MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021814	ACC	2	6	720183	720188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837320
13002	NC_021814	GAT	2	6	720200	720205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837320
13003	NC_021814	GCC	2	6	720221	720226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837320
13004	NC_021814	GCC	2	6	720240	720245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837320
13005	NC_021814	GCG	2	6	720287	720292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837320
13006	NC_021814	TC	3	6	720308	720313	0 %	50 %	0 %	50 %	525837320
13007	NC_021814	GAA	2	6	720324	720329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837320
13008	NC_021814	CG	3	6	720334	720339	0 %	0 %	50 %	50 %	525837320
13009	NC_021814	GCG	2	6	720363	720368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837320
13010	NC_021814	ATC	2	6	720427	720432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837320
13011	NC_021814	GCC	2	6	720438	720443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837320
13012	NC_021814	TCG	2	6	720553	720558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837320
13013	NC_021814	GGA	2	6	720602	720607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837320
13014	NC_021814	TGT	2	6	720662	720667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837320
13015	NC_021814	CGC	2	6	720681	720686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837320
13016	NC_021814	CTG	2	6	720693	720698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837320
13017	NC_021814	GC	3	6	720702	720707	0 %	0 %	50 %	50 %	525837320
13018	NC_021814	CGC	2	6	720713	720718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837320
13019	NC_021814	ATC	2	6	720739	720744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837320
13020	NC_021814	CGAGC	2	10	720747	720756	20 %	0 %	40 %	40 %	525837320
13021	NC_021814	GC	3	6	720809	720814	0 %	0 %	50 %	50 %	525837320
13022	NC_021814	CTG	2	6	720936	720941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837320
13023	NC_021814	TCC	2	6	720976	720981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837320
13024	NC_021814	GGC	2	6	721032	721037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837320
13025	NC_021814	T	8	8	721059	721066	0 %	100 %	0 %	0 %	525837320
13026	NC_021814	ATC	2	6	721087	721092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837320
13027	NC_021814	GCC	2	6	721099	721104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837320
13028	NC_021814	AAT	2	6	721134	721139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837320
13029	NC_021814	AAAG	2	8	721164	721171	75 %	0 %	25 %	0 %	525837320
13030	NC_021814	ATC	2	6	721207	721212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837320
13031	NC_021814	GCA	2	6	721373	721378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837320
13032	NC_021814	GGC	2	6	721515	721520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837320
13033	NC_021814	CTT	2	6	721703	721708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837320
13034	NC_021814	CAAC	2	8	721784	721791	50 %	0 %	0 %	50 %	525837320
13035	NC_021814	CG	3	6	721858	721863	0 %	0 %	50 %	50 %	525837320
13036	NC_021814	GC	4	8	721991	721998	0 %	0 %	50 %	50 %	525837320
13037	NC_021814	GCG	2	6	722026	722031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837320
13038	NC_021814	TGC	2	6	722062	722067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13039	NC_021814	GAT	2	6	722068	722073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837321
13040	NC_021814	GC	3	6	722095	722100	0 %	0 %	50 %	50 %	525837321
13041	NC_021814	ACAG	2	8	722110	722117	50 %	0 %	25 %	25 %	525837321
13042	NC_021814	AGC	2	6	722205	722210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13043	NC_021814	TGC	2	6	722235	722240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13044	NC_021814	CG	3	6	722251	722256	0 %	0 %	50 %	50 %	525837321
13045	NC_021814	GCT	2	6	722269	722274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13046	NC_021814	CGA	2	6	722280	722285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13047	NC_021814	GC	3	6	722324	722329	0 %	0 %	50 %	50 %	525837321
13048	NC_021814	TGGC	2	8	722397	722404	0 %	25 %	50 %	25 %	525837321
13049	NC_021814	TGT	2	6	722523	722528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837321
13050	NC_021814	TCG	2	6	722548	722553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13051	NC_021814	GC	3	6	722563	722568	0 %	0 %	50 %	50 %	525837321
13052	NC_021814	GGC	2	6	722612	722617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837321
13053	NC_021814	TCG	2	6	722640	722645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13054	NC_021814	ATT	2	6	722690	722695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837321
13055	NC_021814	CCAGC	2	10	722714	722723	20 %	0 %	20 %	60 %	525837321
13056	NC_021814	TCA	2	6	722728	722733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837321
13057	NC_021814	GCGG	2	8	722783	722790	0 %	0 %	75 %	25 %	525837321
13058	NC_021814	CAC	2	6	722813	722818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837321
13059	NC_021814	AG	3	6	722822	722827	50 %	0 %	50 %	0 %	525837321
13060	NC_021814	CGCTG	2	10	722845	722854	0 %	20 %	40 %	40 %	525837321
13061	NC_021814	CGA	2	6	722884	722889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13062	NC_021814	TTC	2	6	722894	722899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837321
13063	NC_021814	CGC	2	6	722900	722905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837321
13064	NC_021814	TGC	2	6	722916	722921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13065	NC_021814	TGC	2	6	722997	723002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837321
13066	NC_021814	ATA	2	6	723152	723157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837321
13067	NC_021814	CGGCG	2	10	723275	723284	0 %	0 %	60 %	40 %	525837321
13068	NC_021814	GCG	2	6	723303	723308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837321
13069	NC_021814	GAAG	2	8	723321	723328	50 %	0 %	50 %	0 %	525837321
13070	NC_021814	GGC	2	6	723366	723371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837321
13071	NC_021814	TGA	2	6	723393	723398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837321
13072	NC_021814	GGT	2	6	723527	723532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840618
13073	NC_021814	CGC	2	6	723681	723686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13074	NC_021814	CAG	2	6	723705	723710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840618
13075	NC_021814	GCC	2	6	723774	723779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13076	NC_021814	GGT	2	6	723803	723808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840618
13077	NC_021814	TGGT	2	8	723853	723860	0 %	50 %	50 %	0 %	525840618
13078	NC_021814	GAC	2	6	723961	723966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840618
13079	NC_021814	ATT	2	6	723978	723983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840618
13080	NC_021814	GGTGTA	2	12	723987	723998	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525840618
13081	NC_021814	TGG	2	6	724052	724057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840618
13082	NC_021814	CGC	2	6	724062	724067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13083	NC_021814	GGC	2	6	724080	724085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840618
13084	NC_021814	CGC	2	6	724149	724154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13085	NC_021814	GGT	2	6	724224	724229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840618
13086	NC_021814	TCG	2	6	724250	724255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840618
13087	NC_021814	CCAG	2	8	724571	724578	25 %	0 %	25 %	50 %	525840618
13088	NC_021814	CAT	2	6	724622	724627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840618
13089	NC_021814	GTATCG	2	12	724675	724686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525840618
13090	NC_021814	TTC	2	6	724753	724758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840618
13091	NC_021814	ATG	2	6	724789	724794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840618
13092	NC_021814	CGC	2	6	724833	724838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13093	NC_021814	GAG	2	6	724863	724868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840618
13094	NC_021814	GAC	2	6	724881	724886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840618
13095	NC_021814	GGT	2	6	724908	724913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840618
13096	NC_021814	CGC	2	6	725021	725026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13097	NC_021814	CAG	2	6	725067	725072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840618
13098	NC_021814	TTG	2	6	725112	725117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840618
13099	NC_021814	CGC	2	6	725171	725176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13100	NC_021814	CTT	2	6	725213	725218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840618
13101	NC_021814	GAT	2	6	725229	725234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840618
13102	NC_021814	ATC	2	6	725247	725252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840618
13103	NC_021814	CGC	2	6	725303	725308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13104	NC_021814	GTT	2	6	725325	725330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840618
13105	NC_021814	TGTC	2	8	725372	725379	0 %	50 %	25 %	25 %	525840618
13106	NC_021814	TAA	2	6	725417	725422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840618
13107	NC_021814	GCG	2	6	725431	725436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840618
13108	NC_021814	CT	3	6	725476	725481	0 %	50 %	0 %	50 %	525840618
13109	NC_021814	CCG	2	6	725495	725500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13110	NC_021814	CGC	2	6	725576	725581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13111	NC_021814	CGTTGG	2	12	725606	725617	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525840618
13112	NC_021814	GTG	2	6	725632	725637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840618
13113	NC_021814	ATC	2	6	725652	725657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840618
13114	NC_021814	TAA	2	6	725693	725698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840618
13115	NC_021814	CTGGT	2	10	725707	725716	0 %	40 %	40 %	20 %	525840618
13116	NC_021814	CGC	2	6	725822	725827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840618
13117	NC_021814	CGG	2	6	725864	725869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840618
13118	NC_021814	TCG	2	6	725879	725884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840618
13119	NC_021814	AGC	2	6	725938	725943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840618
13120	NC_021814	GCG	2	6	725962	725967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840618
13121	NC_021814	ACC	2	6	725991	725996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840618
13122	NC_021814	GC	3	6	726059	726064	0 %	0 %	50 %	50 %	525840618
13123	NC_021814	CAG	3	9	726069	726077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840618
13124	NC_021814	CGG	2	6	726110	726115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840618
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13128	NC_021814	GA	3	6	726264	726269	50 %	0 %	50 %	0 %	525840618
13129	NC_021814	TGC	2	6	726281	726286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840618
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13139	NC_021814	CGG	2	6	726740	726745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840618
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13240	NC_021814	GAT	2	6	731454	731459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840618
13241	NC_021814	GGC	2	6	731568	731573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840618
13242	NC_021814	GTG	2	6	731620	731625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840618
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13344	NC_021814	TACC	2	8	738526	738533	25 %	25 %	0 %	50 %	525837325
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13347	NC_021814	CTGG	2	8	738617	738624	0 %	25 %	50 %	25 %	525837325
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13350	NC_021814	TTG	2	6	738764	738769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837325
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13476	NC_021814	GAA	2	6	744969	744974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837330
13477	NC_021814	GATG	2	8	745101	745108	25 %	25 %	50 %	0 %	525837330
13478	NC_021814	ATC	2	6	745135	745140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837330
13479	NC_021814	CG	3	6	745162	745167	0 %	0 %	50 %	50 %	525837330
13480	NC_021814	ATC	2	6	745177	745182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837330
13481	NC_021814	CGT	2	6	745198	745203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837330
13482	NC_021814	TGCAGG	2	12	745223	745234	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525837330
13483	NC_021814	CGA	2	6	745260	745265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837330
13484	NC_021814	ATG	2	6	745276	745281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837330
13485	NC_021814	AAG	2	6	745282	745287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837330
13486	NC_021814	GAA	2	6	745290	745295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837330
13487	NC_021814	GAT	2	6	745311	745316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837330
13488	NC_021814	GAT	2	6	745332	745337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837330
13489	NC_021814	GCC	2	6	745338	745343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837330
13490	NC_021814	GTT	2	6	745730	745735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837331
13491	NC_021814	TTC	2	6	745787	745792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837331
13492	NC_021814	AGA	2	6	745813	745818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837331
13493	NC_021814	CTGGAT	2	12	745829	745840	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525837331
13494	NC_021814	GCG	2	6	745889	745894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837331
13495	NC_021814	A	7	7	745909	745915	100 %	0 %	0 %	0 %	525837331
13496	NC_021814	ATG	2	6	745940	745945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837332
13497	NC_021814	AGCA	2	8	745946	745953	50 %	0 %	25 %	25 %	525837332
13498	NC_021814	CGC	2	6	745957	745962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837332
13499	NC_021814	TTC	2	6	746002	746007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837332
13500	NC_021814	TCC	2	6	746039	746044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837332

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