MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 91338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021818	CAC	2	6	80614	80619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855792
1502	NC_021818	GC	3	6	80628	80633	0 %	0 %	50 %	50 %	525855792
1503	NC_021818	GCGCG	2	10	80637	80646	0 %	0 %	60 %	40 %	525855792
1504	NC_021818	GCG	2	6	80790	80795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855792
1505	NC_021818	CCGC	2	8	80974	80981	0 %	0 %	25 %	75 %	525855793
1506	NC_021818	GCA	2	6	80998	81003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1507	NC_021818	CAT	2	6	81011	81016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855793
1508	NC_021818	GCC	2	6	81024	81029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855793
1509	NC_021818	GCT	3	9	81046	81054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1510	NC_021818	GCA	2	6	81121	81126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1511	NC_021818	CGC	2	6	81133	81138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855793
1512	NC_021818	TCC	2	6	81147	81152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525855793
1513	NC_021818	AGCC	2	8	81291	81298	25 %	0 %	25 %	50 %	525855793
1514	NC_021818	CAT	2	6	81313	81318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855793
1515	NC_021818	TCC	2	6	81360	81365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525855793
1516	NC_021818	CAG	2	6	81404	81409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1517	NC_021818	CTG	2	6	81431	81436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1518	NC_021818	CTG	2	6	81449	81454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1519	NC_021818	GGC	2	6	81482	81487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855793
1520	NC_021818	GC	5	10	81534	81543	0 %	0 %	50 %	50 %	525855793
1521	NC_021818	CCG	2	6	81559	81564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855793
1522	NC_021818	GGCGCA	2	12	81577	81588	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525855793
1523	NC_021818	CCG	2	6	81590	81595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855793
1524	NC_021818	CGA	2	6	81607	81612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1525	NC_021818	CCCG	2	8	81620	81627	0 %	0 %	25 %	75 %	525855793
1526	NC_021818	GGC	2	6	81635	81640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855793
1527	NC_021818	GCA	2	6	81646	81651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1528	NC_021818	CAG	2	6	81656	81661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1529	NC_021818	GCG	2	6	81679	81684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855793
1530	NC_021818	GC	3	6	81710	81715	0 %	0 %	50 %	50 %	525855793
1531	NC_021818	GAT	2	6	81728	81733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525855793
1532	NC_021818	GGC	2	6	81739	81744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855793
1533	NC_021818	CCT	2	6	81751	81756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525855793
1534	NC_021818	GCG	2	6	81776	81781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525855793
1535	NC_021818	ATC	2	6	81795	81800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525855793
1536	NC_021818	TGT	2	6	81820	81825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525855793
1537	NC_021818	GCAGC	2	10	81839	81848	20 %	0 %	40 %	40 %	525855793
1538	NC_021818	CTG	2	6	81869	81874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855793
1539	NC_021818	GGT	2	6	81908	81913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855793
1540	NC_021818	CAGCAT	2	12	81944	81955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525855793
1541	NC_021818	GCC	2	6	81983	81988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855794
1542	NC_021818	GC	3	6	82104	82109	0 %	0 %	50 %	50 %	525855794
1543	NC_021818	GTC	2	6	82210	82215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855794
1544	NC_021818	CAC	2	6	82231	82236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525855794
1545	NC_021818	AGC	2	6	82316	82321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855794
1546	NC_021818	TCG	2	6	82431	82436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525855794
1547	NC_021818	GC	3	6	82456	82461	0 %	0 %	50 %	50 %	525855794
1548	NC_021818	CAG	2	6	82471	82476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855794
1549	NC_021818	CGC	2	6	82477	82482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525855794
1550	NC_021818	CAG	2	6	82489	82494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855794
1551	NC_021818	CAG	2	6	82501	82506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525855794
1552	NC_021818	TAA	2	6	82510	82515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525855794
1553	NC_021818	CGG	3	9	82555	82563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859385
1554	NC_021818	CAG	2	6	82584	82589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1555	NC_021818	CAG	2	6	82605	82610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1556	NC_021818	CTC	2	6	82680	82685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525859385
1557	NC_021818	GCG	2	6	82693	82698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859385
1558	NC_021818	CCG	2	6	82717	82722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1559	NC_021818	CGC	2	6	82728	82733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1560	NC_021818	TCA	2	6	82739	82744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859385
1561	NC_021818	GCA	2	6	82781	82786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1562	NC_021818	CGC	2	6	82832	82837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1563	NC_021818	CGCC	2	8	82907	82914	0 %	0 %	25 %	75 %	525859385
1564	NC_021818	GCC	2	6	82993	82998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1565	NC_021818	GA	3	6	83016	83021	50 %	0 %	50 %	0 %	525859385
1566	NC_021818	CAG	2	6	83080	83085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1567	NC_021818	GCCATC	2	12	83086	83097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525859385
1568	NC_021818	CCG	2	6	83102	83107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1569	NC_021818	GAT	2	6	83115	83120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525859385
1570	NC_021818	CAG	2	6	83130	83135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1571	NC_021818	AGC	3	9	83182	83190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1572	NC_021818	CCCCCA	2	12	83234	83245	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	525859385
1573	NC_021818	GCA	2	6	83246	83251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1574	NC_021818	CCCAGC	2	12	83317	83328	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525859385
1575	NC_021818	GCA	2	6	83345	83350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1576	NC_021818	CAG	2	6	83358	83363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1577	NC_021818	CAC	2	6	83364	83369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525859385
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1579	NC_021818	CAG	2	6	83385	83390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1580	NC_021818	GTT	2	6	83394	83399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525859385
1581	NC_021818	AGC	3	9	83404	83412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1582	NC_021818	CG	3	6	83417	83422	0 %	0 %	50 %	50 %	525859385
1583	NC_021818	GTT	2	6	83433	83438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525859385
1584	NC_021818	CAG	3	9	83475	83483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1585	NC_021818	GCC	2	6	83487	83492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1586	NC_021818	CG	3	6	83528	83533	0 %	0 %	50 %	50 %	525859385
1587	NC_021818	CAG	2	6	83595	83600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1588	NC_021818	CAG	3	9	83625	83633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1589	NC_021818	GC	3	6	83653	83658	0 %	0 %	50 %	50 %	525859385
1590	NC_021818	GCA	2	6	83681	83686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1591	NC_021818	GCCA	2	8	83698	83705	25 %	0 %	25 %	50 %	525859385
1592	NC_021818	AGG	2	6	83714	83719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525859385
1593	NC_021818	ACC	2	6	83741	83746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525859385
1594	NC_021818	GCC	2	6	83748	83753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1595	NC_021818	CCAGC	2	10	83754	83763	20 %	0 %	20 %	60 %	525859385
1596	NC_021818	GTA	2	6	83766	83771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525859385
1597	NC_021818	GCCGA	2	10	83779	83788	20 %	0 %	40 %	40 %	525859385
1598	NC_021818	CGC	2	6	83817	83822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1599	NC_021818	CGGG	2	8	83832	83839	0 %	0 %	75 %	25 %	525859385
1600	NC_021818	CAG	2	6	83874	83879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1601	NC_021818	GGCGAA	2	12	83889	83900	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525859385
1602	NC_021818	CAG	2	6	83931	83936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1603	NC_021818	CGG	2	6	83937	83942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859385
1604	NC_021818	GCA	2	6	83966	83971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1605	NC_021818	CGA	2	6	84095	84100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1606	NC_021818	CCG	2	6	84104	84109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1607	NC_021818	ACCGCC	2	12	84127	84138	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	525859385
1608	NC_021818	TCA	2	6	84152	84157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859385
1609	NC_021818	GCA	2	6	84158	84163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1610	NC_021818	CAG	3	9	84168	84176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1611	NC_021818	C	6	6	84191	84196	0 %	0 %	0 %	100 %	525859385
1612	NC_021818	GGC	2	6	84201	84206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525859385
1613	NC_021818	CGCC	2	8	84305	84312	0 %	0 %	25 %	75 %	525859385
1614	NC_021818	CAG	2	6	84324	84329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1615	NC_021818	CAT	2	6	84354	84359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859385
1616	NC_021818	CG	3	6	84361	84366	0 %	0 %	50 %	50 %	525859385
1617	NC_021818	CGC	2	6	84368	84373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525859385
1618	NC_021818	GC	3	6	84372	84377	0 %	0 %	50 %	50 %	525859385
1619	NC_021818	CAG	3	9	84402	84410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1620	NC_021818	CAG	2	6	84432	84437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525859385
1621	NC_021818	CAT	2	6	84456	84461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525859385
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1623	NC_021818	GGT	2	6	84496	84501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525855795
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