MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_021814	GGC	2	6	908054	908059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837437
16503	NC_021814	GTGA	2	8	908073	908080	25 %	25 %	50 %	0 %	525837437
16504	NC_021814	GGCG	2	8	908092	908099	0 %	0 %	75 %	25 %	525837437
16505	NC_021814	CTT	2	6	908201	908206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837437
16506	NC_021814	GCC	2	6	908269	908274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837437
16507	NC_021814	TGGCCA	2	12	908291	908302	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525837437
16508	NC_021814	GC	3	6	908318	908323	0 %	0 %	50 %	50 %	525837437
16509	NC_021814	GCG	2	6	908336	908341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837437
16510	NC_021814	CG	4	8	908364	908371	0 %	0 %	50 %	50 %	525837437
16511	NC_021814	AGCT	2	8	908418	908425	25 %	25 %	25 %	25 %	525837437
16512	NC_021814	GCA	2	6	908462	908467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837437
16513	NC_021814	GCC	2	6	908475	908480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837437
16514	NC_021814	ATT	2	6	908508	908513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837437
16515	NC_021814	A	6	6	908521	908526	100 %	0 %	0 %	0 %	525837437
16516	NC_021814	CAG	2	6	908595	908600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837437
16517	NC_021814	GC	3	6	908618	908623	0 %	0 %	50 %	50 %	525837437
16518	NC_021814	TGC	2	6	908763	908768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837437
16519	NC_021814	CCA	2	6	908780	908785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837437
16520	NC_021814	T	8	8	908788	908795	0 %	100 %	0 %	0 %	525837437
16521	NC_021814	TGG	2	6	909091	909096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837438
16522	NC_021814	GCT	2	6	909140	909145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837438
16523	NC_021814	CTG	2	6	909168	909173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837438
16524	NC_021814	GC	3	6	909186	909191	0 %	0 %	50 %	50 %	525837438
16525	NC_021814	TTA	2	6	909261	909266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837438
16526	NC_021814	GCA	2	6	909296	909301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837438
16527	NC_021814	CGC	2	6	909356	909361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837438
16528	NC_021814	GATG	2	8	909389	909396	25 %	25 %	50 %	0 %	525837438
16529	NC_021814	ATT	2	6	909402	909407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837438
16530	NC_021814	GGT	2	6	909458	909463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837438
16531	NC_021814	CTGGTG	2	12	909513	909524	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525837438
16532	NC_021814	TGC	2	6	909586	909591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837438
16533	NC_021814	CAG	2	6	909636	909641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837438
16534	NC_021814	TGG	4	12	909676	909687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837438
16535	NC_021814	CTGG	2	8	909698	909705	0 %	25 %	50 %	25 %	525837438
16536	NC_021814	T	6	6	909707	909712	0 %	100 %	0 %	0 %	525837438
16537	NC_021814	CTG	2	6	909738	909743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837438
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16540	NC_021814	ATT	2	6	909876	909881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837438
16541	NC_021814	ATT	2	6	909951	909956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837438
16542	NC_021814	GTG	2	6	909963	909968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837438
16543	NC_021814	CGG	2	6	909974	909979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837438
16544	NC_021814	G	6	6	909994	909999	0 %	0 %	100 %	0 %	525837438
16545	NC_021814	CCATT	2	10	910009	910018	20 %	40 %	0 %	40 %	525837438
16546	NC_021814	CAA	2	6	910313	910318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840640
16547	NC_021814	TG	3	6	910324	910329	0 %	50 %	50 %	0 %	525840640
16548	NC_021814	CGGC	2	8	910418	910425	0 %	0 %	50 %	50 %	525840640
16549	NC_021814	TGA	2	6	910588	910593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840640
16550	NC_021814	TTTC	2	8	910680	910687	0 %	75 %	0 %	25 %	525837439
16551	NC_021814	CAC	2	6	910699	910704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837439
16552	NC_021814	TCAA	2	8	910763	910770	50 %	25 %	0 %	25 %	525837439
16553	NC_021814	CA	3	6	910842	910847	50 %	0 %	0 %	50 %	525837439
16554	NC_021814	CAG	2	6	910882	910887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837439
16555	NC_021814	T	6	6	910957	910962	0 %	100 %	0 %	0 %	525837439
16556	NC_021814	TCA	2	6	911161	911166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837440
16557	NC_021814	TGT	2	6	911167	911172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837440
16558	NC_021814	GAC	2	6	911181	911186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837440
16559	NC_021814	AATA	2	8	911286	911293	75 %	25 %	0 %	0 %	525837440
16560	NC_021814	TGCG	2	8	911323	911330	0 %	25 %	50 %	25 %	525837440
16561	NC_021814	TTCAT	2	10	911350	911359	20 %	60 %	0 %	20 %	525837440
16562	NC_021814	CGGG	2	8	911445	911452	0 %	0 %	75 %	25 %	525837440
16563	NC_021814	TCA	2	6	911471	911476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837440
16564	NC_021814	CAG	2	6	911481	911486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837440
16565	NC_021814	TCAA	2	8	911521	911528	50 %	25 %	0 %	25 %	525837440
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16568	NC_021814	CTG	2	6	911623	911628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837440
16569	NC_021814	TGA	2	6	911700	911705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837440
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16571	NC_021814	A	6	6	911932	911937	100 %	0 %	0 %	0 %	525837441
16572	NC_021814	ATG	2	6	912017	912022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837441
16573	NC_021814	TGA	3	9	912038	912046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837441
16574	NC_021814	GACG	2	8	912061	912068	25 %	0 %	50 %	25 %	525837441
16575	NC_021814	TAC	2	6	912175	912180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837441
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16577	NC_021814	GTC	2	6	912305	912310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837441
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16579	NC_021814	TAT	2	6	912327	912332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837441
16580	NC_021814	GCG	2	6	912413	912418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837441
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16585	NC_021814	GC	4	8	912544	912551	0 %	0 %	50 %	50 %	525837441
16586	NC_021814	ACA	2	6	912578	912583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837441
16587	NC_021814	CGAC	2	8	912647	912654	25 %	0 %	25 %	50 %	525837441
16588	NC_021814	AGC	2	6	912708	912713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837441
16589	NC_021814	CTG	2	6	912730	912735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837441
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16592	NC_021814	GCCGC	2	10	912884	912893	0 %	0 %	40 %	60 %	525837442
16593	NC_021814	GCG	2	6	912972	912977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837442
16594	NC_021814	TCCG	2	8	912999	913006	0 %	25 %	25 %	50 %	525837442
16595	NC_021814	CGTTAG	2	12	913017	913028	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525837442
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16597	NC_021814	CG	3	6	913036	913041	0 %	0 %	50 %	50 %	525837442
16598	NC_021814	CGCTA	2	10	913063	913072	20 %	20 %	20 %	40 %	525837442
16599	NC_021814	TGG	2	6	913074	913079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837442
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16602	NC_021814	GCCA	2	8	913163	913170	25 %	0 %	25 %	50 %	525837442
16603	NC_021814	GAC	2	6	913177	913182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837442
16604	NC_021814	CAG	2	6	913265	913270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837442
16605	NC_021814	CGGTAA	2	12	913272	913283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525837442
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16609	NC_021814	GATG	2	8	913435	913442	25 %	25 %	50 %	0 %	525837442
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16612	NC_021814	GCA	2	6	913692	913697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837442
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16615	NC_021814	AAGC	2	8	913970	913977	50 %	0 %	25 %	25 %	525837443
16616	NC_021814	CAG	2	6	914061	914066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837443
16617	NC_021814	GC	4	8	914073	914080	0 %	0 %	50 %	50 %	525837443
16618	NC_021814	GAA	2	6	914206	914211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837443
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16981	NC_021814	ATC	2	6	935024	935029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837456
16982	NC_021814	GCC	2	6	935036	935041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837456
16983	NC_021814	GTC	2	6	935093	935098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837456
16984	NC_021814	GCG	2	6	935111	935116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837456
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