MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021814	GGC	2	6	833639	833644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837398
15003	NC_021814	GCG	2	6	833652	833657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837398
15004	NC_021814	CAA	2	6	833716	833721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837398
15005	NC_021814	CGCGC	2	10	833791	833800	0 %	0 %	40 %	60 %	525837398
15006	NC_021814	TTAA	2	8	833845	833852	50 %	50 %	0 %	0 %	525837398
15007	NC_021814	ACT	2	6	834051	834056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837399
15008	NC_021814	ATG	2	6	834095	834100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837399
15009	NC_021814	GAA	2	6	834170	834175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837399
15010	NC_021814	A	6	6	834302	834307	100 %	0 %	0 %	0 %	525837399
15011	NC_021814	CAT	2	6	834316	834321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837399
15012	NC_021814	ACCT	2	8	834392	834399	25 %	25 %	0 %	50 %	525837399
15013	NC_021814	CAT	2	6	834418	834423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837399
15014	NC_021814	AGC	2	6	834442	834447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837399
15015	NC_021814	GAC	2	6	834455	834460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837399
15016	NC_021814	CAT	2	6	834475	834480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837399
15017	NC_021814	AAC	2	6	834488	834493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837399
15018	NC_021814	GTG	2	6	834503	834508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837399
15019	NC_021814	CG	5	10	834539	834548	0 %	0 %	50 %	50 %	525837399
15020	NC_021814	ATC	2	6	834551	834556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837399
15021	NC_021814	GC	3	6	834669	834674	0 %	0 %	50 %	50 %	525837399
15022	NC_021814	CGT	2	6	834683	834688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837399
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15027	NC_021814	GC	3	6	834915	834920	0 %	0 %	50 %	50 %	525837399
15028	NC_021814	TGC	2	6	835041	835046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837399
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15030	NC_021814	GAA	2	6	835115	835120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837399
15031	NC_021814	CAT	2	6	835235	835240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837399
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15033	NC_021814	ACG	2	6	835338	835343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837400
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15035	NC_021814	GCG	2	6	835380	835385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837400
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15037	NC_021814	GAACTG	2	12	835556	835567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525837400
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15039	NC_021814	AAATA	2	10	835652	835661	80 %	20 %	0 %	0 %	525837400
15040	NC_021814	GCA	2	6	835710	835715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837401
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15049	NC_021814	AAC	2	6	836485	836490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837402
15050	NC_021814	GAC	2	6	836532	836537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837402
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15052	NC_021814	TGG	2	6	836599	836604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837402
15053	NC_021814	CGC	2	6	836618	836623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837402
15054	NC_021814	CGG	3	9	836632	836640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837402
15055	NC_021814	AGC	2	6	836679	836684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837402
15056	NC_021814	AAC	2	6	836689	836694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837402
15057	NC_021814	GAA	2	6	836697	836702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837402
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15059	NC_021814	TTA	2	6	836739	836744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837403
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15061	NC_021814	CGT	2	6	836784	836789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837403
15062	NC_021814	GGC	2	6	836792	836797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837403
15063	NC_021814	CT	3	6	836822	836827	0 %	50 %	0 %	50 %	525837403
15064	NC_021814	CAG	3	9	836910	836918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837403
15065	NC_021814	CGGT	2	8	836926	836933	0 %	25 %	50 %	25 %	525837403
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15071	NC_021814	GTG	2	6	837186	837191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837403
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15088	NC_021814	TGG	2	6	837943	837948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837403
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15093	NC_021814	GC	3	6	838086	838091	0 %	0 %	50 %	50 %	525837403
15094	NC_021814	TGCGC	2	10	838094	838103	0 %	20 %	40 %	40 %	525837403
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15099	NC_021814	GC	3	6	838366	838371	0 %	0 %	50 %	50 %	525837403
15100	NC_021814	CGC	2	6	838382	838387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837403
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15102	NC_021814	GCC	2	6	838425	838430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837403
15103	NC_021814	GAT	2	6	838458	838463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837403
15104	NC_021814	AAAC	2	8	838500	838507	75 %	0 %	0 %	25 %	525837403
15105	NC_021814	CGC	2	6	838524	838529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837403
15106	NC_021814	TCG	2	6	838544	838549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837403
15107	NC_021814	CG	3	6	838548	838553	0 %	0 %	50 %	50 %	525837403
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15109	NC_021814	TGCGC	2	10	838674	838683	0 %	20 %	40 %	40 %	525837404
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15119	NC_021814	TAA	2	6	839456	839461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837406
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15132	NC_021814	GCG	2	6	840037	840042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837406
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15153	NC_021814	GGC	2	6	841183	841188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837407
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15157	NC_021814	CCCAA	2	10	841316	841325	40 %	0 %	0 %	60 %	525837407
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15183	NC_021814	TCA	2	6	843318	843323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840630
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15187	NC_021814	CAC	2	6	843410	843415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840630
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15189	NC_021814	CCT	2	6	843447	843452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840630
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15192	NC_021814	GCA	2	6	843550	843555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840630
15193	NC_021814	CCA	2	6	843557	843562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840630
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15198	NC_021814	TCCTG	2	10	843774	843783	0 %	40 %	20 %	40 %	525840630
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15202	NC_021814	A	6	6	843857	843862	100 %	0 %	0 %	0 %	525840630
15203	NC_021814	GGT	2	6	843866	843871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840630
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15214	NC_021814	CCAGC	2	10	844550	844559	20 %	0 %	20 %	60 %	525837409
15215	NC_021814	GCT	2	6	844583	844588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837409
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15220	NC_021814	GGCG	2	8	844850	844857	0 %	0 %	75 %	25 %	525837409
15221	NC_021814	GTT	2	6	844913	844918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837409
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15223	NC_021814	TTC	2	6	845023	845028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837409
15224	NC_021814	CGA	2	6	845059	845064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837409
15225	NC_021814	GCG	3	9	845103	845111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837409
15226	NC_021814	GCT	2	6	845144	845149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837409
15227	NC_021814	GC	3	6	845197	845202	0 %	0 %	50 %	50 %	525837409
15228	NC_021814	AGCA	2	8	845211	845218	50 %	0 %	25 %	25 %	525837409
15229	NC_021814	CG	3	6	845236	845241	0 %	0 %	50 %	50 %	525837409
15230	NC_021814	CGT	2	6	845366	845371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837409
15231	NC_021814	CAGC	2	8	845372	845379	25 %	0 %	25 %	50 %	525837409
15232	NC_021814	TGC	2	6	845470	845475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837409
15233	NC_021814	A	6	6	845539	845544	100 %	0 %	0 %	0 %	525837409
15234	NC_021814	GC	3	6	845602	845607	0 %	0 %	50 %	50 %	525837409
15235	NC_021814	GTG	2	6	845761	845766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837409
15236	NC_021814	AGTG	2	8	845768	845775	25 %	25 %	50 %	0 %	525837409
15237	NC_021814	GCCA	2	8	845778	845785	25 %	0 %	25 %	50 %	525837409
15238	NC_021814	AAG	2	6	845791	845796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837409
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15240	NC_021814	CTG	2	6	845832	845837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837409
15241	NC_021814	GTC	2	6	845848	845853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837409
15242	NC_021814	TCG	2	6	845861	845866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837409
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15275	NC_021814	GCGT	2	8	847423	847430	0 %	25 %	50 %	25 %	525837409
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15343	NC_021814	CAT	2	6	850099	850104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837410
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15345	NC_021814	CTG	2	6	850297	850302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837410
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15347	NC_021814	GCG	2	6	850333	850338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837410
15348	NC_021814	GC	3	6	850342	850347	0 %	0 %	50 %	50 %	525837410
15349	NC_021814	GGC	3	9	850361	850369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837410
15350	NC_021814	GCG	2	6	850398	850403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837410
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15352	NC_021814	CG	3	6	850598	850603	0 %	0 %	50 %	50 %	525837410
15353	NC_021814	ATC	2	6	850608	850613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837410
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15356	NC_021814	CTGC	2	8	850794	850801	0 %	25 %	25 %	50 %	525837410
15357	NC_021814	CGC	2	6	850818	850823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837410
15358	NC_021814	GCT	2	6	850838	850843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837410
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15360	NC_021814	GCT	2	6	850865	850870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837410
15361	NC_021814	CTGG	2	8	850913	850920	0 %	25 %	50 %	25 %	525837410
15362	NC_021814	GCG	2	6	850931	850936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837410
15363	NC_021814	GGCCGC	2	12	850984	850995	0 %	0 %	50 %	50 %	525837410
15364	NC_021814	GCC	2	6	851009	851014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837410
15365	NC_021814	CCG	2	6	851061	851066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837410
15366	NC_021814	CGC	2	6	851081	851086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837410
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15373	NC_021814	CGC	2	6	851537	851542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837411
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15379	NC_021814	CGG	2	6	852043	852048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837411
15380	NC_021814	CGG	2	6	852087	852092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837411
15381	NC_021814	GCC	2	6	852119	852124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837411
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15393	NC_021814	CGG	2	6	852712	852717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837411
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15431	NC_021814	GCT	2	6	854647	854652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837413
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15434	NC_021814	GCT	2	6	854815	854820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837413
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15457	NC_021814	TGTC	2	8	855474	855481	0 %	50 %	25 %	25 %	525837414
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15465	NC_021814	GCG	2	6	855979	855984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837414
15466	NC_021814	GCTGCG	2	12	856002	856013	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525837414
15467	NC_021814	AC	3	6	856107	856112	50 %	0 %	0 %	50 %	525837414
15468	NC_021814	CAT	2	6	856302	856307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837415
15469	NC_021814	A	6	6	856326	856331	100 %	0 %	0 %	0 %	525837415
15470	NC_021814	GCA	2	6	856340	856345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837415
15471	NC_021814	GC	3	6	856351	856356	0 %	0 %	50 %	50 %	525837415
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15473	NC_021814	TGC	2	6	856394	856399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837415
15474	NC_021814	GC	3	6	856417	856422	0 %	0 %	50 %	50 %	525837415
15475	NC_021814	ACG	2	6	856439	856444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837415
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15477	NC_021814	CCA	2	6	856553	856558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837415
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