MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_021814	A	6	6	857676	857681	100 %	0 %	0 %	0 %	525837416
15503	NC_021814	CGC	2	6	857712	857717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837416
15504	NC_021814	ACG	2	6	857785	857790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837416
15505	NC_021814	CTA	2	6	857820	857825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837416
15506	NC_021814	GC	3	6	857875	857880	0 %	0 %	50 %	50 %	525837416
15507	NC_021814	ATCG	2	8	857907	857914	25 %	25 %	25 %	25 %	525837416
15508	NC_021814	TGA	2	6	857929	857934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837416
15509	NC_021814	TGGC	2	8	858001	858008	0 %	25 %	50 %	25 %	525837416
15510	NC_021814	GAAT	2	8	858373	858380	50 %	25 %	25 %	0 %	525837417
15511	NC_021814	CACG	2	8	858389	858396	25 %	0 %	25 %	50 %	525837417
15512	NC_021814	ACC	2	6	858414	858419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837417
15513	NC_021814	AAC	2	6	858445	858450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837417
15514	NC_021814	CAGC	2	8	858458	858465	25 %	0 %	25 %	50 %	525837417
15515	NC_021814	GAA	2	6	858516	858521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837417
15516	NC_021814	AT	3	6	858563	858568	50 %	50 %	0 %	0 %	525837417
15517	NC_021814	AGA	2	6	858599	858604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837417
15518	NC_021814	CTG	2	6	858609	858614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837417
15519	NC_021814	GC	3	6	858641	858646	0 %	0 %	50 %	50 %	525837417
15520	NC_021814	CGT	2	6	858687	858692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837417
15521	NC_021814	A	6	6	858693	858698	100 %	0 %	0 %	0 %	525837417
15522	NC_021814	CTGG	2	8	858725	858732	0 %	25 %	50 %	25 %	525837417
15523	NC_021814	TGG	3	9	858765	858773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837417
15524	NC_021814	GCA	2	6	858788	858793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837417
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15526	NC_021814	CTGAA	2	10	858829	858838	40 %	20 %	20 %	20 %	525837417
15527	NC_021814	ACG	2	6	858900	858905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837417
15528	NC_021814	CGGCTC	2	12	858916	858927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525837417
15529	NC_021814	CGG	2	6	858949	858954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837417
15530	NC_021814	CGG	3	9	858976	858984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837417
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15532	NC_021814	CTG	2	6	859108	859113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837417
15533	NC_021814	TGA	2	6	859132	859137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837417
15534	NC_021814	CTG	2	6	859151	859156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837417
15535	NC_021814	AAG	2	6	859182	859187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837417
15536	NC_021814	GC	3	6	859261	859266	0 %	0 %	50 %	50 %	525837417
15537	NC_021814	CGC	2	6	859606	859611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837418
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15540	NC_021814	TGG	3	9	859764	859772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837418
15541	NC_021814	GC	4	8	859776	859783	0 %	0 %	50 %	50 %	525837418
15542	NC_021814	CGC	2	6	859863	859868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837418
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15544	NC_021814	TTG	2	6	859985	859990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837418
15545	NC_021814	GATC	2	8	859999	860006	25 %	25 %	25 %	25 %	525837418
15546	NC_021814	GCGG	2	8	860033	860040	0 %	0 %	75 %	25 %	525837418
15547	NC_021814	CG	3	6	860041	860046	0 %	0 %	50 %	50 %	525837418
15548	NC_021814	CTG	2	6	860081	860086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837418
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15550	NC_021814	CG	5	10	860186	860195	0 %	0 %	50 %	50 %	525837418
15551	NC_021814	AGC	2	6	860268	860273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837418
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15553	NC_021814	ATC	2	6	860309	860314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837418
15554	NC_021814	CGGGC	2	10	860329	860338	0 %	0 %	60 %	40 %	525837418
15555	NC_021814	GGC	2	6	860369	860374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837418
15556	NC_021814	GCGT	2	8	860403	860410	0 %	25 %	50 %	25 %	525837418
15557	NC_021814	ACG	2	6	860427	860432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837418
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15559	NC_021814	TGA	2	6	860482	860487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837418
15560	NC_021814	TGC	2	6	860505	860510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837418
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15565	NC_021814	GTAT	2	8	861230	861237	25 %	50 %	25 %	0 %	525837419
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15585	NC_021814	GC	3	6	862023	862028	0 %	0 %	50 %	50 %	525837420
15586	NC_021814	TGGC	2	8	862033	862040	0 %	25 %	50 %	25 %	525837420
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15589	NC_021814	TGC	2	6	862075	862080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837420
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15601	NC_021814	GC	4	8	862449	862456	0 %	0 %	50 %	50 %	525837420
15602	NC_021814	ATG	2	6	862508	862513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837420
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15621	NC_021814	GTC	2	6	863565	863570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837421
15622	NC_021814	CAA	2	6	863628	863633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837421
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15625	NC_021814	CGG	2	6	864021	864026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837422
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15643	NC_021814	CGT	2	6	864708	864713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837422
15644	NC_021814	GC	3	6	864730	864735	0 %	0 %	50 %	50 %	525837422
15645	NC_021814	CTG	2	6	864763	864768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837422
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15656	NC_021814	TGA	2	6	865295	865300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837422
15657	NC_021814	GCC	2	6	865521	865526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840632
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15663	NC_021814	A	6	6	866114	866119	100 %	0 %	0 %	0 %	525837423
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15726	NC_021814	ATG	2	6	868947	868952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837424
15727	NC_021814	TCG	2	6	868995	869000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837424
15728	NC_021814	GGTACC	2	12	869018	869029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525837424
15729	NC_021814	CGG	2	6	869119	869124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837424
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15734	NC_021814	GCGG	2	8	869589	869596	0 %	0 %	75 %	25 %	525840633
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15739	NC_021814	CGC	2	6	869720	869725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840633
15740	NC_021814	TGG	2	6	869777	869782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840633
15741	NC_021814	GCG	2	6	869930	869935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840633
15742	NC_021814	CCA	2	6	870002	870007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840633
15743	NC_021814	CCG	2	6	870051	870056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840633
15744	NC_021814	ACC	2	6	870130	870135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840633
15745	NC_021814	GGT	3	9	870180	870188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840633
15746	NC_021814	GAAG	2	8	870195	870202	50 %	0 %	50 %	0 %	525840633
15747	NC_021814	CGC	2	6	870218	870223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840633
15748	NC_021814	CCG	2	6	870266	870271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840633
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15751	NC_021814	CCCG	2	8	870377	870384	0 %	0 %	25 %	75 %	525840633
15752	NC_021814	GGC	2	6	870390	870395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840633
15753	NC_021814	AGCG	2	8	870399	870406	25 %	0 %	50 %	25 %	525840633
15754	NC_021814	CGT	2	6	870420	870425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840633
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15762	NC_021814	GCG	2	6	870703	870708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840633
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15764	NC_021814	TCG	2	6	870925	870930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840633
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15787	NC_021814	GCG	2	6	872074	872079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840633
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15850	NC_021814	GC	3	6	875336	875341	0 %	0 %	50 %	50 %	525840634
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15852	NC_021814	CTGGC	2	10	875395	875404	0 %	20 %	40 %	40 %	525840634
15853	NC_021814	CG	3	6	875413	875418	0 %	0 %	50 %	50 %	525840634
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15858	NC_021814	GCC	2	6	875519	875524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840634
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15861	NC_021814	CGG	2	6	875609	875614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840634
15862	NC_021814	CGCC	2	8	875651	875658	0 %	0 %	25 %	75 %	525840634
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15966	NC_021814	GCT	2	6	880317	880322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840634
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15970	NC_021814	G	6	6	880544	880549	0 %	0 %	100 %	0 %	525840634
15971	NC_021814	CAGT	2	8	880584	880591	25 %	25 %	25 %	25 %	525840634
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15974	NC_021814	CGC	2	6	880790	880795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840634
15975	NC_021814	CGGG	2	8	880840	880847	0 %	0 %	75 %	25 %	525840634
15976	NC_021814	CGG	2	6	880866	880871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840634
15977	NC_021814	GAT	2	6	881002	881007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840634
15978	NC_021814	CGA	2	6	881046	881051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840634
15979	NC_021814	GCT	2	6	881181	881186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840634
15980	NC_021814	GGC	2	6	881187	881192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840634
15981	NC_021814	TGG	2	6	881398	881403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840634
15982	NC_021814	GCG	2	6	881404	881409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840634
15983	NC_021814	GCG	2	6	881456	881461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840634
15984	NC_021814	GT	3	6	881503	881508	0 %	50 %	50 %	0 %	525840634
15985	NC_021814	GCG	2	6	881581	881586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840634
15986	NC_021814	AGC	2	6	881635	881640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840634
15987	NC_021814	GCCA	2	8	881782	881789	25 %	0 %	25 %	50 %	525840634
15988	NC_021814	ACC	3	9	881797	881805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840634
15989	NC_021814	CGGATA	2	12	881966	881977	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525840634
15990	NC_021814	GTT	2	6	881982	881987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840634
15991	NC_021814	TGCA	2	8	882095	882102	25 %	25 %	25 %	25 %	525840634
15992	NC_021814	ACA	2	6	882137	882142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840634
15993	NC_021814	ATA	2	6	882191	882196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840634
15994	NC_021814	GCG	2	6	882281	882286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840634
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15996	NC_021814	CGTG	2	8	882365	882372	0 %	25 %	50 %	25 %	525840634
15997	NC_021814	ATGT	2	8	883081	883088	25 %	50 %	25 %	0 %	525840635
15998	NC_021814	CCAAA	2	10	883159	883168	60 %	0 %	0 %	40 %	525840635
15999	NC_021814	ATA	2	6	883186	883191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840635
16000	NC_021814	CG	4	8	883199	883206	0 %	0 %	50 %	50 %	525840635

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