MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021814	GCT	2	6	806749	806754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14502	NC_021814	GCC	2	6	806762	806767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840627
14503	NC_021814	GGC	2	6	806860	806865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14504	NC_021814	TCGATG	2	12	806969	806980	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525840627
14505	NC_021814	CGC	2	6	807024	807029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840627
14506	NC_021814	CGC	2	6	807084	807089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840627
14507	NC_021814	TGC	2	6	807114	807119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14508	NC_021814	GATC	2	8	807121	807128	25 %	25 %	25 %	25 %	525840627
14509	NC_021814	CGTG	2	8	807205	807212	0 %	25 %	50 %	25 %	525840627
14510	NC_021814	CTGGC	2	10	807275	807284	0 %	20 %	40 %	40 %	525840627
14511	NC_021814	CGG	2	6	807298	807303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14512	NC_021814	CTG	2	6	807305	807310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14513	NC_021814	GCG	2	6	807345	807350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14514	NC_021814	GAG	2	6	807404	807409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840627
14515	NC_021814	GCG	2	6	807414	807419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14516	NC_021814	CTGG	2	8	807512	807519	0 %	25 %	50 %	25 %	525840627
14517	NC_021814	TGG	2	6	807587	807592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840627
14518	NC_021814	ACC	2	6	807599	807604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840627
14519	NC_021814	CGC	2	6	807724	807729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840627
14520	NC_021814	GGC	3	9	807805	807813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14521	NC_021814	CTG	2	6	807860	807865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14522	NC_021814	TGG	2	6	807900	807905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840627
14523	NC_021814	GCG	2	6	807909	807914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14524	NC_021814	GGGC	2	8	807939	807946	0 %	0 %	75 %	25 %	525840627
14525	NC_021814	CGA	2	6	807988	807993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14526	NC_021814	CTT	2	6	808003	808008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840627
14527	NC_021814	CGCTGG	2	12	808023	808034	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525840627
14528	NC_021814	GAT	2	6	808054	808059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840627
14529	NC_021814	GCT	3	9	808174	808182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14530	NC_021814	CGG	2	6	808371	808376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14531	NC_021814	GAC	2	6	808378	808383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14532	NC_021814	ATG	2	6	808406	808411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840627
14533	NC_021814	AGC	2	6	808512	808517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14534	NC_021814	CTG	2	6	809241	809246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837380
14535	NC_021814	CTGGC	2	10	809259	809268	0 %	20 %	40 %	40 %	525837380
14536	NC_021814	GCA	2	6	809320	809325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837380
14537	NC_021814	GAT	2	6	809493	809498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837380
14538	NC_021814	AGCGGC	2	12	809570	809581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525837380
14539	NC_021814	CG	3	6	809582	809587	0 %	0 %	50 %	50 %	525837380
14540	NC_021814	CG	3	6	809650	809655	0 %	0 %	50 %	50 %	525837380
14541	NC_021814	GCA	2	6	809657	809662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837380
14542	NC_021814	ACA	2	6	809666	809671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837380
14543	NC_021814	GAT	2	6	809792	809797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837380
14544	NC_021814	TGAG	2	8	809890	809897	25 %	25 %	50 %	0 %	525837380
14545	NC_021814	GCT	2	6	809993	809998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837380
14546	NC_021814	GGT	2	6	810008	810013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837380
14547	NC_021814	GGT	2	6	810041	810046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837380
14548	NC_021814	CAG	2	6	810062	810067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837380
14549	NC_021814	ATTG	2	8	810083	810090	25 %	50 %	25 %	0 %	525837380
14550	NC_021814	CGC	2	6	810157	810162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837380
14551	NC_021814	TGG	2	6	810172	810177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837380
14552	NC_021814	TGCC	2	8	810193	810200	0 %	25 %	25 %	50 %	525837380
14553	NC_021814	ATG	2	6	810210	810215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837380
14554	NC_021814	TGA	2	6	810268	810273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837380
14555	NC_021814	GCG	2	6	810385	810390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837380
14556	NC_021814	T	6	6	810431	810436	0 %	100 %	0 %	0 %	525837380
14557	NC_021814	CCA	2	6	810446	810451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837380
14558	NC_021814	TCG	2	6	810509	810514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837380
14559	NC_021814	GA	3	6	810523	810528	50 %	0 %	50 %	0 %	525837380
14560	NC_021814	TGG	2	6	810535	810540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837380
14561	NC_021814	GTTT	2	8	810558	810565	0 %	75 %	25 %	0 %	525837380
14562	NC_021814	AGCGC	2	10	810748	810757	20 %	0 %	40 %	40 %	525840628
14563	NC_021814	CG	3	6	810905	810910	0 %	0 %	50 %	50 %	525840628
14564	NC_021814	GC	4	8	810916	810923	0 %	0 %	50 %	50 %	525840628
14565	NC_021814	GAT	2	6	810931	810936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840628
14566	NC_021814	CGC	2	6	810989	810994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840628
14567	NC_021814	GCG	2	6	810999	811004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840628
14568	NC_021814	GC	3	6	811034	811039	0 %	0 %	50 %	50 %	525840628
14569	NC_021814	TGCGC	2	10	811164	811173	0 %	20 %	40 %	40 %	525840628
14570	NC_021814	CAG	2	6	811174	811179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840628
14571	NC_021814	ACC	2	6	811210	811215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840628
14572	NC_021814	CGC	2	6	811292	811297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840628
14573	NC_021814	GGCGC	2	10	811330	811339	0 %	0 %	60 %	40 %	525840628
14574	NC_021814	CTG	3	9	811392	811400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837381
14575	NC_021814	CGT	2	6	811463	811468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837381
14576	NC_021814	AG	3	6	811475	811480	50 %	0 %	50 %	0 %	525837381
14577	NC_021814	AGGA	2	8	811486	811493	50 %	0 %	50 %	0 %	525837381
14578	NC_021814	TAC	2	6	811501	811506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837381
14579	NC_021814	TAA	2	6	811528	811533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837381
14580	NC_021814	ATGG	2	8	811554	811561	25 %	25 %	50 %	0 %	525837381
14581	NC_021814	TA	3	6	811708	811713	50 %	50 %	0 %	0 %	525837381
14582	NC_021814	GACG	2	8	811751	811758	25 %	0 %	50 %	25 %	525837381
14583	NC_021814	TGC	2	6	811798	811803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837381
14584	NC_021814	GC	3	6	811818	811823	0 %	0 %	50 %	50 %	525837381
14585	NC_021814	GCG	2	6	811948	811953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837381
14586	NC_021814	ATT	2	6	811982	811987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837381
14587	NC_021814	GC	3	6	811995	812000	0 %	0 %	50 %	50 %	525837381
14588	NC_021814	GTT	2	6	812036	812041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837381
14589	NC_021814	GGC	2	6	812045	812050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837381
14590	NC_021814	GGC	2	6	812055	812060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837381
14591	NC_021814	GCT	2	6	812111	812116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837381
14592	NC_021814	GCA	2	6	812152	812157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837381
14593	NC_021814	ATT	2	6	812184	812189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837381
14594	NC_021814	TAC	2	6	812250	812255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837381
14595	NC_021814	GCT	2	6	812315	812320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837381
14596	NC_021814	ATC	2	6	812326	812331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837381
14597	NC_021814	TGA	2	6	812401	812406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837381
14598	NC_021814	CTT	2	6	812470	812475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837381
14599	NC_021814	TGAAC	2	10	812564	812573	40 %	20 %	20 %	20 %	525837381
14600	NC_021814	ACGC	2	8	812613	812620	25 %	0 %	25 %	50 %	525837381
14601	NC_021814	AGT	2	6	812701	812706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837381
14602	NC_021814	ATT	2	6	812800	812805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837382
14603	NC_021814	AGGT	2	8	812846	812853	25 %	25 %	50 %	0 %	525837382
14604	NC_021814	CGCGG	2	10	812920	812929	0 %	0 %	60 %	40 %	525837382
14605	NC_021814	AT	3	6	812931	812936	50 %	50 %	0 %	0 %	525837382
14606	NC_021814	GAC	2	6	812980	812985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837382
14607	NC_021814	CAT	2	6	813009	813014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837382
14608	NC_021814	TCTTTG	2	12	813053	813064	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525837382
14609	NC_021814	GAA	2	6	813097	813102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837382
14610	NC_021814	GAC	2	6	813103	813108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837382
14611	NC_021814	CGA	2	6	813231	813236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837383
14612	NC_021814	GGC	2	6	813292	813297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837383
14613	NC_021814	CCG	2	6	813300	813305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837383
14614	NC_021814	TTG	2	6	813331	813336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837383
14615	NC_021814	GCCA	3	12	813346	813357	25 %	0 %	25 %	50 %	525837383
14616	NC_021814	CAGG	2	8	813414	813421	25 %	0 %	50 %	25 %	525837383
14617	NC_021814	ATC	2	6	813497	813502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837383
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14619	NC_021814	CAG	2	6	813553	813558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837383
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14978	NC_021814	TGA	2	6	832065	832070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837396
14979	NC_021814	TGG	2	6	832074	832079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837396
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14982	NC_021814	GT	3	6	832157	832162	0 %	50 %	50 %	0 %	525837396
14983	NC_021814	ATTAC	2	10	832289	832298	40 %	40 %	0 %	20 %	525837396
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