MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 91338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021818	CAA	2	6	154266	154271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525855848
3002	NC_021818	CGC	2	6	154293	154298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855848
3003	NC_021818	GCT	2	6	154353	154358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855848
3004	NC_021818	TAA	2	6	154380	154385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525855848
3005	NC_021818	ATA	2	6	154399	154404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525855848
3006	NC_021818	ATA	2	6	154758	154763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525855849
3007	NC_021818	TCT	2	6	154914	154919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855849
3008	NC_021818	GC	3	6	154966	154971	0 %	0 %	50 %	50 %	525855849
3009	NC_021818	GC	3	6	155033	155038	0 %	0 %	50 %	50 %	525855849
3010	NC_021818	GTTA	2	8	155050	155057	25 %	50 %	25 %	0 %	525855849
3011	NC_021818	GGC	2	6	155072	155077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855849
3012	NC_021818	GTG	2	6	155096	155101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855849
3013	NC_021818	CGC	2	6	155154	155159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855849
3014	NC_021818	ATT	2	6	155189	155194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525855849
3015	NC_021818	TGT	2	6	155205	155210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855849
3016	NC_021818	TAT	2	6	155308	155313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525855849
3017	NC_021818	T	6	6	155362	155367	0 %	100 %	0 %	0 %	525855849
3018	NC_021818	GGT	2	6	155407	155412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855849
3019	NC_021818	CGT	2	6	155505	155510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855849
3020	NC_021818	ACT	2	6	155520	155525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855849
3021	NC_021818	CTT	2	6	155575	155580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855849
3022	NC_021818	GCT	2	6	155611	155616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855849
3023	NC_021818	GCT	2	6	155779	155784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855849
3024	NC_021818	GTT	2	6	155801	155806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855849
3025	NC_021818	GGC	3	9	155836	155844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855849
3026	NC_021818	TTCT	2	8	155886	155893	0 %	75 %	0 %	25 %	525855849
3027	NC_021818	TTG	2	6	156002	156007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855849
3028	NC_021818	CGG	2	6	156010	156015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855849
3029	NC_021818	ACC	2	6	156059	156064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855849
3030	NC_021818	AGCG	2	8	156071	156078	25 %	0 %	50 %	25 %	525855849
3031	NC_021818	CGT	2	6	156092	156097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855849
3032	NC_021818	GAT	2	6	156127	156132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855849
3033	NC_021818	CCG	2	6	156152	156157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855849
3034	NC_021818	CG	4	8	156189	156196	0 %	0 %	50 %	50 %	525855849
3035	NC_021818	CAA	2	6	156238	156243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525855849
3036	NC_021818	GTG	2	6	156353	156358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855849
3037	NC_021818	GAT	2	6	156436	156441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855849
3038	NC_021818	CGT	2	6	156447	156452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855849
3039	NC_021818	TTTGCG	2	12	156499	156510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525855849
3040	NC_021818	TGT	2	6	156525	156530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855849
3041	NC_021818	GCAAC	2	10	156532	156541	40 %	0 %	20 %	40 %	525855849
3042	NC_021818	GC	4	8	156547	156554	0 %	0 %	50 %	50 %	525855849
3043	NC_021818	GAA	2	6	156835	156840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525855850
3044	NC_021818	TCG	2	6	156866	156871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855850
3045	NC_021818	CG	3	6	156943	156948	0 %	0 %	50 %	50 %	525855850
3046	NC_021818	CTT	2	6	156978	156983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855850
3047	NC_021818	GGT	2	6	156991	156996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855850
3048	NC_021818	GGC	2	6	157027	157032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855850
3049	NC_021818	ACA	2	6	157054	157059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525855850
3050	NC_021818	CTCA	2	8	157085	157092	25 %	25 %	0 %	50 %	525855850
3051	NC_021818	GCA	2	6	157105	157110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855850
3052	NC_021818	AC	3	6	157145	157150	50 %	0 %	0 %	50 %	525855850
3053	NC_021818	A	6	6	157160	157165	100 %	0 %	0 %	0 %	525855850
3054	NC_021818	CT	3	6	157315	157320	0 %	50 %	0 %	50 %	525855851
3055	NC_021818	TGG	2	6	157363	157368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855851
3056	NC_021818	CCA	2	6	157390	157395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855851
3057	NC_021818	TGA	2	6	157396	157401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855851
3058	NC_021818	GTT	2	6	157439	157444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855851
3059	NC_021818	ACC	2	6	157461	157466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855851
3060	NC_021818	ATT	2	6	157506	157511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525855851
3061	NC_021818	ACC	2	6	157627	157632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855851
3062	NC_021818	TGG	2	6	157672	157677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855851
3063	NC_021818	CT	3	6	157683	157688	0 %	50 %	0 %	50 %	525855851
3064	NC_021818	TGG	2	6	157705	157710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855851
3065	NC_021818	TCA	2	6	157744	157749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855851
3066	NC_021818	ACCG	2	8	157760	157767	25 %	0 %	25 %	50 %	525855851
3067	NC_021818	TGACG	2	10	157886	157895	20 %	20 %	40 %	20 %	525855851
3068	NC_021818	ATG	2	6	157965	157970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855851
3069	NC_021818	ATG	2	6	158065	158070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855851
3070	NC_021818	TGC	2	6	158080	158085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855851
3071	NC_021818	TGA	2	6	158140	158145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855851
3072	NC_021818	GTG	2	6	158205	158210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855851
3073	NC_021818	AGC	2	6	158371	158376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855851
3074	NC_021818	TGA	2	6	158488	158493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855851
3075	NC_021818	CGA	2	6	158516	158521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855851
3076	NC_021818	AAGA	2	8	158550	158557	75 %	0 %	25 %	0 %	525855851
3077	NC_021818	CAT	2	6	158600	158605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855851
3078	NC_021818	CAT	2	6	158651	158656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855851
3079	NC_021818	CATG	2	8	158660	158667	25 %	25 %	25 %	25 %	525855851
3080	NC_021818	A	6	6	158764	158769	100 %	0 %	0 %	0 %	525855851
3081	NC_021818	CTT	2	6	158819	158824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855852
3082	NC_021818	CTG	2	6	158846	158851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855852
3083	NC_021818	T	6	6	158888	158893	0 %	100 %	0 %	0 %	525855852
3084	NC_021818	TAA	2	6	158899	158904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525855852
3085	NC_021818	TTC	2	6	158916	158921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855852
3086	NC_021818	GATC	2	8	158983	158990	25 %	25 %	25 %	25 %	525855852
3087	NC_021818	CTG	2	6	159005	159010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855852
3088	NC_021818	TCG	2	6	159039	159044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855852
3089	NC_021818	GCC	2	6	159074	159079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855852
3090	NC_021818	GCGCTG	2	12	159080	159091	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525855852
3091	NC_021818	TCG	2	6	159123	159128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855852
3092	NC_021818	TGA	2	6	159165	159170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855852
3093	NC_021818	TGC	2	6	159171	159176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855852
3094	NC_021818	GCG	2	6	159183	159188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855852
3095	NC_021818	CGC	2	6	159322	159327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855852
3096	NC_021818	TGC	2	6	159336	159341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855852
3097	NC_021818	GCG	2	6	159389	159394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855852
3098	NC_021818	CAT	2	6	159475	159480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855852
3099	NC_021818	GC	3	6	159488	159493	0 %	0 %	50 %	50 %	525855852
3100	NC_021818	CT	3	6	159494	159499	0 %	50 %	0 %	50 %	525855852
3101	NC_021818	CGG	2	6	159513	159518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855852
3102	NC_021818	GCC	2	6	159545	159550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855852
3103	NC_021818	GTG	2	6	159551	159556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855852
3104	NC_021818	GGC	2	6	159560	159565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855852
3105	NC_021818	TTG	2	6	159594	159599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855852
3106	NC_021818	TAA	2	6	159634	159639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525855852
3107	NC_021818	TCC	2	6	159662	159667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525855852
3108	NC_021818	GAT	2	6	159676	159681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855852
3109	NC_021818	GGT	2	6	159691	159696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855852
3110	NC_021818	ACA	2	6	159720	159725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525855852
3111	NC_021818	AAC	2	6	159735	159740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525855852
3112	NC_021818	A	6	6	159770	159775	100 %	0 %	0 %	0 %	525859394
3113	NC_021818	CTG	2	6	159792	159797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859394
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3115	NC_021818	TGG	2	6	159936	159941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525859394
3116	NC_021818	AAC	2	6	159956	159961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525859394
3117	NC_021818	GTC	2	6	160124	160129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859394
3118	NC_021818	A	6	6	160187	160192	100 %	0 %	0 %	0 %	525859394
3119	NC_021818	CAG	2	6	160271	160276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859394
3120	NC_021818	GCC	2	6	160283	160288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859394
3121	NC_021818	GCCA	2	8	160307	160314	25 %	0 %	25 %	50 %	525859394
3122	NC_021818	GC	4	8	160429	160436	0 %	0 %	50 %	50 %	525859394
3123	NC_021818	TGG	2	6	160464	160469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525859394
3124	NC_021818	TCA	2	6	160638	160643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859394
3125	NC_021818	TAA	2	6	160649	160654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525859394
3126	NC_021818	GCA	2	6	160815	160820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855853
3127	NC_021818	TGC	2	6	160930	160935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855853
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3129	NC_021818	GTTG	2	8	161152	161159	0 %	50 %	50 %	0 %	525855853
3130	NC_021818	CGC	2	6	161214	161219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855853
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3132	NC_021818	CAT	2	6	161258	161263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855853
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3134	NC_021818	CTG	2	6	161312	161317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855853
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3136	NC_021818	CAT	2	6	161329	161334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855853
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3140	NC_021818	GCC	2	6	161493	161498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855853
3141	NC_021818	GCC	2	6	161537	161542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855853
3142	NC_021818	GGA	2	6	161581	161586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525855853
3143	NC_021818	GCC	3	9	161621	161629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855853
3144	NC_021818	GC	3	6	161652	161657	0 %	0 %	50 %	50 %	525855853
3145	NC_021818	TTCCG	2	10	161662	161671	0 %	40 %	20 %	40 %	525855853
3146	NC_021818	CAG	2	6	161702	161707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855853
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3149	NC_021818	TTA	2	6	161778	161783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525855854
3150	NC_021818	TGAG	2	8	161799	161806	25 %	25 %	50 %	0 %	525855854
3151	NC_021818	GCG	2	6	161828	161833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855854
3152	NC_021818	GCG	2	6	161952	161957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855854
3153	NC_021818	CGA	2	6	162013	162018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855854
3154	NC_021818	CTG	3	9	162074	162082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855854
3155	NC_021818	ATG	2	6	162146	162151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855854
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3160	NC_021818	GGC	3	9	162389	162397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855854
3161	NC_021818	CGATG	2	10	162460	162469	20 %	20 %	40 %	20 %	525855854
3162	NC_021818	ATG	2	6	162540	162545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855854
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3195	NC_021818	TGG	2	6	164024	164029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525859395
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3200	NC_021818	T	6	6	164094	164099	0 %	100 %	0 %	0 %	525859395
3201	NC_021818	TC	3	6	164132	164137	0 %	50 %	0 %	50 %	525855855
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3206	NC_021818	CGC	2	6	164456	164461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855855
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3220	NC_021818	CTG	2	6	170996	171001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855856
3221	NC_021818	GTA	2	6	171026	171031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855856
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3224	NC_021818	GCC	2	6	171236	171241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855856
3225	NC_021818	TCA	2	6	171252	171257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855856
3226	NC_021818	GCCC	2	8	171407	171414	0 %	0 %	25 %	75 %	525855856
3227	NC_021818	ACG	2	6	171602	171607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855857
3228	NC_021818	TC	3	6	171648	171653	0 %	50 %	0 %	50 %	525855857
3229	NC_021818	GTCATG	2	12	171696	171707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525855857
3230	NC_021818	GAA	2	6	171749	171754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525855857
3231	NC_021818	GGC	2	6	171872	171877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855857
3232	NC_021818	AGA	2	6	171898	171903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525855857
3233	NC_021818	TGA	2	6	171916	171921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855857
3234	NC_021818	TAA	2	6	171923	171928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525855857
3235	NC_021818	T	7	7	171945	171951	0 %	100 %	0 %	0 %	525855858
3236	NC_021818	AAC	2	6	171978	171983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525855858
3237	NC_021818	TAA	2	6	172076	172081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525855858
3238	NC_021818	TGC	2	6	172149	172154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855858
3239	NC_021818	CG	3	6	172191	172196	0 %	0 %	50 %	50 %	525855858
3240	NC_021818	CTT	2	6	172202	172207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855858
3241	NC_021818	GCG	2	6	172233	172238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855858
3242	NC_021818	T	6	6	172248	172253	0 %	100 %	0 %	0 %	525855858
3243	NC_021818	GGA	2	6	172305	172310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525855858
3244	NC_021818	GCG	2	6	172443	172448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855858
3245	NC_021818	TCA	2	6	172566	172571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855858
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3253	NC_021818	GAT	2	6	172993	172998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855858
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3362	NC_021818	CG	3	6	178989	178994	0 %	0 %	50 %	50 %	525855862
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3364	NC_021818	CGC	2	6	179020	179025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855862
3365	NC_021818	A	6	6	179029	179034	100 %	0 %	0 %	0 %	525855862
3366	NC_021818	GCG	2	6	179116	179121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855862
3367	NC_021818	GAT	2	6	179129	179134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855862
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3426	NC_021818	T	6	6	181497	181502	0 %	100 %	0 %	0 %	525855865
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3452	NC_021818	TCG	2	6	182587	182592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855866
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3484	NC_021818	ACT	2	6	184117	184122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855867
3485	NC_021818	T	6	6	184176	184181	0 %	100 %	0 %	0 %	525855867
3486	NC_021818	CTT	2	6	184203	184208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855867
3487	NC_021818	CGC	2	6	184226	184231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855867
3488	NC_021818	AGA	2	6	184249	184254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525855867
3489	NC_021818	TCT	2	6	184270	184275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525855867
3490	NC_021818	TGC	3	9	184293	184301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855867
3491	NC_021818	ATT	2	6	184312	184317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525855867
3492	NC_021818	GAC	2	6	184537	184542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859398
3493	NC_021818	GAC	2	6	184636	184641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859398
3494	NC_021818	GC	3	6	184652	184657	0 %	0 %	50 %	50 %	525859398
3495	NC_021818	GCC	2	6	184664	184669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859398
3496	NC_021818	T	6	6	184721	184726	0 %	100 %	0 %	0 %	525859398
3497	NC_021818	TCTGT	2	10	184820	184829	0 %	60 %	20 %	20 %	525859398
3498	NC_021818	GCTG	2	8	184883	184890	0 %	25 %	50 %	25 %	525859398
3499	NC_021818	TGC	2	6	184919	184924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525859398
3500	NC_021818	CAA	2	6	185026	185031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525859398

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