MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_021814	GCG	2	6	883228	883233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16002	NC_021814	CGC	2	6	883316	883321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840635
16003	NC_021814	GGCGC	2	10	883348	883357	0 %	0 %	60 %	40 %	525840635
16004	NC_021814	CAC	2	6	883395	883400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16005	NC_021814	TGA	2	6	883446	883451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840635
16006	NC_021814	GCA	2	6	883574	883579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16007	NC_021814	ACAG	2	8	883591	883598	50 %	0 %	25 %	25 %	525840635
16008	NC_021814	CAG	3	9	883689	883697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16009	NC_021814	CAA	2	6	883708	883713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840635
16010	NC_021814	GTT	2	6	883774	883779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840635
16011	NC_021814	GCG	2	6	883925	883930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16012	NC_021814	CGG	2	6	883931	883936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16013	NC_021814	GGC	2	6	883972	883977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16014	NC_021814	CCA	2	6	884039	884044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16015	NC_021814	CGACGG	2	12	884052	884063	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525840635
16016	NC_021814	GCA	2	6	884171	884176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16017	NC_021814	GCA	2	6	884243	884248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16018	NC_021814	A	6	6	884267	884272	100 %	0 %	0 %	0 %	525840635
16019	NC_021814	CGTCAT	2	12	884306	884317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525840635
16020	NC_021814	CT	3	6	884320	884325	0 %	50 %	0 %	50 %	525840635
16021	NC_021814	TAC	2	6	884370	884375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840635
16022	NC_021814	CGA	2	6	884385	884390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16023	NC_021814	CCAG	2	8	884393	884400	25 %	0 %	25 %	50 %	525840635
16024	NC_021814	GACC	2	8	884409	884416	25 %	0 %	25 %	50 %	525840635
16025	NC_021814	ACG	2	6	884441	884446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16026	NC_021814	GCT	2	6	884487	884492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16027	NC_021814	GC	3	6	884561	884566	0 %	0 %	50 %	50 %	525840635
16028	NC_021814	GCC	2	6	884578	884583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840635
16029	NC_021814	GGACG	2	10	884595	884604	20 %	0 %	60 %	20 %	525840635
16030	NC_021814	CGA	2	6	884646	884651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16031	NC_021814	GATC	2	8	884660	884667	25 %	25 %	25 %	25 %	525840635
16032	NC_021814	TGAT	2	8	884672	884679	25 %	50 %	25 %	0 %	525840635
16033	NC_021814	ATA	2	6	884783	884788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840635
16034	NC_021814	GC	4	8	884839	884846	0 %	0 %	50 %	50 %	525840635
16035	NC_021814	GCAG	2	8	884872	884879	25 %	0 %	50 %	25 %	525840635
16036	NC_021814	GCA	2	6	884936	884941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16037	NC_021814	CGG	2	6	885015	885020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16038	NC_021814	GCC	2	6	885028	885033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840635
16039	NC_021814	CGC	3	9	885039	885047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840635
16040	NC_021814	AAC	2	6	885115	885120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840635
16041	NC_021814	AAC	2	6	885181	885186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840635
16042	NC_021814	GCG	2	6	885191	885196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16043	NC_021814	CAC	2	6	885198	885203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16044	NC_021814	CGG	2	6	885210	885215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16045	NC_021814	GCG	2	6	885251	885256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16046	NC_021814	ACA	2	6	885263	885268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840635
16047	NC_021814	GCG	2	6	885269	885274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16048	NC_021814	GCG	2	6	885362	885367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16049	NC_021814	ACA	2	6	885368	885373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840635
16050	NC_021814	CGG	2	6	885381	885386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16051	NC_021814	CAC	2	6	885387	885392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16052	NC_021814	CGG	2	6	885399	885404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16053	NC_021814	GCG	2	6	885440	885445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16054	NC_021814	GCG	2	6	885458	885463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16055	NC_021814	GCG	2	6	885551	885556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16056	NC_021814	CGG	2	6	885570	885575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16057	NC_021814	CAC	2	6	885576	885581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16058	NC_021814	CGG	2	6	885588	885593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16059	NC_021814	GCG	2	6	885647	885652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16060	NC_021814	GGCGAG	2	12	885664	885675	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	525840635
16061	NC_021814	GCG	2	6	885740	885745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16062	NC_021814	CGG	2	6	885759	885764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16063	NC_021814	CAC	2	6	885765	885770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16064	NC_021814	CGG	2	6	885777	885782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16065	NC_021814	GGCGAG	2	12	885853	885864	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	525840635
16066	NC_021814	GCG	2	6	885929	885934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16067	NC_021814	CGG	2	6	885948	885953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16068	NC_021814	CAC	2	6	885954	885959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16069	NC_021814	CGG	2	6	885966	885971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16070	NC_021814	GGC	2	6	886117	886122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16071	NC_021814	ACA	2	6	886124	886129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840635
16072	NC_021814	CCA	2	6	886142	886147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16073	NC_021814	GCC	2	6	886171	886176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840635
16074	NC_021814	ACA	2	6	886208	886213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840635
16075	NC_021814	CAC	2	6	886263	886268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16076	NC_021814	GCG	2	6	886274	886279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16077	NC_021814	GCA	2	6	886301	886306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16078	NC_021814	CGA	2	6	886374	886379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16079	NC_021814	CCG	2	6	886391	886396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840635
16080	NC_021814	GGC	2	6	886411	886416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16081	NC_021814	ACAG	2	8	886447	886454	50 %	0 %	25 %	25 %	525840635
16082	NC_021814	CGA	2	6	886518	886523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16083	NC_021814	GAAT	2	8	886538	886545	50 %	25 %	25 %	0 %	525840635
16084	NC_021814	AGA	2	6	886548	886553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840635
16085	NC_021814	ACA	2	6	886595	886600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840635
16086	NC_021814	CCTC	2	8	886619	886626	0 %	25 %	0 %	75 %	525840635
16087	NC_021814	AAG	2	6	886781	886786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840635
16088	NC_021814	CT	3	6	886804	886809	0 %	50 %	0 %	50 %	525840635
16089	NC_021814	GCG	2	6	886826	886831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16090	NC_021814	CAC	2	6	886833	886838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16091	NC_021814	CGC	2	6	886860	886865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840635
16092	NC_021814	ACG	2	6	886870	886875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16093	NC_021814	AAT	2	6	886900	886905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840635
16094	NC_021814	CAC	2	6	886956	886961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16095	NC_021814	GCG	2	6	886967	886972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16096	NC_021814	CGA	2	6	886973	886978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
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16098	NC_021814	GGC	2	6	887110	887115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16099	NC_021814	GTC	2	6	887122	887127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16100	NC_021814	GC	4	8	887146	887153	0 %	0 %	50 %	50 %	525840635
16101	NC_021814	GCG	2	6	887207	887212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16102	NC_021814	CAAT	2	8	887273	887280	50 %	25 %	0 %	25 %	525840635
16103	NC_021814	GCG	2	6	887483	887488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16104	NC_021814	GCG	2	6	887501	887506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16105	NC_021814	CAGC	2	8	887568	887575	25 %	0 %	25 %	50 %	525840635
16106	NC_021814	CGG	2	6	887607	887612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16107	NC_021814	AGC	2	6	887743	887748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16108	NC_021814	CGG	2	6	887799	887804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16109	NC_021814	CGA	2	6	887832	887837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16110	NC_021814	CAC	2	6	887883	887888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840635
16111	NC_021814	GTG	2	6	887944	887949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840635
16112	NC_021814	GGC	2	6	887956	887961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16113	NC_021814	A	6	6	887988	887993	100 %	0 %	0 %	0 %	525840635
16114	NC_021814	TACC	2	8	888015	888022	25 %	25 %	0 %	50 %	525840635
16115	NC_021814	TGA	3	9	888078	888086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840635
16116	NC_021814	GCG	2	6	888092	888097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16117	NC_021814	TGA	2	6	888099	888104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840635
16118	NC_021814	GAC	2	6	888151	888156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16119	NC_021814	GGC	2	6	888157	888162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16120	NC_021814	GAC	2	6	888187	888192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840635
16121	NC_021814	GGC	2	6	888193	888198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16122	NC_021814	CGG	2	6	888201	888206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16123	NC_021814	CGG	2	6	888228	888233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840635
16124	NC_021814	GC	3	6	888292	888297	0 %	0 %	50 %	50 %	525840635
16125	NC_021814	GC	3	6	888367	888372	0 %	0 %	50 %	50 %	525840635
16126	NC_021814	ACT	2	6	888431	888436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840635
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16132	NC_021814	CGC	2	6	888809	888814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840635
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16134	NC_021814	TGA	2	6	889020	889025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840635
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16140	NC_021814	GTC	2	6	889471	889476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837425
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16149	NC_021814	GCT	2	6	889927	889932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837425
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16156	NC_021814	GC	3	6	890118	890123	0 %	0 %	50 %	50 %	525837425
16157	NC_021814	ACGA	2	8	890142	890149	50 %	0 %	25 %	25 %	525837425
16158	NC_021814	CGT	2	6	890162	890167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837425
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16222	NC_021814	TTC	2	6	893115	893120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837427
16223	NC_021814	TGC	3	9	893132	893140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837427
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16225	NC_021814	TCG	2	6	893174	893179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837427
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16229	NC_021814	ATC	2	6	893326	893331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837427
16230	NC_021814	CGA	2	6	893355	893360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837427
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16232	NC_021814	GCG	2	6	893431	893436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837427
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16236	NC_021814	GGGCC	2	10	893611	893620	0 %	0 %	60 %	40 %	525837427
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16360	NC_021814	GCA	2	6	900773	900778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837430
16361	NC_021814	ATA	2	6	900810	900815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837430
16362	NC_021814	AGC	2	6	900817	900822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837430
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16384	NC_021814	TTCT	2	8	901812	901819	0 %	75 %	0 %	25 %	525837430
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16390	NC_021814	GCG	2	6	902085	902090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837431
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16467	NC_021814	GCCTGA	2	12	906037	906048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525837434
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16471	NC_021814	CT	3	6	906238	906243	0 %	50 %	0 %	50 %	525837435
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16475	NC_021814	CGC	2	6	906402	906407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837435
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16477	NC_021814	GT	3	6	906534	906539	0 %	50 %	50 %	0 %	525837435
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