MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 91338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78002	NC_021818	CGC	2	6	4260654	4260659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525860235
78003	NC_021818	TC	3	6	4260707	4260712	0 %	50 %	0 %	50 %	525860235
78004	NC_021818	CTG	2	6	4260721	4260726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860235
78005	NC_021818	CTG	2	6	4260755	4260760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860235
78006	NC_021818	CTT	2	6	4260769	4260774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525860235
78007	NC_021818	GGC	2	6	4260788	4260793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525860235
78008	NC_021818	TCA	2	6	4260800	4260805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860235
78009	NC_021818	CTG	2	6	4260823	4260828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860235
78010	NC_021818	T	8	8	4260835	4260842	0 %	100 %	0 %	0 %	525860235
78011	NC_021818	GGCA	2	8	4260855	4260862	25 %	0 %	50 %	25 %	525860235
78012	NC_021818	GCAACA	2	12	4260910	4260921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525860235
78013	NC_021818	TCA	2	6	4260941	4260946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860235
78014	NC_021818	CA	3	6	4261005	4261010	50 %	0 %	0 %	50 %	525860235
78015	NC_021818	CTGG	2	8	4261048	4261055	0 %	25 %	50 %	25 %	525860235
78016	NC_021818	CTG	2	6	4261090	4261095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860235
78017	NC_021818	GCAG	2	8	4261183	4261190	25 %	0 %	50 %	25 %	525860235
78018	NC_021818	GCA	2	6	4261293	4261298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860235
78019	NC_021818	TGT	2	6	4261322	4261327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525860235
78020	NC_021818	T	6	6	4261336	4261341	0 %	100 %	0 %	0 %	525860235
78021	NC_021818	CTG	2	6	4261375	4261380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860235
78022	NC_021818	GCT	2	6	4261404	4261409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860235
78023	NC_021818	T	6	6	4261409	4261414	0 %	100 %	0 %	0 %	525860235
78024	NC_021818	TGT	2	6	4261479	4261484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525860235
78025	NC_021818	A	7	7	4261520	4261526	100 %	0 %	0 %	0 %	525860235
78026	NC_021818	AC	3	6	4261590	4261595	50 %	0 %	0 %	50 %	525860236
78027	NC_021818	GCA	2	6	4261597	4261602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860236
78028	NC_021818	CAT	2	6	4261732	4261737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860236
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78030	NC_021818	TGC	2	6	4261852	4261857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860236
78031	NC_021818	ATG	2	6	4261927	4261932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525860237
78032	NC_021818	CAC	2	6	4262066	4262071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525860237
78033	NC_021818	GCT	2	6	4262087	4262092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860237
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78035	NC_021818	CTGCCG	2	12	4262136	4262147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525860237
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78038	NC_021818	GAT	2	6	4262405	4262410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525860237
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78040	NC_021818	TAT	2	6	4262487	4262492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525860237
78041	NC_021818	GGA	2	6	4262513	4262518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525860237
78042	NC_021818	TGA	2	6	4262521	4262526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525860237
78043	NC_021818	CTG	2	6	4262535	4262540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860237
78044	NC_021818	CG	3	6	4262542	4262547	0 %	0 %	50 %	50 %	525860237
78045	NC_021818	ACCG	2	8	4262565	4262572	25 %	0 %	25 %	50 %	525860237
78046	NC_021818	AGGA	2	8	4262583	4262590	50 %	0 %	50 %	0 %	525860237
78047	NC_021818	TGC	2	6	4262594	4262599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860237
78048	NC_021818	CT	3	6	4262604	4262609	0 %	50 %	0 %	50 %	525860237
78049	NC_021818	GCA	2	6	4262626	4262631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860237
78050	NC_021818	A	6	6	4262635	4262640	100 %	0 %	0 %	0 %	525860237
78051	NC_021818	TCA	2	6	4262718	4262723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525858869
78052	NC_021818	GGC	2	6	4262800	4262805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525858869
78053	NC_021818	GCG	2	6	4262821	4262826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525858869
78054	NC_021818	CAC	3	9	4262828	4262836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525858869
78055	NC_021818	GCATC	2	10	4262866	4262875	20 %	20 %	20 %	40 %	525858869
78056	NC_021818	TTC	2	6	4262882	4262887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525858869
78057	NC_021818	GCT	2	6	4262917	4262922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525858869
78058	NC_021818	GCA	2	6	4262944	4262949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525858869
78059	NC_021818	GCAC	2	8	4262952	4262959	25 %	0 %	25 %	50 %	525858869
78060	NC_021818	ATGTCC	2	12	4262964	4262975	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525858869
78061	NC_021818	TCG	2	6	4262994	4262999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525858869
78062	NC_021818	CG	3	6	4262998	4263003	0 %	0 %	50 %	50 %	525858869
78063	NC_021818	CGG	2	6	4263005	4263010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525858869
78064	NC_021818	GTCA	2	8	4263113	4263120	25 %	25 %	25 %	25 %	525858869
78065	NC_021818	ACAG	2	8	4263175	4263182	50 %	0 %	25 %	25 %	525860238
78066	NC_021818	CAGC	2	8	4263197	4263204	25 %	0 %	25 %	50 %	525860238
78067	NC_021818	TCA	2	6	4263227	4263232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860238
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78082	NC_021818	CCAG	2	8	4263671	4263678	25 %	0 %	25 %	50 %	525860238
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78087	NC_021818	GGC	2	6	4263888	4263893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525860238
78088	NC_021818	AAG	2	6	4263952	4263957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525860238
78089	NC_021818	GCC	2	6	4264027	4264032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525860238
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78098	NC_021818	CGTGGC	2	12	4264278	4264289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525860238
78099	NC_021818	ACC	2	6	4264309	4264314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525860238
78100	NC_021818	TAC	2	6	4264332	4264337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860238
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78102	NC_021818	GCG	2	6	4264357	4264362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525860238
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78106	NC_021818	GCT	2	6	4264657	4264662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860239
78107	NC_021818	TG	3	6	4264676	4264681	0 %	50 %	50 %	0 %	525860239
78108	NC_021818	CT	4	8	4264735	4264742	0 %	50 %	0 %	50 %	525860239
78109	NC_021818	TTTC	2	8	4264778	4264785	0 %	75 %	0 %	25 %	525860239
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78232	NC_021818	ACC	2	6	4275167	4275172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525860245
78233	NC_021818	GAA	2	6	4275196	4275201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525860245
78234	NC_021818	TTA	2	6	4275236	4275241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525860245
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78243	NC_021818	GCT	2	6	4275715	4275720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860246
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78259	NC_021818	T	7	7	4276195	4276201	0 %	100 %	0 %	0 %	525860246
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