ATC	2	6	335287	335292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218278
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6116	NC_021820	CCT	2	6	335405	335410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218278
6117	NC_021820	CTG	2	6	335419	335424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218278
6118	NC_021820	GGCT	2	8	335479	335486	0 %	25 %	50 %	25 %	526218278
6119	NC_021820	CTG	2	6	335515	335520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218278
6120	NC_021820	CGC	2	6	335570	335575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218278
6121	NC_021820	GC	3	6	335636	335641	0 %	0 %	50 %	50 %	526218278
6122	NC_021820	CCGGC	2	10	335648	335657	0 %	0 %	40 %	60 %	526218278
6123	NC_021820	GGC	2	6	335676	335681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218278
6124	NC_021820	CAT	2	6	335697	335702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218278
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6127	NC_021820	ATG	2	6	335758	335763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218278
6128	NC_021820	TAC	2	6	335790	335795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218278
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6131	NC_021820	ATC	2	6	335905	335910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218278
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6133	NC_021820	GGC	2	6	336069	336074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218278
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6141	NC_021820	GCG	2	6	336349	336354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218279
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6145	NC_021820	CTGG	2	8	336467	336474	0 %	25 %	50 %	25 %	526218279
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6231	NC_021820	CAT	2	6	340171	340176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218282
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6237	NC_021820	TCT	2	6	340442	340447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218282
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6240	NC_021820	TGG	2	6	340542	340547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218282
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6242	NC_021820	CGC	2	6	340581	340586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218282
6243	NC_021820	GCC	2	6	340600	340605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218282
6244	NC_021820	CGG	3	9	340611	340619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218282
6245	NC_021820	GC	3	6	340620	340625	0 %	0 %	50 %	50 %	526218282
6246	NC_021820	TGA	2	6	340644	340649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218282
6247	NC_021820	CGG	2	6	340710	340715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218282
6248	NC_021820	ATG	2	6	340718	340723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218282
6249	NC_021820	TGA	2	6	340779	340784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218282
6250	NC_021820	TGA	2	6	340877	340882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218282
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6261	NC_021820	CTG	2	6	341326	341331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218283
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6483	NC_021820	CGTG	2	8	354581	354588	0 %	25 %	50 %	25 %	526218292
6484	NC_021820	TGCCAA	2	12	354617	354628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526218292
6485	NC_021820	CCGG	2	8	354634	354641	0 %	0 %	50 %	50 %	526218292
6486	NC_021820	AGA	2	6	354724	354729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218292
6487	NC_021820	CAAAAT	2	12	354746	354757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526218292
6488	NC_021820	ACCA	2	8	354837	354844	50 %	0 %	0 %	50 %	526218292
6489	NC_021820	GGCG	2	8	354873	354880	0 %	0 %	75 %	25 %	526218292
6490	NC_021820	GAA	2	6	354930	354935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218292
6491	NC_021820	AGA	2	6	354950	354955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218292
6492	NC_021820	GTC	2	6	354980	354985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218292
6493	NC_021820	TTA	2	6	355021	355026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218293
6494	NC_021820	CAG	2	6	355036	355041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218293
6495	NC_021820	GGC	2	6	355057	355062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218293
6496	NC_021820	CTC	2	6	355093	355098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218293
6497	NC_021820	CG	4	8	355155	355162	0 %	0 %	50 %	50 %	526218293
6498	NC_021820	CTGC	2	8	355324	355331	0 %	25 %	25 %	50 %	526218293
6499	NC_021820	GAC	2	6	355351	355356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218293
6500	NC_021820	CTA	2	6	355449	355454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218293

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