MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_021814	GGC	2	6	1166879	1166884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840673
21503	NC_021814	CGG	2	6	1166891	1166896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840673
21504	NC_021814	CGC	2	6	1166915	1166920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840673
21505	NC_021814	GAG	2	6	1166928	1166933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840673
21506	NC_021814	TAC	2	6	1166964	1166969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840673
21507	NC_021814	CTG	2	6	1167003	1167008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840673
21508	NC_021814	GGGC	2	8	1167017	1167024	0 %	0 %	75 %	25 %	525840673
21509	NC_021814	CCG	3	9	1167050	1167058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840673
21510	NC_021814	TTA	2	6	1167098	1167103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837645
21511	NC_021814	GCT	2	6	1167106	1167111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837645
21512	NC_021814	CTG	2	6	1167119	1167124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837645
21513	NC_021814	GCT	2	6	1167136	1167141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837645
21514	NC_021814	GC	3	6	1167152	1167157	0 %	0 %	50 %	50 %	525837645
21515	NC_021814	CGA	2	6	1167177	1167182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837645
21516	NC_021814	TGC	2	6	1167291	1167296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837645
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21518	NC_021814	GAC	2	6	1167398	1167403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837645
21519	NC_021814	GC	3	6	1167504	1167509	0 %	0 %	50 %	50 %	525837645
21520	NC_021814	GGC	2	6	1167625	1167630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837645
21521	NC_021814	TGATGC	2	12	1167656	1167667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525837646
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21540	NC_021814	GGGTG	2	10	1168081	1168090	0 %	20 %	80 %	0 %	525837646
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21546	NC_021814	GGCT	2	8	1168315	1168322	0 %	25 %	50 %	25 %	525837646
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21550	NC_021814	CGG	2	6	1168476	1168481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837646
21551	NC_021814	GCT	2	6	1168485	1168490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837646
21552	NC_021814	AGC	3	9	1168559	1168567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837646
21553	NC_021814	GGC	2	6	1168584	1168589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837646
21554	NC_021814	GAT	2	6	1168596	1168601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837646
21555	NC_021814	CGG	2	6	1168616	1168621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837646
21556	NC_021814	CGG	2	6	1168630	1168635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837646
21557	NC_021814	CGC	2	6	1168757	1168762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837647
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21559	NC_021814	TTTG	2	8	1168849	1168856	0 %	75 %	25 %	0 %	525837647
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21565	NC_021814	GATC	2	8	1169230	1169237	25 %	25 %	25 %	25 %	525837647
21566	NC_021814	TCCAGT	2	12	1169283	1169294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525837647
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21568	NC_021814	GTC	2	6	1169327	1169332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837647
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21582	NC_021814	TA	3	6	1170470	1170475	50 %	50 %	0 %	0 %	525840674
21583	NC_021814	GAT	2	6	1170491	1170496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840674
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21588	NC_021814	CAGC	2	8	1171171	1171178	25 %	0 %	25 %	50 %	525837648
21589	NC_021814	GCG	2	6	1171179	1171184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837648
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21597	NC_021814	TGGT	2	8	1171609	1171616	0 %	50 %	50 %	0 %	525840675
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21601	NC_021814	GGC	2	6	1171836	1171841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840675
21602	NC_021814	TTTG	2	8	1171859	1171866	0 %	75 %	25 %	0 %	525840675
21603	NC_021814	CGT	2	6	1171869	1171874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840675
21604	NC_021814	CG	3	6	1171883	1171888	0 %	0 %	50 %	50 %	525840675
21605	NC_021814	TTA	2	6	1171906	1171911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840675
21606	NC_021814	TGA	2	6	1171919	1171924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840675
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21608	NC_021814	CTGG	2	8	1171955	1171962	0 %	25 %	50 %	25 %	525840675
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21614	NC_021814	A	6	6	1172922	1172927	100 %	0 %	0 %	0 %	525840676
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21967	NC_021814	TGG	2	6	1194731	1194736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837661
21968	NC_021814	CTT	2	6	1194747	1194752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837661
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21996	NC_021814	CCA	2	6	1196278	1196283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837662
21997	NC_021814	CAG	2	6	1196315	1196320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837662
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21999	NC_021814	AAT	2	6	1196357	1196362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837662
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