MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021814	TTA	2	6	1252566	1252571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837708
23003	NC_021814	CCG	2	6	1252578	1252583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837708
23004	NC_021814	ACG	2	6	1252603	1252608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837708
23005	NC_021814	CGT	2	6	1252670	1252675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837708
23006	NC_021814	GCCAG	2	10	1252681	1252690	20 %	0 %	40 %	40 %	525837708
23007	NC_021814	GGC	2	6	1252808	1252813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837708
23008	NC_021814	AAT	2	6	1252823	1252828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837708
23009	NC_021814	AAC	2	6	1252889	1252894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837708
23010	NC_021814	CGGAA	2	10	1252915	1252924	40 %	0 %	40 %	20 %	525837708
23011	NC_021814	GCGG	2	8	1252937	1252944	0 %	0 %	75 %	25 %	525837708
23012	NC_021814	CAG	2	6	1252961	1252966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837708
23013	NC_021814	TAT	2	6	1253011	1253016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837708
23014	NC_021814	CAGC	2	8	1253350	1253357	25 %	0 %	25 %	50 %	525837709
23015	NC_021814	GC	3	6	1253401	1253406	0 %	0 %	50 %	50 %	525837709
23016	NC_021814	TGA	2	6	1253445	1253450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837709
23017	NC_021814	A	6	6	1253450	1253455	100 %	0 %	0 %	0 %	525837709
23018	NC_021814	AAG	2	6	1253498	1253503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837709
23019	NC_021814	GAT	2	6	1253514	1253519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837709
23020	NC_021814	GCC	2	6	1253603	1253608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837709
23021	NC_021814	CT	3	6	1253618	1253623	0 %	50 %	0 %	50 %	525837709
23022	NC_021814	T	6	6	1253623	1253628	0 %	100 %	0 %	0 %	525837709
23023	NC_021814	CTT	3	9	1253684	1253692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837709
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23025	NC_021814	GAC	2	6	1253746	1253751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837709
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23028	NC_021814	TGA	2	6	1253912	1253917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837709
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23031	NC_021814	GCC	2	6	1254015	1254020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837709
23032	NC_021814	GCG	2	6	1254047	1254052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837709
23033	NC_021814	TGG	2	6	1254059	1254064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837709
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23039	NC_021814	GTT	2	6	1254547	1254552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837709
23040	NC_021814	CTG	3	9	1254596	1254604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837709
23041	NC_021814	TCAG	2	8	1254615	1254622	25 %	25 %	25 %	25 %	525837709
23042	NC_021814	TCG	2	6	1254713	1254718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837709
23043	NC_021814	GAT	2	6	1254774	1254779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837709
23044	NC_021814	TGA	2	6	1254780	1254785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837709
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23046	NC_021814	TGG	2	6	1254815	1254820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837709
23047	NC_021814	CTGGTA	2	12	1254937	1254948	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525837709
23048	NC_021814	CGCTGG	2	12	1254965	1254976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525837709
23049	NC_021814	AGA	2	6	1254981	1254986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837709
23050	NC_021814	GGC	2	6	1255033	1255038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837709
23051	NC_021814	CAAA	2	8	1255175	1255182	75 %	0 %	0 %	25 %	525837709
23052	NC_021814	CTC	2	6	1255278	1255283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837709
23053	NC_021814	GCC	2	6	1255400	1255405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837709
23054	NC_021814	A	6	6	1255430	1255435	100 %	0 %	0 %	0 %	525837709
23055	NC_021814	CAG	2	6	1255507	1255512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837709
23056	NC_021814	CAT	2	6	1255779	1255784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837710
23057	NC_021814	GGC	2	6	1255848	1255853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837710
23058	NC_021814	GAC	2	6	1255968	1255973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837710
23059	NC_021814	TCGT	2	8	1255979	1255986	0 %	50 %	25 %	25 %	525837710
23060	NC_021814	CCG	2	6	1255997	1256002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837710
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23062	NC_021814	A	6	6	1256107	1256112	100 %	0 %	0 %	0 %	525837710
23063	NC_021814	CTGGT	2	10	1256134	1256143	0 %	40 %	40 %	20 %	525837710
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23066	NC_021814	CTC	2	6	1256214	1256219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837710
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23070	NC_021814	CGG	2	6	1256378	1256383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837710
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23084	NC_021814	CTTG	2	8	1256766	1256773	0 %	50 %	25 %	25 %	525837711
23085	NC_021814	ATTA	2	8	1256791	1256798	50 %	50 %	0 %	0 %	525837711
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23088	NC_021814	TGA	2	6	1256939	1256944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837711
23089	NC_021814	GCG	2	6	1256989	1256994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837711
23090	NC_021814	AGG	2	6	1257008	1257013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837711
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23100	NC_021814	GTA	2	6	1257667	1257672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837711
23101	NC_021814	CGT	2	6	1257696	1257701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837711
23102	NC_021814	CGC	2	6	1257702	1257707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837711
23103	NC_021814	GC	3	6	1257731	1257736	0 %	0 %	50 %	50 %	525837711
23104	NC_021814	AGC	2	6	1257757	1257762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837711
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23108	NC_021814	ATT	2	6	1258222	1258227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837712
23109	NC_021814	GC	3	6	1258239	1258244	0 %	0 %	50 %	50 %	525837712
23110	NC_021814	CGG	2	6	1258273	1258278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837712
23111	NC_021814	CAG	2	6	1258283	1258288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837712
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23113	NC_021814	GC	3	6	1258353	1258358	0 %	0 %	50 %	50 %	525837712
23114	NC_021814	CG	3	6	1258371	1258376	0 %	0 %	50 %	50 %	525837712
23115	NC_021814	GCA	2	6	1258384	1258389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837712
23116	NC_021814	TCA	2	6	1258405	1258410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837712
23117	NC_021814	GCT	2	6	1258411	1258416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837712
23118	NC_021814	CGA	2	6	1258450	1258455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837712
23119	NC_021814	CGC	2	6	1258518	1258523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837712
23120	NC_021814	T	6	6	1258565	1258570	0 %	100 %	0 %	0 %	525837712
23121	NC_021814	GCT	2	6	1258594	1258599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837712
23122	NC_021814	CGTAG	2	10	1258607	1258616	20 %	20 %	40 %	20 %	525837712
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23128	NC_021814	TGTTC	2	10	1258832	1258841	0 %	60 %	20 %	20 %	525837713
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23220	NC_021814	ATA	2	6	1263767	1263772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837718
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23223	NC_021814	TAT	2	6	1263850	1263855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837718
23224	NC_021814	AGT	2	6	1263876	1263881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837718
23225	NC_021814	GTA	2	6	1263920	1263925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837718
23226	NC_021814	TCT	2	6	1264003	1264008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837718
23227	NC_021814	AG	4	8	1264086	1264093	50 %	0 %	50 %	0 %	525837718
23228	NC_021814	CTT	2	6	1264312	1264317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837719
23229	NC_021814	CAG	2	6	1264324	1264329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837719
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23231	NC_021814	GTTT	2	8	1264347	1264354	0 %	75 %	25 %	0 %	525837719
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23233	NC_021814	GGC	2	6	1264538	1264543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837719
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23345	NC_021814	CTGG	2	8	1271402	1271409	0 %	25 %	50 %	25 %	525837725
23346	NC_021814	CCG	2	6	1271467	1271472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837725
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23348	NC_021814	TAA	2	6	1271714	1271719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837725
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