MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021814	GT	3	6	780793	780798	0 %	50 %	50 %	0 %	525837356
14002	NC_021814	GCT	2	6	780800	780805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837356
14003	NC_021814	GC	3	6	780885	780890	0 %	0 %	50 %	50 %	525837356
14004	NC_021814	CAT	2	6	780920	780925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837356
14005	NC_021814	A	7	7	780998	781004	100 %	0 %	0 %	0 %	525837356
14006	NC_021814	ATC	2	6	781029	781034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837357
14007	NC_021814	GCTTG	2	10	781069	781078	0 %	40 %	40 %	20 %	525837357
14008	NC_021814	T	6	6	781094	781099	0 %	100 %	0 %	0 %	525837357
14009	NC_021814	CG	3	6	781122	781127	0 %	0 %	50 %	50 %	525837357
14010	NC_021814	T	6	6	781147	781152	0 %	100 %	0 %	0 %	525837357
14011	NC_021814	T	6	6	781177	781182	0 %	100 %	0 %	0 %	525837357
14012	NC_021814	TCA	2	6	781235	781240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837357
14013	NC_021814	CG	3	6	781245	781250	0 %	0 %	50 %	50 %	525837357
14014	NC_021814	CAG	2	6	781285	781290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837357
14015	NC_021814	GTCG	2	8	781450	781457	0 %	25 %	50 %	25 %	525837357
14016	NC_021814	TTG	2	6	781544	781549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837357
14017	NC_021814	GTA	2	6	781687	781692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837357
14018	NC_021814	CAG	2	6	781756	781761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837357
14019	NC_021814	ATCGC	2	10	781781	781790	20 %	20 %	20 %	40 %	525837357
14020	NC_021814	GTTT	2	8	781817	781824	0 %	75 %	25 %	0 %	525837357
14021	NC_021814	TCT	2	6	781937	781942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837357
14022	NC_021814	TA	3	6	781945	781950	50 %	50 %	0 %	0 %	525837357
14023	NC_021814	GCA	2	6	781953	781958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837357
14024	NC_021814	CGT	2	6	781966	781971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837357
14025	NC_021814	CGC	2	6	782028	782033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837357
14026	NC_021814	GCG	2	6	782136	782141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837357
14027	NC_021814	T	6	6	782149	782154	0 %	100 %	0 %	0 %	525837357
14028	NC_021814	TGC	2	6	782174	782179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837357
14029	NC_021814	GCA	2	6	782187	782192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837357
14030	NC_021814	GCC	2	6	782198	782203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837357
14031	NC_021814	GGC	2	6	782266	782271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837357
14032	NC_021814	CAG	2	6	782320	782325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837357
14033	NC_021814	TCG	2	6	782330	782335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837357
14034	NC_021814	TTC	2	6	782517	782522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837358
14035	NC_021814	T	6	6	782549	782554	0 %	100 %	0 %	0 %	525837358
14036	NC_021814	CTG	2	6	782666	782671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837358
14037	NC_021814	CGGA	2	8	782690	782697	25 %	0 %	50 %	25 %	525837358
14038	NC_021814	TTA	2	6	782850	782855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837358
14039	NC_021814	TTA	2	6	782869	782874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837358
14040	NC_021814	CGC	2	6	782898	782903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837358
14041	NC_021814	GCG	2	6	782960	782965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837358
14042	NC_021814	T	7	7	782987	782993	0 %	100 %	0 %	0 %	525837358
14043	NC_021814	GCA	2	6	783031	783036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837358
14044	NC_021814	GC	3	6	783092	783097	0 %	0 %	50 %	50 %	525837358
14045	NC_021814	ATT	2	6	783183	783188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837358
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14047	NC_021814	CT	3	6	783314	783319	0 %	50 %	0 %	50 %	525837359
14048	NC_021814	CAT	2	6	783325	783330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837359
14049	NC_021814	ATT	2	6	783385	783390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837359
14050	NC_021814	TTG	2	6	783427	783432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837359
14051	NC_021814	GC	3	6	783455	783460	0 %	0 %	50 %	50 %	525837359
14052	NC_021814	TCG	2	6	783471	783476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837359
14053	NC_021814	CAG	2	6	783505	783510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837359
14054	NC_021814	CAC	2	6	783538	783543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837359
14055	NC_021814	TGC	2	6	783634	783639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837359
14056	NC_021814	ATC	2	6	783760	783765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837359
14057	NC_021814	GAC	2	6	783766	783771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837359
14058	NC_021814	CGC	3	9	783774	783782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837359
14059	NC_021814	AAC	2	6	783802	783807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837359
14060	NC_021814	ATCC	2	8	783829	783836	25 %	25 %	0 %	50 %	525837359
14061	NC_021814	ATC	2	6	783860	783865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837359
14062	NC_021814	GTT	2	6	783933	783938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837359
14063	NC_021814	CG	3	6	783972	783977	0 %	0 %	50 %	50 %	525837359
14064	NC_021814	GC	3	6	784151	784156	0 %	0 %	50 %	50 %	525837359
14065	NC_021814	GGA	2	6	784180	784185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837359
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14067	NC_021814	CAC	2	6	784240	784245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837359
14068	NC_021814	CGA	2	6	784302	784307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837359
14069	NC_021814	TGC	2	6	784362	784367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837359
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14071	NC_021814	CGG	2	6	784443	784448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837359
14072	NC_021814	GCC	2	6	784474	784479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837359
14073	NC_021814	GAT	2	6	784491	784496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837359
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14076	NC_021814	GCCGC	2	10	784787	784796	0 %	0 %	40 %	60 %	525837359
14077	NC_021814	TCA	2	6	784836	784841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837359
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14081	NC_021814	G	6	6	785460	785465	0 %	0 %	100 %	0 %	525837360
14082	NC_021814	GAA	2	6	785512	785517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837360
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14084	NC_021814	GCG	3	9	785589	785597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837360
14085	NC_021814	GAAA	2	8	785602	785609	75 %	0 %	25 %	0 %	525837360
14086	NC_021814	TGT	2	6	785631	785636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837360
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14088	NC_021814	TCCC	2	8	785675	785682	0 %	25 %	0 %	75 %	525837360
14089	NC_021814	ATA	2	6	785811	785816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837360
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14091	NC_021814	GATG	2	8	785900	785907	25 %	25 %	50 %	0 %	525837361
14092	NC_021814	GCT	2	6	785927	785932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837361
14093	NC_021814	G	6	6	786004	786009	0 %	0 %	100 %	0 %	525837361
14094	NC_021814	AT	3	6	786034	786039	50 %	50 %	0 %	0 %	525837361
14095	NC_021814	GCA	2	6	786119	786124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837361
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14097	NC_021814	GCG	2	6	786165	786170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837361
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14099	NC_021814	TCG	2	6	786217	786222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837361
14100	NC_021814	CAA	2	6	786258	786263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837361
14101	NC_021814	ATG	2	6	786294	786299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837361
14102	NC_021814	AGCC	2	8	786305	786312	25 %	0 %	25 %	50 %	525837361
14103	NC_021814	AGC	2	6	786338	786343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837361
14104	NC_021814	CAG	2	6	786363	786368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837361
14105	NC_021814	AGC	2	6	786376	786381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837361
14106	NC_021814	GTC	2	6	786382	786387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837361
14107	NC_021814	GGC	2	6	786556	786561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837362
14108	NC_021814	TTC	2	6	786569	786574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837362
14109	NC_021814	GCA	2	6	786616	786621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837362
14110	NC_021814	CAGT	2	8	786634	786641	25 %	25 %	25 %	25 %	525837362
14111	NC_021814	ACGC	2	8	786708	786715	25 %	0 %	25 %	50 %	525837362
14112	NC_021814	CCG	2	6	786760	786765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837362
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14114	NC_021814	CAGA	2	8	786933	786940	50 %	0 %	25 %	25 %	525837362
14115	NC_021814	GC	3	6	786965	786970	0 %	0 %	50 %	50 %	525837362
14116	NC_021814	TGGA	2	8	786998	787005	25 %	25 %	50 %	0 %	525837362
14117	NC_021814	CTG	2	6	787037	787042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837362
14118	NC_021814	GCA	2	6	787107	787112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837362
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14359	NC_021814	CTG	2	6	800673	800678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837377
14360	NC_021814	GGC	2	6	800775	800780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837377
14361	NC_021814	GCG	2	6	800857	800862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837377
14362	NC_021814	CTG	2	6	800874	800879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837377
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14389	NC_021814	GCCA	2	8	802002	802009	25 %	0 %	25 %	50 %	525840626
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14477	NC_021814	AAC	2	6	805766	805771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840627
14478	NC_021814	GGCG	2	8	805876	805883	0 %	0 %	75 %	25 %	525840627
14479	NC_021814	TCG	2	6	805926	805931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14480	NC_021814	GGC	2	6	805955	805960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14481	NC_021814	CGG	3	9	805981	805989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14482	NC_021814	CGC	2	6	806072	806077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840627
14483	NC_021814	GCT	2	6	806097	806102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14484	NC_021814	ATG	2	6	806139	806144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840627
14485	NC_021814	GCGG	2	8	806150	806157	0 %	0 %	75 %	25 %	525840627
14486	NC_021814	TC	3	6	806158	806163	0 %	50 %	0 %	50 %	525840627
14487	NC_021814	CGG	2	6	806191	806196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14488	NC_021814	GCG	2	6	806199	806204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840627
14489	NC_021814	CGA	2	6	806233	806238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14490	NC_021814	CG	3	6	806348	806353	0 %	0 %	50 %	50 %	525840627
14491	NC_021814	GAA	2	6	806381	806386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840627
14492	NC_021814	TC	3	6	806392	806397	0 %	50 %	0 %	50 %	525840627
14493	NC_021814	CTG	2	6	806450	806455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840627
14494	NC_021814	CG	3	6	806519	806524	0 %	0 %	50 %	50 %	525840627
14495	NC_021814	A	6	6	806580	806585	100 %	0 %	0 %	0 %	525840627
14496	NC_021814	CCTT	2	8	806586	806593	0 %	50 %	0 %	50 %	525840627
14497	NC_021814	ACCGT	2	10	806607	806616	20 %	20 %	20 %	40 %	525840627
14498	NC_021814	TGG	2	6	806625	806630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840627
14499	NC_021814	CTA	2	6	806704	806709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840627
14500	NC_021814	GC	4	8	806734	806741	0 %	0 %	50 %	50 %	525840627

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