MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_021814	GCG	2	6	960130	960135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837480
17502	NC_021814	CGG	2	6	960147	960152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837480
17503	NC_021814	CGG	2	6	960216	960221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837480
17504	NC_021814	GTG	2	6	960331	960336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837480
17505	NC_021814	GCC	2	6	960415	960420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837480
17506	NC_021814	CAT	2	6	960462	960467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837480
17507	NC_021814	TAC	3	9	960475	960483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837480
17508	NC_021814	GCAA	2	8	960509	960516	50 %	0 %	25 %	25 %	525837480
17509	NC_021814	GAA	2	6	960553	960558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837480
17510	NC_021814	TGA	2	6	960581	960586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837480
17511	NC_021814	GCG	3	9	960602	960610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837480
17512	NC_021814	GGC	2	6	960627	960632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837480
17513	NC_021814	GTAA	2	8	960638	960645	50 %	25 %	25 %	0 %	525837480
17514	NC_021814	TTC	2	6	960656	960661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837481
17515	NC_021814	TGC	2	6	960670	960675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837481
17516	NC_021814	GC	3	6	960742	960747	0 %	0 %	50 %	50 %	525837481
17517	NC_021814	GGT	2	6	960809	960814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837481
17518	NC_021814	GGC	2	6	960839	960844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837481
17519	NC_021814	CTG	2	6	960879	960884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837481
17520	NC_021814	GAA	2	6	961155	961160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837481
17521	NC_021814	GCG	2	6	961161	961166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837481
17522	NC_021814	TGC	2	6	961210	961215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837481
17523	NC_021814	CT	3	6	961251	961256	0 %	50 %	0 %	50 %	525837481
17524	NC_021814	TGA	2	6	961336	961341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837481
17525	NC_021814	TGC	3	9	961414	961422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837481
17526	NC_021814	ACG	2	6	961506	961511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837482
17527	NC_021814	CTG	2	6	961577	961582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837482
17528	NC_021814	GAT	2	6	961588	961593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837482
17529	NC_021814	TGC	2	6	961662	961667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837482
17530	NC_021814	CTG	2	6	961733	961738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837482
17531	NC_021814	CTG	2	6	961781	961786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837482
17532	NC_021814	CTG	2	6	961790	961795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837482
17533	NC_021814	GGT	2	6	961819	961824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837482
17534	NC_021814	CTG	2	6	961841	961846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837482
17535	NC_021814	GGCT	2	8	961874	961881	0 %	25 %	50 %	25 %	525837482
17536	NC_021814	ATG	2	6	961901	961906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837482
17537	NC_021814	GGC	2	6	962011	962016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837482
17538	NC_021814	CGC	2	6	962051	962056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837482
17539	NC_021814	GTG	2	6	962096	962101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837482
17540	NC_021814	CG	3	6	962114	962119	0 %	0 %	50 %	50 %	525837482
17541	NC_021814	GGT	2	6	962143	962148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837482
17542	NC_021814	ACA	2	6	962214	962219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837482
17543	NC_021814	CCG	3	9	962235	962243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837482
17544	NC_021814	TTG	2	6	962246	962251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837482
17545	NC_021814	ATT	2	6	962264	962269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837482
17546	NC_021814	CG	3	6	962321	962326	0 %	0 %	50 %	50 %	525837482
17547	NC_021814	AGG	2	6	962331	962336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837482
17548	NC_021814	TTCC	2	8	962416	962423	0 %	50 %	0 %	50 %	525837483
17549	NC_021814	TTG	2	6	962439	962444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837483
17550	NC_021814	ACG	2	6	962466	962471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837483
17551	NC_021814	CTG	2	6	962472	962477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837483
17552	NC_021814	ATT	2	6	962481	962486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837483
17553	NC_021814	GCC	2	6	962542	962547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837483
17554	NC_021814	CG	3	6	962552	962557	0 %	0 %	50 %	50 %	525837483
17555	NC_021814	ACA	2	6	962620	962625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837483
17556	NC_021814	TGC	2	6	962644	962649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837483
17557	NC_021814	CGCGA	2	10	962650	962659	20 %	0 %	40 %	40 %	525837483
17558	NC_021814	GCG	3	9	962670	962678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837483
17559	NC_021814	CGG	2	6	962756	962761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837483
17560	NC_021814	TGGCGC	2	12	962776	962787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525837483
17561	NC_021814	GC	5	10	962784	962793	0 %	0 %	50 %	50 %	525837483
17562	NC_021814	CTG	2	6	962817	962822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837483
17563	NC_021814	GC	3	6	962836	962841	0 %	0 %	50 %	50 %	525837483
17564	NC_021814	GAA	2	6	962892	962897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837483
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17567	NC_021814	GC	3	6	963106	963111	0 %	0 %	50 %	50 %	525837483
17568	NC_021814	GCC	2	6	963190	963195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837483
17569	NC_021814	GGT	2	6	963283	963288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837483
17570	NC_021814	GGT	2	6	963305	963310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837483
17571	NC_021814	GTTT	2	8	963346	963353	0 %	75 %	25 %	0 %	525837483
17572	NC_021814	CGC	2	6	963539	963544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837484
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17575	NC_021814	GAT	2	6	963648	963653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837484
17576	NC_021814	GAT	2	6	963738	963743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837484
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17581	NC_021814	CGAGG	2	10	963901	963910	20 %	0 %	60 %	20 %	525837484
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17586	NC_021814	AT	3	6	964152	964157	50 %	50 %	0 %	0 %	525837484
17587	NC_021814	TCA	2	6	964203	964208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837484
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17590	NC_021814	CGG	2	6	964275	964280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837484
17591	NC_021814	GTG	2	6	964330	964335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837484
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17595	NC_021814	TTG	2	6	964664	964669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840645
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17598	NC_021814	CAT	2	6	964778	964783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840645
17599	NC_021814	TCG	3	9	964794	964802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840645
17600	NC_021814	GCG	2	6	964919	964924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840645
17601	NC_021814	A	6	6	964926	964931	100 %	0 %	0 %	0 %	525840645
17602	NC_021814	GCG	2	6	964939	964944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840645
17603	NC_021814	ATA	2	6	965006	965011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840645
17604	NC_021814	A	6	6	965063	965068	100 %	0 %	0 %	0 %	525840645
17605	NC_021814	GAC	4	12	965208	965219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837485
17606	NC_021814	CGG	2	6	965242	965247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837485
17607	NC_021814	ACGA	2	8	965327	965334	50 %	0 %	25 %	25 %	525837485
17608	NC_021814	GC	3	6	965381	965386	0 %	0 %	50 %	50 %	525837485
17609	NC_021814	TTC	2	6	965387	965392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837485
17610	NC_021814	CAG	2	6	965426	965431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837485
17611	NC_021814	ACG	2	6	965439	965444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837485
17612	NC_021814	TTC	2	6	965457	965462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837485
17613	NC_021814	TCAT	2	8	965593	965600	25 %	50 %	0 %	25 %	525837486
17614	NC_021814	GC	3	6	965617	965622	0 %	0 %	50 %	50 %	525837486
17615	NC_021814	CTG	2	6	965673	965678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837486
17616	NC_021814	CA	3	6	965944	965949	50 %	0 %	0 %	50 %	525837486
17617	NC_021814	GCG	2	6	965950	965955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837486
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17979	NC_021814	CGA	2	6	985187	985192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837501
17980	NC_021814	CGGTG	2	10	985217	985226	0 %	20 %	60 %	20 %	525837501
17981	NC_021814	GCG	2	6	985303	985308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837501
17982	NC_021814	GAT	2	6	985334	985339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837501
17983	NC_021814	CGGTG	2	10	985355	985364	0 %	20 %	60 %	20 %	525837501
17984	NC_021814	CTG	2	6	985398	985403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837501
17985	NC_021814	ACC	2	6	985411	985416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837501
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17987	NC_021814	A	6	6	985620	985625	100 %	0 %	0 %	0 %	525837501
17988	NC_021814	GTG	2	6	985659	985664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837501
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17991	NC_021814	CGG	2	6	985729	985734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837501
17992	NC_021814	GCA	2	6	985846	985851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837501
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17997	NC_021814	CGC	2	6	986099	986104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837502
17998	NC_021814	GCAG	2	8	986145	986152	25 %	0 %	50 %	25 %	525837502
17999	NC_021814	GTT	2	6	986260	986265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837502
18000	NC_021814	CAGC	2	8	986311	986318	25 %	0 %	25 %	50 %	525837502

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