MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_021814	GGC	2	6	1016760	1016765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840653
18503	NC_021814	GCG	2	6	1016776	1016781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840653
18504	NC_021814	GGC	2	6	1016808	1016813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840653
18505	NC_021814	ATCA	2	8	1016850	1016857	50 %	25 %	0 %	25 %	525840653
18506	NC_021814	CGC	3	9	1016898	1016906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840653
18507	NC_021814	ACA	2	6	1017026	1017031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840653
18508	NC_021814	TGG	2	6	1017034	1017039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840653
18509	NC_021814	GCT	2	6	1017060	1017065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840653
18510	NC_021814	CTT	2	6	1017088	1017093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840653
18511	NC_021814	GCG	2	6	1017114	1017119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840653
18512	NC_021814	GATTG	2	10	1017143	1017152	20 %	40 %	40 %	0 %	525840653
18513	NC_021814	T	6	6	1017156	1017161	0 %	100 %	0 %	0 %	525840653
18514	NC_021814	A	6	6	1017172	1017177	100 %	0 %	0 %	0 %	525840653
18515	NC_021814	A	6	6	1017249	1017254	100 %	0 %	0 %	0 %	525840653
18516	NC_021814	GTC	2	6	1017273	1017278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840653
18517	NC_021814	AT	3	6	1017320	1017325	50 %	50 %	0 %	0 %	525840653
18518	NC_021814	CTGA	2	8	1017345	1017352	25 %	25 %	25 %	25 %	525840653
18519	NC_021814	CGC	2	6	1017377	1017382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840653
18520	NC_021814	ATT	2	6	1017456	1017461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840653
18521	NC_021814	GGC	2	6	1017473	1017478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840653
18522	NC_021814	GC	3	6	1017496	1017501	0 %	0 %	50 %	50 %	525840653
18523	NC_021814	TGT	2	6	1017509	1017514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840653
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18525	NC_021814	A	6	6	1017597	1017602	100 %	0 %	0 %	0 %	525840653
18526	NC_021814	GCA	2	6	1017662	1017667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840653
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18528	NC_021814	CGA	2	6	1017719	1017724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840653
18529	NC_021814	GC	4	8	1017739	1017746	0 %	0 %	50 %	50 %	525840653
18530	NC_021814	CCG	2	6	1017783	1017788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840653
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18532	NC_021814	GCC	2	6	1018216	1018221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837525
18533	NC_021814	TTC	2	6	1018331	1018336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837525
18534	NC_021814	GATCG	2	10	1018470	1018479	20 %	20 %	40 %	20 %	525837525
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18539	NC_021814	CAG	2	6	1018804	1018809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837526
18540	NC_021814	CGC	2	6	1018818	1018823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837526
18541	NC_021814	TGA	2	6	1018841	1018846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837526
18542	NC_021814	TGC	2	6	1018865	1018870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837526
18543	NC_021814	GCCA	2	8	1018871	1018878	25 %	0 %	25 %	50 %	525837526
18544	NC_021814	CATG	2	8	1018917	1018924	25 %	25 %	25 %	25 %	525837526
18545	NC_021814	A	6	6	1018935	1018940	100 %	0 %	0 %	0 %	525837526
18546	NC_021814	GGC	2	6	1018957	1018962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837526
18547	NC_021814	CGC	2	6	1019040	1019045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837526
18548	NC_021814	T	8	8	1019052	1019059	0 %	100 %	0 %	0 %	525837526
18549	NC_021814	AGC	2	6	1019114	1019119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837526
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18551	NC_021814	TCC	2	6	1019279	1019284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837526
18552	NC_021814	TCG	2	6	1019489	1019494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837527
18553	NC_021814	GCG	2	6	1019560	1019565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837527
18554	NC_021814	CG	3	6	1019670	1019675	0 %	0 %	50 %	50 %	525837527
18555	NC_021814	CGAG	2	8	1019706	1019713	25 %	0 %	50 %	25 %	525837527
18556	NC_021814	TCG	2	6	1019718	1019723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837527
18557	NC_021814	TAA	2	6	1019838	1019843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837527
18558	NC_021814	TTA	2	6	1019858	1019863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837527
18559	NC_021814	AT	3	6	1019877	1019882	50 %	50 %	0 %	0 %	525837527
18560	NC_021814	CATCGC	2	12	1019910	1019921	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525837527
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18564	NC_021814	CGAA	2	8	1020134	1020141	50 %	0 %	25 %	25 %	525837527
18565	NC_021814	CGT	2	6	1020199	1020204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837527
18566	NC_021814	CTGG	2	8	1020312	1020319	0 %	25 %	50 %	25 %	525837527
18567	NC_021814	CGG	2	6	1020330	1020335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837527
18568	NC_021814	TCG	2	6	1020520	1020525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837528
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18572	NC_021814	TC	3	6	1020644	1020649	0 %	50 %	0 %	50 %	525837528
18573	NC_021814	GAC	2	6	1020668	1020673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837528
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18576	NC_021814	GC	4	8	1021022	1021029	0 %	0 %	50 %	50 %	525837528
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18584	NC_021814	GT	3	6	1021409	1021414	0 %	50 %	50 %	0 %	525837528
18585	NC_021814	CTG	2	6	1021473	1021478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837528
18586	NC_021814	A	7	7	1021536	1021542	100 %	0 %	0 %	0 %	525837529
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18589	NC_021814	GCC	2	6	1021629	1021634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837529
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18593	NC_021814	TGCC	2	8	1021831	1021838	0 %	25 %	25 %	50 %	525837529
18594	NC_021814	TCA	2	6	1021868	1021873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837529
18595	NC_021814	GTC	2	6	1022000	1022005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837529
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18599	NC_021814	CTGCC	2	10	1022177	1022186	0 %	20 %	20 %	60 %	525837529
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18602	NC_021814	CAC	2	6	1022279	1022284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837529
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18606	NC_021814	GCT	3	9	1022392	1022400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837530
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18735	NC_021814	TGA	2	6	1028726	1028731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837536
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