MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021816	AGC	3	9	339	347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832830
2	NC_021816	GCT	2	6	394	399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832830
3	NC_021816	CGA	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832830
4	NC_021816	GCC	2	6	434	439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832830
5	NC_021816	TG	3	6	441	446	0 %	50 %	50 %	0 %	525832830
6	NC_021816	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832830
7	NC_021816	T	6	6	1412	1417	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
8	NC_021816	TA	3	6	1441	1446	50 %	50 %	0 %	0 %	525832831
9	NC_021816	T	8	8	1460	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
10	NC_021816	A	6	6	1473	1478	100 %	0 %	0 %	0 %	525832831
11	NC_021816	AAAT	2	8	1496	1503	75 %	25 %	0 %	0 %	525832831
12	NC_021816	TCT	2	6	1516	1521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832831
13	NC_021816	TAT	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
14	NC_021816	AT	4	8	1565	1572	50 %	50 %	0 %	0 %	525832831
15	NC_021816	GAT	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832831
16	NC_021816	ATTTG	2	10	1619	1628	20 %	60 %	20 %	0 %	525832831
17	NC_021816	TAG	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832831
18	NC_021816	ATC	2	6	1724	1729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832831
19	NC_021816	ACA	2	6	1743	1748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832831
20	NC_021816	TTTAT	2	10	1770	1779	20 %	80 %	0 %	0 %	525832831
21	NC_021816	TTA	2	6	1785	1790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
22	NC_021816	TC	3	6	1873	1878	0 %	50 %	0 %	50 %	525832831
23	NC_021816	TCA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832831
24	NC_021816	TTA	2	6	1989	1994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
25	NC_021816	TTG	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832831
26	NC_021816	TTC	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832831
27	NC_021816	AACA	2	8	2081	2088	75 %	0 %	0 %	25 %	525832831
28	NC_021816	CAG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832831
29	NC_021816	GGT	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832831
30	NC_021816	ATTTC	2	10	2163	2172	20 %	60 %	0 %	20 %	525832831
31	NC_021816	ACA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832831
32	NC_021816	AACC	2	8	2284	2291	50 %	0 %	0 %	50 %	525832831
33	NC_021816	TC	3	6	2302	2307	0 %	50 %	0 %	50 %	525832831
34	NC_021816	CAT	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832831
35	NC_021816	A	7	7	2393	2399	100 %	0 %	0 %	0 %	525832831
36	NC_021816	TAT	3	9	2443	2451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
37	NC_021816	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
38	NC_021816	ATT	2	6	2609	2614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832831
39	NC_021816	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831
40	NC_021816	GA	3	6	2776	2781	50 %	0 %	50 %	0 %	525832831
41	NC_021816	AGA	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832831
42	NC_021816	T	8	8	2892	2899	0 %	100 %	0 %	0 %	525832831

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.