MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050

Total Repeats: 91338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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77502	NC_021818	AAC	2	6	4231135	4231140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525860212
77503	NC_021818	AT	3	6	4231207	4231212	50 %	50 %	0 %	0 %	525860212
77504	NC_021818	A	6	6	4231216	4231221	100 %	0 %	0 %	0 %	525860212
77505	NC_021818	AGA	2	6	4231256	4231261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525860212
77506	NC_021818	ATA	2	6	4231292	4231297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525860212
77507	NC_021818	GAA	2	6	4231344	4231349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525858862
77508	NC_021818	CG	3	6	4231352	4231357	0 %	0 %	50 %	50 %	525858862
77509	NC_021818	AAT	2	6	4231400	4231405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525858862
77510	NC_021818	TGA	2	6	4231466	4231471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525858862
77511	NC_021818	TTTA	2	8	4231661	4231668	25 %	75 %	0 %	0 %	525858862
77512	NC_021818	TAC	2	6	4231748	4231753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860213
77513	NC_021818	TA	3	6	4231826	4231831	50 %	50 %	0 %	0 %	525860213
77514	NC_021818	GTCA	2	8	4231883	4231890	25 %	25 %	25 %	25 %	525860213
77515	NC_021818	TCA	2	6	4231914	4231919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860213
77516	NC_021818	CGT	2	6	4231981	4231986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860213
77517	NC_021818	TCC	2	6	4231991	4231996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525860213
77518	NC_021818	GCT	2	6	4232007	4232012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860213
77519	NC_021818	CAG	2	6	4232083	4232088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860213
77520	NC_021818	CCTG	2	8	4232119	4232126	0 %	25 %	25 %	50 %	525860213
77521	NC_021818	CCA	2	6	4232144	4232149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525860213
77522	NC_021818	GCC	2	6	4232187	4232192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525860213
77523	NC_021818	TTG	2	6	4232283	4232288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525860213
77524	NC_021818	CAG	2	6	4232321	4232326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860213
77525	NC_021818	TAAT	2	8	4232334	4232341	50 %	50 %	0 %	0 %	525860213
77526	NC_021818	CTG	2	6	4232476	4232481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860213
77527	NC_021818	CGC	2	6	4232537	4232542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525860213
77528	NC_021818	AAAC	2	8	4232561	4232568	75 %	0 %	0 %	25 %	525860213
77529	NC_021818	CAT	2	6	4232612	4232617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860213
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77531	NC_021818	CTG	2	6	4232700	4232705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860214
77532	NC_021818	TG	3	6	4232746	4232751	0 %	50 %	50 %	0 %	525860214
77533	NC_021818	TCA	2	6	4232823	4232828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860214
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77535	NC_021818	CGTC	2	8	4232975	4232982	0 %	25 %	25 %	50 %	525860214
77536	NC_021818	TTC	2	6	4233027	4233032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525860214
77537	NC_021818	GA	3	6	4233072	4233077	50 %	0 %	50 %	0 %	525860214
77538	NC_021818	TGC	2	6	4233180	4233185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860214
77539	NC_021818	GGA	2	6	4233202	4233207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525860214
77540	NC_021818	CAT	2	6	4233244	4233249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860214
77541	NC_021818	C	6	6	4233314	4233319	0 %	0 %	0 %	100 %	525860214
77542	NC_021818	G	7	7	4233360	4233366	0 %	0 %	100 %	0 %	525860214
77543	NC_021818	GCA	2	6	4233371	4233376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860214
77544	NC_021818	CT	3	6	4233385	4233390	0 %	50 %	0 %	50 %	525860214
77545	NC_021818	CAT	2	6	4233477	4233482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860214
77546	NC_021818	CGGCAA	2	12	4233489	4233500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860214
77547	NC_021818	TAGGTG	2	12	4233689	4233700	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525860214
77548	NC_021818	TTCATT	2	12	4233731	4233742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525860214
77549	NC_021818	TGG	2	6	4233768	4233773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525860214
77550	NC_021818	A	6	6	4233803	4233808	100 %	0 %	0 %	0 %	525860214
77551	NC_021818	GGTT	2	8	4233817	4233824	0 %	50 %	50 %	0 %	525860214
77552	NC_021818	GTA	2	6	4233835	4233840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525860214
77553	NC_021818	T	7	7	4233850	4233856	0 %	100 %	0 %	0 %	525860214
77554	NC_021818	T	6	6	4233859	4233864	0 %	100 %	0 %	0 %	525860214
77555	NC_021818	CAG	2	6	4233865	4233870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525860214
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77558	NC_021818	CCT	2	6	4233978	4233983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525860214
77559	NC_021818	ATC	2	6	4234057	4234062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860214
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77563	NC_021818	GAA	2	6	4234200	4234205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525860214
77564	NC_021818	ATTG	2	8	4234225	4234232	25 %	50 %	25 %	0 %	525860214
77565	NC_021818	GGTCA	2	10	4234282	4234291	20 %	20 %	40 %	20 %	525860214
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77567	NC_021818	TCG	2	6	4234408	4234413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860214
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77582	NC_021818	CGTAT	2	10	4235623	4235632	20 %	40 %	20 %	20 %	525860216
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77588	NC_021818	T	8	8	4236178	4236185	0 %	100 %	0 %	0 %	525860217
77589	NC_021818	TTGATG	2	12	4236201	4236212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525860217
77590	NC_021818	CCGTGG	2	12	4236226	4236237	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525860217
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77598	NC_021818	ATC	2	6	4236641	4236646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860218
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77600	NC_021818	T	6	6	4236811	4236816	0 %	100 %	0 %	0 %	525860218
77601	NC_021818	AAC	2	6	4237114	4237119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525860218
77602	NC_021818	TGC	2	6	4237207	4237212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525860218
77603	NC_021818	ACT	2	6	4237217	4237222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860218
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77606	NC_021818	GC	3	6	4237476	4237481	0 %	0 %	50 %	50 %	525860218
77607	NC_021818	AAT	2	6	4237492	4237497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525860218
77608	NC_021818	CAGA	2	8	4237550	4237557	50 %	0 %	25 %	25 %	525860218
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77612	NC_021818	C	6	6	4237750	4237755	0 %	0 %	0 %	100 %	525860218
77613	NC_021818	TCA	2	6	4237814	4237819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525860218
77614	NC_021818	GTT	2	6	4237823	4237828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525860218
77615	NC_021818	CT	3	6	4237862	4237867	0 %	50 %	0 %	50 %	525860218
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77953	NC_021818	GC	4	8	4257280	4257287	0 %	0 %	50 %	50 %	525858866
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77959	NC_021818	CAG	2	6	4257573	4257578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525858866
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77962	NC_021818	TCA	2	6	4257799	4257804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525858866
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