MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021814	CAC	2	6	746135	746140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837332
13503	NC_021814	ATC	2	6	746153	746158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837332
13504	NC_021814	TCT	2	6	746194	746199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837332
13505	NC_021814	GAG	2	6	746246	746251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837332
13506	NC_021814	ACT	3	9	746256	746264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837332
13507	NC_021814	ATG	2	6	746330	746335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837332
13508	NC_021814	A	7	7	746613	746619	100 %	0 %	0 %	0 %	525837333
13509	NC_021814	CTG	2	6	746623	746628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837333
13510	NC_021814	ACCGT	2	10	746672	746681	20 %	20 %	20 %	40 %	525837333
13511	NC_021814	GAC	2	6	746683	746688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837333
13512	NC_021814	CGG	3	9	746697	746705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837333
13513	NC_021814	ATG	2	6	746719	746724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837333
13514	NC_021814	GCA	2	6	746752	746757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837333
13515	NC_021814	GT	3	6	746866	746871	0 %	50 %	50 %	0 %	525837333
13516	NC_021814	GAA	2	6	746920	746925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837333
13517	NC_021814	AGA	2	6	747190	747195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837333
13518	NC_021814	CTGA	2	8	747220	747227	25 %	25 %	25 %	25 %	525837333
13519	NC_021814	AGCA	2	8	747230	747237	50 %	0 %	25 %	25 %	525837333
13520	NC_021814	CAG	2	6	747274	747279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837333
13521	NC_021814	ATG	2	6	747287	747292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837333
13522	NC_021814	ATT	2	6	747353	747358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837334
13523	NC_021814	CCTT	2	8	747395	747402	0 %	50 %	0 %	50 %	525837334
13524	NC_021814	GTT	2	6	747437	747442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837334
13525	NC_021814	ACTC	2	8	747569	747576	25 %	25 %	0 %	50 %	525837334
13526	NC_021814	CGT	2	6	747605	747610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837334
13527	NC_021814	TAC	2	6	747635	747640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837334
13528	NC_021814	AGCG	2	8	747855	747862	25 %	0 %	50 %	25 %	525837335
13529	NC_021814	CGC	2	6	748090	748095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837335
13530	NC_021814	ACC	2	6	748121	748126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837335
13531	NC_021814	AT	3	6	748197	748202	50 %	50 %	0 %	0 %	525837335
13532	NC_021814	TCA	2	6	748261	748266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837335
13533	NC_021814	CG	3	6	748292	748297	0 %	0 %	50 %	50 %	525837335
13534	NC_021814	GTA	2	6	748336	748341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837335
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13537	NC_021814	CGT	2	6	748480	748485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837335
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13543	NC_021814	ACGCA	2	10	748954	748963	40 %	0 %	20 %	40 %	525837335
13544	NC_021814	AGC	2	6	748992	748997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837335
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13546	NC_021814	CGC	2	6	749114	749119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837336
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13551	NC_021814	GGC	2	6	749425	749430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837336
13552	NC_021814	GT	3	6	749448	749453	0 %	50 %	50 %	0 %	525837336
13553	NC_021814	TCT	2	6	749494	749499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837336
13554	NC_021814	TAA	2	6	749535	749540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837336
13555	NC_021814	CAT	2	6	750015	750020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837337
13556	NC_021814	ACGT	2	8	750041	750048	25 %	25 %	25 %	25 %	525837337
13557	NC_021814	AGC	2	6	750080	750085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837337
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13560	NC_021814	ATGG	2	8	750358	750365	25 %	25 %	50 %	0 %	525837337
13561	NC_021814	TGG	2	6	750410	750415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837337
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13563	NC_021814	GC	3	6	750621	750626	0 %	0 %	50 %	50 %	525837337
13564	NC_021814	TTG	2	6	750647	750652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837337
13565	NC_021814	GGC	2	6	750724	750729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837337
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13567	NC_021814	CAGC	2	8	750853	750860	25 %	0 %	25 %	50 %	525837337
13568	NC_021814	GAT	2	6	751135	751140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837338
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13570	NC_021814	GCCT	2	8	751220	751227	0 %	25 %	25 %	50 %	525837338
13571	NC_021814	ACG	2	6	751266	751271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837338
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13573	NC_021814	GTC	2	6	751399	751404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837338
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13583	NC_021814	AGC	2	6	751922	751927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837338
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13587	NC_021814	GCGAT	2	10	752072	752081	20 %	20 %	40 %	20 %	525837338
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13591	NC_021814	GC	3	6	752351	752356	0 %	0 %	50 %	50 %	525837339
13592	NC_021814	CTGG	2	8	752502	752509	0 %	25 %	50 %	25 %	525837339
13593	NC_021814	ATT	2	6	752523	752528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837339
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13596	NC_021814	GAAGGA	2	12	752845	752856	50 %	0 %	50 %	0 %	525837339
13597	NC_021814	CGGCG	2	10	752865	752874	0 %	0 %	60 %	40 %	525837339
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13602	NC_021814	TTA	2	6	753026	753031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837339
13603	NC_021814	GAA	2	6	753123	753128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837339
13604	NC_021814	CAGG	2	8	753148	753155	25 %	0 %	50 %	25 %	525837339
13605	NC_021814	ACG	2	6	753166	753171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837339
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13607	NC_021814	GC	3	6	753233	753238	0 %	0 %	50 %	50 %	525837340
13608	NC_021814	ATG	2	6	753334	753339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837340
13609	NC_021814	GCA	2	6	753353	753358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837340
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13615	NC_021814	GCC	2	6	753534	753539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837340
13616	NC_021814	CG	3	6	753563	753568	0 %	0 %	50 %	50 %	525837340
13617	NC_021814	ACTGC	2	10	753657	753666	20 %	20 %	20 %	40 %	525837340
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13979	NC_021814	CAG	2	6	779320	779325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837354
13980	NC_021814	A	6	6	779431	779436	100 %	0 %	0 %	0 %	525837355
13981	NC_021814	CAG	2	6	779456	779461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837355
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13983	NC_021814	AAT	2	6	779651	779656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837355
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