MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 3643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021815	CAA	2	6	85758	85763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832468
1502	NC_021815	CTG	2	6	85783	85788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832468
1503	NC_021815	ATG	2	6	85826	85831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832468
1504	NC_021815	A	6	6	85833	85838	100 %	0 %	0 %	0 %	525832469
1505	NC_021815	GGTT	2	8	85873	85880	0 %	50 %	50 %	0 %	525832469
1506	NC_021815	CGG	2	6	85921	85926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832469
1507	NC_021815	CTG	2	6	85945	85950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832469
1508	NC_021815	GTG	2	6	85992	85997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832469
1509	NC_021815	CAC	2	6	86080	86085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832469
1510	NC_021815	AG	3	6	86121	86126	50 %	0 %	50 %	0 %	525832469
1511	NC_021815	GCT	2	6	86133	86138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832469
1512	NC_021815	CAT	2	6	86189	86194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832469
1513	NC_021815	ATGG	2	8	86207	86214	25 %	25 %	50 %	0 %	525832469
1514	NC_021815	ACT	2	6	86241	86246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832469
1515	NC_021815	ATTT	2	8	86274	86281	25 %	75 %	0 %	0 %	525832469
1516	NC_021815	CAT	2	6	86323	86328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832469
1517	NC_021815	CGACC	2	10	86344	86353	20 %	0 %	20 %	60 %	525832469
1518	NC_021815	ATG	2	6	86361	86366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832469
1519	NC_021815	T	7	7	86374	86380	0 %	100 %	0 %	0 %	525832469
1520	NC_021815	GGC	3	9	86392	86400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832469
1521	NC_021815	GCG	2	6	86417	86422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832469
1522	NC_021815	CTG	2	6	86433	86438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832469
1523	NC_021815	TCA	2	6	86447	86452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832469
1524	NC_021815	TGG	2	6	86533	86538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832469
1525	NC_021815	TCT	2	6	86563	86568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832469
1526	NC_021815	GCT	2	6	86585	86590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832469
1527	NC_021815	TTA	2	6	86649	86654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832469
1528	NC_021815	G	6	6	87186	87191	0 %	0 %	100 %	0 %	525832470
1529	NC_021815	TTA	2	6	87254	87259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832470
1530	NC_021815	AAT	2	6	87339	87344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832470
1531	NC_021815	TTC	2	6	87412	87417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832470
1532	NC_021815	ATCA	2	8	87543	87550	50 %	25 %	0 %	25 %	525832470
1533	NC_021815	ACG	2	6	87637	87642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832470
1534	NC_021815	GTG	2	6	87648	87653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832470
1535	NC_021815	ATG	2	6	87661	87666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832470
1536	NC_021815	ACT	2	6	87733	87738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832470
1537	NC_021815	GAG	2	6	87762	87767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832470
1538	NC_021815	GGT	2	6	88145	88150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832470
1539	NC_021815	TCA	2	6	88216	88221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832470
1540	NC_021815	CTG	2	6	88337	88342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832470
1541	NC_021815	CGGG	2	8	88381	88388	0 %	0 %	75 %	25 %	525832470
1542	NC_021815	GAA	2	6	88413	88418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832470
1543	NC_021815	TCA	2	6	88435	88440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832470
1544	NC_021815	CCAA	2	8	88806	88813	50 %	0 %	0 %	50 %	525832470
1545	NC_021815	TAA	2	6	88840	88845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832470
1546	NC_021815	CTGA	2	8	88881	88888	25 %	25 %	25 %	25 %	525832470
1547	NC_021815	TA	3	6	88974	88979	50 %	50 %	0 %	0 %	525832470
1548	NC_021815	TTG	2	6	89029	89034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832470
1549	NC_021815	TGA	2	6	89074	89079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832470
1550	NC_021815	CAG	2	6	89095	89100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832470
1551	NC_021815	GCA	2	6	89109	89114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832470
1552	NC_021815	GGC	2	6	89123	89128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832470
1553	NC_021815	GCA	2	6	89133	89138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832470
1554	NC_021815	GAT	2	6	89159	89164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832470
1555	NC_021815	ACA	2	6	89175	89180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832470
1556	NC_021815	AT	3	6	89202	89207	50 %	50 %	0 %	0 %	525832470
1557	NC_021815	TGA	2	6	89230	89235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832470
1558	NC_021815	GAT	2	6	89240	89245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832470
1559	NC_021815	GAA	2	6	89259	89264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832470
1560	NC_021815	A	6	6	89353	89358	100 %	0 %	0 %	0 %	525832470
1561	NC_021815	TGC	2	6	89370	89375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832470
1562	NC_021815	CT	3	6	89388	89393	0 %	50 %	0 %	50 %	525832470
1563	NC_021815	TAT	2	6	89396	89401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832470
1564	NC_021815	A	6	6	89447	89452	100 %	0 %	0 %	0 %	525832470
1565	NC_021815	ATTG	2	8	89493	89500	25 %	50 %	25 %	0 %	525832470
1566	NC_021815	AATT	2	8	89507	89514	50 %	50 %	0 %	0 %	525832470
1567	NC_021815	CAG	2	6	89538	89543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832470
1568	NC_021815	GAA	2	6	89627	89632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832470
1569	NC_021815	GC	3	6	89722	89727	0 %	0 %	50 %	50 %	525832470
1570	NC_021815	TGG	3	9	89732	89740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832470
1571	NC_021815	A	7	7	89743	89749	100 %	0 %	0 %	0 %	525832470
1572	NC_021815	GATT	2	8	89777	89784	25 %	50 %	25 %	0 %	525832471
1573	NC_021815	AAG	2	6	89825	89830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832471
1574	NC_021815	AGGTAG	2	12	89883	89894	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525832471
1575	NC_021815	GAG	2	6	89941	89946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832471
1576	NC_021815	TGC	2	6	89954	89959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832471
1577	NC_021815	CATT	2	8	90141	90148	25 %	50 %	0 %	25 %	525832471
1578	NC_021815	TCAG	2	8	90213	90220	25 %	25 %	25 %	25 %	525832471
1579	NC_021815	AAG	2	6	90251	90256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832471
1580	NC_021815	GCTGA	2	10	90392	90401	20 %	20 %	40 %	20 %	525832471
1581	NC_021815	TGT	2	6	90526	90531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832471
1582	NC_021815	CTG	2	6	90573	90578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832471
1583	NC_021815	GGT	2	6	90620	90625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832471
1584	NC_021815	TGT	2	6	90643	90648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832471
1585	NC_021815	GCT	2	6	91235	91240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832472
1586	NC_021815	A	6	6	91265	91270	100 %	0 %	0 %	0 %	525832472
1587	NC_021815	ATC	2	6	91328	91333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832472
1588	NC_021815	TAA	2	6	91360	91365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832472
1589	NC_021815	TATTT	2	10	91503	91512	20 %	80 %	0 %	0 %	525832472
1590	NC_021815	TCA	2	6	91600	91605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832472
1591	NC_021815	TTA	2	6	91921	91926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832473
1592	NC_021815	ATT	2	6	92003	92008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832473
1593	NC_021815	TGC	2	6	92011	92016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832473
1594	NC_021815	ATAC	2	8	92022	92029	50 %	25 %	0 %	25 %	525832473
1595	NC_021815	CTGT	2	8	92053	92060	0 %	50 %	25 %	25 %	525832473
1596	NC_021815	AAC	2	6	92090	92095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832473
1597	NC_021815	CAT	3	9	92116	92124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832473
1598	NC_021815	CTT	2	6	92193	92198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832473
1599	NC_021815	TA	3	6	92234	92239	50 %	50 %	0 %	0 %	525832473
1600	NC_021815	ACT	2	6	92240	92245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832473
1601	NC_021815	GTA	2	6	92261	92266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832473
1602	NC_021815	AGT	2	6	92283	92288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832473
1603	NC_021815	CTTT	2	8	92324	92331	0 %	75 %	0 %	25 %	525832473
1604	NC_021815	TCT	2	6	92362	92367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832473
1605	NC_021815	CTT	2	6	92418	92423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832473
1606	NC_021815	TGA	2	6	92443	92448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832473
1607	NC_021815	TTAA	2	8	92489	92496	50 %	50 %	0 %	0 %	525832473
1608	NC_021815	T	6	6	92532	92537	0 %	100 %	0 %	0 %	525832473
1609	NC_021815	CAA	2	6	92598	92603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832473
1610	NC_021815	GCA	2	6	92621	92626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832473
1611	NC_021815	CTT	2	6	92651	92656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832473
1612	NC_021815	TCG	2	6	92684	92689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832473
1613	NC_021815	CTT	2	6	92757	92762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832473
1614	NC_021815	ACT	2	6	92785	92790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832473
1615	NC_021815	ATCAAT	2	12	92791	92802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525832473
1616	NC_021815	T	6	6	92836	92841	0 %	100 %	0 %	0 %	525832473
1617	NC_021815	TTGAAG	2	12	92882	92893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832473
1618	NC_021815	TTG	2	6	93051	93056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832473
1619	NC_021815	TTA	2	6	93176	93181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832473
1620	NC_021815	TGC	2	6	93468	93473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832474
1621	NC_021815	CTT	2	6	93557	93562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832474
1622	NC_021815	GAT	2	6	93606	93611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832474
1623	NC_021815	TGA	2	6	93626	93631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832474
1624	NC_021815	TGC	2	6	93637	93642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832474
1625	NC_021815	GCT	2	6	93665	93670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832474
1626	NC_021815	AG	3	6	93695	93700	50 %	0 %	50 %	0 %	525832474
1627	NC_021815	GAG	2	6	93761	93766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832474
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1629	NC_021815	CAT	2	6	93810	93815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832474
1630	NC_021815	TTG	2	6	93841	93846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832474
1631	NC_021815	GAT	2	6	93939	93944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832474
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1633	NC_021815	CTTG	2	8	94040	94047	0 %	50 %	25 %	25 %	525832474
1634	NC_021815	AGT	2	6	94061	94066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832474
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1655	NC_021815	AAAG	2	8	96666	96673	75 %	0 %	25 %	0 %	525832478
1656	NC_021815	G	6	6	96759	96764	0 %	0 %	100 %	0 %	525832478
1657	NC_021815	CAGC	2	8	96784	96791	25 %	0 %	25 %	50 %	525832478
1658	NC_021815	TC	3	6	96798	96803	0 %	50 %	0 %	50 %	525832478
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1661	NC_021815	CTG	2	6	97074	97079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832478
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1663	NC_021815	TGA	2	6	97151	97156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832478
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1744	NC_021815	CGA	2	6	101465	101470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832481
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1748	NC_021815	ACG	2	6	101581	101586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832481
1749	NC_021815	TCT	2	6	101666	101671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832481
1750	NC_021815	TTC	2	6	101680	101685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832481
1751	NC_021815	GTT	2	6	101739	101744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832481
1752	NC_021815	AG	3	6	101776	101781	50 %	0 %	50 %	0 %	525832481
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1756	NC_021815	CATCAG	2	12	102021	102032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525832482
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1772	NC_021815	TCA	2	6	103138	103143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832484
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1776	NC_021815	ACT	2	6	103419	103424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832484
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1865	NC_021815	ATC	2	6	109590	109595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832490
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1989	NC_021815	TGA	2	6	122137	122142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832505
1990	NC_021815	TC	3	6	122208	122213	0 %	50 %	0 %	50 %	525832505
1991	NC_021815	GGT	2	6	122477	122482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832506
1992	NC_021815	TCC	2	6	122548	122553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832506
1993	NC_021815	CAGC	2	8	122573	122580	25 %	0 %	25 %	50 %	525832506
1994	NC_021815	CAA	2	6	122730	122735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832507
1995	NC_021815	ATG	2	6	122743	122748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832507
1996	NC_021815	CTG	2	6	122751	122756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832507
1997	NC_021815	AGA	2	6	122861	122866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832507
1998	NC_021815	CAAA	2	8	122901	122908	75 %	0 %	0 %	25 %	525832507
1999	NC_021815	ACA	2	6	122923	122928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832507
2000	NC_021815	TTA	2	6	122951	122956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832507

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