MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_021814	GGC	2	6	1042688	1042693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837550
19003	NC_021814	TTTGGC	2	12	1042700	1042711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525837550
19004	NC_021814	TAA	2	6	1042741	1042746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837550
19005	NC_021814	CAG	2	6	1042778	1042783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837550
19006	NC_021814	ACC	2	6	1042797	1042802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837550
19007	NC_021814	GCC	2	6	1042813	1042818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837550
19008	NC_021814	GCC	2	6	1042862	1042867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837550
19009	NC_021814	GCG	2	6	1042882	1042887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837550
19010	NC_021814	GGT	2	6	1042889	1042894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837550
19011	NC_021814	GGCCT	2	10	1042910	1042919	0 %	20 %	40 %	40 %	525837550
19012	NC_021814	TAA	2	6	1042929	1042934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837550
19013	NC_021814	T	7	7	1042964	1042970	0 %	100 %	0 %	0 %	525837550
19014	NC_021814	GTA	2	6	1043084	1043089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837550
19015	NC_021814	CAC	2	6	1043098	1043103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837550
19016	NC_021814	TGA	2	6	1043127	1043132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837550
19017	NC_021814	TGG	2	6	1043185	1043190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837550
19018	NC_021814	AT	3	6	1043196	1043201	50 %	50 %	0 %	0 %	525837550
19019	NC_021814	TGAC	2	8	1043409	1043416	25 %	25 %	25 %	25 %	525837551
19020	NC_021814	GC	3	6	1043528	1043533	0 %	0 %	50 %	50 %	525837551
19021	NC_021814	ATT	2	6	1043573	1043578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837551
19022	NC_021814	CAG	2	6	1043597	1043602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837551
19023	NC_021814	GCG	2	6	1043609	1043614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837551
19024	NC_021814	CTT	2	6	1043632	1043637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837551
19025	NC_021814	GTG	2	6	1043777	1043782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837551
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19028	NC_021814	GAA	2	6	1043887	1043892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837551
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19031	NC_021814	TGG	2	6	1044114	1044119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837551
19032	NC_021814	ATTTG	2	10	1044157	1044166	20 %	60 %	20 %	0 %	525837551
19033	NC_021814	GCG	2	6	1044177	1044182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837551
19034	NC_021814	GAC	2	6	1044206	1044211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837551
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19038	NC_021814	CT	3	6	1044467	1044472	0 %	50 %	0 %	50 %	525837551
19039	NC_021814	CAGC	2	8	1044475	1044482	25 %	0 %	25 %	50 %	525837551
19040	NC_021814	ACG	2	6	1044534	1044539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837551
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19042	NC_021814	ATT	2	6	1044579	1044584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837551
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19049	NC_021814	T	6	6	1045043	1045048	0 %	100 %	0 %	0 %	525837552
19050	NC_021814	GCG	2	6	1045065	1045070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837552
19051	NC_021814	GTTT	2	8	1045157	1045164	0 %	75 %	25 %	0 %	525837552
19052	NC_021814	TGC	2	6	1045197	1045202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837552
19053	NC_021814	CGG	3	9	1045234	1045242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837552
19054	NC_021814	TGA	2	6	1045305	1045310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837552
19055	NC_021814	ATGGA	2	10	1045322	1045331	40 %	20 %	40 %	0 %	525837552
19056	NC_021814	ATT	2	6	1045337	1045342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837552
19057	NC_021814	GCG	2	6	1045362	1045367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837552
19058	NC_021814	TATT	2	8	1045368	1045375	25 %	75 %	0 %	0 %	525837552
19059	NC_021814	GTA	2	6	1045403	1045408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837552
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19067	NC_021814	TGC	3	9	1045708	1045716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837552
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19069	NC_021814	CTGG	2	8	1045795	1045802	0 %	25 %	50 %	25 %	525837552
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19116	NC_021814	GCGAAT	2	12	1047955	1047966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525837554
19117	NC_021814	GCGG	2	8	1048014	1048021	0 %	0 %	75 %	25 %	525837554
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19348	NC_021814	AT	3	6	1060116	1060121	50 %	50 %	0 %	0 %	525840657
19349	NC_021814	CTT	2	6	1060245	1060250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840657
19350	NC_021814	TG	3	6	1060358	1060363	0 %	50 %	50 %	0 %	525840657
19351	NC_021814	T	6	6	1060413	1060418	0 %	100 %	0 %	0 %	525840657
19352	NC_021814	ATG	2	6	1060450	1060455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840657
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19368	NC_021814	TGG	2	6	1061072	1061077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840657
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19374	NC_021814	CG	3	6	1061464	1061469	0 %	0 %	50 %	50 %	525840658
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19455	NC_021814	CAG	2	6	1065551	1065556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837570
19456	NC_021814	GCC	2	6	1065591	1065596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837570
19457	NC_021814	TCG	2	6	1065615	1065620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837570
19458	NC_021814	GCA	2	6	1065628	1065633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837570
19459	NC_021814	TCAG	2	8	1065663	1065670	25 %	25 %	25 %	25 %	525837570
19460	NC_021814	CGG	2	6	1065686	1065691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837570
19461	NC_021814	AG	3	6	1065692	1065697	50 %	0 %	50 %	0 %	525837570
19462	NC_021814	ACG	2	6	1065698	1065703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837570
19463	NC_021814	TCA	2	6	1065795	1065800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837570
19464	NC_021814	GGTGTT	2	12	1065848	1065859	0 %	50 %	50 %	0 %	525837570
19465	NC_021814	GC	3	6	1065914	1065919	0 %	0 %	50 %	50 %	525837570
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19468	NC_021814	TAC	2	6	1066066	1066071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837570
19469	NC_021814	GC	3	6	1066072	1066077	0 %	0 %	50 %	50 %	525837570
19470	NC_021814	CGG	2	6	1066098	1066103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837570
19471	NC_021814	ATG	2	6	1066125	1066130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837570
19472	NC_021814	GTC	2	6	1066271	1066276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837570
19473	NC_021814	TCA	2	6	1066314	1066319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837570
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19475	NC_021814	CGC	2	6	1066372	1066377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837570
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19481	NC_021814	GTG	2	6	1066689	1066694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837570
19482	NC_021814	CGC	2	6	1066711	1066716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837570
19483	NC_021814	ATA	3	9	1066836	1066844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837570
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19486	NC_021814	CAC	2	6	1066986	1066991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837571
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19488	NC_021814	TGA	2	6	1067015	1067020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837571
19489	NC_021814	GCC	2	6	1067041	1067046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837571
19490	NC_021814	CCG	2	6	1067134	1067139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837571
19491	NC_021814	GAC	2	6	1067159	1067164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837571
19492	NC_021814	TCT	2	6	1067239	1067244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837571
19493	NC_021814	TGG	2	6	1067246	1067251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837571
19494	NC_021814	TCAG	2	8	1067290	1067297	25 %	25 %	25 %	25 %	525837571
19495	NC_021814	CAG	2	6	1067301	1067306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837571
19496	NC_021814	TGATC	2	10	1067333	1067342	20 %	40 %	20 %	20 %	525837571
19497	NC_021814	CCG	2	6	1067488	1067493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837571
19498	NC_021814	TTC	2	6	1067523	1067528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837571
19499	NC_021814	CGA	2	6	1067599	1067604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837571
19500	NC_021814	TTC	2	6	1067652	1067657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837571

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