MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18012	NC_021814	AATG	2	8	987545	987552	50 %	25 %	25 %	0 %	525837504
18013	NC_021814	TGC	2	6	987585	987590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837504
18014	NC_021814	TGC	2	6	987612	987617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837504
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18022	NC_021814	TGCG	2	8	988332	988339	0 %	25 %	50 %	25 %	525837504
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18105	NC_021814	GCG	2	6	993181	993186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837508
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18238	NC_021814	GGC	2	6	1000805	1000810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837513
18239	NC_021814	TGG	3	9	1000843	1000851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837513
18240	NC_021814	CAAAC	2	10	1000918	1000927	60 %	0 %	0 %	40 %	525837513
18241	NC_021814	T	7	7	1000937	1000943	0 %	100 %	0 %	0 %	525837513
18242	NC_021814	GC	3	6	1000945	1000950	0 %	0 %	50 %	50 %	525837513
18243	NC_021814	ATC	2	6	1000980	1000985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837513
18244	NC_021814	CG	3	6	1001008	1001013	0 %	0 %	50 %	50 %	525837513
18245	NC_021814	CAT	2	6	1001060	1001065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837513
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18251	NC_021814	CG	3	6	1001480	1001485	0 %	0 %	50 %	50 %	525837513
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18322	NC_021814	TCAG	2	8	1005876	1005883	25 %	25 %	25 %	25 %	525837517
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18341	NC_021814	GTA	2	6	1006521	1006526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837517
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18343	NC_021814	GCG	2	6	1006581	1006586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837517
18344	NC_021814	CGACT	2	10	1006720	1006729	20 %	20 %	20 %	40 %	525837517
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18346	NC_021814	GC	3	6	1006861	1006866	0 %	0 %	50 %	50 %	525837517
18347	NC_021814	TATT	2	8	1006970	1006977	25 %	75 %	0 %	0 %	525837517
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18352	NC_021814	CCA	2	6	1007179	1007184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837517
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18354	NC_021814	CAG	2	6	1007252	1007257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837517
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18469	NC_021814	GC	3	6	1015140	1015145	0 %	0 %	50 %	50 %	525837524
18470	NC_021814	GAA	2	6	1015177	1015182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837524
18471	NC_021814	TGA	2	6	1015184	1015189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837524
18472	NC_021814	GCC	2	6	1015200	1015205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837524
18473	NC_021814	AGA	2	6	1015224	1015229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837524
18474	NC_021814	CAA	2	6	1015230	1015235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837524
18475	NC_021814	CCG	2	6	1015310	1015315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837524
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18477	NC_021814	TGA	2	6	1015358	1015363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837524
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18481	NC_021814	CTG	2	6	1015573	1015578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837524
18482	NC_021814	CGG	2	6	1015659	1015664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837524
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18491	NC_021814	TGG	2	6	1016290	1016295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840653
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18493	NC_021814	A	6	6	1016424	1016429	100 %	0 %	0 %	0 %	525840653
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18496	NC_021814	ACTGG	2	10	1016583	1016592	20 %	20 %	40 %	20 %	525840653
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18498	NC_021814	GC	4	8	1016625	1016632	0 %	0 %	50 %	50 %	525840653
18499	NC_021814	GC	3	6	1016672	1016677	0 %	0 %	50 %	50 %	525840653
18500	NC_021814	A	6	6	1016703	1016708	100 %	0 %	0 %	0 %	525840653

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