MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20501	NC_021814	GCGA	2	8	1118569	1118576	25 %	0 %	50 %	25 %	525837610
20502	NC_021814	AGA	2	6	1118577	1118582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837610
20503	NC_021814	TAT	2	6	1118643	1118648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837610
20504	NC_021814	GGT	2	6	1118745	1118750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837610
20505	NC_021814	GGC	2	6	1118769	1118774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837610
20506	NC_021814	GCATTG	2	12	1118861	1118872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525837610
20507	NC_021814	GCA	2	6	1118923	1118928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837610
20508	NC_021814	GGC	2	6	1118997	1119002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837610
20509	NC_021814	GTT	2	6	1119078	1119083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837610
20510	NC_021814	GCG	2	6	1119094	1119099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837610
20511	NC_021814	CTG	2	6	1119103	1119108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837610
20512	NC_021814	CAT	2	6	1119126	1119131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837610
20513	NC_021814	ATTA	2	8	1119138	1119145	50 %	50 %	0 %	0 %	525837610
20514	NC_021814	CAT	2	6	1119193	1119198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837610
20515	NC_021814	AAG	2	6	1119255	1119260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837611
20516	NC_021814	ACC	2	6	1119305	1119310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837611
20517	NC_021814	GCG	2	6	1119329	1119334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837611
20518	NC_021814	GTT	2	6	1119352	1119357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837611
20519	NC_021814	ATC	2	6	1119399	1119404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837611
20520	NC_021814	GCCA	2	8	1119428	1119435	25 %	0 %	25 %	50 %	525837611
20521	NC_021814	GC	3	6	1119539	1119544	0 %	0 %	50 %	50 %	525837611
20522	NC_021814	CCG	2	6	1119569	1119574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837611
20523	NC_021814	GCG	2	6	1119611	1119616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837611
20524	NC_021814	TC	3	6	1119763	1119768	0 %	50 %	0 %	50 %	525837611
20525	NC_021814	CGC	2	6	1119847	1119852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837611
20526	NC_021814	GCG	2	6	1119860	1119865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837611
20527	NC_021814	T	6	6	1119868	1119873	0 %	100 %	0 %	0 %	525837611
20528	NC_021814	CAG	2	6	1119970	1119975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837611
20529	NC_021814	TCAG	2	8	1119997	1120004	25 %	25 %	25 %	25 %	525837611
20530	NC_021814	AGG	2	6	1120103	1120108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837612
20531	NC_021814	TGC	2	6	1120133	1120138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837612
20532	NC_021814	AT	3	6	1120340	1120345	50 %	50 %	0 %	0 %	525837613
20533	NC_021814	GCC	2	6	1120348	1120353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837613
20534	NC_021814	TGC	2	6	1120568	1120573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837613
20535	NC_021814	ATA	2	6	1120610	1120615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837613
20536	NC_021814	ATTTT	2	10	1120633	1120642	20 %	80 %	0 %	0 %	525837613
20537	NC_021814	T	6	6	1120639	1120644	0 %	100 %	0 %	0 %	525837613
20538	NC_021814	AT	3	6	1120756	1120761	50 %	50 %	0 %	0 %	525837613
20539	NC_021814	TGG	2	6	1120768	1120773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837613
20540	NC_021814	GA	3	6	1120806	1120811	50 %	0 %	50 %	0 %	525837613
20541	NC_021814	GCT	2	6	1120845	1120850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837613
20542	NC_021814	GAC	2	6	1120860	1120865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837613
20543	NC_021814	CAC	2	6	1120876	1120881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837613
20544	NC_021814	TCTG	2	8	1120914	1120921	0 %	50 %	25 %	25 %	525837613
20545	NC_021814	T	7	7	1120960	1120966	0 %	100 %	0 %	0 %	525837613
20546	NC_021814	TAT	2	6	1121038	1121043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837613
20547	NC_021814	TGAT	2	8	1121091	1121098	25 %	50 %	25 %	0 %	525837613
20548	NC_021814	T	7	7	1121098	1121104	0 %	100 %	0 %	0 %	525837613
20549	NC_021814	TGA	2	6	1121114	1121119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837613
20550	NC_021814	ACA	2	6	1121248	1121253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837613
20551	NC_021814	TA	3	6	1121284	1121289	50 %	50 %	0 %	0 %	525837613
20552	NC_021814	AT	3	6	1121335	1121340	50 %	50 %	0 %	0 %	525837613
20553	NC_021814	GAC	2	6	1121863	1121868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837614
20554	NC_021814	CT	3	6	1121882	1121887	0 %	50 %	0 %	50 %	525837614
20555	NC_021814	GCG	2	6	1121904	1121909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837614
20556	NC_021814	GCA	2	6	1121971	1121976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837614
20557	NC_021814	T	6	6	1122051	1122056	0 %	100 %	0 %	0 %	525837614
20558	NC_021814	CGCAA	2	10	1122215	1122224	40 %	0 %	20 %	40 %	525837614
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20562	NC_021814	GCG	2	6	1122520	1122525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837614
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20566	NC_021814	CG	3	6	1122718	1122723	0 %	0 %	50 %	50 %	525837614
20567	NC_021814	GC	3	6	1122725	1122730	0 %	0 %	50 %	50 %	525837614
20568	NC_021814	GAT	2	6	1122733	1122738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837614
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20570	NC_021814	GC	3	6	1122819	1122824	0 %	0 %	50 %	50 %	525837614
20571	NC_021814	TCCGG	2	10	1122851	1122860	0 %	20 %	40 %	40 %	525837614
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20574	NC_021814	CGC	4	12	1123022	1123033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837615
20575	NC_021814	AGGG	2	8	1123108	1123115	25 %	0 %	75 %	0 %	525837615
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20578	NC_021814	GAA	2	6	1123167	1123172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837615
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20582	NC_021814	CTTCA	2	10	1123377	1123386	20 %	40 %	0 %	40 %	525837615
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20586	NC_021814	GC	3	6	1123490	1123495	0 %	0 %	50 %	50 %	525837615
20587	NC_021814	CGTT	2	8	1123504	1123511	0 %	50 %	25 %	25 %	525837615
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20593	NC_021814	CGA	2	6	1123790	1123795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837615
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20600	NC_021814	GTCA	2	8	1124040	1124047	25 %	25 %	25 %	25 %	525837615
20601	NC_021814	GGA	2	6	1124091	1124096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837615
20602	NC_021814	GC	3	6	1124105	1124110	0 %	0 %	50 %	50 %	525837615
20603	NC_021814	TGC	2	6	1124146	1124151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837615
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20606	NC_021814	AG	3	6	1124338	1124343	50 %	0 %	50 %	0 %	525837616
20607	NC_021814	GTC	2	6	1124366	1124371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837616
20608	NC_021814	CG	3	6	1124398	1124403	0 %	0 %	50 %	50 %	525837616
20609	NC_021814	CAG	2	6	1124464	1124469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837616
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